星際聯邦中曾經廣為流傳一個笑話，叫「女神的色誘」。一群人因為「窺視」一個叫雅典娜的女神，而留在了一個遙遠邊境的不毛星球，一呆就是一千兩百多年。其它星系的少數居民也著了魔一樣，移居到那裡，再也沒出來過。正常人是不會選擇這樣的，可這群人太不正常。似乎只有受了「女神的色誘」可以作為解釋，於是這個笑話不脛而走。
現在所有人和神都明白了。在那個被聯邦忽視的邊緣星球，這麼多年來一直在進行陰謀，向遠處進一步擴展勢力，卻守口如瓶。只有一個詞可以解釋這種行為：「造反！」沒有人特意到太過遙遠，遠離9大主流宜居星球的荒無的巴洛斯旅遊。就算有，也是衝著看一下美雅斯。但這種人肯定也很少，因為根據聯邦公約，那裡屬於其他文明所有，不可降落遊覽。在互聯網上看下圖片、錄像也就差不多了。那邊太偏遠了，以致於沿途沒有專門的補給站。聯邦無意浪費資源，也認為沒有必要。巴洛斯星球一直是被人遺忘的角落。
如果沒有25年前的爆出的建造超光速戰艦和研究eva計劃兩大新聞，有許多人甚至不知道它的存在。25年前那裡處死了一批異端者，並接受了聯邦全面檢查。eva計劃被終止，超光速戰艦被擊毀，似乎一切恢復正常了。現在又跳出來一個「911」恐怖襲擊，緊接著又爆出一個全新的星際組織——「自由同盟」。那邊所發生的一切，繃緊了每一個人的神經。連神也感到意外。
當年，天狼星人向美雅斯星球移民，不料在最後關頭，被女神雅典娜搶先一步，先到那裡。這件事情天狼星人並不是完全沒理，畢竟自己是提早發現的。但波塞東下了死命令，一定要放棄美雅斯。不少人心生不滿，質疑波塞東的星際移民政策。加上波塞東處處壓制科技進步，連向外拓展的宇航探索也逐漸限制，明擺著是在制約人類的發展。以萊因哈特為首的異端者，暗中商定留下來建立革命根據地，為將來的鬥爭作準備。不僅要發展實力，戰勝雅典娜，奪回「美雅斯」。更要挑戰波塞東，爭取全體天狼星人的解放和自由。甚至最終要一統宇宙。所以在其他人要走的時候，堅決留下。這裡太偏遠，幾乎與世隔絕，幹了什麼外邊也不知道，可謂佔盡天時地利。就這麼留下來，也沒引起外人懷疑，都認為他們是一時捨不得走。女神雅典娜只關注自己的「新雅典」，也沒興趣注意這夥人的動向。
巴洛斯發展很快，也制定了下一步的行動方向。繼續向更遠的地方前進，建立真正的根據地。巴洛斯只是作為一個前哨站。巴洛斯人製造了新的太空飛船，用一種被稱作「蛙跳」的方法，尋找合適的足夠遠的新領地。這種方法是這樣的：探測飛船一直前進，當燃料不足時，停在某顆行星上，採集製造燃料，完成後繼續前進。反覆幾次，就可以到達非常遠的地方。巴洛斯人在離巴洛斯都很遠的地方，找到了一個宜居星球，取名為「美雅琪」。以此為基地，不斷向更遠更廣闊的星域推進。最後建立了一個新的星際組織，取名叫「自由同盟」。
自由同盟為了促進人口增長，才用了非常手段。採用工業化的手段，在工廠中「生產」人。用高科技手段，改造普通干細胞變成具有分化能力的胚胎細胞，在模擬子宮的容器設備中，培養下一代。為了使下一代產生遺傳差別，對每個胚胎細胞的基因進行了差別更改。直接複製人，畢竟成本太高了，因為那純粹是大量原子、分子的複雜堆砌，所以沒有採用。為了更快發展，科學家甚至通過改變基因，大幅縮短了人的生長期。人生長至成年的時間被縮短為5年，各種知識記憶都用機器直接植入大腦。人可以說完全是在用違法的方式生產。
在這裡也沒有星際聯邦的種種科研限令。超光速、人造神、空間跳躍等等的研究都是合法的。經過千年的發展，自由同盟建造了一批兼具超光速和空間跳躍的戰艦，同時也基本實現了eva計劃，改造出一大批「神」，包括萊因哈特本人也實行了這樣的改造。但畢竟對真正神的能力，也不太瞭解，出於謹慎的目的，沒有對聯邦用兵。為了保持秘密，不讓聯邦懷疑，巴洛斯也一直存在和發展，做足表面文章。
25年前機遇好像來了，由於其他5個文明進入了太空時代，與星際聯邦的領土矛盾顯現。聯邦各個星球都出現了抗議聲，要求本方的神使用強硬手段干涉。波塞東自然不肯。聯邦民眾中關於發展新式戰艦和開展eva計劃的討論轟轟烈烈，想著既然自己的神不肯幫忙，只能使自己變強，去解決問題。波塞東嚴厲控制，使得自身的威信受到一定程度損傷。
萊因哈特決定先試下水，高調向全聯邦宣佈更改憲法，進行超光速研究，建造新式大威力戰艦，並實施eva計劃。可是全聯邦都不相信一個邊緣化的星球能搞出什麼名堂來，反響平平，應者寥寥。萊因哈特決定拿出實際性的東西來，震撼一下聯邦民眾，將他們的鬥爭熱情激發出來。為了真實，利用自由同盟的已有技術，在巴洛斯建立研究機構和工廠，折騰出了超光速戰艦「無畏者號」，性能與同盟已有的基本持平。將戰艦的消息和eva計劃的初級成果洩露出去，看聯邦的反應。確實新聞效果非常好，但聯邦的反壓也很強大，要求立即拆毀戰艦，取消計劃，不然進行戰爭打擊。執行特別處置任務的艦隊迅速向巴洛斯開進。
萊因哈特決定讓「無畏者號」升空，逃入聯邦內部，將各方面的注意力全部吸引過去。抓緊時間，消除所有自由同盟留在巴洛斯的痕跡。銷毀了超光速戰艦的科技資料。又製造了一批包括自己在內的高級領導人的冒牌複製品頂罪。真身則躲到外太空某個隱蔽的行星，對巴洛斯及自由同盟遠程遙控。
聯邦忙於應付那艘到處流竄的戰艦，忽視了詳盡調查事件的真相。處死了相關罪首，搗毀了超光速造船廠和eva計劃研究所，又在巴洛斯設置一個監督機構後，就結束了。過了段時間，萊因哈特覺得事情總要有個了結，要搞就搞大的。命令自由同盟作好戰爭準備，將艦隊開赴到聯邦邊境隱蔽。同時還讓所有人造神隨軍。
為了徹底重創聯邦，決定兵行險招，用「無畏者號」摧毀地球，引發眾神對聯邦的圍攻，再尋找機會動武。不料後來收到來自聯邦官方的消息，「無畏者號」被神摧毀了，這也給萊因哈特敲響了警鐘。所有軍隊又撤回了自由同盟。
這23年來，自由同盟主要的科研方向，就是eva人造神計劃的進一步改進。因為靠原先技術，改出來的神實力不強。終於技術又有了突破，改造出來的神可以擁有光速移動的能力。但這似乎已經是極限。萊因哈特本以為製造了大量這樣的神，實力就夠了。
正好收到諜報，知道了波塞東在恩美雅召開萬神大會。於是制定了一個稱作「諸神的黃昏」的作戰方案。在眾神開會的時候，用超光速飛船撞擊。
但是到了恩美雅，通過對聯邦高層的刺探，得知了當年「無畏者號」的被毀詳情，又動搖了。親自找了趟令狐沖後，更是徹底死心了。實力的差距是明擺著的。當即率部下離開了恩美雅。
但是眾神大會的決議又讓萊因哈特很不爽，讓出大量星球不算，連巴洛斯也犧牲了。巴洛斯可是自由同盟不可分割的一部分，長期以來作為與聯邦鬥爭的前沿陣地存在。而且如果巴洛斯人被轉移到別處，難保同盟的秘密不被暴露。趁著開大會，全宇宙的注意焦點都在恩美雅，包括雅典娜都到了那邊。命令太空運輸艦隊將巴洛斯人整體運回同盟。臨走前，「諸神的黃昏」依計劃進行，算是送給眾神的禮物。如果真能挑起波塞東和其他神之間的矛盾也不錯。整個計劃做得也算天衣無縫，不料被一個光腦白癡「出賣」了。隱蔽的自由同盟被**裸地暴露在光天化日之下。