攻佔淮南新城後，因為當地的各項基礎建設更加完善，所以原處前塘村和興集縣城的各種行政機構、商業機構、軍事工業部門等全都將按計劃遷移到淮南；工程實在可謂浩大，規劃起來千頭萬緒，行動起來更是勞心勞力。
楊明突然現世界上居然還有比打仗更加麻煩的事！
一開始，他還事無鉅細樣樣過問，結果後來今天這個找他簽字、明天那個要他核准，再加上劉文軒時不時還來找他的「麻煩」，提的要求更是五花八門；到最後，他實在煩到不行，乾脆兩手一攤，把事情一股腦推給了衛建國、龐世輝等人，自己則往軍營裡一躲，專心處理軍務去了。
「看來這民政官司還真是夠嗆！那些民事官兒也不好當啊！」楊明坐在張斌的辦公室裡，心有餘悸地對幸災樂禍的幾個部下感慨道。
然而，部隊的整編工作同樣任務繁重。
在送走了沈家祥的裝甲團和邱新佳的防空團後，皖北楊明部抵抗軍被整編為三個師，共六個旅的部隊。原一團、二團、三團、四團正式擴編為第二師三旅、四旅和第四師七旅、八旅；此外，約偽軍23師投誠起義的第六師十一旅、十二旅。
全部三個主力師被稱為華東第二軍，又稱皖省第二軍，由楊明任軍長；而蘇省的趙長海部三個師則為華東第一軍，由趙長海任軍長。
兩軍合稱華東野戰軍，趙長海任總司令，楊明任副總司令。
編製人員問題相對好解決，可各部師旅長人選和轄區分配等問題可著實讓楊明費了一番腦筋；不要說新投誠的幾位高級軍官，就是原來的四位旅長互相間也是大不服氣：三旅長張斌一直自詡為楊部嫡系，常常不把其他同僚放在眼裡，為此也沒少得罪人；七旅長羅璟全和八旅長彭世偉因為都是半路加入，又同是礦場難友，互相間倒還和諧，只是與張斌頗為不和；而四旅長方傑又是個出了名的冷人兒，和誰都走不到一起，倒是特立獨行的很，連帶著他的部隊也很難讓人親近，與其他兄弟部隊彼此走動也不勤；而最近方傑又因為私事失了蹤，把個副旅長張雲恩累得實在夠嗆，好在幾天後，方傑又回到了部隊，這才讓楊明和四旅上下齊齊鬆了口氣。
此外，還有第六師的人選問題，十一旅和十二旅旅長仍由杜一凡和王金魁擔任，只是師長人選臨時出了岔子：按照原來的說法，只要閻勝彪率部起義，就繼續讓他擔任新編師的師長；可事到臨頭，閻師長居然拒絕了這個任命，並且委婉地表達了只想好好留在家裡，和兒子多一些時間相處的想法。
這樣一來，六師師長的人選又空閒出來，如果臨時調派一名軍官去貿然接手，恐怕只會引起原23師官兵的不滿，而且工作也不好展開。
為了調和各部主官的矛盾，將部隊的力量揮到最佳水平，楊明只得暫時採用一個折中的辦法：第二師師長為張斌、副師長方傑，下轄第三、第四旅，兩人同時兼任旅長；第四師師長為羅璟全、副師長彭世偉，下轄第七、第八旅，同樣兼任旅長；第六師師長杜一凡、副師長王金魁，下轄第十一、第十二旅，一樣各自兼任旅長。
在解決了編製和人員安排問題後，根據第二軍下一步的作戰構想，各旅又重新安排了各自的轄區：三旅張斌部繼續向北，爭取將整個皖北北部地區囊括，將防線推至皖蘇交界地區，從而減輕第一軍在蘇省的壓力，並配合他們行動。
四旅方傑部單獨南下，準備渡過江泛區進入皖南地區，從而在南線開闢一個新的戰場，另一方面也為皖北新政權提供一個南面的緩衝地帶；而一向習慣於獨來獨往的四旅是最適合這項行動的部隊。
七旅羅璟全部向西北挺進，目標是距離豫省最近的毫州地區，並適時對豫省境內實行戰術偵察，並配合軍情局向豫省境內滲透。
八旅彭世偉部向西南進軍，主要任務是進入大別山地區，對來自鄂省方向的敵軍進行警戒和防禦；由於鄂省的襄陽是中國地區「聯邦政府」的府，因而那個方向的敵軍兵力和戒備程度也是最高的，所以八旅將在很長時間內作為第二軍的戰略防禦性力量而使用。
十一旅杜一凡部隨同七旅向西進軍，目標是攻佔皖西的阜陽地區；然後就地駐紮展；向西警戒豫省可能的東犯，向北向南可以支援七旅、八旅的戰鬥，向東又可以迅回援淮南，是作為一支機動力量而使用。
十二旅王金魁部先期隨同四旅南下，在佔領滁州地區後，將暫時留守皖東，一來可以維持與東部蘇省境內第一軍的通道和聯繫，也可以隨時入蘇增援；二來，也可以作為皖北政權東南方向防禦蘇省敵軍西犯的主要力量，並隨時準備南下，進入江泛區以南的皖南地區，協同四旅共同作戰。
這樣，師一級的構架只為臨時編製性質，只在部隊作戰序列上體現，實際各旅各有防區，既可以放手讓他們各自展，也免得因個人的意氣之爭而互相影響。
在三個主力師之餘，第二軍還編製了一些軍直屬部隊，包括：一個重炮團，團長錢豪；一個工兵團，團長穆文康；一個新編裝甲營，營長耿飆；一個新編防空營，營長薛華；一個特種偵察營，營長潘國強；一個警衛營，營長肖大兵；一個重裝突擊聯隊，聯隊長關大虎；還有一些醫療、通信、後勤等單位。
軍直屬部隊將全部駐紮在淮南新城地區，作為全軍的戰略總預備隊。
待整編完成後，第二軍的總兵力將達到近五萬人的規模；而且在裝備方面也得到了極大地改善：雖然失去了技術含量最高的裝甲團和防空團，但新編成的裝甲營和防空營依然不失為兩支勁旅，雖然裝備略顯陳舊了一些。
比如坦克，全營三十多輛坦克，大多是是老式的t59型，少量為t62輕型坦克和t63水6兩棲坦克，而新繳獲的t96和t99則全都裝備給了沈家祥的裝甲團；車雖然老了些，但因保養得當，還是非常實用的。
再有如防空營的裝備，一個營三個連，有兩個是57毫米和37毫米高炮連，只有一個連裝備了導彈，也只有兩套射車，一套是hq12、另一套是hq7，此外還有一些肩扛式的單兵防空導彈作為補充。
第二軍的秘密武器——「武士ii」，也增加到一個聯隊共三個大隊，一百一十四台機甲的數量，他們是第二軍中絕對的王牌！
特別值得一提的是，攻佔淮南後，抵抗軍在城南一處小型機場內現了一架直升機和兩架輕型戰鬥機；此後，在進軍皖省全境的過程中，各支部隊又在各地6續現了不少完好或損壞的飛機，計有：z-9、z-11輕型直升機各一架，z-15民用型直升機一架，z-17中型直升機兩架，z-18大型直升機一架，z-1o、z-19武裝直升機各一架，共八架直升機；固定翼飛機方面有ft-5兩架，ft-6、ft-7各一架，f-7輕型戰鬥機六架，f-8重型戰鬥機一架，f-1oa中型戰鬥機兩架，f-11b重型戰鬥機一架，a-5輕型攻擊機兩架，f/b-7a戰鬥轟炸機兩架，c-8、c-9中型運輸機各一架，共二十架飛機。
此外，還有不少已經嚴重損壞無法再飛的飛機，只能作為等待被拆的零配件供應者而存在了。不過，在這其中有一架缺失一個動機的b-6k大型轟炸機十分可惜，劉文軒看過後也捨不得拆，在做了一定程度的保護後進行了封存，以備日後有機會修復後再使用。
因為這些飛機，楊明特意開始組建一支小規模的航空兵部隊，並在所控制區域的所有範圍內徵召有飛行經驗的人，甚至通過軍情局和商隊的關係從外地招募。
至正月底，華東野戰軍空軍第一混成聯隊正式成立，所有二十八架飛機和三十餘名飛行員全部到位，楊明兼任總司令和教官之職。
另外，對於閻勝彪的問題，楊明也另行作了安排。
人家雖然說想要留在家裡和兒子好好相處，可也不能真把他晾在一邊吧！
既然當初作出了承諾，就該給人家一個說法。不然，難保不會冷了投誠官兵的心，也免得將來再落人話柄！
隨著地盤的擴大，原來作為社會安定力量的民防隊的職能和權限已經大大越了預想，原來的編制和成員結構也不再合適；為此，新成立的皖北政府取消了民防隊的編制，並增加了警察總局這一部門；作為政府主席的楊明親自上門，盛情邀請閻師長擔任總局的局長。
這一次，閻勝彪略微客套一番後，也就欣然同意了，並與三天後正式上任，開始擔任了皖北警察總局任局長一職。
至此，皖北政府的強力部門由原來的軍情局獨腳戲，變成了軍情局、警察總局的雙簧：軍情局負責對外，主要業務為軍事情報刺探與反刺探，以及要員安全保衛任務等工作；警察總局則負責對內，更多涉及社會安定和秩序維護等問題。
隨著皖北地區的光復，社會開始逐步安定，經濟力量也逐漸恢復，皖北商業聯盟組建了許多商隊分頭向鄰近各省各地區進，而軍情局也趁勢隨同各支商隊將「種子」撒向了各地……
就這樣，跟隨著各路部隊和商隊的腳步，軍情局的觸角也開始伸向各個角落，並逐漸滲透到鄰省乃至更偏遠地區的境內。
正月十六，元宵節之後第一天，各旅紛紛開拔，各自返回駐地後整訓集結，並相繼對各自目標區域開始進軍。
在「聯邦軍」整編23師大部起義，且駐紮在皖省的一整個聯隊的機械軍被殲滅後，整個皖省的主要防禦力量被完全抽空。第二軍各旅進展神、勢如破竹，所到之處，各地的保安團、維持隊等地方武裝無不望風而降。
至三月下旬，第二軍先後攻佔宿州、淮北、阜陽、六安、滁州、毫州等地區；四月七日，八旅挺進大別山地區，其前鋒甚至進入鄂省的英山地區；四月十五日，四旅全部渡過江泛區，正式進入皖南地區。
至此，皖省已基本全境光復。
與此同時，皖北政府更名為皖省政府，仍以楊明任主席，主管軍政全部要務。
其餘政府要員包括：衛建國，任副主席，兼管農業；劉文軒主管工業，包括全部軍用民用工業部門；龐世輝主管商業，包括商隊的對外工作和與軍情局的合作事宜；李小萬主管教育，並負責各級學校的重建工作；唐薇主管醫療衛生，開始對各地的醫院診所進行重新規劃和建設；而一名叫金昌鑫的中年人，被任命為新的金融部門負責人，此人原來是美國華爾街的海歸，擅長玩的就是各類金融理念和工具，其主要工作職責就是將皖省的金融系統重新建立起來，並將皖省的金融模式和金融產品，包括貨幣在內推銷到鄰近各省，甚至更遠的地區。
再加上皖省最高法院法官6一暉，最高監察院院長康小軍和警察總局局長閻勝彪，整個皖省新政府的行政、司法體系已基本完備。
此外，楊明還特意成立了一個全新的科研機構——皖省科學技術院，用以招攬流落在各地的科學技術人才；並且他還特地邀請了傷癒恢復的周逸夫教授出任院長，並請原來獨立團的軍醫——孫文浩醫生擔任副院長，劉文軒任顧問。
而原來的前塘村村民委員會，如今也以擴大為皖省國民委員會，並作為皖省的最高權力機構和立法機構，正副委員長由原獨立團另一位軍醫——蔣先坤醫生和肖大兵的父親肖剛老師擔任。
至此，皖省民事體系全部組建完畢。
自五月二十六日始，皖省新軍政中心正式於淮南新城開始運作！