至於從浙江搜羅來得難民，總參建議在台灣設立中轉地。
難民先到台灣，在台灣的營地內「囤積」一階段之後再轉運回臨高。一部分人可以直接留在台灣，開台灣的土地，形成第二個殖民地。
當然，台灣的局面要複雜一些，上面多多股勢力，包括荷蘭人、西班牙人和鄭芝龍在上面都有自己的地盤：荷蘭人控制大員，鄭芝龍佔據北港，西班牙人佔領雞籠（基隆）。大體從台北到台南的，沿著朝向大陸的海岸線展開。台灣的土著、馬來移民和日本人在當地也有一點小勢力。
不過，這些勢力的規模都很小，佔據的地盤也不大。荷蘭人、西班牙人和鄭芝龍，其勢力不過是以一二個城堡支撐點為核心，佔據周邊很小的一塊地盤。除了貿易之外就是收取福建薩民和土著民的貢賦。
後者的比例很小。除了鄭芝龍在當地有一點組織移民搞農業開之外，歐洲人佔據這些地方的主要目的還是充當貿易據點和收集當地的土物一主要是台灣的鹿皮。
以穿越眾的海陸軍實力來說，消滅這些勢力易如反掌。根據歷史資料：西班牙人在雞籠的全部守備力量不過90名歐洲人，再加一二菲律賓徵集來得輔助部隊。荷蘭人在1631~1632年還在修築熱蘭遮城，
全部歐洲人駐軍不超過400人。其勢力範圍在城堡外30公里即到了極限。1630年甚至差點被台灣土著目加溜社逼走。到11635年東印公司大規模增兵之後才開始大規模討伐周圍的原住民村落，擴大統治區域。
因此這些勢力在陸地上的威脅性都很小，說不堪一擊也不為過。
派遣一個步兵營加強少量炮兵就足夠橫掃全島。但是在海上狀況就要複雜一些。荷蘭人現在是貿易夥伴，而且它在東亞的海上實力有限，不會冒著觸怒元老院的風險來採取敵對行動，西班牙人在台灣附近海域只能算是「存在」。
唯一的障礙就是鄭芝龍。福建沿海是他的主要活動區域，海軍的運輸船隊經過這一地區，甚至就在台灣島上登陸，修築中轉基地，這事絕對是瞞不住他的，如果他要動干涉，對動機行動就是很大的阻礙。
如果是通過台灣海峽。以和諧輪的噸位、武裝和護航戰艦的戰力來說，鄭芝龍除非動大規模的海戰，否則幾乎不能產生什麼威脅。
海軍在圖上推演中，扮演鄭芝龍一方的很少能夠在台灣海峽捕捉到運輸船隊經過。換句話說，在當時的通訊航海水平下，鄭芝龍就算存心要開打，也不見得能捕捉到戰機。
但是，若是要在台灣本島靠岸停泊，勢必要出入台灣沿海港灣，鄭芝龍就會有很多作戰機會了。這一點是要放入考量中的。
大家認為，在台灣開設基地是有必要的一從開價值來看，台灣高於海南。但是到底選額哪裡作為中轉基地有不同的意見。被列入選擇的有多處，包括雞籠、台南、huā蓮、高雄等處。
西班牙人佔據的雞籠、淡水被先否決。儘管雞籠附近有豐富的礦產資源，有著名的基隆煤礦和金瓜石金銅礦，但是開難很大，而且地理環境極其惡劣。需要投入大量的人力物力進行整治。
當時人的記載對此地也無好評：「雞籠（keeang）及淡水（tanooei）
並非優良之碇泊地1加上附近之番人兇惡1無法交往二」、「君不聞雞籠、淡水水土之惡乎？人至即病，病輒死。凡隸役聞雞籠、淡水之遣，皆欷頤悲歎如使絕域：水師例春秋更戍，以得生還為幸。彼健兒役隸且然1君奚堪此。」
雞籠、淡水都位於台灣北部1這裡是全島降水最豐富的區域1每年降水量在3000毫米以上。在通常年份台北有半年時間都在下雨。雨水過多的區域有利於植物和微生物生長1但不利於人類。因而明清時期的福建人將台北稱為瘴癘之地移民在當地的死亡率很高。把中轉地基設在這裡，死亡率是可想而知了。
台灣比部在1694年還有一次大地震。強之大直接在台北盆地內震出了一個30平方公里的台北湖。無論從哪個角來看，台北地區都不是穿越眾應該涉足的地點。
huā蓮也得到了很多人的支持。huā蓮的優勢是安全性極高。它偏處台灣東部，與台灣島的其他地方又山脈阻隔。周圍地形險峻，大多數地區都不適合船舶停靠，沿岸大多是非常陡峭的海岸地形，只有河口有停船的地形。只要在河口建立基地，從其他地方根本無法登陸。歷史上huā蓮在1932年公路通車前與台灣其他地區的聯繫只能靠船運，被稱為台灣的「陸上離島」。整個17世紀，除了1622年西班牙去過huā蓮采砂金之外，沒有人對這塊地方感興趣。
huā蓮礦產資源比較豐富，其中穿越者能立即開採的有三種：硅酸鹽的蛇紋石石棉礦，大理石、石灰石。huā蓮到21世紀都是台灣最重要的水泥產地。可以做出高標號的水泥就地供應開台灣。當地還有少量的鐵礦，儲量不大，但是開採容易。另外huā蓮的蛇紋石礦有不少都伴生絡鐵礦磁鐵礦還有鍋鎂。huā蓮的地表當時應該除煤礦外都或多或少的有零星分佈，很適合臨高這種規模小的集團去展開採。
淡水資源上，huā蓮有三條比較大的河，有不少面積不算小的衝擊平原，去種地展農業也有一定的潛力。
但是最後，huā蓮的雨水過多使得此地落選了。雨水過多造成當地的環境不適合大規模移比。日踮台灣期間曾經打算向huā蓮移民建立農業屯墾區，最後因為氣候和疾病的關係最終失敗。
最後列入考慮的就是屏東、高雄一帶了。此地正在台灣島相對適宜居住和農業耕種的台南平原上，高雄有港口，儘管當時的港口未經過整治，無法停泊大船，但是停泊千噸級以下的帆船還是能做到的。
屏東、高雄以南是山區，以北是荷蘭人的勢力。目前荷蘭人和元老院有商業協議，雙方保持著一種「和平」的商業合作關係。荷蘭人即無實力，也不敢冒著得罪大供貨商的危險來攻打屏東、高雄的中轉基地。荷蘭人還可以起到隔離鄭芝龍的作用。況且以鄭芝龍目前在福建沿海的忙碌火並的狀況來說，他也不見得有空來對付「境賊」。
「我們把浙江移民運到高雄屏東，不但可以有一個合適的地點進行檢疫淨化，一部分人還可以就地開展農業開。嘉南平原是台灣最好的農業生產區，不論日照、雨水還是土地都是上等的。我們完全可以以大型農場的方式進行集約化開，比在海南這裡小農經濟據多的生產環境要好得多了。對我們的農業生產來說將會是個飛躍性進步。可以大幅改善我們糧食基本要靠進口的局面。」羅鋒在力陳以高雄為基地的好處的言結尾如是說。
「鄭芝龍要對我們不利怎麼辦？他的老窩可就在福建。」有人提出了異議。鄭芝龍把福建視為老巢，他又有官身，勢力不容小覷。
「我們沒必要害怕他的帆船艦隊。1631年底，我們的854改和第一批901完工之後，我們的艦隊在台灣海峽就是神一般的存在。將蒸汽機艦隊前進部署到高雄，對通過台灣海峽的我方船隻進行區域護航。」海軍的參謀李迪說道「我海軍在海南島周邊直至港島有充分的制海權。
蒸汽機艦隊進駐高雄，即可威懾福建、浙江沿海的各股勢力不敢輕舉妄動。保證北上濟州島，南下港島的安全。」
具體措施是組建兩支分遣隊。以854改和4艘901為核心的台灣分遣艦隊駐泊在高雄，負責監視浙江、福建、廣東沿海。重點是保證台灣海峽的「自由航行」。護送運輸船隊通過。以搬3艘901為核心的登萊分遣艦隊駐泊在濟州島，隨時對山東沿海和渤海灣地區執行干涉任務。
除了混合動力戰艦之外，分遣隊還編入若干經過改裝的大噸位的風帆戰艦。兩支分遣隊的戰艦採用分區護航的方式，運輸船隊在航行途中結隊航行，每艘運輸船都配有足夠的自衛火力。
這7艘萋汽機戰艦預計在這一海域活動到1633年的年初。到這個時候，第二批在臨高建造建造的901艦已經能夠投入現役，即可將前一批戰艦接替回臨高進行維護。
這兩支分遣艦隊將以高雄為主基地。為蒸汽機，風帆混合動力戰艦提供後勤支援的港口設施和儲備的物資要比風帆戰艦複雜的多，因此北上接運難民的船隻也不會有空載噸位的憂慮了。除了運送難民所需的物資之外，在高雄和濟州島兩處開設分基地的所需要的物資也足夠塞滿船艙了。！。