呂梁商幫幫主喬宇亮涉嫌向蒙古走私糧食，並突然暴病身亡、喬府被查抄的消息，在京師商界中引起了極大震動。首當其衝的就是呂梁商幫，幫主犯了掉腦袋的大罪，他們這些底下的商人自是驚惶不已。儘管官府沒有採取任何行動，但很多人已經無心做生意，有些心裡有鬼的更是關張收拾東西，準備盡快逃離京師。
其次就是其他幾大商幫。京師七大商幫中，徽州商幫與呂梁商幫實力最強，其他商幫則要稍遜一籌。如今呂梁商幫突然出事，市場一下子出現了空缺，按理說是這幾家搶佔市場份額的好機會。
可是這幾家商幫中，也有偷著走私糧食、鹽鐵的。雖然數量不如呂梁商幫那麼大，可查出來照樣是死罪。喬宇亮說完就完，誰不害怕？因此這些人只顧忙著銷毀罪證，根本無暇照顧生意。
結果五洲商社趁虛而入，接連在京師開辦銀號、茶店、布店等一系列產業。除了因為沒有鹽引而未涉足鹽業，可以說五洲商社的觸角已經伸向各行各業，業務流水也大幅增加，步入了良性循環。
而其他幾大商幫，陝西商幫本來就是「特務」，粵商、閩商等則巴不得出現新興勢力，將市場攪渾，動搖晉、徽兩家獨霸京師商界的局面。
真正受到衝擊的是徽商和浙商。但許友三老奸巨猾，總覺得呂梁商幫突然垮台與五洲商社的出現似乎有著某種聯繫，因而行事低調了很多，再也不敢打壓五洲商社了。
商業格局發生重大變化的同時，對走私案的調查也在緊鑼密鼓地進行。不過正如朱由檢所預料的那樣，雖然通過審訊，又逮捕了呂梁商幫內幾十名直接或間接參與走私的商人，但都是些小魚小蝦。錦衣衛一直懷疑京師有官員充當呂梁商幫的保護傘，甚至就是走私糧食的真正幕後主使，可在審訊中卻是一無所獲。看來如果真有這種無恥官員的話，他肯定是和喬宇亮單線聯繫，外人根本無法得知。
現在喬宇亮死了，他的家產也被毫不客氣地充公，包括他的一些家人和管家、家丁之類都被收監，但這條線索顯然是斷了。
而宣府那邊，同樣沒有什麼進展。郝永忠一去宣府城，宣大總督魏雲中和宣府巡撫盧睿就知道了走私案。二人均大為惶恐，上疏向皇帝請罪。但是二人均表示，對鄭明德串通商人走私一事毫不知情。宣府總兵王忠同樣表示不知道鄭明德暗中搗鬼。至於那些參與走私的邊軍，也問不出什麼來。
內閣對這件大案同樣很震驚。由於朱由檢令錦衣衛審理此案，閣臣們不清楚具體案情，便請求皇帝將案子轉給刑部。
朱由檢則是斷然拒絕，在沒有查出到底誰是涉案官員之前，他絕不肯把案件轉給刑部。說不定這個人就是刑部的，轉過去不是更方便他消滅罪證！
閣臣們對於這次被皇帝駁回倒沒有太堅持，一則此案涉及軍事，由同為軍隊系統的錦衣衛審理並無不當；二則內閣裡現在除了孫承宗、王在晉和袁可立這三位老臣以外，又多了一個皇帝的支持者，那就是周延儒。
這位老兄自從入閣之後，往日年輕氣盛的作風不改，但對像卻變了。凡是皇帝支持的事，他就堅決支持；凡是皇帝反對的事，他就堅決反對。只要東林系大臣和皇帝有不同意見，他非得和他們吵個天翻地覆不可。而且他是狀元出身，口才極佳，辯論起來引經據典、頭頭是道，即使是錢龍錫、李標這樣的飽學之士，也往往被他駁得啞口無言。
除了周延儒以外，內閣還有十六名中書舍人。他們雖然沒有票擬權，但在內閣商議朝政時，也可以發表自己的見解。像黃宗羲、顧炎武、王夫之等人，也都是皇帝的堅定支持者。因此內閣也在悄然發生著變化，不像以前那樣，幾乎事事都和皇帝對著幹了。
當然，這麼大的案件，如果內閣一點建議也沒有，也顯得閣臣太過窩囊。經過集體討論，閣臣再次奏請皇帝，將宣大總督、宣府巡撫和宣府總兵調往他處，另派官員接替他們的職務。
這次朱由檢欣然同意。一方面是給了內閣一次面子，另一方面，如果案件涉及到這三個頂級官員的話，將他們調走，無疑有利於案件的深入調查。就算他們與本案無關，但就看他們在獨石口一役中的表現，簡直麻木到了極點，宣府直接拱衛著京師，交給這種酒囊飯袋鎮守怎能放心！
對於接替人選，內閣提交了幾次名單，朱由檢都不大滿意。比如內閣建議讓洪承疇擔任宣大總督，雖然他資歷足夠，但朱由檢對洪承疇有一種天然的戒備之心，怎會讓他駐守邊關重地。
又比如內閣建議讓孫傳庭出任宣府巡撫。雖然孫傳庭是朱由檢非常信任的人，但陝西方面同樣非常重要，現在流賊盤踞於湖北西北部的山區中，隨時有可能重返陝西，潼關需要有孫傳庭這樣一位可靠之人鎮守，否則關中平原和西安就危險了。
最後，朱由檢不得不通過陳圓圓的京華時報，將自己中意的人選透露了出去。京華時報連續幾天，連篇累牘地報道兩位官員的事跡，自然也引起了朝臣的注意。
這兩人就是袁崇煥和盧象升。
袁崇煥曾任遼東巡撫，獨自對付後金，出任宣大總督當然有資格。自從邊軍退守山海關後，朱由檢把袁崇煥閒置了一陣，讓他好好反省擅殺毛文龍之事，袁崇煥也為自己的冒失而後怕不已。如今正在用人之際，袁崇煥雖然能力有限，但忠誠和嚴謹方面卻沒有問題。
至於盧象升，朱由檢早就想提拔自己這位義兄了。不過他現在只是正五品大名知府，驟然提到高位，恐怕引起物議，所以讓他先擔任宣府巡撫比較適宜。盧象升的「天雄軍」在明軍中顯然屬於戰鬥力很強的，宣府這麼重要的邊鎮，自然需要敢戰能戰的軍隊駐守。
而宣府總兵這個空缺，朱由檢希望李定國能回來補上。在他的籌劃中，宣府總兵不單單是抵禦外敵入侵，而且在不久的將來，還是反擊後金的第一支奇兵。遍觀明軍諸將，只有李定國能當此大任！
因此朱由檢不禁望眼欲穿，急盼著李定國和李來亨能早日平定西南，迅速班師！