在皇太極到達尊化的同時，在尊化城樓上的嘹望的值班士兵就現了皇太極的大隊後金士兵.值班士兵連忙向上級報告。已經好幾天沒有好好休息的馬世龍剛剛上床，外面就有傳令兵找他。
馬世龍聽到城外又出現大量後金士兵，他趕忙穿上衣服，心急火燎的跑到城樓上觀察情況。馬世龍在城樓上模糊的看到大量的後金士兵在城外的空地上在建立營寨，由於天色已經很晚了，只能憑借後金士兵點燃的火把來觀測。
馬世龍看到後金這架勢，知道這才是主力部隊，先前那些只是先鋒。而站在他身後的眾將領也出了一身冷汗。暗想多虧自己沒有出兵和先前那些後金騎兵出城野戰，否則這個尊化城就守不住了。
後金軍隊並沒有乘夜色進攻尊化。所以一夜無戰事，但是在城樓上的馬世龍等將領卻不敢大意，他們可是全副武裝的呆在城樓之上，一夜也沒有合眼。
在第二天的一大早，後金的營寨之中就傳來了鼓號之聲。一夜沒睡的馬世龍等人站起身來，走出城樓，站在城牆上向後金的營寨望去。馬世龍知道，後金這是要攻城了。他趕緊命令明軍趕緊進行登上城牆，作好作戰準備。
在後金的營寨之中，皇太極已經將軍隊集結完畢。皇太極騎在戰馬上，望著堅固的尊化城池，他的手突然向前一揮，整裝待的後金大軍邁著整齊的步伐，帶著攻城器械，走出營寨，來到尊化城下。
金軍隊在尊化城下不緊不慢的排好陣形，作好了攻擊準備。而城牆上的明軍也已經作好了防守準備，火炮已經裝填完畢，炮手們也已經瞄準了目標。一旦後金軍隊進入射程，他們就會用犀利的炮火來狠狠的打擊這些侵略者。
但是後金軍隊並沒有著急攻城，皇太極命令一個明朝的降官，來到兩軍陣前。那個降官在後金的軍陣之前大聲喊，說自己是皇太極的使者，要見尊化的最高長官。t
在城牆之上的馬世龍知道這是皇太極要先禮後兵啊。但是兩軍交戰不斬來使，再說馬世龍也想瞭解後金的虛實，就讓哪個自稱是皇太極的使者的那個人上前答話。
明朝的降官戰戰兢兢的走到尊化城牆之下，向城牆上的馬世龍等將領開始了招降活動。提出只要馬世龍等將領投降後金，高官厚祿不在話下，而且還能得到皇太極的重用，如果馬世龍膽敢抗拒後金的大軍，那就是城破身死的下場。而且那個明朝的降官還大言不慚的說三屯營已經被皇太極的大軍攻破了。
在城牆之上的馬世龍斷然的拒絕了投降的要求，表示自己是大明天朝的臣子，怎麼能向建酋皇太極投降。馬世龍並嘲笑那個降官，說他忘記了自己的祖宗，竟然投敵判國，還不如自殺了好。
皇太極的使者被馬世龍罵得是狗血噴頭，心裡十分的羞愧，只得掩面而走，退回到後金的軍陣之中。皇太極看到馬世龍堅決抵抗的態度，知道這件事情沒有辦法和平解決了，他立刻吩咐他的兩黃旗和莽古爾太的正藍旗揮師攻城。
後金士兵吶喊著瘋狂的向前衝鋒，城牆上的明軍看到後金士兵蜂擁而上，馬世龍趕緊命令炮手開炮還擊。一時間，城牆上的紅夷火炮、拂郎機火炮等火器一起開火。猛烈的轟擊衝鋒的後金士兵。
而後金士兵全然不顧火炮的轟擊，冒這如雨的鉛彈，推著雲梯、浮橋和其他的攻城器具，猛烈的攻擊尊化城，明金雙方剛一交火，戰鬥就進入了白熱化。
一時間戰場上弩箭和鉛彈如暴雨一樣。莽古爾太是一個猛將，但是他生性鹵莽、有勇無謀，一開戰的時候，他就帶領著他的親軍，來到戰場上督戰，他看到自己的正藍旗在明軍猛烈的炮火下，死傷慘重，莽古爾太是怒不可扼。他大罵手下的將領都是一幫廢物。
後金經過一天的苦戰，也沒有攻破尊化的城牆，在傍晚時分，皇太極無奈的下令退兵。一天的攻城戰，後金軍隊可算是損失重大，死傷官兵將近一千餘人。而明軍同樣是損失慘重。在後金的箭雨下，明軍傷亡數百人。耗費火藥無數，城牆也被鑿的千瘡百孔。
馬世龍看到自己堪堪擋住後金軍隊的進攻，他終於鬆了一口氣，這一天總算是個過去了。馬世龍命令城防軍嚴加防守，吩咐完後，馬世龍拖著疲憊的身體，回到了他在尊化的府邸。雖然經歷了一天的激戰，馬世龍是一點的睡意都沒有，後金軍隊竟然肆虐大明天朝的京畿附近，自己的前程是完了。但願自己能守住尊化，保住自己的家人吧。
十二月初十日，皇太極再次率領後金和蒙古聯軍猛烈的進攻尊化城池。在後金軍隊悍不懼死的衝鋒之下，尊化城的城牆有好幾處幾乎被後金士兵挖穿，多虧是因為冬天，所以尊化城的城牆才沒有被後金士兵所挖垮。
馬世龍看到城牆幾乎快被挖穿，但是城牆卻沒有被挖塌，他心裡暗叫一聲幸運啊。但是面對嚴峻的形式，馬世龍趕緊命人收集棺材，然後在棺材中填滿土，外面包上鐵皮，然後組織趕死隊，將這些棺材堵在城牆的缺口處，這樣馬世龍才堪堪擋住後金的進攻。
莽古爾太看到自己的士兵幾乎都要攻陷尊化了，但是明軍竟然又擋住了後金士兵的攻勢，莽古爾太是氣的哇哇直叫。他趕緊策馬上前，大聲的指揮後金士兵向前進攻。
戰場之上，鉛彈和弓箭四處亂飛。正好偏偏有一隻羽箭，不知怎麼了，竟然直向莽古爾太飛來，擊中了莽古爾太的前額。頓時莽古爾太是血流滿面啊。
莽古爾太見自己讓流矢所傷，氣得是七竅生煙，當下凶氣大，竟然一馬當先的向尊化衝鋒，莽古爾太的部署看到自己的主將帶頭衝鋒，頓時氣勢猛增，更加悍不畏死的向前進攻。城牆上的明軍壓力頓時倍增。
有為尊化城周圍有壕溝相護，所以當莽古爾太衝到壕溝邊上的時候，他下馬步行，莽古爾太揮舞著他的配劍，指揮著他的士兵衝鋒。
城牆上的明軍用手中的武器拚命的回擊。奈何後金士兵太過凶悍，好幾架雲梯已經架上城頭。情形十分危機。在城牆上指揮的一個受傷的標統看到莽古爾太穿著後金的鎧甲，明顯與他身旁的人的鎧甲不同，於是他判斷這是後金的一個大官。
那個標統想到：他媽的，老子大概是要交代在這了。不過老子死也要找個墊背的。正好老子就選上你了。
那個標統召集他身邊的幾十個火槍手和弓箭手，讓他們瞄準了莽古爾太，標統一聲令下，明軍士兵一齊對著莽古爾太就是一通的射擊。
莽古爾太正在城下指揮戰鬥，他突然感覺到不妙，他剛要抬頭四周望望，還沒等他抬頭看，就聽到他身邊的親兵大叫道：主子，小心！
莽古爾太暗叫不好，剛想要閃身躲避，但是莽古爾太還是沒有躲開，莽古爾太身中七槍八箭，道在了地上，莽古爾太的親信德克勒急忙趕了過來，看到莽古爾太身負重傷，德克勒趕緊命令四周的士兵把莽古爾太抬下去。
同時德克勒也知道，這仗也沒有辦法打了，主將莽古爾太身負重傷，生死不明，後金士兵聽到這個消息後，肯定是軍心士氣不振，無奈之下，德克勒只好指揮士兵徐徐退下，這一天的戰鬥就這樣虎頭蛇尾的結束了。
皇太極正在指揮兩黃旗奮力的攻城，眼看著兩黃旗士兵就要攻上城頭了，他突然看到正藍旗的士兵竟然退出了戰場。皇太極十分的震怒，這是要功虧一簣啊。憤怒的皇太極剛想要責問莽古爾太為什麼要退兵，那邊就傳來消息說，莽古爾太被明軍打傷，現在生死不明。皇太極聽到這個消息，差點沒有栽下馬去