崇禎元年的一月中旬，內閣大臣們已經都到了北京，此前的內閣事務大都由孫承宗負責，這些新閣員的餓到來使內閣恢復了正常的運轉.
不過隨著新內閣的運做，那些閹黨殘餘是不會坐以待斃的，楊維垣眼見昔日的同黨一個個的落馬，他可是心急如焚，急忙找來御史袁宏勳商議。兩人密議許久，定下攻守同盟，決心除掉劉鴻訓，以穩定自己目前在朝堂的地位，保護自己利益。
誰料不等楊維垣難，劉鴻訓在有意無意間已經搶先下手了。原尚寶監司卿黃正賓上疏彈劾楊維垣與徐大化貪污，挪用公款，請求將兩人驅除出朝廷。
奏疏送到內閣時，正好錢龍錫當值。錢龍錫頭一回擬旨，不知底細，而且他本就宅心仁厚，不欲多生事端，便在黃正賓的奏疏上批示道：大化已落職，不必苛求，楊維垣反覆無常，著落職閒住！
等到崇禎皇帝接到這份奏章的時候，看到楊維垣和徐大化這兩個名字，隨即想到歷史上對他們的評價，閹黨人員，政治小丑，為了自己的利益什麼都能幹。於是批復道：楊維垣不許潛住京師，徐大化著回原籍去！
楊維垣接到聖旨時傻了眼，他不是沒有想到過自己可能回被罷官，卻沒想到回怎麼突然，而且是受到徐大化的連累，這有委屈也沒法說啊。
楊維垣畢竟見過大風大浪，他想了一會兒便有了注意，他當即乘轎子來到袁宏勳的府上，將情況一一告知袁宏勳，且密議良久。
話說袁宏勳，當他聽到這個消息自然吃驚不小，並且感到危險已迫在眉睫，送走楊維垣後他立即草擬奏章，攻擊劉鴻訓。
其實袁宏勳並不知道驅除楊維垣的正式皇上，而劉鴻訓根本就和這件事沒有什麼關係——當然，如果當日值班的是劉鴻訓的話，那麼黃正賓的奏章落在他手裡的話，他最有可能擬旨將楊維垣驅除出朝廷。
袁宏勳到底是做了幾年主管檢舉糾劾的御史，奏疏是這樣寫的：劉鴻訓一入黃扉（內閣），揚揚自得，旬日之間，革職閒住無虛日。猶可意者，楊所修，賈繼春，楊維垣夾攻表裡之奸，有功未賞，無罪被驅，閣臣所為，出人意表。劉鴻訓殘害忠良，以暴易暴，長此安窮！
這篇奏章寫得理不直而氣壯，若是不明事理的人讀了，說不準就會將同情心傾注在他這一邊。
緊接著，錦衣張僉事在楊維垣和袁宏勳的指使下也上疏攻擊劉鴻訓，說他在出使朝鮮時，授受賄賂.
兩份奏章先後呈上，劉鴻訓避嫌，韓獷，錢龍錫不敢自專，於是未經票擬，直接送到了崇禎皇帝的手裡。
崇禎皇帝看完奏章之後，輕蔑的一笑，轉而向侍立一旁的王承恩問道：承恩啊，最近有阮大誠的奏章嗎？
王承恩恭敬的回道：回萬歲，老奴最近沒有看到阮大誠的奏章。
崇禎皇帝滿意的一笑，心裡想：這個阮大誠還真是個聰明人，知道這裡水深，他乾脆就不參與這場打倒東林黨的運動。
第二天，皇上批復道：著袁宏勳落職侯勘！
內閣接到批復後，大為驚訝。誰都沒想到皇上會對內閣如此信任。劉鴻訓更是感激涕零，決心以自己的一腔熱血報答皇上的知遇之恩。
劉鴻訓到底是一個君子，看到袁宏勳受此重處，於心不忍，便上疏求情。不過給事中鄧英檢舉袁宏勳貪污白銀共計十五萬兩，並且賄賂楊維垣，才得到御史一職。其中人證及證言也一同呈上。
奏折呈給皇上後，龍顏大怒，下旨查抄楊維垣，袁宏勳府第，並將二人押入錦衣衛北鎮撫司。同時傳來消息，錦衣衛指揮使有吳孟明接任。這個吳孟明在錦衣衛中是一個比較正派的人物，並且政治上傾向東林，這一切都表明，皇上現在正倚重東林。而東林也正信心滿滿的餓要重振朝綱，重興大明盛世。
與此同時，朝堂上六部尚書也進行了大的調整，吏部尚書由王永光擔任，工部尚書由李長庚接任，刑部尚書是喬允升，禮部尚書由何如寵擔任，畢自嚴擔任戶部侍郎。經過了一番整治，魏忠賢時代的遺留問題已經消失殆盡，朝廷內外暗暗的增長著一股欣欣向榮的期許。
但是陝地連年旱災，民不聊生，加之官府橫徵暴斂，邊軍久不餉，在陝西時局已經不穩，隱隱有爆大規模農民起義的前兆。
崇禎皇帝接到錦衣衛指揮使吳孟明的奏報，大雷霆，將奏折往地上一甩，怒道：陝西的官員是幹什麼的？還有邊軍將領，是幹什麼吃的？陝地旱災連連，流民大起，他們為什麼不報？御史言官在幹嗎？都統統死絕了？！
御書房內一干內侍，宮女，錦衣衛指揮使吳孟明見皇上震怒，連連叩頭請罪，直呼萬歲息怒。
崇禎皇帝平息了一下情緒，向吳孟明道：吳指揮，招內閣六部大臣入宮晉見！
旨意傳下，御書房內一干人等都愣住了，尤其是吳孟明。錦衣衛指揮使吳孟明想：這錦衣衛什麼時候改行管這事了，我們一直是管偵緝的啊，我們這一去，還不知道要傳出什麼小道消息，那些大臣一看我們錦衣衛前去傳旨，還不知道他們要嚇成什麼樣子。不過皇上下旨，我們錦衣衛只能照辦。
想到此處，吳孟明領旨謝恩，立刻率領錦衣衛人馬，到各處朝廷大員家中傳達旨意去了。再一旁的曹化淳看到皇上氣得都這樣子了，便暗替陝西的官員惋惜，看來陝西的官員要被大清洗了。
話說那些內閣大臣，看到是皇上親軍，專管偵緝詔獄的錦衣衛前來傳旨，都驚訝不已，不知此次前去是福是禍，憂心不已。
內閣大臣急匆匆的趕到皇宮建極殿中左門平台，看到皇上已經在平台了，急忙叩頭謝罪。
崇禎皇帝臉色很是難看，錢龍錫，李標，劉鴻訓，王祚遠，韓獷，孫承宗看到皇上面色不善，也是提心吊膽，不知所措。
崇禎皇帝沉默了一會兒，輕輕的一擺手，曹化淳會意，將吳孟明的奏章交給現在已經是內閣輔的韓獷手中。
韓獷看了看奏章，大驚失色，道：這……這，皇上。錢龍錫，李標，劉鴻訓，王祚遠，孫承宗看到韓獷這個樣子，茫然的看著他。
崇禎皇帝說道：吳孟明，將事情講一講吧。
吳孟明說道：是陛下。諸位大人。皇上於前幾日特命錦衣衛秘密偵察三邊各地守備情況與民生吏治。從現在傳來的消息看，在陝西一地，連年旱災，民不聊生，各地官府對於災情隱瞞不報，致使各地民生凋敝，流民或三人，或五人為一群，聚而生亂，打家劫舍；邊軍久不餉，只好典當衣物，甚至出妻賣子，亦不能維持生計。
在平台的眾位大臣聽到吳孟明奏對。頓時驚出了一身冷汗，跟陝西有關係的幾位官員更是戰戰兢兢。
崇禎皇帝面無表情的說道：眾位愛卿，看看這些大明的地方官吏！
各位大臣趕緊叩頭謝罪。孫承宗出列道：皇上息怒，兵部監管不利，致使邊軍紀律敗壞，微臣有罪，請皇上責罰！
崇禎皇帝看著這為忠心耿耿的老臣，真是百感交集，在明末這個動盪的年代，正是有了象孫承宗這樣的傑出的人才，才使明王朝苟延殘喘的延續了十七年，如果不是歷史上的那個疑心重重的朱由檢爛殺無辜，也許明朝不會那麼快的滅亡。
崇禎皇帝溫言說道：孫愛卿，此事與你無關。皇帝又轉過頭，問道：戶部何在？
新任戶部尚書曹於汴說道：臣上任不久，不過距臣所知，戶部已經三，四年沒有撥過餉銀了。
此語一出，眾位大臣紛紛變色，一些官員暗怪曹於汴怎麼能將實話說出，這不是自找麻煩嗎。說不定還會連累自己。
崇禎皇帝奇怪的說道：怎麼會這麼長的時間沒餉銀？
「回皇上，皆因國庫空虛，加上重修三大殿，國庫已經入不敷出了！」
「那現在國庫還有多少銀兩？」
「回皇上，近期查抄了一些貪官污吏，國庫現有存銀一千一百五十二兩八錢。」
「好，曹愛卿，三十萬兩軍餉，另撥三百萬兩救濟陝西旱災。」
「臣，尊旨！」
崇禎皇帝向王永光說道：陝西巡撫，延隧巡撫欺君罔上，將其革職查辦。
吏部尚書王永光說道：尊旨！
崇禎皇帝又說道：各位愛卿，可有合適人選繼任陝西巡撫，延綏巡撫？
一陣沉默，誰也沒有回答皇上的問題。崇禎皇帝又向吳孟明問道：吳愛卿，你在陝西有沒有現恪盡職守的官員？
「回皇上，據微臣所知，陝西官員只有一部分官員欺君罔上，大部分的官員還是忠心耿耿的。」
「哦？前幾日愛卿不是說有一個叫洪承疇的官員，恪盡職守，愛民如子，是一個不可多得的好官嗎？」
吳孟明的汗頓時就出來了，心想：皇上啊，你不是玩我嗎？我什麼說這個話了！你叫我們錦衣衛要秘密的查探陝西的民情，也沒叫我們甄別官員的好壞啊？看來皇上對這個洪承疇很是看重啊，不過皇上什麼時候知道這個人的？是通過東廠，還是內行廠？
吳孟明心裡雖然這般計較，但還是裝做恍然大悟的表情，說道：臣愚頓，竟然將此人忘了，回皇上，此人不僅恪盡職守，愛民如子，還素知兵事，是一個不可多得的人才。
崇禎皇帝滿意的點點頭，這個吳孟明還不錯，是一個知心人啊。皇上又對王永光說道：王愛卿，那就任命洪承疇為陝西巡撫，另外將延綏巡撫職權併入陝西巡撫。命洪承疇統領陝西一切政務，軍務。