五千年前，人間開始出現文明的雛型，地面被許多勢力所瓜分，其中以東方的情形最惹人擔心。因為其中一股巨大勢力，由有魔族血統的赤帝蚩尤所控制，展現了統一地面的才能及野心。
能夠制衡蚩尤的就只有黃帝軒轅和炎帝神農，然而這兩個氏族先打起上來。最終軒轅黃帝打倒了炎帝，並且收編了其族人，實力大大增強；但連場激戰讓軒轅黃帝元氣大傷，一時間無力抗衡蚩尤的進襲。天帝有見及此，遂派遣上古戰神九天玄女下凡幫助軒轅黃帝，抵擋蚩尤入侵，並傳授他神兵和神技。
九天玄女來到人間，加入了軒轅黃帝的軍隊。雖說軒轅黃帝也是雄才大略、風度翩翩；其部屬多受教養，沒有其他氏族的野蠻，但對於九天玄女來說，人類的落後仍使她煩厭。想要盡快完成任務的九天玄女，決定自行解決蚩尤。
蚩尤再強亦不過是半個魔人，而且只有數百年道行，如何與九天玄女相比？雖然與天帝的原意有少許出入，如果能夠殺死蚩尤，相信其氏族亦會隨之瓦解，人間得到真正的和平。那時候沒有諸神協定，神魔干涉人間事務本來就天經地義。
九天玄女帶著神兵昆吾劍來到蚩尤的根據地，指名挑戰。然而當蚩猶帶領著八十一個悍將走到陣前，九天玄女卻不其然的感覺心旌搖曳！可能有著魔族血統的關係，蚩尤身高過兩米，背厚腰闊，魁梧非常；他長得銅頭鐵額，渾身皮膚泛著金屬般的光澤；頭上長著一對又尖又彎的長角，顯得更威武、兇惡。尤其那雙如銅鈴般大、會放光的眼睛，差點便迷住了九天玄女。
雖然只是數百年道行的魔人，但是蚩尤的氣勢、自信還有風範，在天界找不到第二個。
兩人的戰鬥無法避免，九天玄女拔出神兵昆吾劍，駕雲向蚩尤飛過去。蚩尤不懂得飛翔之術，伸手拍了拍坐騎飛虎，飛虎四爪在地上一蹬，已載著蚩尤飛上半空。
蚩尤雙手在腰後一探，左手刀右手斧，將九天玄女的昆吾劍抵住。
昆吾劍乃是天界神兵，尋常兵器莫不能擋。九天玄女定睛一看，蚩尤左手握著的是一把惡形惡相的魔刀，刃長背厚，顏色茶黃有如琥珀，半透明的材質奇特，隱隱散著妖邪之氣；右手執著的一柄巨斧，奇形怪狀，鋒利無匹，充滿了血腥之味。
魔刀「虎魄」、鬼斧「干戚」，這兩把魔兵在蚩尤手中一點也不輸天界神兵。
莫看蚩尤身材高大，手長腳長，但身手靈活猶勝九天玄女。在兩把魔界神兵的幫助下，蚩尤著著搶攻，終於趁九天玄女一個疏神，打飛了昆吾劍，魔刀「虎魄」已擱在九天玄女的頸上。
哪怕是數十萬年道行的真神，若被魔刀虎魄在喉嚨割上一刀，九天玄女不死也得重傷，非休養三、五個月不可。畢竟宇宙同源，大部份高級生命的身體結構大同小異，尤其幾個重要器官不可或缺。但是蚩尤沒有傷害九天玄女，輕易便放她走路。蚩尤從來沒想過有女人能夠跟他戰個勢均力敵，心中起了惺惺相惜之意。
對於九天玄女，這一戰的結果更是出人意表。要是認真再戰一次，九天玄女自信一定能贏，因為兩人的道行有著明顯差距；然而她震懾於蚩尤的戰意和勇悍，戰敗亦是不爭的事實。九天玄女並沒有因此而感到羞恥，反而覺得理所當然。
蚩尤展現出來的是人類甚至眾神所欠缺的粗獷、野性和霸道，卻沒有太多的心計和顧慮。就像氏族與氏族之間的戰爭，蚩尤憑藉實力勇往直前，不去考慮甚麼戰略和兵法，結果取得勝利比誰都多。
另一方面，不工心計的蚩尤並非愚魯之輩，往往聞一而知十，勉強要批評的話，只能說他的心思快而不密。蚩尤豪氣干雲、快人快語，對朋友推心置腹，很快便引九天玄女為紅顏知己。
一個人生活了二十萬年的九天玄女，雖然有明顯性徵，有時候仍然懷疑自己的性別。這並不奇怪，宇宙中盡有雌雄同體的生物，也有好像精靈般無須交合繁殖的族類。九天玄女沒有同類，對其身世可說是一無所知，會懷疑亦是理所當然。直到有一日，事情終於生了，九天玄女才肯定自己也是一個女人。
有道是好景不常。過不了幾天，九天玄女接到天帝的指示，要她盡快幫助軒轅黃帝戰勝蚩尤，回虛無天界覆命。九天玄女心中很是猶疑，她由衷覺得蚩尤的才華極佳，無論文、武均比軒轅黃帝優勝。但她轉念一想：虛無天界如何不知道這事實？要不然，也不會要她下凡來輔助軒轅黃帝，因為若是公平對戰，軒轅黃帝必輸無疑。可惜蚩尤是魔族與人類女子交媾而生，而軒轅黃帝卻曾跟天人學道，兩人在諸神心目中的地位和形象可謂是雲泥之別、差天共地。
九天玄女明白到虛無天界的絕對權威，斷不容許她違抗上命，更何況即使她拒不從命，天帝仍會派來第二位、第三位天神幫助軒轅黃帝。正自苦惱間，九天玄女見到蚩尤消滅了一支軒轅黃帝的軍隊，那可真是意氣風。九天玄女再三思量，覺得蚩尤雖有通天徹地之能，但其個性剛愎自用、鋒芒畢露，終究不是治國之材，只能做一方霸主。因此她下定決心，將仙術「奇門遁甲」及神兵昆吾劍也贈予軒轅黃帝，並告訴他有關蚩尤的情報。
涿鹿之戰中，天帝派遣了聖龍界的龍將應龍，與及神將女魃幫助軒轅黃帝，把整個局勢都扭轉了。雖然蚩尤勇武，以一人之力支撐大局，並打倒神將女魃，但其族仍節節敗退。蚩尤要力挽狂瀾，衝破數層如鐵桶般嚴密的防線，直奔軒轅黃帝面前，要跟他單打獨鬥、一決雌雄。
這一戰強弱懸殊、勝負分明，蚩尤的實力遠高於軒轅黃帝，軒轅黃帝根本無從招架。但是軒轅黃帝卻在眾目睽睽之下使出仙術奇門遁甲，令到蚩尤的攻擊完全無效。蚩尤正自驚疑，忙舉手中兩把魔兵，虎魄和干戚往軒轅黃帝身上招呼。
當魔刀、鬼斧齊被軒轅黃帝架住，蚩尤心中的詫異非筆墨所能形容；待他看清楚軒轅黃帝手中的乃是昆吾劍，更是如半空中突然打了一個焦雷，腦袋變得一片空白。軒轅黃帝就趁這空檔，一劍將蚩尤從坐騎飛虎上面挑下來。
九天玄女把昆吾劍送給軒轅黃帝，是因為只有天界神兵才能敵住虎魄、干戚兩把魔兵，人類武器起不了作用；另一個原因，是希望蚩尤見到昆吾劍後能夠知難而退，保住性命。九天玄女猜不到昆吾劍帶給蚩尤的震憾是如此巨大，令他在瞬間失去反應而被刺傷；她更沒料到的是，平日厚道的軒轅黃帝，這次會趕盡殺絕。
軒轅黃帝殺了蚩尤，成為人世間的東方皇者。九天玄女短暫的感情失落了，也回到虛無天界。自此以後，九天玄女沒了以往的孤僻，脾氣卻變得更差，因而有了「惡女」之名。至於蚩尤原來沒死，自願留在寒冰地獄一事，九天玄女和王天君也毫不知情。
「即使你知道我和蚩尤的過去也沒有用，我有沒有兒子難道自己也也不知道？三界五行之間下哪有這事情？」
「的確有啊！」王天君冷笑著說道：「只是你不明白魔族而矣。」
九天玄女沒立即說話，一雙眼睛緊盯著王天君不放。
「魔族雖分陰、陽二性，亦喜歡交合，但是魔族的雌體和雄體均能進行繁殖。」王天君揚了揚手，說道：「魔族在交合中互相換取對方的遺傳因子，然後在體內孕育出魔蛋……雄性魔族會從口中吐出魔蛋。」
九天玄女霍地抬頭：「你說蚩尤他用我的遺傳因子製造魔蛋？」
王天君咬了咬牙，緩緩說道：「蚩尤在涿鹿之戰前吐出了魔蛋，豈料他被軒轅黃帝打敗，魔蛋也在亂軍中遺失了。」
九天玄女實在是無法相信，喃喃說道：「魔蛋裡的當然是你吧！你竟然直呼自己父親的名字……」
「魔族不計較這些！」王天君哈哈大笑：「最重要我連他也恨上了！如果蚩尤不是如此軟弱，又怎會輸給軒轅黃帝？我也會繼承他成為地上的皇者！而不是被人所厭惡的怪物！」
九天玄女兩眼呆似的望著王天君，久久不能言語。自有記憶以來，九天玄女已習慣獨個兒生活，對於「親情」二字完全沒有概念，她以為自己是獨一無二的個體生命，沒想過可以生育、繁衍後代。陡然間不知從哪裡跑出一個兒子來，此事如何能夠相信？更有甚者，這兒子竟是她一直討厭的王天君，就更難以接受了。
九天玄女並非鄙視魔人，怎麼說她也曾經為蚩尤著迷；何況王天君的魔族血統比蚩尤更少？九天玄女討厭的只是王天君本人罷了。同是魔人，蚩尤行事光明正大，教人心折；王天君卻是鬼鬼祟祟，令人噁心。
「接受不到吧！我是你的兒子這回事。」王天君不屑地笑道：「沒相干！即使你不認我也沒關係，橫豎我也沒打算認你這個母親。這些年來我不是一直隱瞞著嗎？」
九天玄女始終覺得難以置信，只是王天君的說話與當日情形絲絲入扣，她不得不一再求證：「你是何時知道自己身世的？你不是在蚩尤死後才出生嗎？」
王天君從懷裡取出一個玻璃球，解釋道：「童年時受盡人類欺負，我終於忍不住大開殺戒，一夕間血洗了我所居住的村莊。後來我師父收了我作弟子，替我追查身世，終於現我乃蚩尤之子。至於九天玄女的事，我幾經辛苦才查出來。」
王天君的師父應該不是魔族，觀乎他擁有法器金剛降魔杵，與及能夠使出「金摩金摩金摩」這種正派的神技，便知一二。
九天玄女望著王天君，心中百般滋味。灰白臉色、深深的眼窩、細小而透明的眼珠子、矮小的身軀，還有那令人不寒而慄的笑容，無論如何也惹人討厭，九天玄女實在無法改變自己的感覺。如果宇宙的意志真替自己安排一個兒子，而這兒子遍生是王天君，實在是「天意弄人」。九天玄女見王天君雙眼直盯著自己，自覺要有所表示：「你……這些年來你受苦了……」
「九天玄女，你不懂得表現母愛，也就算吧！」王天君作難受狀：「受不了……這種對話不適合你也不適合我，聽著讓人想吐！」
九天玄女只想表達善意，被王天君一句頂了回來，自是氣極，「若是如此，你為麼要告訴我這些事情？」
「別忘了是你問我的來歷，我只是滿足你而矣。」
「你曾說要向我和虛無天界復仇，難道天界有負於你？」
「虛無天界軒轅黃帝，你也在最後關頭背叛了蚩尤，令到結局不同了……要不是這樣，我便是地上皇者的繼承人，而不是被人類所欺負的怪物！」王天君神情更是冰冷：「只因為蚩尤的魔族血統，就被天界針對……我要以魔人身份在天界辦事，爭這一口氣。當我地位比其他天人、神龍都要高的時候，我就感到一陣快意。」
「你若為此而投*雷帝，只怕會得不償失！我不以為雷帝真心信任你，你們不過是互相利用罷了。」
王天君捧著玻璃球，微笑道：「那又如何？我甚麼時候又把雷帝當作恩人了？先借雷帝上位，同時為他賣命，正是各取所需……這個宇宙之中，我們本來就是互相利用，難道你不是這樣嗎？」
王天君改口不再尊稱雷帝作「大人」，九天玄女感到王天君那隱藏在陰謀後面的瘋狂：「果然是魔人……你自以為聰明絕頂，智珠在握，其實目光短淺。所謂善惡到頭終有報，你最終會被你那齷齪的想法害死！」
「善惡到頭終有報？」王天君指著九天玄女，冷笑道：「笑話！何謂善惡是你說了算數？你幫助軒轅黃帝打敗蚩尤，便是理所當然的正義？在我來說你們才是萬惡……如果真的有報，你們的報應要來了！我就是執行這報應的人。你以為我甘於當雷帝的走狗嗎？很快連雷帝也要向我俯稱臣！」
九天玄女以為自己聽錯了：「你想要的還不只此？難道你真要顛覆虛無天界？你知道自己在做甚麼嗎？」
「早在進入虛無天界的一刻開始，已在等候今天的來臨。」王天君走近九天玄女：「我說過要爭一口氣，不會滿足於當個區區神官。你說我貪得無厭也可以，但蚩尤只差一點便成為地上皇者，本來應該繼承其位的我，目標只有一個──取代雷帝三界五行中唯我獨尊的天界領袖！」
九天玄女一陣錯愕，然後猛搖頭道：「你知道自己在說甚麼？即使你心機算盡，也沒可能辦到……天界領袖是初神和宇宙的意志揀選出來，萬年以前已是天帝、王母和雷帝三人。即使天帝和王母離開了，雷帝也是擁有數十萬年道行的真神，你這星星之火敢與日月爭光？雷帝絕不是憑你那些計謀和微不足道的力量便能夠拉下來的！」
「我也想繼續靜待時機，看準機會才行動，但我已等不及了！本來一切都很順利，可是納蘭龍的出現把事情都搞和了。好不容易被雷帝打倒，他竟然會復活過來。結果我為了對付他而使出神技『金摩金摩金摩』，這一招暴露了我的秘密，既然你察覺到了，只怕連雷帝也瞞不下去。」
「王天君！我看不到你有任何勝算，除了雷帝，還有我、老子、瑤姬等真神級的人存在，誰都不會任你胡作非為。看著你做愚蠢的事，不如由我來打倒你！」
「我早想要收拾你。」王天君一臉不在乎：「如果能夠把你打倒，那代表我有能力與雷帝競爭吧？」
九天玄女實在不知道王天君哪裡來的自信。
「我沒有把握不會出手。雖然無法填補道行上的巨大差距，但我仍然可以取勝。」王天君不懷好意的笑道：「我有秘密武器，這時候不怕告訴你……天眼系統不能監視虛空島，何況泰安殿便是天眼系統的中樞。九天玄女，我知道無法憑實力打敗你們這些真神，因此我暗中修煉仙術和法寶，尤其是心靈感應術……」
「所以變成癡呆的華光太子和受到控制的沉香太子，的確是你的傑作！」看見王天君得意的笑容，九天玄女厭惡地說：「沒用的！誰不知道天界最強的心靈感應術便是瑤姬？瑤姬的道行雖然較差，但也遠勝於你，更何況心靈感應……」
王天君說：「我知道瑤池仙子心靈感應術的厲害，但我也有法子解決她！來到泰安殿前，我已把瑤池仙子的精神封瑣，如今她跟華光一樣變成了白癡！」
九天玄女吃了一驚，伸手抓住王天君的衣領，喝道：「你說甚麼？」
王天君拍開九天玄女的手，冷冷說道：「我在妙玄宮附近遇上瑤池仙子……看你的神情似乎不相信我控制了瑤池仙子。的確她的心靈感應術勝我一籌，但我乘虛而入，打敗了她。」王天君本不想向瑤姬動手，但瑤姬卻先用心靈感應來試探他。王天君無法強行攻入瑤姬的思想裡面，但瑤姬主動進入他的腦部，反而讓自己的意識打開，給予他反擊的機會。
九天玄女不知道內情，滿腹都是疑團。她不以為王天君可以在戰鬥中勝過自己；相反，連瑤姬也抵擋不了的心靈控制，足以讓王天君稱霸宇宙。九天玄女不知道，王天君控制華光和沉香已是他的極限，若不取巧難以對付真神：「你想要連雷帝也操控？王母離開以後，雷帝許多令人無法接受的決定，其實是你幹的好事？」
「不！直到現在為止，雷帝所有決定均是他個人意願。我只是對雷帝作出有限度暗示罷了。任何人的內心深處均是光影交織，問題傾向哪一面多些。即使正義的人。雷帝的個性比你我估計還要極端，接近人格分裂。過去數千年來，雷帝時刻警惕自己，保持低調；但只要對其偏激思想稍加推波助瀾，一切都會變得不同。」
九天玄女早就覺得雷帝像是回復帝釋天時期的行事作風，奇怪的是經歷萬年後，雷帝為何突然轉變？原來是王天君以心靈感應術影響雷帝！
「你打算煽動雷帝，趁機製造混亂，好讓你從中得利？」
「可以這樣說，我的計劃更周詳。」王天君聳了聳肩，道：「未來一段日子，雷帝會因為倒行逆施而眾叛親離，我將會扮演雷帝最忠實的唯一追隨者，並以他的實力打倒所有阻撓我大業的人，包括你和老子……可惜納蘭龍破壞了我的計劃，令我要及早收拾殘局。我要先下手為強，盡快收拾所有真神，否則我便要倒霉了。」
「雷帝注視著你與納蘭龍的戰鬥，定必對你起疑，你已沒機會了！」
「雷帝思想偏激，再受到納蘭龍、哪吒和楊戩的刺激，已失去冷靜，我要控制他的思想變得非常容易。」王天君說：「至於你，我……」
九天玄女舉起右手：「我已經知道你的技倆了！在你侵入我的思想前，一招神技已將你殺死。」
「不愧為九天玄女，連自己的兒子也能殺死。」王天君將玻璃球擲到九天玄女的腳邊：「我用辛苦煉成的法寶對付你。」
玻璃球掉到地上，出清脆的聲響。在玻璃碎裂的同時，裡面流出了大量半透明的液體，濺到九天玄女的裙擺之上，並且迅活化、蔓延，瞬間已爬滿九天玄女全身。不但如此，連四周的空氣也變得奇怪，除了本來的液體以幾何級數的度增加，彷彿空氣也凝固起來。
九天玄女雖沒親眼見過，卻曾聽王母提及，不禁叫道：「這……這是初神遺留下來的法寶『五行蛋晶』？」
玻璃球裡面是一種懂得自我繁殖、擁有記憶體的物質「白精」，只要受到撞擊再與空氣接觸，立即便會活化，吞食附近的事物，其「食量」則看白精的數量而定。由於白精擁有記憶體，能夠隨意改變自己的分子結構，使之變成不同屬性。
看著九天玄女在兩、三秒間被白精所包圍，然後變成一個水晶像──那些白精在吞食了九天玄女後逐漸凝固，並且完全變成透明──王天君心裡感覺舒暢。他想不到「五行蛋晶」這麼有效，不枉他潛入九龍壁將之盜出來。
「我自知永遠無法及得上你們這些真神，但我比你們都要聰明，這個天界很快便屬於我的了！」
在天宮的核心地方，靈霄寶殿的鬼斧神工已然啟動，變成一個足以容納萬人的巨大廣場。其中納蘭龍正與二十餘個天君、雷將周旋，而楊戩、哪吒和雷帝正在旁邊觀戰。
當此之時，雷帝自然沒機會留意天眼系統的報告，而天眼系統並不覆蓋虛空島，因此在泰安殿旁生的事，雷帝並不知悉。九天玄女、瑤姬兩位真神，不為人知的已被王天君所收拾。
納蘭龍的出現破壞了王天君原先的計劃。想當日納蘭龍繼承敖玉的龍魂，令到平靜已久的虛無天界鬧得熱哄哄的，王天君趁機爭取對付納蘭龍的差使，其實是有心激反納蘭龍，製造衝突好令雷帝失去人心，同時找機會剷除有實力的人。結果哪吒先被牽連，而華光和沉香亦落入他的掌心。
另一方面，不斷變強的納蘭龍在打倒毗娑婆、敖琉、地煞神和廣目天後，終於被雷帝殺死，亦是個不錯的結果。王天君擔心讓他繼續進步，早晚會出自己的控制。
誰料納蘭龍再次到人世，實力果然更上一層樓。王天君在戰鬥中不敵，使出一直隱藏的神技「金摩金摩金摩」，不但未能打敗納蘭龍，反而暴露了自己的秘密。但是王天君沒有氣餒，他含糊其辭有責任全推到雷帝身上，使得納蘭龍、楊戩和哪吒三人前去靈霄寶殿質問雷帝。如此一來，雷帝沒時間過問王天君關於金剛降魔杵和金摩金摩金摩的事，連帶華光和沉香的問題也擱到旁邊去。王能夠爭取時間另謀對策，搞不好還可以暗算雷帝，把他也控制了。
納蘭龍雖然對王天君充滿了敵意，尤其王天君是殺死拉比的兇手。但是納蘭龍深信王天君只是從犯而矣，真正的主謀應該是雷帝。
而再與雷帝戰鬥前，先要打倒面前這些天君、雷將和靈霄寶殿四大元帥。
雷帝座下有二十四天君、三十六雷將。其中雷將只是二級神將，實力與敖玉同級的納蘭龍，輕易便幹掉其中二人，更把秦天君一條手臂卸了下來。天君屬一級神官，雖然其餘二十三人沒王天君那麼厲害，但他們各有絕技、法寶和仙術，比雷將難纏多。
納蘭龍正被辛天君、陶天君和金光聖母夾擊，不能有絲毫大意。
陶天君以法寶「聚風幡」令到廣場上的氣流變得急勁，令到納蘭龍無法站穩。偏生辛天君擁有法寶「天翔翼」，金光聖母擁有法寶「定風珠」，兩人皆能在強勁的風勢中來去自如，使納蘭龍處於最於最大的劣勢。
就在這時候，納蘭龍使出新防技「水晶球」，將辛天君的練錘和金光聖母的金飛劍擋住。水晶球和冰壁相似，卻像一個肥皂泡般把納蘭龍完全保護，四面八方均不能傷他。
就在眾人驚愕之際，納蘭龍舉起右拳，全力打出白龍鋼彈，從裡面將水晶球打穿，直射到辛天君胸口。辛天君反應不及，被白龍鋼彈貫穿身體，連帶安裝在他背上的法寶天翔翼也給轟至粉碎！
雷帝見納蘭龍舉臂，已知道他要使出神技，然而提醒的說話才出口，辛天君已被打倒。雷帝怒不可遏，大吼一聲，便從須彌座飛起，直撲到納蘭龍頭頂！