上回說到人族三皇已滿，五帝之治即將開始。
黃帝之孫顓頊，二十歲得黃帝傳位為人皇。顓頊在位時，加強各部族間的融合，在截教強大的支持下強令禁絕從洪荒時代、人巫融合之後便一直流傳下來的巫教，將許多小部落信奉的神明一概抹去，大力宣揚道門的正統性。
顓頊死之日，將帝位傳於堂侄高辛氏姬嚳。那帝嚳生於窮桑，少小聰明好學，十二三歲便有盛名，十五而佐顓頊，封有辛地方，三十而得帝位，遷都毫邑，享壽百歲。帝師為人教玄都**師所化的赤松子大仙，在位之時，人才濟濟，天下大治。
此後堯舜二帝相繼而起，興禪讓，行德政，天下敬服。堯嚴肅恭謹，光照四方，上下分明，能團結族人，使邦族之間團結如一家，和睦相處。且為人簡樸，吃粗米飯，喝野菜湯，自然便得到了百姓的愛戴。興禪讓，很好地解決了權力交替之時可能出現的動亂和不滿。
舜娶堯二女為妻，受各部族推薦而為帝。增設官吏，知人善任，治下政通人和。設置諫言之鼓，讓天下百姓盡其言；立誹謗之木，讓天下百姓攻擊他的過錯。治天下五十餘年，卻終於在他為帝期間發生了一件危及天下百姓生死存亡的大事件，滔天的洪水暴發了。
卻說五帝期間三教修士常往來四大部州，在人族中傳道授徒，宣揚道法。又有顓頊大力宣揚道教，巫教既滅，道門正統地位無可撼動，香火日盛一日。
至巫妖大戰之後，洪荒數百萬妖族全部避居北俱蘆洲。一時高手俱失，許多強大的法門神通不是隨著大戰消失，便是被帶到了隱居之地。導致三大部州妖族一蹶不振。數萬年來，北俱蘆洲之外新生的小妖都只能修到妖王境界。所有的妖族也都認為妖王便是妖修的最高境界了。
這些妖族盤踞深山，劃分地盤。因巫族與人族融合，秉持了巫妖血仇的新生妖族們便不斷騷擾人族部落。人族在巫師們的帶領下，也不斷剿滅妖族。雙方仇怨越積越大，普通人族對妖怪漸漸形成了恐懼和厭惡的心理，可說聞妖色變。
當然，也有妖族仗著變化之術混跡人間，普通人族也辨認不出。以其神通法術，一概認為神仙，享受了一些人間香火。
卻說前時巫族支持的蚩尤爭帝失敗身死，刑天又被砍掉了頭顱，在外的大巫相柳不知各中情況，大怒。相柳本是水之祖巫共工的大巫，控水之法無與倫比，因怒遂發洪水於天下，以警世人。相柳本意不過懲戒一番，聊以示威耳。奈何其本身神通廣大，散落人間各個幽暗角落的妖族又不斷興風作浪，普通巫師也趁機推波助瀾，發洩心頭怨氣。竟使得這場洪水聲勢越發浩大，越演越烈，漸漸不可收拾。
道教先也知是相柳只是想警戒一下世人，心下也確實有愧。起先便也聽之任之，任由洪水氾濫。但見大水經久不息，百姓流離失所，苦不堪言，終於也忍不住了。三教聖人同時發旨，命弟子下山相助人皇治理洪水。又命弟子去墟山找到了帝虛，讓他去約束相柳。帝虛也知此事再下去便過了，便前去把相柳抓了回來，象徵性的懲罰他呆在祖巫殿。
然而洪水滔天之勢已成。源頭雖斷，洪水一時卻仍然無法消退。一時間，三教各顯神通，巫妖並逞手段。三界再次熱鬧起來。
卻說人間洪水肆虐，三教聖人命門下齊出，救助人族於危難之中。人教玄都**師化身赤松子四處傳道，普施符水，教民簡樸安樂之道。闡教金仙在廣成子的帶領下徑去求見人皇舜帝。聲言要助人族斬妖除魔，治理水患。舜帝大喜，當下命手下能臣鯀為治水大臣，與闡教一眾金仙同去治理洪水。
眼見洪水肆虐，鯀依過往經驗，首先便想到深壘高牆將水堵住。闡教仙人一想，五行之中，土能克水，正該用堵的方法，遂欣然同意。廣成子便自告奮勇的前去崑崙山請元始天尊去女媧娘娘處借來了息壤。
女媧娘娘對廣成子說道：「今天下洪水滔滔，其中亦有不明事理的妖族後輩興風作浪。其至惡者，殺之可也。有悔過者，你等也宜存好生之德，好生教導，網開一面。切不可一味打殺，致增罪孽。」
廣成子連忙答應，取了九天息壤回轉人族，將女媧娘娘之意告知眾人。眾人面面相覷，只得答應。心中卻暗暗埋怨女媧娘娘偏袒妖族，遂對女媧之言不甚在意。一意只要斬妖除魔，在人族中樹立闡教的正義形象。
當下闡教副教主燃燈道人率領一部分弟子外出尋找作惡的巫妖，將之打殺。廣成子率領一部分弟子拿著九天息壤隨鯀一起將水道堵塞，雲中子居中調度協調。闡教金仙全力動作起來，一心要拿下這份救助人族的大功德。
堵的方法在開始時頗為有用。九天息壤用之不竭，可大可小，將鯀查找出的水患肆虐通道堵的嚴嚴實實。鯀等見此法有用，心中欣喜。廣成子，燃燈等金仙更是賣力，彷彿看到了治水勝利的前景。
誰料好景不長，堤壩越築越高，水也越蓄越深，九天息壤雖強，卻也不可能將整個三大部洲完全護住。反而將危險蓄積起來，洪水終於在所有人都意想不到的時候衝破堤壩，再次席捲天下。並且越演越歷，竟比上次危害更大，百姓苦不堪言。舜帝下旨嚴厲地申斥了鯀。卻也知其確實盡了心的，因而此次只是嚴令鯀盡快想辦法平息水患，並未過多責罰。
闡教一眾金仙聽了舜帝斥責鯀的詔書，就像有人當面煽了自己幾個大耳光一樣，心裡頗不是滋味。廣成子等人一商量，覺得以土克水乃是五行正道，絕不會有錯。那麼問題當是出在那些興風作浪的巫妖身上。
覺得顏面大失的闡教仙人當下大怒，四處尋找混跡在山林湖澤之中的妖族和巫師們的麻煩。一見之下，立馬打殺，毫不留情。卻是將女媧聖人的話忘在了腦後。
帝虛見人族大亂，其中有一些巫族之人便命刑天前去收攏巫族眾人，其中有一個非天非地非神非人非鬼，亦非蠃非鱗非毛非羽非昆。又有四猴混世，不入十類之種的混世四猴之一的赤尻馬猴淮水無支祁。無支祁本是共工坐下的大將，見相柳發水便在一旁推波助瀾幫忙。
人族鯀受命治水，用圍堵的辦法，歷經九年，收效甚微。洪水不時決口，百姓日日驚惶。闡教一眾金仙亦無計可施。四方百姓心生怨憤，紛紛要求嚴懲治水無功的鯀。
舜帝於是巡視天下，所到之處，哀鴻遍野。心知必須要做一個交代了。於是昭告天下，責鯀失職之罪，處死於羽山之郊。百姓心中的憤怒這才平緩下來。
然而舜帝也知道這只是暫時的。若洪水不能得到有效的治理，百姓將繼續受苦，天下始終不會安寧。當下便著力尋找可以繼任鯀治理洪水之人。
有人進言道：「鯀之子禹有大才，治水本領青出於藍可以用他前來治水。」禹乃是其父鯀死後的屍體中被人發現救出的，長大後明白其父死的原因也不怨恨舜帝，只是努力地研究如何治水。
舜帝也知鯀治水實在是盡了心的，為治水長年累月不回家。只是方法不對，沒能成功。當下聽到其子不僅繼承了他的能力，而且青出於藍便說道：「既如此，可叫禹來，由我當面考校一番。」
使臣傳旨到禹家。禹長聲大笑，其聲悲嗆。拈香遙祭其父，三叩而起，即領旨而去。至帝宮見舜，舜親自考察禹的能力，見其果然膽識過人。當下大喜，即命禹繼鯀之位，領生殺褫奪大權而治水。
大禹受命，仔細研究了父親治水失敗的原因，認為堵不如疏。當下在多寶等人幫助下，請見黃河之神河伯，求得記錄了天下水文地理圖形的河圖。依圖治理水患，疏導山川，成效立顯。
又有太上老子賜下開山斧和定海神針治水之力越加高強，大禹治水，經歷數年之功，洪水漸漸受到控制。雖仍然兇猛，卻不再四溢橫流，天下稍安。
大禹理清山川地理，將天下河流分為九條大的流脈。又築起九座高大的山脈，依地勢重新劃分九州。由是滾滾流水盡往東流，注入大海，天下水患平定。禹以其功德，受四方百姓尊敬，被舜帝定為自己的接班人。
水患已定，大禹地位也已經確立。在大禹治水功成之日，人族祭祀大殿之上天降功德，獎勵大禹治水有功。闡教諸人也有一絲功德，卻是他們也幫過治水，天道至公便發下一絲功德。
大禹在舜死後即位勵精圖治，還收集天下之銅鑄造了九鼎鎮壓九州，建起九州結界。因九鼎之中各有一個龍子，故從此之後百姓便以龍的傳人自稱。而大禹死後皇位本是傳給伯益，但是其子夏啟不服，再加諸多大臣的幫助奪得了帝位，建立了大夏朝，從此從禪讓制轉向了家族制。
不說人族在大禹治水之後如何，天**將發生一件大事。卻是在軒轅大戰蚩尤時天庭揚名於人族，這些年天庭人生鼎沸，也有了一絲興盛之象。昊天與瑤池商議以蟠桃為名舉行一屆蟠桃盛會。此次昊天不管修為高低，只要已成仙便法力請柬，而且請了諸位聖人，當讓身為紫微大帝，鴻鈞老祖弟子的帝虛也是被請了，顯然是昊天欲使天庭再揚名。
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