王士珍之所以被稱為北洋的「龍目」，極為重要的原因就是袁世凱的公文基本都由王士珍起草，最後發出去之前也會由王士珍做最後的審定。單單以對北洋軍務政務的熟悉瞭解程度而言，袁志凱都在王士珍之下。
慈禧命袁世凱上折「自辯」，王士珍自然要對這篇關係到袁世凱未來命運的折子詳加修改。王士珍已經在奏折上修改了十幾處地方，這些小的細節修改完之後，王士珍就盯著奏折看了好久。袁世凱從來沒有見到王士珍在一篇奏折上花過如此多的時間。但是袁世凱也絕對不去催促，既然王士珍認為要花這麼久的時間修改奏折，袁世凱就堅信的確需要這麼久的時間。
看到王士珍下定決心的提起筆，袁世凱心裡面一陣輕鬆。兩人一起這些修改奏折已經不知多少次了。這是王士珍下定決心時特有的神色。袁世凱靜靜端起了茶碗，無聲的啜飲了一口茶碗裡的白水，又悄無聲息的把水咽進肚子裡。他本以為王士珍會和往常一樣奮筆疾書，卻意外的看到，王士珍竟然把毛筆放回了筆架上。
「聘卿，不急，慢慢來。」在關係到自己身家性命上的大事，袁世凱不僅沒有催促，反而勸慰道。
王士珍卻說道：「袁公，就用現在這封折子遞上去吧。」
「哦？」袁世凱有些驚訝。他拿過改好的折子看了起來，這篇折子與其說是一篇誠惶誠恐謝罪自辯的折子，還不如說是一篇溫情脈脈的敘事家信。在這裡頭，先敘述了袁世凱與嚴復的交往歷史，又以袁世凱與陳克的認識過程為主線，將陳克在北京的所作所為陳述了一番。但袁世凱是何等人物，這篇奏折裡頭極為誠懇的提及了庚子事變是袁世凱對慈禧的效忠與效勞，北洋集團對朝廷盡忠的過程。雖然這些內容都是夾雜在袁世凱與嚴復交往的歷史中，但寥寥數語卻寫的情深意切。整篇折子竟然毫無虛言，只是說袁世凱作為一位忠厚長輩，對一位晚輩的關心。對陳克的描寫也沒有刻意醜化，也寫出了一位晚輩對長輩該有的模樣。
看完了折子，袁世凱忍不住歎道，「聘卿寫得好。」
這兩人都是一等的豪傑，他們都知道如果此時上了什麼「最該萬死」，「罪不可恕」之類的話，不過是給人平添借口。在這等危機關頭，對方擺明了不懷好意的時刻，袁世凱恰恰不能誠惶誠恐，反而要有理有據的據理力爭。
「聘卿，既然你已經寫好這奏折，方才為何想要大改？」袁世凱好奇的問道。
王士珍歎道：「袁公，陳克此人才具甚佳，我方才卻是有些想多了。」
袁世凱也是心有慼慼焉，「這等人竟然被我輕易放過，我現在也有些追悔莫及。」
聽了袁世凱愛才的話，王士珍立刻正色勸道：「袁公，陳克絕無投奔北洋的心思。即便第一次見袁公的時候，他或許有這麼一絲念頭。現在時機已經錯過，袁公萬萬不可對陳克心軟。此人已經與大清勢不兩立，與我北洋也成水火之勢。對此人決不可有絲毫輕視之心。袁公，我覺得如今之上策，莫過於調集北洋北洋六鎮，加上湖北新軍，江北新軍與江南新軍一同剿滅。萬萬不可輕敵。」
聽到這話，袁世凱忍不住苦笑了一下。他不是覺得王士珍的建議沒有可取之處，之所以苦笑，是因為現在的朝局根本沒有實現多路並剿的可能。
於此同時，在安徽鳳台縣根據地，人民黨軍委針對即將來到的反圍剿會議也進行的更加激烈起來。每次軍事會議中，章瑜都不喜歡最先發言，而每次軍事回憶中，章瑜都是要比較靠前發言。他又把最新的北京情報拿起來看了看，這才問道：「陳主席，北洋新軍會南下麼？」
「如果我們消滅了黎元洪和王士珍所部，北洋新軍一定會南下。」陳克明確的回答道。
聽這話之後，章瑜忍不住皺起了眉頭，陳克身為人民黨的領袖，人民黨的每次決策最終都是按照陳克的意見執行的。但這不等於同志們會俯首帖耳的對陳克惟命是從。章瑜並非不能理解陳克的計劃，在初期的時候，章瑜一直非常贊同陳克對敵人的判斷。不過他在軍隊中幹了一年多，軍事能力日漸增長的現在，章瑜反倒是越來越培養出謹慎的個性來。人民黨的對手滿清雖然爛，不過陳克的態度未免過於托大，萬一滿清偶爾發次神經病，稍微改變一下以往的作風，那人民黨立刻就會面臨危險的境地。陳克從不給自己這邊留下餘地的做法讓章瑜很是擔心。
「萬一北洋新軍領頭打來呢？」章瑜最終還是提醒道。
「北洋新軍領頭？」陳克覺得章瑜實在是在說一個最大的笑話。若是北洋新軍能成全國新軍的頭領，那滿清是絕對不會覆滅的。
袁世凱知道王士珍既忠於自己，也忠於朝廷。所以他也不願意對王士珍大潑冷水。但是現在的這個局面，袁世凱就算是能從陳克這檔子事情裡頭脫身出來，也不可能再被無條件的信任。北洋六鎮新軍都是袁世凱一手操練出來的。若是沒有袁世凱親自指揮，這些人也未必會乖乖的給滿人賣命。北洋新軍對袁世凱的忠誠這方面，王士珍可謂功不可沒。
既然不能名言此事，袁世凱只好討論起剿匪的戰略問題了，「聘卿，你覺得黎元洪不是陳克的對手麼？」
「黎元洪絕對不是陳克的對手。袁公，若是讓我帶3000人，千里奔襲，一夜破安慶，我是絕對做不到的。更別說陳克手中的兵馬還是他不到半年時間倉促聚集的。咱們北洋老底子裡頭有多少淮北人？袁公也知道，淮北這地方民風彪悍，幫派會黨眾多。陳克一個外鄉人按理是在當地無法立足的。但是陳克現在既然能立足，那當地的百姓跟了陳克，黎元洪帶了湖北新軍，安徽人不待見湖北人。我不認為黎元洪能贏陳克。」
袁世凱對這個觀點很是贊同，「張之洞現在明顯傾向於清流，我就算是去勸告他，他也只會當作耳旁風。我現在若是提出謹慎用兵，朝廷裡頭多少人立刻就要以此為把柄。黎元洪我是說不動的。」
王士珍知道朝廷的內鬥遠沒有結束，對於那些爭權奪利的傢伙會幹出什麼來，王士珍能想的明白，他正色說道：「袁公，若是黎元洪大敗，安徽南邊肯定就會大亂。江南新軍只怕就要去皖南一帶。我只有帶著江北新軍作戰了。若是局面變成這等模樣，我只請袁公派段祺瑞南下吧。」
「聘卿放心，我決不會讓你孤掌難鳴。」
陳克絕不相信以滿清現在的內部情況，他們能夠在短期內達成統一作戰的程度。最重要的是，滿清沒錢。章瑜聽了陳克的分析之後，雖然也贊同，但是他對北洋新軍很是忌憚。「陳主席，按你以前所說，我們打了安慶之後，大概有一年的戰略主動權。現在一年還不到，滿清就開始圍攻根據地，那這仗會打到什麼地步？現在北洋軍想進攻我們，有三條線路可以走，第一就是走河南，從阜陽打過來。第二走運河，從江蘇打過來。第三就是走武漢，從安慶打過來。咱們就算是有了情報，但是會不會防不勝防？」
陳克信心滿滿的說道：「所以我們要打內線作戰的模式，北洋軍無論怎麼打，首要目標都是城市。其實不止北洋軍，包括黎元洪也是如此。我不知道王士珍這個人會怎麼打，他可能會追著我們的主力打吧。但是也沒什麼可怕的，我們把主力駐紮在城市，王士珍總不可能先下鄉。等他們過來了之後，我們再撤入農村作戰就好了。」
「但是這真的行麼？萬一北洋軍直接進攻鳳台根據地怎麼辦？」章瑜還是有些擔心。不僅僅是章瑜，其他軍委的同志們都有如此的擔心。人民黨的主要工業都在鳳台縣，別的城市可以拋棄不要，而鳳台縣的工業中心是無論如何都要保住的。
章瑜素來追求穩妥，他接著說道：「我們的部隊現在就只有一萬五千人。黎元洪就不說了，王士珍如果掌管了江北的新軍，他手下可就有一萬多人了。江南新軍同樣有一萬多人，北洋六鎮哪一鎮都有上萬人。我們兵力並不佔多大優勢。更何況，夏收剛結束，我們的部隊集中訓練也不過一個月而已。這些現實的困難都不能置之不理啊。」
陳克笑道：「所以我現在要把部隊擴大到三萬人的規模。除了現在的部隊要集中訓練之外，根據地各縣都要開始徵兵。」
聽了陳克的話，何足道忍不住說道：「新建的部隊只怕不是新軍的對手。」
陳克耐著性子解釋道：「我又不準備讓這些人和新軍打仗，這些部隊只是配合一下主力部隊的工作。」
章瑜也不知道吃錯了什麼藥，他還是糾纏起北洋的事情來。「現在的關鍵還是北洋新軍……」
陳克再也不願意和章瑜在這個事情上扯下去，他一巴掌拍在桌子上。「章瑜同志，你是不是怕了？北洋有什麼可怕的？一群過渡時期的部隊，讓他們打打城市作戰，他們或許還行。和咱們打運動戰，他們就是群廢物。我這次親自領著你們打這幾仗，你若是覺得沒信心，你現在直說，我們不缺有信心的同志。」
所有軍委的同志都是第一次見陳克發這麼大的火，雖然大家都有自己的顧慮，不過每一個人想被扣上「臨陣畏縮」這樣的帽子。
陳克騰的站起身來，「大家怕什麼？不就是怕打爛了家裡頭的瓶瓶罐罐麼？大家覺得好不容易攢起了這點子家底，不忍心讓自己受絲毫的損失。我給你們說清楚，這種心思我覺得很好，但是你們把這心思給我花到替老百姓考慮上。敵人若是殺進根據地來，大家要有效的幫助群眾們轉移財產和糧食，讓滿清的部隊禍害不到老百姓。咱們內線作戰，要人有人，要消息有消息。滿清外線作戰，在根據地裡頭根本看到不到一個百姓，他們就是兩眼一抹黑。只要有了百姓的支持，咱們打一群瞎子還用害怕？天下有這道理麼？」
章瑜被一頓猛批，若是別人只怕臉上就掛不住了。但是章瑜完全沒有進退失據，他站起身來說道：「我只是擔心讓我獨擋一面，我是做不來。既然是陳主席親自指揮，那我就沒有一點可怕的。陳主席你下令讓我怎麼打，我絕對完成任務。」
華雄茂聽到這話，心裡頭別提多彆扭了。章瑜想獨當一面？那華雄茂該幹什麼去呢？不過在這個時候，華雄茂也不能再說多什麼了。他心裡頭給章瑜狠狠的記了一筆賬。等這仗打完之後，華雄茂準備和章瑜好好算算帳。
嚴復作為軍校校長，有資格參加軍委會議。他能記得自己的學生黎元洪，兩人雖然多年未見，不過好歹也曾經都是是北洋水師的。他說道：「陳主席，黎元洪此人做事比較小心，我覺得他不會輕易冒險進攻合肥吧？」
陳克剛發過火，此時餘怒未消。他的聲音**的，「就是因為黎元洪小心，他才會只進攻合肥。現在滿清朝廷裡頭黨爭複雜。張之洞若是想有所作為，他就必須在軍事上有所建樹才行。所以黎元洪必須盡快攻下合肥，這才能讓張之洞有資本證明自己的能力。所以黎元洪能打的目標恰恰是合肥。」
看著同志們不少人一臉茫然的表情，陳克覺得自己的軍事教育實在是很失敗，但是轉念一想，同志們沒有打過這等大仗。對手也不是新軍，倉促間不知道怎麼應用自己掌握的知識與力量倒也不是稀奇事情。
陳克問道：「同志們，我早就說過，滿清的戰爭模式是依托交通線，他們選擇的目標很少。大家都是從農村幹起來的，大家熟悉農村，瞭解農村。而且有足夠的行軍作戰的經驗和能力。但是滿清的軍隊沒有這種能力。你們不能憑空給滿清想像出這種能力。」
看眾人聽了自己的話之後，還是將信將疑。陳克大聲說道：「這次我親自指揮。大家若是覺得不敢打的，現在說，我可以立刻讓他脫離軍隊。但是，若是現在不肯走的，我怎麼指揮，大家就怎麼給我執行命令。我不論勝敗，我只看誰畏敵如虎，誰不能堅持完成任務。若是到了關鍵時刻還有人不敢打的，那就只有軍法從事了。」
軍委裡頭的委員根本沒有膽小鬼，他們之所以諸多疑惑，主要是是因為沒經驗。而且事情來的有些倉促，看陳克如此信心百倍，同志們自然不肯當了膽小鬼。所有人一起站起來，幾乎是異口同聲的答道：「堅決完成任務。」
無論是北洋集團還是人民黨根據地，雙方的高層都已經根據自己的經驗和能力認清了現在的局勢，確立了近期的軍事鬥爭方向。而慈禧卻沒有這樣的準備。她本來就不懂軍事，加上現在黨爭激烈，七十二歲的慈禧根本沒有精力關注此事。
政潮翻動，波譎雲詭，溢出常態。慈禧原想藉助清廉派來裁抑北洋派，結果反中北洋之計，搞了個顛倒。表面看來，北洋派是丁未政潮的勝利者，但也沒有佔到什麼便宜，清廉派失勢，北洋派亦未得勢，結局是兩敗俱傷。政潮後，慈禧對北洋的疑慮非但沒有打消，反而加深，她開始扶植別的親貴和老臣勢力來與北洋對抗。
因為陳克的事情，袁世凱遞上自辯奏折前，按理是不能主持朝廷差事的。慈禧立刻就連續幾天召見張之洞。她急切想找一個超然於這兩派之外的第三者來商議，張之洞無疑是很合適的人選。
開缺瞿鴻禨時，慈禧本想把奕劻也一併開去，慈禧召孫家鼐、世續、鹿傳霖等人密議奕劻的進退問題，孫等提出，驟去奕劻「無人接手，於事無益」。19日，慈禧命醇親王載灃入軍機處學習行走，意圖扶植載灃來抗衡以至取代奕劻。見此情勢，奕劻只好以退為進，提出辭職，進行試探要挾。慈禧考慮到載灃初入軍機，年青缺乏經驗，一下子還不能把軍機處的全盤工作拿起，瞿鴻禨已去，如奕劻再遵行引退，中樞機構很可能出現混亂乃至癱瘓的局面，當即降旨加以慰留，這實在是慈禧不得已的權宜之計。除載灃外，慈禧還重用世續、載澤、善耆等親貴。肅親王善耆、鎮國公載澤分別就任民政部和度支部尚書。一般史書將晚清重用親貴掌國的局面形成歸諸載灃，不太公平。其實，丁未後期，慈禧業已開始實行這一轉變。
瞿鴻禨罷職後，軍機處更形空缺，北洋想乘機把楊士琦塞進，奕劻為此特向慈禧推薦。而慈禧想援引孫家鼐入樞，孫卻自感「老病不勝重任」。不過，孫直言不諱地告訴慈禧，「士琦小有才，性實巧詐，與臣同鄉，臣知之最捻。蓋古所謂饑則依人，飽則遠颺者也」。反對用楊，推薦了老臣勢力中的另一重要人物鹿傳霖。鹿傳霖由此再入樞廷。不僅如此，慈禧還實行揚張抑袁並分袁勢的策略，授張之洞為協辦大學士，又授為體仁閣大學士，袁世凱的自辯奏折遞上之後沒多久，慈禧批示「知道了」，隨即同時任命張之洞、袁世凱為軍機大臣。軍機處形成新的組合，北洋一翼，有奕劻、袁世凱兩人，反北洋一翼，有載灃、張之洞、鹿傳霖三人，世續為騎牆派。北洋派在權力中樞機構內並不佔有優勢。
與這些內部消息一起傳到根據地的，就是黎元洪開始出兵的消息。