半個時辰之後，朱由檢在紫禁城養心殿召見了錦衣衛北鎮撫司鎮撫使嚴振綱。
現在朱由檢已經把寢宮和書房搬到了養心殿。這養心殿位於乾清宮西側，原來只做為紫禁城內的造辦處使用。朱由檢登基後，首先將上朝的地點設為乾清宮，可是乾清宮又同時是皇帝寢宮，未免有些不便。養心殿離乾清宮最近，所以朱由檢把這裡稍微收拾了一下，就搬了進來。
至於紫禁城的南半部分，三大殿本來正在維修，王恭廠大爆炸後，工程陷於停頓。禮部和工部多次奏請恢復修繕，朱由檢都予以駁回，他現在可沒這個閒工夫和閒錢搞這種形象工程。與此同理，焚燬的文華殿，至今仍是一片瓦礫。
而且朱由檢還有一個想法沒對群臣說，那就是他想把紫禁城南半部分那些閒置的殿閣都利用起來，做為政府機構的辦公地點。現在六部都有各自的衙門，但分處京師各處，相距頗遠。若能把這些衙門集中到一起，在這個交通和信息傳遞都很落後的時代，無疑能提高不少效率。
除此之外，他還要建立一系列新機構，這些機構自然也需要辦公地點。放著現成的殿閣不用，擺在那裡充門面，這種缺心眼的事朱由檢當然是不會幹的。
多日不見，剛剛升任鎮撫使的嚴振綱身著鮮艷的飛魚服，加上他為人又沉靜嚴肅，一看就帶著不怒自威的氣勢。
東廠和錦衣衛原來皆淪為魏忠賢的爪牙，平定閹黨叛亂後，田爾耕、許顯純等大批錦衣衛官員被捕下獄，東廠更是隨著宦官制度的廢止，直接被朱由檢取消了。
也有大臣上疏奏請朱由檢將錦衣衛也一併取消，卻被朱由檢堅決地拒絕，並將東廠原來的人馬也併入錦衣衛。由於這兩個部門在官員中口碑極差，此舉又引起了不小的非議。
朱由檢卻知道，錦衣衛及東廠設立的初衷，就是為了監督官員。在封建社會，權力缺乏有效的監督和制約，貪腐行為充斥官場。在這種情況下，指望貪官污吏自我約束，無疑是癡人說夢，惟一能懲戒百官的就只有皇帝。但皇帝只有一個人，官員卻有數十萬，皇帝就是再勤勉、再厲行肅貪，也難免掛一漏萬。
所以太祖朱元璋才會設置錦衣衛，直接對皇帝負責，在三法司體系之外，專門監督官員，並有巡察緝捕之權。可是這樣一來，錦衣衛就凌駕於官員系統與法律之上，他監督別人，卻沒有人來監督他，導致錦衣衛也漸漸貪腐，甚至以監督之名濫用刑罰，為自己牟取私利。
到了成祖朱棣時期，又不得不設立東廠，用對皇帝更為忠心的太監來監督錦衣衛。後果就不用多說了，東廠又凌駕於錦衣衛之上，為禍更烈，魏忠賢就是其中的反面典型。
雖然東廠和錦衣衛做了不少壞事，但朱由檢認為，現在的官場一方面**極其嚴重，另一方面，官員集團勢力異常強大。為了保住他們的既得利益，他們一定會對自己的各種改革推三阻四，陽奉陰違，導致政令不出京師，地方上仍然我行我素。
在這種情況下，錦衣衛的存在就很有必要了。它凌駕於官員系統之上，也就繞過了這個本身問題重重的系統，執行起皇帝的命令來也更為堅決。至於它本身缺乏監督這個問題，朱由檢只好暫且擱置一邊，通過任用自己信任、品行上佳的官員，將錦衣衛的副作用盡可能降低。等到以後進行全面制度改革，再制約錦衣衛不遲。
嚴振綱正是錦衣衛的合適人選，他性格冷靜，嫉惡如仇，又有一套刑訊的厲害手段，不管是多麼狡猾的犯罪分子，碰到他也只能乖乖招供。因此朱由檢登基之後，先是直接任命他為正五品錦衣衛千戶，後又升為從四品北鎮撫司鎮撫使。
雖然官階僅升了半級，但北鎮撫司鎮撫使的權力卻比錦衣衛千戶大多了，因為鎮撫使直接管著錦衣衛詔獄。詔獄是錦衣衛在刑部之外另立的監獄，也是錦衣衛的核心機構，所以雖然錦衣衛名義上的領導人是錦衣衛指揮使，但實際權力多在鎮撫使手中。
叩拜已畢，嚴振綱先向朱由檢匯報了這段時間繼續審理閹黨分子的情況。在他的嚴刑審訊下，田吉、田爾耕、許顯純等人又陸續供出不少犯罪事實，尤其又追繳出三百多萬兩贓銀。這些人現在是把能想起來的罪行全招供了，只求速死，因為在嚴振綱的手裡，活著比死了還難受！
朱由檢見也確實再審不出什麼了，便命嚴振綱向刑部移交犯人和卷宗，讓刑部依律定罪。然後又道：「朕現在給你一項新任務：嚴打京師的地痞、流氓、惡霸！」
嚴振綱微微一怔道：「聖上，錦衣衛一向是只對官員不對平民，這些人雖然為非作歹，似乎還是該歸順天府管轄吧…」
朱由檢卻搖頭道：「若順天府能管，朕也不用你親自出馬了。這些社會渣滓之所以猖獗，正是因為衙門裡有人充當他們的保護傘！」
他將黃宗羲仗義執言，反被地痞毆打的事講給嚴振綱聽，末了忿忿地道：「黃宗羲已經報官了，可是有用麼？現在大明正處於內憂外患之中，這些人卻還在凌虐百姓、欺行霸市，且還官匪一家，讓百姓投訴無門，是可忍孰不可忍！
「不過，要根治這些社會的毒瘤，首先得先清理官場，剷除他們的保護傘。朕的主要精力現在只能放在軍事上，暫時顧不上刷新吏治。治不了本，治治標也是好的，所以就用得上你的錦衣衛啦！」
接下來朱由檢將嚴振綱喚至近前密授機宜，嚴振綱聽罷苦笑道：「陛下，這麼做是不是有點…」
「有點無賴是吧？」朱由檢哈哈大笑道，「有時候對付無賴，非得用些更加無賴的手段不可！」
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