落在佛界而成「雨花石」，此石凝天地之靈氣，聚日月之精華，孕萬物之風采。起群星之璀璨。藏蒼穹之浩瀚，攬海天之宏博。落在神界化作「冥石」，沉寂千年後被天帝帝俊所得，溟濛未開天帝以神力通靈，藏於扶桑神樹之上的「天地寶庫」，因此之顧後世多稱之為「天帝冥石」，還有一塊據說落於北極冰原，萬載寒氣淬煉凝之為「青靈石」，乃是北極冰原至寶之一。
又過了千年宇宙的混沌之氣孕育了第二代神靈，伏羲、太一、木公、西王母、神農，九幽之主青若與燃燈古佛差不多也是這個時期誕生的。混沌青蓮的「蓮台」孕育了佛界眾生的誕生，是以佛界「四大吉祥花」以蓮花為首。佛界燃燈佛生時，一切身邊如燈，故名燃燈。燃燈古佛身邊有一隻靈猴，西方須彌山所出，聰慧頑劣，壽逾千載，遂開靈目，能見千里，能御草木土石，為燃燈古佛座下護法。即是「洪荒九獸」之一的三眼靈猴。
青若應該說是一個異類，無情與癡情聚於一身，巫力精純獨自支撐三界之一的冥界，修為雖強卻全無爭勝之心，傾世的容顏風華萬代。收服了「洪荒九獸」之一的九幽靈蠍，這九幽靈蠍飲盡九幽至陰至寒之氣，乃是至陽至剛之物的剋星。后羿射落金烏的十枝箭矢，便是煉化九幽靈蠍所得。「冰弓玄箭」一說的玄箭指的就是那十枝箭，而冰弓卻是北極冰原碧水寒潭所出。據說她的一滴眼淚使得淚海氾濫，溢出來的海水浸濕冥界的土地，這才有了黃泉，當無情海的藍色曼陀羅花花開之際，才能見到那難得的笑容。
伏羲正是源於太始之初的混沌之氣，與女媧有著相近的血脈，乃是蛇族大聖，後得女媧垂青授以陣法，也是第二代神靈之中修為最高的。對天地法則、自然之道有著獨特的感悟，依河圖演繹先天八卦，黃帝后以洛書演繹後天八卦。先天之理，五行萬物相生相制，以生發為主。後天之理，五行萬物相剋相制，以滅亡為主。
河圖為體，洛書為用；河圖主常，洛書主變；河圖重合，洛書重分；方圓相藏，陰陽相抱。河圖本是星圖，其用為地理，故在天為象，在地成形也。在天為象乃三垣二十八宿，在地成形則青龍、白虎、朱雀、玄武。青龍、白虎、朱雀、玄武乃為「四靈」，亦傳說乃是地上萬年難遇的靈獸感應星宿之力所化。
太一則是幽冥血海之天地戾氣與太一元氣交合所化，後與帝俊交好結為兄弟。帝俊即為天帝，被尊稱為「東皇」。而太一即為「妖帝」，也被妖族尊稱為「妖皇」。因妖皇太一和東皇帝俊兩人交情匪淺，常在一起出沒，後二人又合被稱為「東皇太一」。到了「上古時代」多有混淆。太一所用的法寶傳說為盤古開天之時部分混沌之氣所化之鍾（混沌鍾），此鍾又被稱之為東皇鐘。
西王母法力高強，居於崑崙山，門口有開明獸守護，瑤池乃是崑崙山重地，各種奇花異草、珍稀靈禽居於此地，仙鶴、縣圃、涼風、樊桐，在崑崙闔閱之中。疏圃之池，浸浸黃水，黃水三周復其原，是為丹水〈赤色水〉，飲之不死。仙界所需之物，這裡應有盡有，有不死樹、不死藥、不死水等等。
值得一提的是西王母坐下的九尾天狐，在狐妖一族之中，有一支最聰慧最神秘的支系，傳說他們隨著修行道行的增加，身後的尾巴會不斷增長，百年道行會有三條尾巴，稱為妖狐；千年道行便有六條，便為魔狐；魔狐歷經千年甚至萬年的修習，當到了出現有九隻尾巴的地步，便已是世間妖物的無上境界，無人知道這究竟要修行多少年才能達到，但傳說之中，道行到了九尾的狐妖已經是絕世妖物，法力通神，是為「九尾天狐」！
而在女媧的相助之下西王母收復了洪荒七禽之中最強的鳳凰一種，九天玄女更是其得意弟子，麾下諸神眾多各有千秋，奈何容貌不佳為東王公所棄，夫妻二人經常大大出手。起先只是與東王公異地而居，以「洪荒七禽」之一的青鳥傳信往來，後東王公鍾情於神界最美的「三仙子」之一的姑射仙子，夫婦二人再無往來徹底決裂。「洪荒七禽」之比翼鳥從此消失於神界！
東王公坐鎮蓬萊仙山，神力與天地帝俊亦有相近之處，天帝便令其守護扶桑神樹，東王公後也被稱之為「扶桑大帝」，其坐騎七色神鹿也是帝俊助其降服的，東王公為首領的蓬萊諸神奉帝俊為「天帝」。天地帝俊的所有的寶物即藏於此，後世人稱之為「天帝寶庫」。十隻金烏與十二個月亮俱是天帝最愛，對其溺愛有加。這十二個月亮其中有一個修為最高，後化身為嫦娥，天帝賜月宮居住，被封為「月神」。
洪荒時代佛界、冥界、神界三界並立，尤以神界實力最為濃厚。西王母追隨女媧，神農、炎帝相繼依附，逐漸形成以女媧為首的炎黃神系。蓬萊之所的東王公則依附天帝帝俊，帝俊兩位妻子常羲與羲和修為不弱，後少昊、后羿、顓頊等相繼歸順，形成東夷神系。東夷神系與炎黃神系相比終究是弱了幾分，三界之外本應該還有魔界、妖界，佛界嫌棄魔眾稱其魔性難除，神界不屑於提起妖界，何況最初的妖物有些被神界、佛界之人收為坐騎，魔界、妖界自是不甘於境況，奮起抗爭。而北極冰原自古以外並無法力強大的神靈出世，譽為被「眾神遺棄的角落」，直到誇父與后羿自北極冰原而出，三界的並立有不公之處，因此之故後來變成了禍及三界的大戰。