台灣大捷，當然要對有功將士進行封賞，但是朝臣們對如何封賞這些將士，尤其是如何封賞鄭芝龍有些分歧.t鄭芝龍的背景有些複雜，他出身於一個南安一個官吏家庭，原名一官，字飛黃，後改芝龍。
鄭芝龍在他十七歲的時候，因為家庭生計困難，帶著他的兩個弟弟芝虎與芝豹到澳門投靠舅父黃程，黃程是個海商，他見鄭芝龍非常能幹，就把他留在身邊，協力商務，後來鄭芝龍在到呂宋經商的時候學會了盧西塔語和葡萄牙文，並在此期間入了天主教。
之後鄭芝龍在經商期間，可以說是亦商亦盜，並且鄭芝龍在日本經商期間，娶了平戶侯之家臣田川昱皇之女田川松。
對於這樣一個背景如此複雜的人，朝廷該如何的封賞？原先鄭芝龍歸順朝廷的時候，因為他是帶著一支艦隊歸降的，所以朝廷就任命鄭芝龍為福建水師副都督，現在他率領水師在收復台灣的戰役中立下大功，任命他統帥朝廷在東南的水師也不過分。
但是這個鄭芝龍在歸順朝廷後也不怎麼安分，鄭芝龍在歸順朝廷後，在泉州安平鎮大興土木，大有佔山為王的意圖；不僅如此，他還利用自己所擁有的艦隊與商船隊，在沒有通過市舶司，偷逃稅款的情況下，擅自與外商進行海貿。
要知道，在明朝時期，對外貿易是非常掙錢的。自從朝廷開放海禁以來，每年為朝廷帶來數百萬兩的白銀收入，史料記載，西班牙等西方殖民者從美洲等地掠奪來的白銀，幾乎都流入到了中國。
通過海外貿易，鄭芝龍可謂是富可敵國，但是鄭芝龍的這種行為卻極大的影響了朝廷的海關收入，所以朝廷內各大臣對鄭芝龍多有詬病。於是對如何封賞鄭芝龍大家就出現分歧了.
有些大臣說鄭芝龍是有大功，但是他的一些行為確實違反了國法，再說鄭芝龍的那支艦隊，不只有皇上，是只有「一官」。所以對於這樣的情況，朝廷是不是考慮將鄭芝龍調離福建，然後將瓦解鄭芝龍的艦隊，收為己用。
有的朝臣就反對這種意見，因為不管怎麼說，鄭芝龍都是這次台灣之戰的功臣，對於這種「鳥盡弓藏」的行為，是不是會寒了邊疆將士的心啊；還有，如果朝廷這麼辦的話，是否會刺激鄭芝龍，使他心生叛意。
兩種意見相持不下，但是總的來說，因為鄭芝龍的種種作為，朝臣們是不信任他的。現在分歧是現在動他，還是等朝廷準備充足之後在動他。大臣們眾說紛紜，根本形不成統一的意見。
最後韓獷、錢龍錫、劉鴻訓等閣員與吏部尚書成基命商議了一下，最後吏部尚書成基命說：有功不賞確實會寒了邊關將士的心，但是鄭芝龍的種種行為確實不妥。依臣看來，不如任命鄭芝龍為福建、廣東水師都督，並把署衙遷往廣東新安縣的香港。
成基命的這個方法還是比較好的，鄭芝龍的根據地不是在福建泉州安平鎮嗎，那好，朝廷將你遷移到廣東新安縣的香港，把你調離你的根據地，然後朝廷在慢慢的削平你的勢力，再說新安縣的香港也是一個良港，適於停泊大型船舶，你鄭芝龍也沒有理由拒絕朝廷的調令啊。
鄭芝龍的問題解決了，其他將領的封賞問題就好辦了。聶青雲被任命為台灣總兵，負責防守台灣、澎湖；傅有成被任命為浙江水師都督，至於台灣知府的人選，吏部挑選，然後報內閣討論。
既然事情已經定下了，內閣回到值班房後，立即起草聖旨。起草完畢後，送入乾清宮，加蓋玉璽後，由行人司火的送往福建。
台灣的事情解決之後，朝臣們又開始為新年慶典忙活了起來。朝廷雙喜臨門，台灣大捷，皇后有喜，朝廷理應大肆的慶賀一下。皇上的一些禮儀行動都要禮部來辦，所以新任的禮部上疏徐光啟最近很忙。
由於西北嚴重的旱災，致使流民激增，雖然朝廷想盡了辦法去賑災，可是收效甚微。而忙碌之中的徐光啟恰好知道，從西洋引進來的一些農作物有些是耐旱的品種，而且畝產還算可以，所以徐光啟就上了一道奏疏，請求普及一些西洋引進的一些農作物。
從明朝中期以來，外來的農作物就不斷的被引入到了中國，比如玉米、甘薯等。這些農作物在一定的範圍裡也被廣泛的種植，不過沒有普及，所以大家對這些農作物還不算太熟悉。於是內閣就找來徐光啟，問一問具體情況。
徐光啟對這些外來的農作物還算比較瞭解，就向內閣說明了這些農作物的特點。內閣一聽，心說徐光啟這個人說的應該是實話，既然有這麼優良的農作物，那是應該普及，不過為了穩妥起見，還是在一地試種之後，再說吧。
於是內閣與徐光啟寫了一個折子，請求皇上在熱河以及延安府、薊鎮試種一些西洋引進的農作物，堪坎效果如何，要是效果好的話，就在全國普及耕種。奏章很快就回了內閣。
皇上完全同意內閣的主張，要內閣斟酌處理。內閣接到皇上的批復後，又立即請來戶部與工部，來協商玉米等農作物的試種問題。戶部掌管全國的錢糧，工部掌管全國的工程，種田要有種子，還要派人去指導，當然興修水利工程也是必不可少的，所以必須要這兩個部門全力配合。
兩個部門看到有皇上的命令，他們當然不敢怠慢。不過說道要試種，那少不了種子，可是戶部沒有啊，於是戶部向內閣說戶部沒有這些農作物的種子啊。
內閣看看徐光啟，徐光啟說他知道哪有種子，不過可能不夠，不過既然已經解除海禁了，不如從西洋人那裡買些，至於種法，也可以向那些西洋人請教。內閣一聽，這也是一個辦法，那就這麼著吧。
於是戶部與工部與工部加緊準備，兩部都派出人手到熱河以及延安府、薊鎮，去辦理相關事宜，開種之前不得要先準備準備嗎，否則一開春，怎麼耕種啊。
當然，為了慶賀新年，達到普天同慶的目的，崇禎皇帝在向怎麼讓普通的民眾過的好一些，至少不能讓他們起來造反啊。崇禎想來想去，得，乾脆減稅吧。
不過國家正稅是不能再減了，否則就不足以支撐國家的正常的開支了。崇禎皇帝在即位之初雖然恢復了張居正的改革措施，但是張居正在施行改革的時候，雖然對國家賦稅做出了調整，但是不是很徹底。
而當崇禎在恢復張居正的賦稅制度的時候，恢復也是很不徹底。畢竟張居正改革的賦稅侵犯了地方上氏族大戶的利益，所以地方上的反抗不是一天兩天了。而崇禎重新實行的時候，因為國家財政的問題，所以對底下的一些小動作也是視而不見。
那這就造成了，雖然恢復了張居正的改革措施，但是民眾的負擔並沒有減少。崇禎現在能做的只是盡可能不在加重民眾的負擔而已。崇禎思來想去，乾脆，做個表率，停收崇禎四年以及五年的金花銀吧。
金花銀是在萬曆晚期新增的稅種，這個稅是皇家徵收的，收到的稅款後也不入國庫，而是進入皇帝的內帑，是皇帝個人的私人收入。崇禎心說，一步一步來吧，羅馬不是一天建成的，改革不能急躁，從上而下，循序漸進吧。