戰況容不得松田啟人細想，不兩分鐘，孫悟空獸敗退下來。插上白色翅膀的古拉獸搖晃著飛到空中，可這樣不靈活的巨大物體只能成為靶子。松田啟人焦急地翻找著自己的卡牌，希望能找到用得上的卡片，「要是有藍卡就好了！」
破壞音波拳(kobu**one)！！
從山的那邊發出的低周波阻擋了百萬龍獸和十億龍獸繼續攻擊。鋼鐵豆豆獸、裝甲獅子獸、暴羅剎獸紛紛現身。
「這是設計好的嗎？」松田啟人驚訝地看著出現在戰場上的完全體。
百萬龍獸、十億龍獸敗退，但僅憑完全體還無法拿下它們。
「伏擊？你們怎麼就能肯定這不是聲東擊西呢？」大蛇獸哈哈大笑著從山腹中迤邐而來。
天叢雲劍(amenomurakumo）！！
響尾蛇般的短尾震顫間如劍一般鋒利，輕易擊敗怪蛙皇。而它的那七個頭各有屬性，可以同時突出冰、水、火、雷等等吐息，僅僅大蛇獸一人，眨眼間就挫敗暴君國度好幾隻完全體和成熟期數碼獸。只有古拉獸因為防禦超強頂住了火焰攻擊。
「哈哈~這才是真正的伏擊！薔薇獸，給我捉住那條大蛇！」被薔薇獸拉著在空中飛行的豪德寺瑪麗突然跳下來囂張道。
荊棘之鞭（thornwhip）！！
不僅薔薇獸，混沌海龍獸也來了，兩隻究極體從兩個方向圍住大蛇獸。
「可惡的小蟲子，若不是這該死的數碼世界不能進化，我早就碾死你了！」大蛇獸帶著一點憤恨道。它左側的蛇頭噴出熊熊烈焰，體型嬌小的薔薇獸在它面前真如蟲子一般。
吸收無數敵人資料的大蛇獸因為進化缺失的禁錮無法進化成究極體，在dp值上卻實在已經超越了無數究極體，這火焰僅僅是普通攻擊，但其規模和熱度也已是非同一般。
如此大規模的火焰吐息不僅逼退了豪德寺瑪麗，更破壞了第三新東京市的運輸隊伍，人員物資損失慘重。此情此景終於讓松田啟人再度爆發，古拉獸超進化為大古拉獸。
但目的達到的大蛇獸卻不再戀戰，用兩顆腦袋抵掉了混沌海龍獸的究極波浪炮(ultimatestream)後在大火中隱遁。
另一路隊伍中，生化蓮花獸、鋼鐵猩猩獸、超級安杜路獸，再加上籐枝淑乃和薔薇獸x也只是勉強擋住殘酷獸ex的肆虐。不，正確的說應該是殘酷獸ex輕鬆突破了四隻究極體的包圍圈，戰鬥中毀掉的山石堆滿道路。這條路線短時間是清理不出來了。
「該死~！我小看了這些傢伙的膽量，它們居然敢侵襲到如此靠近暴君國度的地方！」憤怒的生化蓮花獸一腳踢碎一座小土丘。
「更令人擔心的是殘酷獸ex的戰鬥力……」籐枝淑乃咬著手指道。
這就是武力型世界的悲哀，沒有最強武力坐鎮的勢力就像沒有殼的雞蛋，一點安全感都沒有。或許，高石武的想法也是因此而來。
就是在這種情況下，陸峰帶著織本泉和貝露絲塔獸回到暴君國度。得知巨城飛昇的消息十分震驚。隨之而來的便是極大的擔憂——當初留在大阪都的大門大等人都沒有歸來！！
「我不相信他們死了！」陸峰凝聲道，但那微顫的語氣卻卻顯示出他的信心不足。
大門大好歹也是第五部主角，開著光環掛的他是不會死的吧！還有神原拓也、源輝二……黑崎美樹可不能有事啊！只把人名在腦海一過，便能看出野口郁人、大門知香、愛麗絲在陸峰心裡的地位還是要差了很多。
他是真沒想到人類世界的局勢會發展到今天這一步。雖然日本整個消失掉的確是個好消息，但如果代價是部下or好友的生命……
陸峰一點也高興不起來。
「現在我們能送人回人類世界嗎？」仰望星空，陸峰注視著那巨大的現實世界球體。
「第三新東京市已經回來了，沒有地面站的接引，我們不能像以前那樣自由來往兩邊了……」奈奈美攤手道。
真正的專家基思·麥考伊想了想回答：「如果能把世界傳送門的功率增加到百分之一百二，倒是有希望在數字地球上打開一個缺口。但能否通過數字地球的封鎖，只能看運氣了。」
聽了這話，奈奈美連忙擋在陸峰面前：「你現在可不能去人類世界，殘酷獸ex正對我們虎視眈眈呢！」
「但這件事也不能不管啊！」生性善良的籐枝淑乃表態道。
「乾脆組建一個精英小隊，把他們派遣到人類世界，至於能做到什麼程度就靠他們自己了！」奈奈美一臉喪氣道，滿臉的表情都在告訴大家這已經是她能想到的最好方法了。
於是經過精挑細選的隊員們開始在巴別之塔頂層聚集。瑪利亞、羅伯特、加門健太郎、一乘寺賢、井上京、火田伊織、莉莉·羅捨福爾，再加上特別「邀請」的巴克科斯獸。總之，無論從哪個角度來看，這只所謂的「精英」小隊，都和精英半毛錢關係沒有——因為一乘寺賢的搭檔飛蟲獸也沒法進化成究極體，這就是數碼世界的現狀。
至於理論上最應該被加進隊伍的松田啟人，雖然他最近表現很活躍，但資歷太淺，基爾獸的進化雖然被注意到，但數碼獸都是一群情報敏感度無限趨近於零的傢伙，不知道何時陸峰才會知道松田啟人就在他手下，甚而古樂獸也在暴君國度……
世界傳送門那如音叉的巨型堅定被無盡的綠色數碼符淹沒，繼而星河般逆衝上天，逕直轟在巨大的現實世界球體上，打開一個小小的缺口。將這只「精英」小隊送入數字地球…
……
有的人想回到人類世界，有的人卻想進入數碼世界。李連傑和李建良兄弟倆在毀滅龍獸的幫助下迅速解決網絡管理局的監視人員。和李建良不同，在獲得多路戰龍獸親睞後，在得知父親李鎮宇的光輝事跡後，李連傑可是深入鑽研程序語言，雖然遠不能與野生動物小組那批相比，卻也不會輸給山木滿雄多少。
「數字地球已經完全封閉，但要調動軍隊進入數碼世界，他們肯定會留下通道。問題在於要如何或許通過的權限……」
而當數字地球突然發生震動，被打開一個小缺口時，李連傑知道，最好的機會來了。
「龍之領域會在對面接引我。」
陽台上，李建良注視著李連傑被一道光芒籠罩，緩緩升到天上。「哥哥，你真的要去數碼世界？不能帶我一起去嗎？」
「數碼世界的戰鬥將更加危險！你就留在這兒吧，爸爸和小春更需要你照顧！」李連傑如實道。
因為兒子的「叛逃」，李鎮宇被網絡管理局私下通緝。李鎮宇亦是人精，在警衛抓他之前便察覺到異常，在巴別和科莉的掩護下，以一手精湛的太極拳從防衛重重的網絡管理局新大樓逃出。
回到家逼問之下，才第一次知道了毀滅龍獸，知道了龍之領域。「數碼世界的數碼獸們，已經進化到這種程度了嗎？」李鎮宇無力地躺在沙發裡，「可連傑該怎麼辦呢？」
頹廢只是一時，像李鎮宇這樣可以放下工作和家人只身前往香港拯救好友的人可不會被這點兒小事阻擋。「立刻收拾行李，我們去美國……不，去歐洲！」
因人流暴增而還稍顯混亂的那霸機場，李鎮宇通過自己的技術輕鬆「弄到」全家人的機票。在追捕人員到來之前，坐上飛往奧地利的飛機從容離開。
美國，數碼vt公司地下監獄。彩羽尼奧和倉田明宏帶著牧野留姬、城崎慎一郎走過陰森的過道。
這個地下監獄關押著從時空晶界抓來的所有人。時空晶界的毀滅是在數碼vt公司控制下有計劃的被毀滅，當時裡面還活著的人類都被帶到這裡。粗略算下居然有數萬人之多。這麼多人自然不是普通監獄能容納的，現在他們全都被注入安眠藥，裝在棺材一樣的器械裡。
「好陰森……」牧野留姬還不清楚過道兩旁那一排排金屬箱裡裝著的是什麼。
擁有數碼獸搭檔的又是另一類，諸如愛麗絲、野口郁人他們被單獨關押。這其中，大門大又是最特殊的一個。
「人形數碼獸！這是如何做到的？」彩羽尼奧貪婪地注視著大門大。在機器的刺激下，大門大體外燃燒著一層橙色的數碼之魂，卻又彷彿加入某些其他變化。被彩羽尼奧認為是具有重大價值。「你叫做大門大是吧，早聽托馬提起過你，你似乎有種很奇特的能力，能和任何數碼獸打成平手，哪怕對方是究極體，也不例外！」
彩羽尼奧伸手一招，數股看不見的力量於虛空中聚合，彩羽尼奧的得意武器，混沌獸出現了——因強大的力量無法平衡，融合產生的歪曲都彙集到雙臂上，導致其膨脹到駭人的程度，這間極為空曠的倉庫也只能使他勉強存身。
瓦爾德獸的翅膀、八足馬獸的鐵蹄，無法控制的力量呈裸露狀在雙肩奔流。電腦核（digi－core）無法容納在體內而是像兩個眼珠子一樣位於身體的中央。不經抑制的能量波動使得成長期單單靠近便會被徹底絞殺。這不是混沌獸，而是超越混沌獸那樣的特異（bug）數碼獸所使用的總稱——究極混沌獸！
帶著恐怖的力量，究極混沌獸一拳轟來。
與此同時，限制大門大力量的機械脫落。儘管不願，大門大也只能舉拳相迎——番長神威（shiroukamuiofbao）！！番長神拳（bao』sboxingastheheroes）！！！
砰~~~~~！！
灼熱的數碼之魂在山呼海嘯中炸裂。
出乎意料的是，那只與大門大相抵的拳頭忽然動作，抓住大門大，猛地往上拋去，同時雄厚的數碼之魂瞬間貫通大門大四肢，去除了他手腕腳腕上的控制器。
「這是！？」身為人形數碼獸的大門大當然不會被區區天花板傷到，他立刻意識到究極混沌獸是要放他走！可這是為什麼？