柏楊初抵台灣不久，就在1950年因為收聽匪區廣播而被判刑六月。出獄後，歷任教師等職。
1953年，與齊永培結婚，育有二子（郭本城、郭本垣）。1950年代成為中國文藝協會會員。
1954年在救國團任職；而柏楊於救國團任職後才開始寫作小說，而且小說都有相當的現實xing與批判xing。1959年與齊永培仳離，與倪明華結婚，育有一女佳佳（郭本明）。
1960年5月起，以筆名柏楊在《自立晚報》擔任《倚夢閒話》專欄作家，寫作的雜文對於現況有很嚴厲的批判。
1961年開始，在《自立晚報》以鄧克保為筆名所發表的《異域》，以報導手法，描述一支中華民國的忠貞軍隊，奉令撤退到滇緬泰邊區，與命運搏鬥、冀求反攻大陸的事跡。
儘管故事中以虛構人物為主體，但主人翁們悲壯滄桑的血淚史觸動人心，且於泰國北境確實有中華民**人和子弟們苦澀求活，因此讀者們便以泰北孤軍稱此部隊。
《異域》後來不但被拍成電影，還創下在台灣銷售達百萬冊的驚人數字，是一部成功的戰爭小說。
1967年，柏楊代班主編《中華日報》家庭版時，該版以每週五天的篇幅刊載美國連環漫畫《大力水手》。
1968年1月，柏楊因《大力水手》翻譯文中提及大力水手卜派父子流落至一個豐饒的小島而樂不思蜀，兩人要各自競選總統，撰寫競選文宣，柏楊將fellows（夥伴們）翻譯為全**民同胞們，遭國民zheng府情治單位理解為對蔣中正父子的暗諷。以**間諜及打擊國家領導中心的罪名逮捕，判處十二年有期徒刑，1969年起囚於台北縣景美鎮軍法監獄。
不過根據台灣作家、時事評論家李敖的說法，《大力水手》是由一位女性僑生翻譯，柏楊只是照抄才出事情。
1969年倪明華提出離婚要求，結束十年的婚姻，柏楊在獄中絕食二十一天。
1972年跟台北其他政治犯一同解送到國防部綠島感訓監獄。1975年，因蔣中正逝世，而減刑三分之一為八年有期徒刑。
1976年刑滿後仍被留置於綠島。後來因為國際特赦組織等人權團體的要求才被釋放，共被囚禁九年又二十六天。
柏楊在獄中完成了《中國人史綱》、《中國帝王皇后親王公主世系錄》、《中國歷史年表》三部書稿。原本還有第四部《中國歷代官制》，因為參考書於1975年被官員搜去保管，所以只寫了一半。
1978年與後來任教於北一女的詩人張香華女士結婚。出獄後柏楊專事寫作，其中1983年開始。他開始著手譯寫《柏楊版資治通監》，以整體規劃，分期出版的方式發行，至1993年72冊全部完成。
1985年《醜陋的中國人》出版，針對華人集體文化和性格上的缺點作出批判和探討，引發全球華人社會熱烈爭論，1986年秋中國大陸掀起柏楊熱潮。不久，中國學運爆發，**遷怒，柏楊於1987年霎時成為罪犯。其所有著作在中國大陸遭到全面查禁，直到2004年方重新正式授權出版。
柏楊也積極推動有關人權事務，1994年擔任國際特赦組織台灣分會創會會長。
自從1994年進行心臟手術，接著一連串大病之後。柏楊的健康每況愈下。2000年5月20ri接受**聘任為國策顧問一職。
2006年9月，因為年齡和健康的理由。宣佈封筆，不再在公眾場合露面和接受訪問。同月出版的《柏楊曰》大陸新版序成為其封筆之作。
2006年，柏楊同意將56箱、共計11745件文獻、文物捐贈予中國現代館，並於2007年2月6ri舉行柏楊捐贈文獻文物入藏新聞發佈會正式移交。
另外，柏楊亦為國立台南大學首位榮譽博士，南大柏楊文物館亦於2007年6月27ri開幕，系3月31ri捐贈予校方。包括1949年抵台後的重要證書、結婚證書、資治通監手稿、校對稿、雜文手稿等，與běi精的藏量等量。
柏楊於2008年2月24ri因肺炎並呼吸衰竭住進醫院，2008年4月29ri凌晨1點12分在台灣新店耕莘醫院病逝，享壽88歲。
2008年5月17ri，依其遺願海葬，家屬將柏楊骨灰撒入綠島海域，另留部分骨灰擇日帶回中國大陸安葬，經過遺孀張香華的努力，柏楊部分骨灰於2010年9月12ri被安葬在故鄉河南新鄭的福壽園陵園。
基督徒，1942年柏楊在偃師時進入一座防空洞躲避空襲，遇到一位拿著聖經的中年婦女，祈求主耶穌保護在防空洞裡兩個人的平安。在確認這個中年婦女是幫柏楊和自己禱告後，當時柏楊的反應是奚落她的信仰。
十幾年後他已從大陸到台灣，某個星期天，他在新竹見到一群基督徒，每個拿著聖經的中年婦女，都好像當年在防空洞中的那位對柏楊傳福音的婦女，他身不由己的隨著她們走進教堂。從此開始聚會成為基督徒。
柏楊後來曾參加安息ri會，甚至在國際青年歸主協會函授學校擔任過函授教師，與台北仁愛路浸信會的齊永培女士有過一段婚姻。
基督教給我的裨益太多，柏楊如此說。2008年5月14ri15時，柏楊的安息追思會在台北市台灣基督長老教會濟南教會舉行。
柏楊妻子張香華說丈夫的小說很糟糕，並認為其雜文比小說好，但《中國人史綱》和《柏楊版通鑒記事》則寫得很好，因為很有開創xing，用的文體和雜文完全不同。
柏楊好友，物理學家孫觀漢說：每個人差不多都知道自己可自豪的一面，但是柏楊使我瞭解我醜陋的一面，而最使我驚奇而傷心的是這種可怕的醜陋，竟不是我一人所獨佔，而是十億同胞所共有的。
中國現代館館長陳建功評價柏楊是當代史上的奇跡。
台灣遠流出版公司董事長王榮文說：我們常常抱怨社會混亂，柏老卻能永葆信心。因為他從歷史角度看待問題，有時候比我們年輕人還樂觀。
作家聶華苓曾評價柏楊小說和雜文有一個共同點，在冷嘲熱諷之中，蘊藏著深厚的愛和情。
學者陳曉明回憶指出，想要走向現代化之路，就要批判傳統，柏楊對傳統思想文化的批判精神和態度，很大程度上影響了我們，成為一種很經典的認知，在青年知識分子中影響很大。
同時評價柏楊是一個中國歷史文化的批判者，他對中國歷史文化愛之彌深，恨之愈切，只有對傳統文化非常關切、對中國人懷有非常高的期望，他才會批判、揭示它的問題所在。
柏楊一生著作不輟，平生有十年小說、十年雜文、十年牢獄、五年專欄、十年通監等歷程，此外還有古典詩、報導及其他散文，共完成《柏楊全集》等、歷史、思想著作100餘冊。