剿滅了商團還沒有組建完成的武裝後，高振引領著馬湘和廖仲愷巡視士兵，蔣介石趕赴黃埔島，準備讓黃埔學生進城協助維持治安。
巡視完新兵營後高振等人先到大元帥府報告了此事，孫中山對獨立營的戰鬥力感到高興，但是對於事態的展則有些猶豫重重。尤其是高振未經允許私自帶著武裝在廣州城裡面和商團的人交手，這種行為不僅僅是引起了商人的不滿，就是連胡漢民他們幾人也在自己面前要求懲處高振。只有一直要求政府武力解決商團問題的**在這方面支持高振的這次行為。
「總理，學生魯莽了，請您訓示。」高振從動手前就分析出動手的結果，動手就是為了能夠防範於未然，我幫你作了這個後患，你不誇獎我也無所謂，只要別削我的職就成。
「知道魯莽了？」孫中山裝作怒氣的瞪了一眼高振，商團的事情他不是沒有考慮過通過武力解決，只是現在還能夠容忍他們，而且他也看出了高振的小九九。
「學生過於激進了，請總理訓示。」高振乾脆的低頭認錯。
「你給我分析過商團的事情，我也不是沒想過這麼幹，只是人家畢竟以前對革命有過貢獻的，你現在這麼一干倒是乾脆，後面的事情想過沒有。」說著說著，孫中山的語氣慢慢的平和了，像是在教導高振應該顧全大局，事情都想好之後在從事。
「總理教訓的是，學生肉眼愚眉，沒有從全局去考慮。」
孫中山聽到這句話下了書，抬起頭拋出了一抹欣賞的目光：「知道自己的不足就要去改進，下回遇到這種事情先稟報，這樣你也能師出有名。」
高振恨恨的點了點頭之後，廖仲愷走了進來，倆人就事態分析了將要可能生的事情後，孫中山決定此事全權交給廖仲愷負責，被俘人員也都交給高振負責，因為孫中山最近的工作重點放在北伐上邊，也想鍛煉鍛煉比較你年輕的班底。
「忠革，這件事情上你處理的行為很及時，而且還俘虜了陳廉伯等人。你們能夠俘虜他們，這讓商團的武裝近乎於瓦解。不錯，忠革，處理完這件事情之後你把獨立營整編一下，北伐的時候我們可是要用到你這支部隊哦。」孫中山安排好所有的事情後滿意的看著高振邊點頭邊欣慰的說。
「總理您過獎了，學生只是做到該做的。」高振心裡面也很高興，不過還是難以遮掩眼神裡哀傷的神態，來到大元帥府的時候，胡宗南報告說又有6名士兵不幸逝世了。
離開了大元帥府，高振和廖仲愷回到了革命省政府，這裡已經趕來了許多的商人，大部分都是廣州商團裡的商人，他們需要政府為今天上午的事情有個交代，賠禮和道歉。聽到他們的言論之後高振勃然大怒，看到他的表現之後商團便趕緊把一切幻想都拋到了腦後，表示一定支持政府的行為，一定服從政府的政令。
高振和廖仲愷都知道這幫商人都是人前人後兩個面，並不得以相信，不過為了能夠迅的讓這次事件能夠平定他倆還是和商人好好談了談。出於默契，在會議當中一個演白臉，一個扮紅臉，廣州商團的團隊在這次衝突後已經損失殆盡，本來打算組建的4ooo人也已經不可能了。
「這位軍官，我們絕對不會同意你們的方案的！」一名商人拍著桌子怒聲大吼，其他的商人也紛紛表示這個方案太過於苛刻了。
高振坐在那裡，眺了一眼：「不同意是麼？我記得陳廉伯先開始也是不同意啊，這怎麼辦好呢？」
廖仲愷內心偷笑，這個忠革，哎。
高振嘴裡一蹦出「陳廉伯」著三個字，會場陷入了寂靜的沉默，還在叫囂的商人臉上火辣辣的，有些尷尬。來之前，他們已經聽說了陳廉伯被拘捕在了大元帥府，這個軍官說的話好像是在警告自己莫要學了前人。
「廖部長，我先說一下，這件事情的理可不再你們這邊。全中國的商團都可以買槍，為什麼我們買了就要被你們扣押，我覺得你們應該向我們道歉，把槍支、團丁還有陳家的兄弟都還給我們，不然……」商人代表說著說著，臉上不自主的露出了一絲猙獰的面孔。
「這……」廖仲愷聽到不知道說什麼好，求助的把目光投向了高振。
高振像是沒有聽到商人的話，自娛自樂的跟那裡掏著耳朵，彈掉了手上的耳屎之後正了正面孔，頓時變得嚴肅起來，平淡的看著坐在對面的商人代表說道：「不然怎麼樣？」
「罷市？還是調動你們其他的武裝？」一句反問讓對方說不出話來，看看商人代表流露出的臉色，伸展一下疲憊的雙臂：「那你們那還來這幹什麼，回去該幹什麼幹什麼不就完了，我還正愁這回繳的槍和人不夠呢。你們這裡誰想陪陳廉伯的話，先在這裡大聲招呼，別到時候怪我沒實現你們的願望，讓你們見了閻王。」
商人代表炸了窩，沒想到一直禮讓自己等人的政府，竟然開始威脅自己。
廖仲愷也沒想到高振會說出這話，趕緊解釋道：「各位，別著急。聽我說兩句，其實用武力解決你們商團不是我們的意思，蘇俄顧問和**那方面一直在向總理施壓，但是都沒有被允許。而你們這回一下運來那麼多的槍械，忠革他也是為了能夠盡量保護你們的利益，不得已才下令圍剿陳廉伯的。你們想想，為什麼我們只抓了陳廉伯，對各位的工廠和家屬分毫未動不也是正面撇清了你們和陳廉伯的關係麼。」
有幾個人聽到廖的話點頭稱是，高振趕緊說道：「其實大家沒必要這麼劍拔相見……」
……
在會議上一再妥協之後，雙方達成了諒解：一，廣州商團不得在擁有武裝力量，革命政府會在一定情況下派兵維護商團利益。二，廣州商團下屬在革命政府管轄權企業須制定最低保障收入和每天最高9小時工作時間。三，革命政府有責任維護廣州商團下屬在革命政府管轄企業利用，如有罷工等運動須先由政府同意才可實施，未得同意的運動視為暴力破壞經濟。五，商團所有武裝部隊交與政府整編，歸於政府編制（獨立營）。六，所有服從此條例的廣州商團下屬企業享受減免1/6稅收。
所有的商團代表和高振、廖仲愷都在這份協議上簽上了自己的名字，雙方在這上面都得到了一定的好處，也付出了一定的代價。政府這一邊，不僅要為保護廣州商團的利益，還需要減免稅收，而且還可能會被某些人咒罵；商團這邊呢，需要付出的更多一些，而且還不能擁有武裝部隊。但是雙方還是都願意接受這個條例，也選擇一些條例為秘密條例，暫時不想外公開。
拖著疲憊的身軀回到了獨立營，上午在作戰結束後，獨立營一直在等待黃埔學生的趕來，直到快到了晌午，黃埔軍校的學生們才被學生隊總隊長張治中等人帶到此地，短暫的交接之後，獨立營扣押著士兵和槍械奔赴黃埔島，同時回來的還有犧牲的同伴。
高振到達島上後立即為犧牲的士兵舉辦了簡短的入殮儀式，在全營軍官士兵的脫帽下，他們被埋葬在了獨立營的營帳內，高振特意讓人開出一小片場地，作為他們的墳地。警衛排找來會雕刻的石匠開鑿了一些石碑，每個石碑上面都刻寫上「忠革英魂永垂不朽」八個大字，斜鋪在他們的墳地上（就像西方式的墳墓）。
之後炊事班從黃埔軍校端來了晚飯，全體軍官士兵一同用餐，飯間沒有幾個人說話，大部分人都在埋頭苦吃，眼睛裡還閃爍著淚花。文書趙謙從大元帥府領回了撫恤金之後便郵寄回了他們的家鄉，高振在每封要寄出的撫恤金裡面塞進了一封自己親筆信，信上面說希望他們能夠看到此信的時候節哀順變，並表達了自己內疚的心情，同時也希望他們在遇到困難後能夠寫信送來獨立營……
這種失去戰友的情緒在獨立營裡面持續了很久，被整編進入獨立營的團丁們也受到了很大的敵視，高振一邊告訴他們要總結經驗的同時希望他們能夠同視剛剛編入的新兵（原團丁），大部分士兵在高振放話後都慢慢的選擇了接受，開始幫新兵們盡快的掌握獨立營的戰術知識等。
時間來到了9月5日，大部分的新兵已經接受了近兩個月的訓練了，以前的一些隔閡也隨著一次次的配合訓練、一次次的一起挨罰、一次次的一起上課被消磨殆盡了，高振也被孫中山任命為上校，同時獨立營也被擴編為獨立團。如果只說他是團級單位的話，難麼顯然它是嚴重的編了，總共18oo多名士兵和軍官被分為了3個加強營，每個營的營長由原來的連長暫時代理，連長由排長代理，排長由班長代理，當然這種代理都是要經過嚴格的考試才可以通過的，如果你說誰來出考題，還可以客觀的支出問題的話，你就要看看高振組成的德**事顧問團了。
「高，你應該為你所做的事情負責！」鮑羅廷憤怒的指著高振大嚷道，翻譯張太雷面無表情的看著高振把話原封不動的反應出來。
高振看著坐在對面的鮑羅廷竟然這麼囂張，也拍著沙怒氣沖沖的說道：「我負責，怎麼了？我當初跟你要你不給我，現在我自己雇一個顧問團你又來跟我火急，你應該告訴我你是什麼意思吧。還有，把你的手給我收回去，最起碼的禮節你都不知道麼？」高振很忌諱別人用手指頭指著自己嚷來嚷去，鮑羅廷的行為無疑惹怒了他。
孫中山臉色嚴肅的看著兩人的行為思索著，面色沉重著看著倆人。
「高，你這是違反聯俄政策，我要求你必須把你的顧問團撤掉，這是我們共產國際的決定。」鮑羅廷訕訕的收回自己的手，據理力爭的說道。
「不好意思，我是國民黨員，而且你也只是一個顧問，我沒問你你就來光顧我，是不是有些越職呢？我看應該是我給你的組織寫一封信，是你在破壞合作吧。」高振看著他桀驁不馴的表明了自己的有意思，就是沒戲，你跟誰說也沒戲。
「你……」鮑羅廷聽到這句話被將的說不出話來，扭頭看著默不作聲的孫中山，希望他能夠表一下意見。
為了這件事情，高振可是跟蘇聯顧問在孫中山面前爭論了好幾回，每次他都在孫中山面前將蘇聯顧問的軍，我自己花錢顧得你管的著麼，當初找你們你們說了只能指導，現在我自己顧個你們又來管我。孫中山在這件事情的態度上出於中立派，先他知道德國6軍的實力，其次為了「聯俄、聯共、支持工農」三大政策又不能放棄蘇俄方面的，所以只好選擇中立，稱這是高振的個人行為，與政府和國民黨無關。
高振僱傭的顧問可都是真才實學，其中有前德國總參的軍官鮑爾，是個炮兵專家；赫爾曼.克裡拜爾，高振的熟人，原來老希那邊的；喬治.魏采爾，前德國國防軍總參作戰處處長，是個名將；漢斯.馮.塞克特將軍前德國國防軍總司令等12名德**官。他們都是高振精挑細選請來的，例如塞克特，人家原來是德國國防軍之父、魏瑪共和國國防部部隊局局長，好不容易才給人家請來的，怎麼可能說走就走。
高振為每位顧問配備了秘書，同時跟隨顧問一起前來的還有一個標準的炮兵營設備，該營編制如下：2個榴彈炮連（8門克虜伯12omm重榴彈炮，1個戰防炮連（4門德國19o2式6omm射山炮），1個輜重隊；這支炮兵營的組件完成霎時間吸引了粵、桂、陳炯明、蔣介石的目光，孫中山和蘇俄顧問也特意為此事詢問高振。在孫中山那邊他詳細的講解了自己的計劃，就是總理北伐的時候，這支加強團可以從當先鋒部隊，也可以留守在廣州提防陳炯明等人，也詳細的把武器、經費的來源告知了孫中山，這批軍火的錢大部分是繳獲陳廉伯的時候獲得的，通過廣州商團才把炮送上了島上。跟孫中山說清楚了此事，在這位偉人面前沒有什麼必要隱瞞，當然許多東西你不問我也不會說。蘇俄那邊他含糊其辭的混了過去，但也經常被問及。
現在高振手上的部隊全部加起來一共22oo人左右，而且有些營還沒有真正的形成戰鬥力，例如炮兵營就是戰鬥力最差的部隊，剛剛組建完成，大部分的士兵剛剛學習完如何操作火炮正在培養火炮方面的戰術。而步兵方面雖然人數有所增加，又經過了兩個月的訓練，但是還是沒有展現出原來一個營的實力。
同一天，他得到兩個消息，這兩個消息讓他有喜有憂，第一個是江浙戰爭爆；第二個就是蔣介石準備組建黃埔的教導團，看來他在沉寂了很久之後又要開始爆了，同時讓高振和蔣介石倆人有些頭疼的就是獨立系的士兵人開始看不起黃埔系的學生，而黃埔系的學生也看不起曾經被黃埔考試淘汰的獨立系。倆人聽聞此事後沒有特別的表態，有時候在一起還互相開玩笑稱一個小小的黃埔島竟然出了兩個派系，不過這也證實了黃埔島上微妙的關係。高蔣二人可謂好友，能扶對方的時候絕不踩，但是各自下面的卻不一樣，高振士兵在一入伍時的第一堂課就是軍人不干預政治，只嚴格的服從命令；蔣介石的學生卻是認為身為黃埔和革命軍的軍官應該在政治和軍事上都要有所獵及。雙方的人見了面先開始只是爭吵，然後是大打出手，最後是互相當對方是空氣。
先開始的時候，有些比較富有**的黃埔學生還會主動的挑釁，但是往往是被在場的所有獨立團士兵一頓暴打，美美的回去受罰。這跟高振的軍規有關，一個班的人被欺負了就全班一起上，一個排的士兵被欺負了就全排一起上，一個連的士兵……打贏了的回來半天禁閉，打輸了的一天禁閉，看著自己同伴不出手的，除非你是無戰鬥能力情況下或是執行特殊任務的時候回來一個星期的禁閉。
自從正是成團後，每天各營都在德國顧問的指導下展開戰術和技術訓練，每天都會是一天大漢，所有的士兵都希望能夠盡快的掌握德國人嘴裡講述的知識。獨立團裡面的士兵在文化這方面不是很差，除了先一批的士兵都有中學以上的學歷外（大部分是班長了），收編的商團團丁也有不少人有文化，不過也有一部分的人沒有上過學，於是高振就命令各班的班長每天在晚上的戰術課之後都要再學習一個小時的文化課，沒上過學的人學習識字，上過學的人可以選擇學習英語和德語這兩門選修課程，一般老師都是高振或是翻譯來擔任。