不過在此之前，包括皇帝在內，並無人要求丞相府為此事負責。因為事發之時，正是李斯接任丞相伊始，原本新舊丞相所交接的事情已經夠錯綜複雜，此事沒能夠及時發現處理，也是情有可原。雖說丞相府總管朝政，但實際上直接管轄帝國經濟事務的卻是九卿之一的治粟內史。
治粟內史鄭國，是治理河道的大師。原來是韓國的間諜，韓王為了使用疲秦記，讓鄭國入秦協助秦人修理河渠。本來韓人計謀鄭國修整河道的時候，故意修出一條廢渠，好消耗秦國國力，無力侵犯韓國。結果卻低估鄭國的人品，耗時十餘年，紮實修出了一條河渠來。
當然，在修建河渠的時候，鄭國的間諜身份被揭破，讓嬴政大怒，因此頒布了一個瘋狂的法令《逐客令》。因為逐客令的緣故，李斯借此寫了《諫逐客令》奏章，從此青雲直上。
鄭國修成河渠之後，關內鹽鹼地大大減少，土地增產極多，因此此渠道被命名為鄭國渠。鄭國也理所當然地被任命為治粟內史，掌管天下糧草稅收。深得皇帝器重。卻因為去年糧草之事，引咎辭職，辭去了職位。按照慣例，已經有大臣對此事負責，事情已經可以告一段落，但周青臣卻無故朝廷的潛規則，把事情引到了李斯的身上，真可謂是膽大包天，居心叵測。
「丞相，周御史所言，你可有何辯解？」皇帝眉頭一皺，揮袖屏退了周青臣，對著李斯不陰不陽地問道。
李斯後腦勺一涼，他素有辯才，但面對著周青臣的彈劾和皇帝的詰問，他心中也難免忐忑。周青臣的彈劾他不怕，實際上皇帝這一番詰問才真正可怕。
在朝堂之上，皇帝還是第一次用如此平淡冷漠的語氣對他說話，這才是讓他最為緊張的。李斯在皇帝身邊已經跟隨將近二十年，這近二十年來，他處理事情的時候，極少會自作主張，每每都是根據皇帝的意願，擬出最佳的方案來處理事務。如今的皇帝實際上意願已經給出，這一刻，他就要揣摩上意，迎合皇帝的意向做出合理的舉動。
稍稍冷靜下來之後，李斯臉色平淡，慨言道：「周御史所言甚是。自從去年發生此事之後，南征大軍糧草一度捉襟見肘，險些一度斷糧。這皆是臣的過失，臣每尋思，總夜不能寐，惶恐不已。即周御史不彈劾李斯，李斯也難辭其咎，請陛下降罪！」說完，李斯出列，伏拜地上，一臉悲色。髮冠別著的頭髮，白花花地直晃著，晃出一股難以言喻的滄桑。看到這一幕，皇帝心中稍軟。心中暗道。李斯這些年來為朝廷出謀劃策，殫思極慮，屈卻如此對待於他，會不會讓臣子們心寒？想到這裡，皇帝的眼神的寒意漸消。
群臣一陣死寂的沉默。
李斯的辯才舉朝皆知。如果他要是想反駁周青臣的彈劾，可以列出無數的理由來說明他無罪，加上皇帝對他的寵信，這並不是什麼大不了的事情。再說，周青臣這彈劾也實在過於牽強，就算得有人負責罪責，也輪不到堂堂帝國的丞相直接負責啊！
「馮劫，你說，丞相此言如何？」皇帝臉色依舊靜如秋水，對著御史大夫馮劫問道。
馮劫心中暗暗喊苦。他就清楚，有御史彈劾李斯，皇帝卻讓他來評判，實際上皇帝是把黑鍋往他頭上扣，故意讓人誤會周青臣是受了他的指使，才會做這樣的事情。
馮劫一臉凝重之色，出列應道：「稟陛下，周青臣所言丞相失職二事，實際可歸納為一事，都是購糧一案之事。臣以為，去年我大秦初立，事多紛雜，六國餘孽狡詐無比，行事縝密，黑水閣、各郡縣官長都一時難以發現逆賊企圖，更何況日夜殫思極慮國政大事的丞相？臣以為，此事丞相與丞相並無大干係。臣以為，如今追查六國餘孽事大，追責丞相事小。以避免日後再有此等事情發生。至於丞相，可依我大秦律，罰俸半年，以作為懲戒即可。」
馮劫說話時候，言辭謹慎無比。言語之間不無為李斯開脫的意思。
皇帝冷冷一笑。想了一下，說道：「馮劫說得不錯。緝拿六國餘孽，也不是丞相干的事。但李斯之前也當了十多年的廷尉，掌管帝國律法治安，出了這事，他也難辭其咎。這樣吧，李斯回去當一段時間的廷尉，什麼時候把那群膽大包天的逆賊給抓住，什麼時候再回來做你的丞相。」
此言一出，群臣嘩然。這話說得實在太過於兒戲，以至於不少大臣以為皇帝是在開玩笑。然而皇帝卻不像開玩笑的樣子，他繼續說道：「除了這個，咸陽到北地的馳道修整，也由李斯全權負責蒙恬發來奏章，說北邊的匈奴人不大老實，這馳道的修整，可得抓緊一些。」皇帝的聲音很是平穩。
「是。」李斯聽到皇帝將他從丞相之一擼回到原型，身子如墜冰窟，但聽到皇帝又讓他主持修建馳道，心中又稍安，知道皇帝對自己的寵信並沒減多少，心裡才暗暗鬆了一口氣，只是不知道皇帝這等行為，究竟是為何。只能夠用天威難測來形容了。
皇帝接著說道：「老丞相王綰熟悉政務，這左丞相的政務，先讓他代替一段時間，另，治粟內史隗林兼任右丞相之位，協助老丞相推廣帝國新制；原右丞相馮去疾另安排。」在眾人還沒有回過神來的時候，皇帝又做出了一系列的人事變動。群臣不敢做聲，皇帝以往任命大臣，都會和重臣反覆討論，得出最後的人選，可是現在卻剛愎自用，擅自做出了自己的任命。這種情況很反常。所以諸臣都摸不著皇帝的心思，鮮有膽敢詢問原因之人。
正群臣心中震驚惶恐之時。卻也有人暗暗彈冠相慶。這些人是皇帝的常備顧問團，學官博士們。