不得不說蕭雲貴還是很佩服日本人虛心求教的精神，川路聖謨和一行使團人等恭敬而且不恥下問的態度讓蕭雲貴滿足了一把虛榮心，畢竟太平軍的強大讓滿清感到的只是恐懼並帶來的只有咒罵，而英法美等列強雖然驚訝於太平軍的強大，但他們只覺得太平軍是學習了他們才如此的，英法美等西方國家的人只會敬佩真正在戰場戰勝過自己的人。
而日本人的謙遜和恭禮讓西王大大的滿足了一把做老大的癮，至少日本人只會稱頌蕭雲貴是太平軍的賢王，而不會像英國人那樣說他是中國的威爾士親王。同時，日本人也讓蕭雲貴看到了真正的儒家求學精神，那種朝聞道夕死可矣的精神在中國幾個世紀的異族統治下已經蕩然無存，整個國家的儒生都在為功利的出仕而讀書，講的都是三年清知府、十萬雪花銀，滿清的儒生們卻忘記了儒家真正的求學問道和經世致用之精髓所在。
假如滿清治下的儒生們能有日本人求學精神的一半，也不至於會被列強欺負成這個樣子，更不會被太平軍打成這個樣子。那是因為滿清一開始就在閹割真正的儒學，把它變成統治讀書人和天下人的工具，而並非真正的儒學治國之道。真正的儒學治國並非僅僅是三綱五常，缺少了經世致用和求學問道之後，滿清的儒學就變成後來國人花了幾十年才擺脫的封建思想。可惜國人在擺脫這種思想之後，卻發現沒有儒學的中國人還能稱為中國人嗎？於是乎在蕭雲貴穿越前的那個時期，國人們又開始重新學習儒學，希望能夠把儒學重新給找回來，不得不說這是一個曾今向世界傳播儒學的民族悲劇。
反觀日本，他們雖然有時候偏執而且狹隘，但不可否認他們卻一直繼承著儒學求學問道和經世致用的精髓。所以日本後來幾經沉淪依舊能夠站起來，卻並非僅僅是日本人的堅韌所能解釋的。
在見識到日本人的這種求學精神之後，蕭雲貴開始擔心自己的計劃能否實現。畢竟日本倒幕派那幾個大佬才能更加的強大，不用些非常手段。只怕幕府還是爭不過倒幕大軍的。
於是蕭雲貴在和川路聖謨討論完幕府的改良問題之後，微露可以派人到日本親自指導幕府改良的意思，這讓川路聖謨大喜過望，畢竟有太平天國的人親自到日本指導好過自己只學了些皮毛就回去的好。
既然談到了派人到日本去，就涉及到了兩國的邦交問題和合作關係問題。讓蕭雲貴沒有想到的是，川路聖謨表示回去一定稟告幕府太平天國的現狀，並非常願意上疏幕府。請求幕府承認太平天國。川路聖謨表示，按照太平天國現在的狀況，幕府是極有可能承認太平天國的。
蕭雲貴不禁有些哭笑，想不到日本倒成了願意第一個承認太平天國的國家。但他不稀罕這些，連忙以還要上報天京方面給推辭了過去，但雙方的合作關係可以由上海軍政司出面來完成。
換句話說，蕭雲貴不需要日本承認立國之事，也不想過早和日本玩什麼結盟。省得到時候列強一旦對日本有什麼動作，自己還被繞進去，為了日本而和列強交惡，蕭雲貴還沒有那麼蠢。川路聖謨失望之色一閃而過，隨即兩人談起合作的事宜來。
蕭雲貴選擇同日本合作。最大的因素就是日本離庫頁島和廟街較近，從北海道的箱館港（今函館）到北庫頁島不過幾天的海程。一旦日本像對待美國一樣，對太平天國開放長崎和箱館兩處口岸，在上海和寧波的太平海軍就可以護送著商船先到長崎進行一部分的商貿交易，然後在日本就地採購糧食和新鮮的瓜果蔬菜，從箱館出發直接北上補給廟街和庫頁島。然後船隊又可以帶著庫頁島和廟街出產的人參、毛皮等東西回到日本或上海交易，同時船隊還可以長期保持和日本的商貿，這種商路和補給路線合併的方式才是最為合理以及划算的。
而中國的海船絕對可以到達日本，甚至滿清治下還有海船長期跑長崎港交易的，沒理由太平海軍做不到這些。為此蕭雲貴專門讓太平海軍通寶和尚、唐正財等幾名海軍將領到蘇州來詳細詢問過這條線路的可行性。幾個海軍將領得出一致結論，就是太平海軍之所以不太適宜遠洋航行是因為船體太小，能夠運載的補給物資和貨物比不上洋船，但如果能在日本長崎歇腳，太平海軍的船隊絕對可以沿著上海、長崎、箱館、廟街這條海線跑下去。
於是兵部海軍司和戶部商業司以及禮部專門聯合商討了詳細的章程，最後一致形成了必須要日本開放長崎和箱館兩處港口通商，才能保證廟街和庫頁島以及大連的補給。
當蕭雲貴不緊不慢的說出太平天國的條件之時，川路聖謨似乎沒有感覺得太為難，長崎港一直對中國、朝鮮、荷蘭等國長期開放，雖然太平天國是滿清的叛軍，但在日本人心目中反而覺得太平天國這個漢人政權才更算是正朔，對太平天國開放長崎港根本不是什麼問題。而北海道的箱館港一早也對美國開放了，同時太平天國需要箱館港開放也是出於北上抵抗俄國的緣故，川路聖謨相信開放箱館港給太平天國也不是什麼問題，甚至國民還會歡迎。
而川路聖謨的條件也很簡單，就是向太平天國學習改良治國之路，並且日本需要太平天國輸出西洋科技，派遣人員到日本指導等等。
蕭雲貴當然很樂意派人過去，指導日本幕府改良是非常有必要的，同時白澤堂和情報司也需要把觸角伸到日本去，甚至蕭雲貴打算把閒養在蘇州的幾個大佬派過去，當年像關刀幫、寧波幫等幾個幫派的大佬現在都在蘇州賦閒，沐英紅她爹沐關刀甚至讓女兒在西王面前提過想要領些差事的意願。
雖然蕭雲貴還沒有收納沐英紅的意思，但每次到上海，沐英紅和周秀英一道還是把自己伺候得非常舒服，現下洪韻兒既然不反對自己在外面養小的，蕭雲貴也琢磨著今後在上海弄個金屋藏嬌，所以沐英紅的爹還是要照顧一下的。
派幾個上海黑幫大佬跟著船隊到日本去，讓沐關刀等人在日本建立中國的黑幫勢力是非常有必要的，既然太平天國要和日本長期進行商貿，在港口以及通商口岸就必須有自己的勢力才能保證自己的利益，在上海、寧波有太平軍保護，自己家的商人能夠得到保障，但在日本太平天國沒有什麼勢力可以保護自家商人的，在那邊弄幾個中國幫派保護自家商人順便欺負一下朝鮮、荷蘭人也是不錯的。
而白澤堂和情報司也是各有任務的，就如同蕭雲貴擔心的那樣，倒幕派那幾個高人假如實在太高的話，蕭雲貴是不介意讓白澤堂的死士在日本提前幹掉他們，以保證幕府能活得久一些。情報司的職責也很明確就是收集日本的各種情報，就像當年日本侵華前做的前期工作那樣，蕭雲貴希望能夠清楚日本的一切，包括日本天皇每晚睡在哪裡。
當清楚日本的一舉一動，並且在商貿、軍事和政治上都影響日本的情況下，蕭雲貴就自信能夠把日本徹底變成太平天國的小弟，如果到時候還控制不了日本，蕭雲貴也不介意直接進行軍事干預，相信到那時候滿清早已經被太平天國推翻了，蕭雲貴自信到時候太平天國絕對有這個能力。
川路聖謨並沒有真正體會出西王的別有用心，就像後世民國初年，人們天真的以為日本會幫助中國一樣，在日本留學的留學生很多、很多，甚至魯迅先生也在日本留學過一樣。直到後來日本侵華，大多數人才清醒過來，原來日本一直都包藏禍心。現在只是變了個方向，變成蕭雲貴在算計日本了。
於是雙方在商談好大致方向後，便由川路聖謨和西殿禮部的官員去商討具體章程細節了，而為了辦好日本的事，西殿禮部專門開設了日本司，和其他幾國專設的司部一樣，專門負責處理日本的外交事務。
對日本的商貿，蕭雲貴專門和朱昌齡、魏鶴林等人商議過，蕭雲貴不安好心的甚至想把鴉片進行提純，然後買到日本去。但考慮到初期需要博得日本的信任，販賣鴉片提純品的想法就暫時擱淺，但上海民營工廠生產的火柴、香煙、香皂等物品在日本絕對有市場，甚至在蠻荒的廟街、庫頁島當地，這些商品絕對是暴利的東西。當年俄國人和東北、西北的牧民進行貿易的時候，非常不厚道的進行不等價交換，一盒俄國火柴在那些地方竟然可以換一頭牛，真是不可思議的暴利。
有了日本開放口岸的合作，太平天國的西王也有了繼續在廟街和庫頁島待下去的底氣，其實在和包令等人攤牌前幾天，上海和寧波的太平軍商船、貨船和海軍已經浩浩蕩蕩的出海了，他們的目的地就是日本的長崎。