人類的勞動果實有了剩餘，自然就會有商貿活動的產生，但往往十分複雜，以物易物，不甚方便，在了真的提議下，神農又推行了鑄造錢幣，以錢易物的措施，人族自此迅猛發展，其間卻也發生些其他事情。
神農經常得聽到有些老弱族人偶爾遇上頭痛、發燒之事仍然無法治癒，有些族人就這樣死掉了，甚至一些壯年男女發生這樣的狀況也就無法幹活了，只能躺在床上等著好轉，而且這些現象現在越來越多，再就是誤食毒物或被毒蟲、毒蛇所傷的族人越來越多，雖然有上次伏羲出去帶回來毒物的記錄，但是現在族人卻是越來越多，需要的土地也越來越多，族人需要到山林中燒山為林，遇上很多未曾見過的草木。萬事有一利則必有一弊，穀物雖然使族人得到了更多的食物，可是食用穀物之人卻是身體不如食肉之人，故以前對族人基本無害的一些病痛現在卻是可以要命。
神農聽到這些事便坐不住了，將部落之事安排好之後便出門向大山深處行去，一路之上但凡見到以前未曾見過的草木便用了真所給的神鞭赭鞭打一下，看其有毒無毒，並將他們記錄下來，等到晚上的時候便將那些毒草服下，檢驗其毒性的強烈，慢慢的神農發現各種毒藥都有都有五行屬性，有些厲害的毒藥更是混含了數種五行之力，所以才毒性劇烈，神農察其寒、溫、平、熱之性，辨其君、臣、佐、使之義，慢慢的便可以用之解毒，還可以治病。一天神農在石縫中找到一支開小黃花的籐狀植物，神農用赭鞭打一下發現其中蘊含劇毒，便把花和莖吃到肚子裡以後，沒有多久，就感到肚子鑽心地痛，好像腸子斷裂了一樣，連忙用功將毒性化解，一會神農起身擦了一下頭上的汗說道：「幸好我有老師傳下的道法護身，不然就會死在這裡了，一定要將這種草記下來告訴族民，以免族民誤食而喪命。這種草吃下去肚子鑽心地痛，好像腸子斷裂了一樣，就叫『斷腸草』吧」。經過數十年的辯嘗發現甘草可以治療咳嗽，大黃可以治療便秘，黃蓮可以消腫等等。
經過數十年的辯嘗，神農終於幾乎將所有的草木都嘗遍了，還寫下了一本書《神農本草經》，《神農本草經》闡述了藥物的三品分類及其性能意義，藥物的君臣佐使及在方劑配伍中的地位和作用，藥物的陰陽配合、七情合和、四氣（寒熱溫涼）五味（辛甘酸苦鹹）、有毒無毒，藥物的采造，藥物的煎煮法，藥物與病證的關係等，最後神農將得自了真之處的煉丹技巧等等也寫在了上面。當這本書寫完的時候神農忽然感覺心中空靈一片，心想自己大道已成，所剩的便是傳授這丹道之術以及找尋下一代人族共主接班人了。
神農回到陳郡便開始教授族人醫藥之術，神農又發現有些病發起來很快，等藥煎好的時候病人已經快不行了，藥服下去也不管用了。所以神農又想找到一種方法，將藥物的精華全部存下來，在病人剛發病的時候便將其服下，病人便可以乘早將其服下便可以保住性命，神農想了很久，都沒找到方法。突然有一天神農想起當年自己中毒時老師給自己服下一丸丹藥，治好了自己中的毒，不由想到：「仙丹是仙人將仙草仙果去其糟粕煉製而成的，那麼人應該也可以將草藥煉成丹藥，可是老師沒有教我怎樣煉製丹藥。嗯，還得去向老師請教。」
來到了真居所，見了了真，神農對了真說了真來意，這了真倒是沒想過，遂取出一個匣子，打開一看，正是一部名為《丹學經典》的黃皮書。乃是玄天算到神農會問及丹學上的事情，特意賜下此書交於了真，等神農來問時將此書交給神農。這書可是玄天精心編製的，雖然在煉丹一途上，其他聖人都不如老子，但玄天不怕，玄天畢竟是後世來的，多少也知道些後世製藥的原理，且老子那一套煉鉛煉汞的手法還是不要在人族流傳的好，他一幹幹瘦老頭是聖人吃了沒關係，不代表下面那些凡人吃了沒關係，萬一哪個白癡沒事兒要想成仙，煉些鉛汞吃了，跟找死沒兩樣。
神農得了此書，立馬歡歡喜喜的回到人族，又丹學經典一書傳於人族中。
卻說這玉虛宮中的元始天尊，一早就在打人族的主意，上次讓廣成子去收神農為徒就是徒的是神農乃是天地人三皇中的地皇，結果玄天走了個先手，先一步讓了真收下神農，廣成子只好退去，可元始心中可沒放下啊，這次，他要比玄天更快，早早的，就讓廣成子下界在洪荒中找尋軒轅部落的下落。
在大地西北方的姬水河畔，生活著兩個古老的部落，有軒轅族和有蟲喬氏族。他們世代以水為姓，通婚融合，不斷發展。這一年，軒轅氏族的首領少典，娶了有蟲喬氏族中的女子附寶為妻。
一天晚上，附寶觀看北斗七星時，天樞之處忽然白光閃耀，照得四野通明。附寶受到感應懷孕了，懷孕三年而生，在壽丘生下一個兒子，取名公孫軒轅。
軒轅一生下來，就顯得異常的神靈。生下沒多久，便能說話，且力大無比，五歲便能獵熊，族人皆異之，少典見軒轅聰穎敏慧，驍勇神武，心中甚喜，便下令將軒轅部落改名為有熊部落。
這廣成子得了元始天尊之令，下界來尋找下代人皇，元始曾言人皇將出生於有熊部落當中，可廣成子找了很久皆沒有找到有熊部落，這一日，廣成子來到姬水河畔，見一部落中人皆歡喜無比，一問之下，正是軒轅部落更名為有熊部落，又得知部落首領少典之子，懷孕三年而生，取名公孫軒轅，聰慧異常，廣成子心道此子定是下代人皇。遂趕往有熊部落中。
待到了部落中，廣成子找到少典，說道：「吾乃崑崙山玉虛宮元始聖人座下弟子廣成子是也，今算到與你家公子軒轅有師徒之緣，特來收徒。」
少典一聽是聖人門下收自己兒子為徒，當下欣然應允，又召集部落中人，為軒轅舉行拜師之禮，這正合了廣成子的虛榮心。
廣成子便在有熊部落住下，盡心盡力教導軒轅，只是他多居於山中修煉，對於修仙煉道或許還在行，但對於民事生產便不怎麼清楚了。如今有熊部落尚武之風盛行，廣成子於武藝之道倒是頗知一二，無奈之下便在那煽風點火，對少典軒轅大言洪荒以武為尊，習武之好處。少典凡夫，如何懂得這些，那軒轅年紀尚幼，卻是慢慢的被廣成子感化了。