雖然鄭芝龍一再的擊敗劉香，但是始終不能殲滅劉香；而劉香也是一個聰明人，他知道，想要在正面擊敗鄭芝龍實在是太困難了，於是乎劉香就轉換戰術，不再與鄭芝龍正面交鋒，轉而攻擊大明沿海各地。
劉香戰術的轉變給鄭芝龍帶來了極大的麻煩，而鄭芝龍現在實在是沒有功夫搭理這個四處煽風點火的劉香，作為縱橫海上數十年，和無數洋人打過交道一代海梟，鄭芝龍十分清楚西班牙的海上實力，所以鄭芝龍將絕大部分的精力都集中在擴充實力，整訓士卒上面了，而鄭芝龍的這種做法，實際上也在一定程度上縱容了劉香的這種行為。
鄭芝龍整軍備戰，劉香肆虐呂宋、閩、粵、台等大明沿海各地，這下之靠著海上貿易營生的各大商幫、江南世家可就坐不住了。原先商船出海，只要付清出關的關稅，然後在給鄭芝龍這個「地頭蛇」一筆「保安費」，在南中國海這個地方就可以安安全全的做生意。
但是原本被鄭芝龍打得奄奄一息的劉香突然回魂了，不僅僅騷擾沿海各地，而且還要劫掠商船，強收「保護費」，要是收取的「保護費」要是能低廉一點的話，那這些商幫、江南世家也就認了，但是劉香太黑了，收費收的太狠了，實在是讓這些人忍受不了了，但是要是不交的話，那就是船毀、貨沒、人死。
於是乎這些商幫、江南世家先是找鄭芝龍，說鄭將軍，我們都是交了「保護費」的，不過眼下海路可不是很順暢啊，你得出面管一管啊，要不然咱們的關係，那可就要在重新商量一下了啊。
鄭芝龍也明白，這些人是不太好往死裡得罪的，所以鄭芝龍非常大度的接待了這些商幫、江南世家的代表，對於這些代表提出的質詢，鄭芝龍也難得的回答這些代表的質詢，鄭芝龍表示，因為西班牙人的報復行動在即，所以水師正在集訓，準備與西班牙人決一死戰，只要打垮了西班牙人，往後在南中國海就咱們說了算了，就是衝出南海也不是問題的。
至於說劉香，那只是小問題，只要我大軍一致，保管劉香那一夥人「飛灰湮滅」，連一點渣都不待剩下的。所以諸位不必擔心，只要等鄭某人消滅了西班牙人，就會讓劉香永遠的消失，只你們交足了「保護費」，鄭某人一定擔保諸位的安全。
這些代表都明白了鄭芝龍的意思，鄭芝龍明白的告訴了他們，眼下我鄭芝龍沒有功夫去搭理劉香，等我有空的時候再說，至於「保護費」，你們也得按規矩交，不然的話，不等劉香去搶你們，老子就去搶你們。所以看著辦啊。
不過鄭芝龍也說，雖然眼下我沒有辦法，但是你們可以其找關係，請求朝廷在派遣一支水師南下，去與劉香拚命。這些代表也是沒有辦法，只能回去覆命。商幫、江南世家聽到鄭芝龍這樣的回復，一個個氣的牙根都癢癢。
但是沒有什麼好對策，誰叫人家鄭芝龍在南中國海上勢力龐大呢。雖然商幫、江南世家忍了下來，也按照鄭芝龍說的，開始找關係，遊說朝廷在派遣一支水師來清剿劉香。但是商幫、江南世家對鄭芝龍卻開始越的不滿了，並開始制定對付鄭芝龍的計劃。
朝廷裡的大員正在忙著應付蒙古人擾邊行動，根本就沒有什麼精力來處理該死的劉香騷擾沿海，致使海上貿易不順的問題。市舶司接連的上疏根本就沒有濺起絲毫的浪花。
隨著時間的推移，商幫、江南世家的損失是越來越大，這下子他們實在是坐不住了，只能開始動用各種的關係，並不惜本錢的開始疏通關係，終於是引起了朝廷的重視，可是正當朝廷開始重視海上的問題的時候，西北的一份加緊奏章又送到朝廷裡面。
自從洪承疇被任命為陝甘總督後，開始全力的清剿西北的農民起義，再加上朝廷說不上十分得力，但是卻有一定作用的賑災行動下，西北的形式還是有一些很大的改變的，一些較大規模的農民起義很快的備鎮壓了下去。
不過朝廷雖然有賑災行為，不過由於因為官員**等一系列的問題，賑災的力度並不十分的大，但這無疑給了西北民眾一個活下去的希望，只要有了希望，那大部分的西北民眾就不願意再去參加叛亂的行動。
但是因為有些官員為了政績和自己腰包，不顧民眾死活，加緊催逼錢糧，致使部分西北民眾為了生存而參加農民起義軍。再加上由於遼東後金努爾哈赤的叛亂，自從明萬曆四十六年起，朝廷開始調集包括西北在內的各鎮開赴遼東平叛。但是因為朝廷**，將領要麼懦弱無能、要麼互相傾軋，致使明軍兵敗失地。
而開赴遼東的西北士卒，有的僥倖逃過一劫，歷經重重險阻，好不容易回到西北，但是他們的長官卻因為種種原因，不允許他們歸伍。而他們或者流落各地，或者為了活命而參加農民軍。這樣，就為農民起義軍提供了雖不充足，但是卻必不可缺的兵員，這就是為什麼農民軍屢剿不滅的原因。
但是那些農民軍的領袖也不是什麼笨人，相應的，他們很聰明。他們看到那些大股的義軍備朝廷剿滅以後，他們之中開始分化了，一些人動搖了，他們與朝廷暗通款曲，並且投降了明軍，接受了朝廷的官職；而有的繼續堅持反抗活動，決不妥協。
但是問題正是出在這些投降了的，接受朝廷官職的起義軍。他們中的一部分並不甘心這樣「平庸」的活著，他們想念的是打家劫舍，洗掠縣城的生活。於是他們在暗中串聯勾結，準備在適當的時機再度舉起叛旗。
本來持這種看法的致使一些原起義軍的頭目，大多數的士卒並不願意再過刀劍舔血的生活。不過正是由於明軍的一些陳規陋習再度將他們，還有一些沒有參加過起義軍，但是卻十分不滿上官作為的一些低級軍官和士卒推到了這些陰謀叛亂的人的那邊。
崇禎五年末，陝甘總督府內，陝甘總督正眉頭緊皺的聽著下屬的匯報，匯報事情的是駐紮在陝甘的明軍賀人龍部一營原起義軍投降過來的人馬決定再度舉起叛旗，而匯報此事的就是賀人龍的副手，陳彬。
究其原因，不外乎就是軍中各級將領剋扣軍餉，而賀人龍也不例外，因為朝廷財政困難，軍餉本就不能按時放，再加上各級將領的剋扣，致使軍中怨聲載道，賀人龍部也是如此，於是一些起義軍頭目利用軍中的不滿情緒，準備起事。
但消息並沒有進行嚴密的封鎖，於是一些看不慣上官，但是卻忠於朝廷的低級軍官也得到了消息，於是他們就將消息通知了陳彬。
而陳彬也是一個有野心的人，他知道。如果上告賀人龍，那自己可能就會得不到什麼好處，於是他並沒有通知他的上官賀人龍，而是越級到總督府，請求面見總督洪承疇。而洪承疇也明白陳彬的意思，所以洪承疇不僅勉勵了陳彬一番，也許諾會對陳彬加官進爵。
洪承疇聽到消息後，也是不敢怠慢，如果要是讓那些叛賊將一個營給拖走，那後果可就嚴重了，於是洪承疇趕緊集合自己直接所掌握的軍隊，快馬加鞭的趕到賀人龍所部的駐地。
而賀人龍得知總督大人突然駕臨，也是非常的吃驚，於是賀人龍趕緊來到中軍帳拜見總督洪承疇。賀人龍看到總督洪承疇面色很不好看，心裡非常的忐忑，他不知道自己的什麼小辮子被洪承疇給抓了。
洪承疇心裡是一肚子的火，見到賀人龍以後，屏退左右後，對這賀人龍就是一通的訓斥，洪承疇罵完賀人龍後，就問他，你是如何安置那些投降的農民軍的，你現在有多少能徹底掌握的部隊。
賀人龍聽到這番話，就覺得有些不妙了，就說：我手下的部隊都能掌握住啊。
洪承疇聽完後，大罵道：混蛋，還都能掌握，你知不知道，你手下的一個營的士卒都要集體反叛了！！！