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反對議和的大臣們將奏章遞入宮中，也只好回家等待消息。不料皇帝既不改變主意，也不駁斥眾人，而是將奏章全部「留中」了。這不禁讓孫承宗等人擔心起來，一是確實擔心皇帝的龍體是不是出了大問題，二也是這些奏章是不是根本沒遞到皇帝手中。
接下來一連數天，崇禎又未臨朝，也不參加日講，更讓大臣們心中驚疑不定。還有些人如魯迅老先生說的那樣，「向來不憚以最大的惡意來揣測中國人」，甚至開始懷疑皇帝是不是以新設機構、大封女官為名，實際是躲在宮中晝夜宣銀，不理朝政了。
但是皇帝又很快用實際行動證明了，他們的猜測全是錯的。除了涉及到和議的奏章繼續被留中外，其他奏章全部得到了皇帝的批復。而且與以往的「批紅」不同的是，現在所有批復除了用「皇帝之寶」外，還有崇禎皇帝的親筆簽名「朱由檢」三個字，與批復的字跡相同，是聖旨完全出於聖意的明證。
不過這些批復卻讓這些滿腹經綸的官員們大搖其頭，一是皇帝這兩筆字實在太寒磣了，簡直跟狗爬的差不多；二是批復簡單到了不能再簡單，最多的就是「可」與「不可」，偶爾還有批「廢話」的，完全不講究辭藻。而且大臣們最為關心的和議問題，還是全部被留中了。
在他們搖頭歎息的同時，面色蒼白的朱由檢卻在乾清宮的御案前盯著梅劍剛捧進來的一大摞奏章發呆，半晌才道：「大爺的，這是要累死我老人家啊！」
原來朱由檢為了批閱奏章，已經三天三夜沒合眼了！
其實說來不難理解，過去內閣負責票擬，司禮監負責批紅，很多已有成例的、涉及到具體事務的奏章，尤其是地方官員的奏章，根本不用經過皇帝，這兩個部門就直接完成決策了。而皇帝上朝處理的，多是涉及到人事的，尤其是參劾官員的奏章，以及一些內閣認為自己擔不起責任、必須聖斷的大事。所以朱由檢前一段時間還算輕鬆。
現在卻不一樣了，朱由檢取消司禮監，把批紅權收歸己手，那麼相應地，所有奏章也都必須事必躬親。大明帝國這麼大，每天的奏章都有數百份之多，朱由檢的工作量可想而知！
更為氣人的是，這些奏章裡面至少有四分之一都是請安、頌聖，沒有任何實質內容，偏偏寫得還特別長。朱由檢耐著性子從頭看到尾，居然一句有用的話都沒有，不禁氣得七竅生煙。
結果他不得不先完善秘書處，從紫禁城的九千多名宮女中挑出二十名才學俱佳的，將其分為四組，進行奏章的篩選工作。具體而言，就是第一組的五名組員先將所有奏章粗審一遍，進行分門別類，比如分為請安類、報災類、人事調整類、參劾類、涉及軍事類等等。
然後第二組的組員再對每類奏章按照重要性進行排列，最重要的排在最前面，不太重要的則往後排。第三組、第四組純是審核，如果第一組、第二組出現分類錯或是排錯的情況，則予以糾正。梅劍並不參與審奏章，是負責來回巡視。
朱由檢之所以如此安排，就是要秘書處真正發揮「秘書」的作用，而絕不能出現偷懶甚至是作假糊弄自己的情況。雖然這些宮女未必敢這麼做，但以後秘書處遲早要引入男性，而且人員要定期更換，所以一開始就定好規矩也是十分必要的。
經過整理分類的奏章到了朱由檢這裡，對於請安的奏章他就直接跳過正文，在末尾批上「廢話」二字。其餘奏章，重要的他會通篇細讀，一般的則是一目十行，批示也言簡意賅，就是「可」或「不可」，然後簽名，再由梅劍統一用印。
雖然這樣已經節省了大量的時間和精力，朱由檢還是累得不輕。不說別的，光是寫字就夠他一嗆。到了第四天下午，朱由檢終於忍無可忍，突然召集「日講」。
東林派的大臣們幾天未能和皇帝照面，今天終於逮到了他，自是十分興奮，想借這個機會再力勸他不要與建虜議和。
孰料朱由檢根本不給別人說話的機會，而是取出傳教士馬爾蒂尼贈給他的鵝毛筆，向大臣們演示如何用硬筆寫字。
這下大臣們又炸了營，因為他們從啟蒙開始，就是用毛筆寫字。其實硬筆並非舶來品，中國古已有之，包括這個時代的工匠幹活，有時偶爾會用到筆，用的也全是鵝毛筆、粉筆之類的硬筆。但對讀書人而言，毛筆卻是一種身份和學問的象徵，因為沒念過書、下過苦功夫的人，毛筆是玩不轉的。
因此他們見皇帝竟要改用硬筆寫字，馬上紛紛出言反對。尤其是黃道周，更是直截了當地對朱由檢提出了批評，認為他毛筆書法不行就該勤學苦練，而不應改用什麼硬筆。
朱由檢倒沒生氣，也不與黃道周爭辯，而是微微一笑道：「你說朕書法不行，那你的書法一定是不錯的了？」
其實在這個時代，凡是能通過科舉考試入朝為官的，無不在書法上下過一番苦功夫。黃道周同樣如此，他寫得一手好蠅頭小楷，自己也常引以為傲，當即得意地道：「臣在君前何敢賣弄，無非字跡工整而已。」
「那好，今日咱們君臣來個比賽如何？」朱由檢狡黠地笑道，「讓袁尚書隨便選一篇文章，你用毛筆朕用硬筆，咱們同時開寫。如果你能先寫完，朕從今往後再不用硬筆；如果朕先寫完，那就對不起了，你以後就要改用硬筆寫奏章。敢比麼？」
黃道週一想到朱由檢那歪歪扭扭的御筆，就覺得皇帝不過是有些小聰明，真要動筆桿子，是無論如何比不過自己的，當即答道：「臣自當奉詔！」
很快，一場別開生面的書法比賽在文昭閣開始了。袁可立出的題目是劉禹錫的《陋室銘》，話音剛落，朱由檢即用鵝毛筆蘸上些墨水，在紙上刷刷點點寫了起來。
而黃道周也趕緊研墨、潤筆，等他準備好下筆，朱由檢已經寫了一半了。
黃道周不禁額頭冒汗，剛寫下頭一句「山不在高有仙則名」，朱由檢大笑一聲道：「朕贏了！」——
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