就在林清華為吳三桂命運操心的時候，吳三桂卻正在開封周圍東躲西藏。自從他從民兵的伏擊圈中逃出來後，就一直在開封以南轉悠，因為附近的民兵武裝很多，對過往的行人盤查很嚴，凡是可疑的人全部抓起來送到西平寨。而吳三桂早已剃了頭，腦袋後面的那根辮子使他難以偽裝，所以他不得不到處躲避追捕。這樣逃了幾天之後，他隨身帶的乾糧已全部吃完，眼看就要挨餓，萬般無奈之下，他只得鋌而走險，趁著天黑，到一個村子裡搶東西吃，不料被村民所養的狗現，行蹤暴露，逃跑時所騎的戰馬也被火槍打傷，沒走多遠戰馬便死了。
吳三桂只好躲藏在一個樹林裡，靠著馬肉熬了十天，但沒多久民兵的搜索力度明顯加大了，因為林清華已懸下重賞，凡是找到吳三桂的屍體或是抓住吳三桂的人，重賞白銀五百兩。
吳三桂被逼無奈，只好從藏身處逃走，在跋涉了三天之後，終於抵達開封附近。此時的吳三桂已餓了整整三天，身上的所有東西也全部丟掉。由於他的腦袋後面還拖著辮子，行動十分不便，他為了順利逃到北京，只好用隨身小刀將辮子割掉，並把頭剃光，想化裝成和尚。為了弄到僧袍，他只得在附近到處尋找，終於找到了一座寺院。
這座寺院名為「普濟寺」，本是開封城南的一座較大的寺院，鼎盛時期寺中有僧人三百多人，而現在由於多年的戰亂和饑荒，寺中只剩下了十五個老眼昏花的老和尚，所以吳三桂就很容易的趁著夜黑溜了進去。
進寺以後，吳三桂東找西找，好不容易才在一個禪房裡偷了件破僧袍，接著他又溜到廚房裡啃了兩個素面饅頭，喝了兩碗冷水，然後在柴草堆裡扒開個窩睡了進去。睡到後半夜時，吳三桂忽然被屋子外的腳步聲驚醒，他條件反射般跳起來就跑。
寺院很大，吳三桂跑了幾圈就跑迷糊了，他怎麼也找不到進來時的那個狗洞了，不知不覺他跑進了寺院的後院。這裡是和尚們的菜地，種著不少蔬菜，院子的西北角就是茅房，茅房緊鄰著寺院的圍牆，而緊靠著茅房有一棵老樹，順著老樹就可以爬到茅房上，再從茅房頂上爬到圍牆上。吳三桂看得真切，所以他立即將僧袍的下擺繫住，跑到茅房下開始爬樹。雖然吳三桂年紀不小了，但多年的軍旅生涯使他的身手仍很敏捷，所以他很快就爬到了樹枝上。正當吳三桂站在樹枝上想繼續爬到茅房上時，忽然「啪」的一聲，他硬是將樹枝壓斷了。情急之下，吳三桂拚命想抓住茅房頂上的稻草，但那用繩子綁住的稻草房頂怎能經得住他的體重？只聽「撲通」一聲，吳三桂兩隻手中各抓著一束稻草跌進了茅房腳下的糞坑之中。這糞坑是僧人們用來堆肥的，裡面積滿了大糞和水，而且坑很深，足有一丈。吳三桂跌進去後立即喝了幾口糞水，嗆得他眼冒金星，他拚命想爬上去，但坑壁四周都很光滑，根本用不上力。掙扎了一陣後，吳三桂筋疲力盡，終於淹死在糞坑之中，一代梟雄，歷史上最大的漢奸就此殞命。
正當吳三桂在糞坑中掙扎的時候，林清華也沒閒著，他正在冥思苦想，俯在桌子上認真畫著一幅草圖。開封會戰結束後，林清華被鎮虜軍的巨大傷亡所震撼，他感到自己曾引以為傲的全火器部隊已經不可能獨領風騷了，雖然清軍仍是火繩槍為主，但仍給鎮虜軍造成重大傷亡，而他也親眼看到，在黃得功的部隊中也出現了數支和左夢庚一樣的裝備著燧槍的全火器部隊，而且據潛伏在武昌的細作報告，左夢庚繼續從南京購買燧槍，試圖也把自己的部隊變成像鎮虜軍一樣的全火器部隊。
在這些事情的刺激下，林清華決定改進鎮虜軍的武器裝備，用更好、更先進的武器武裝鎮虜軍。林清華打算研製一種後裝線膛槍，用這種槍逐步替換前裝槍。
要想製造後裝線膛槍，就離不開沖壓機和車床，而這兩種機械必須要有動力來驅動，在目前的生產條件下，最好的動力恐怕就是水力了。
林清華在上學的時候就對機械很感興趣，所以設計簡單的沖壓機和車床並不太困難。他設計的沖壓機結構很簡單，就是一個沖台加一個沖錘，在沖台的四個角上各有一根定位槽，均長一丈，它將用來限制沖錘的運動路線。沖錘是一個五百斤重的鐵塊，頂上有一個鐵環，上面拴一根鐵鏈，鐵鏈穿過一組滑輪組，連接在由水車帶動的一個絞車上。當水車轉動時，帶動絞車旋轉，絞車拉動鐵鏈，進而將沖錘緩緩提起，當沖錘到達定位槽的頂端時，絞車在工人的控制下與水車脫離，這時鐵鏈就鬆了，而沖錘則在重力的作用下快下落，擊打沖台。
沖壓機主要是用來加工槍管的膛線的，這種加工膛線的方法是林清華根據抗戰時期根據地兵工廠的土方法改進的。這種方法較簡單，先製造一個棗核形的硬度極高的鋼模，在鋼模的四周欲先刻上幾根凸起來的斜線，然後將此鋼模放入槍管毛坯，在其上插一根很硬的鋼條，直徑小於槍管，接著便將其放在沖壓機上進行沖壓，直到將鋼模從槍管的另一頭打出來，這樣，一根線膛槍管就算是初步做好了。
除了用來加工膛線以外，沖壓機還能用來加工金屬彈殼。不過，至於到底能不能用這種粗糙的沖壓機造出彈殼來，林清華心裡也沒有底，畢竟沒有實驗過，他讓工匠們先製作了一台人力沖壓機，在這台機器上進行實驗。實驗的結果是令人鼓舞的，雖然沒有衝出完整的彈殼，但衝出了許多比較規整的銅盅，這些銅盅長度約為三分之一寸，而且厚薄均勻。林清華決定改進這種彈殼，比照獵槍子彈製造一種前部為紙筒，後部為銅盅的混合型子彈。
車床的製造就比較困難了，雖然林清華努力回憶，並畫了詳細的圖紙，但工匠們還是琢磨了十幾天，最後終於做出一台簡陋的車床，由於沒有適合的刀具，所以這種車床的效率很低，而且廢品率也比較高，但林清華還是很滿意的，畢竟這個時代的技術只能做到這樣了。
槍和子彈的問題解決了，剩下的就是火藥了。現在各國所用的都是黑色火藥，這種火藥的威力較小，而且點燃後的煙霧很大，更為嚴重的問題是它燃燒後的殘留物較多，若是用在前裝槍上問題不大，但若是用在後裝槍上就不行了，每射几子彈後，槍管中就會留下許多污垢，若不及時清理的話，很容易生炸膛事故，危及射手安全。
解決這個問題最好的辦法就是製造無煙火藥。無煙火藥通稱硝化棉，是用棉花或其它植物纖維放入硝酸中進行硝化而成的，這種硝化棉俗稱強棉，燃燒度快，並不適用於線膛槍，線膛槍所用的火藥為弱棉，是在強棉中加入鈍化劑後製成的，它的燃燒度比較慢，能保證火藥燃燒完全，子彈的射程也就遠了。
要想制無煙火藥，就必須先制硝酸，而硝酸的製造又離不開硫酸，所以林清華讓工匠們動手製造了幾個陶罐反應器，用接觸法製造硫酸，接著用製出的硫酸與硝石反應，從而得到硝酸。
有了硝酸，製造無煙火藥就不是難事了，而且子彈上的底火所用的雷酸汞也可以製造了，更為重要的是，以硝酸和甘油為原料的硝酸甘油也能製造出來，再用吸附力強的多孔物質將其吸收，那麼爆炸力強、安全性高的軍用高爆炸藥就能裝備軍隊了。
為了保持自己在這種先進武器上的壟斷性，林清華決定用一種特殊的方式來生產硝酸、硫酸和雷酸汞。他準備修建一個大型的全封閉式的工廠，工廠的四周被三丈高、一丈寬的圍牆圍起來，然後他準備向朝廷上道奏章，以修建防禦工事為借口，向朝廷索要數百名被判了斬監候和絞監候的死囚，把這些死囚關進這座工廠，讓他們來生產雷酸汞等物。為了保證生產質量，這些人將被分成三十個組，每一批生產出的東西都要嚴格驗收，若是質量不合格，那麼整個組的人都要受到懲罰。這些人除了不能出工廠以外，其它的待遇都很好，每人一間單獨的小屋，每天有酒有肉，而且若是其本人提出申請，那麼可以允許他的家屬前來與其一起生活，不過進來以後就再也不能出去了。
為了保衛這座工廠和看住這些死囚，林清華決定把他的衛隊擴充到一個旅，稱為「近衛旅」，由其負責工廠的安全。這支部隊將長期守衛工廠，並將不定時的進入工廠進行檢查，以防其中的死囚造反。
這些只是林清華的初步構想，要想將其實現，還需要時間。先要做的就是選一處山溪較多而交通便利的地方，把生產線膛槍的工廠建起來，經過派人勘察，林清華決定在豫鄂交界的桐柏山中建造槍廠，在鎮虜軍三千人掃蕩了那裡的土匪後，槍廠就動工興建了，與其同時動工興建的是位於桐柏山腳下的火藥廠。
在這些工廠興建的同時，林清華將鎮虜軍重新進行了整編，將原來的白旺的人馬和其他的一些軍隊併入鎮虜軍，並從民兵中又招募了一些人，從而將鎮虜軍擴充到了十五個師。隨後林清華對這支部隊進行了強化訓練，特別是各級軍官，由於很多軍官是從士兵提拔上來的，所以素質不高，必須通過軍校對其進行嚴格的培訓。
經過兩個月的努力，軍隊的士氣又恢復了，而且槍廠和火藥廠也已基本完工，可以進行生產了。正當林清華躊躇滿志的要把鎮虜軍變成一支真正的現代化軍隊的時候，一個從西安傳來的消息又讓林清華感到不安了。
原來，自從中原大會戰結束以後，山西、河南、山東已全部重新歸明朝所有，而滿清所能控制的地區僅局限於直隸、陝西、蒙古，由於阿濟格所率領的陝西清軍精銳盡失，陝西的兵力空虛，加上多爾袞準備調集兵力固守直隸一帶，所以他下令駐紮陝西的清軍大部繞道蒙古撤到直隸，而留在陝西的清軍不過只有近一萬人的漢軍部隊。正因為這樣，佔領著四川的張獻忠準備派兵從川北進入陝西，佔領關中地區。
另外一個讓林清華感到意外的消息是，在陝西南部的終南山一帶活動著一支忠明武裝，他們約有三萬人，領是明朝副都統孫守法，他們先是抵抗李自成的大順軍，後來又與清軍作戰，現在孫守法趁清軍兵力空虛之機，派副將賀珍與另一名忠明武裝領武大定合兵三萬人，攻打西安。由於消息閉塞，所以無論是朝廷還是林清華，以前都沒有注意到這支武裝。
現在讓林清華為難的是，到底是應該先休整一段時間呢，還是先帶兵前往陝西，將清軍徹底趕出陝西，並阻止張獻忠對陝西的進攻呢？林清華左右為難，始終拿不定主意。