魔法少女可以說是有別於魔法側的一方勢力，因為她們多數是因為種種坑蒙拐騙的原因，成為了一名懵懂無知的魔法少女。
對於她們而言，大部分的情況並不能十分有效的分辨出來。畢竟她們是少女，心智不成熟，很容易就遭人利用。
如今出現在門口的兩波魔法少女分別是魔法少女小圓臉與魔法少女奈葉兩方，實力不分伯仲，旗鼓相當。
魔法少女奈葉主要講述的就是平凡的小學三年級的小學生高町奈葉和一個來自為太古遺產進行挖掘而來異世界米德芝爾達的尤諾·斯克萊亞的魔法邂逅下，成為了與尤諾一起對平行次元中存在的高度科技的文明的遺產——「聖石之種」進行收集的魔法少女。
高町奈葉
代號：星辰1號（stars01）
所屬單位：時空管理局總局武裝隊航空戰技教導隊第5班、總局次元航行部特務六課
階級：一等空尉
職務：戰技教導官、星辰分隊隊長。
出生日期：3月15ri
星座：雙魚座
出生地：第97管理外世界「地球」
血型：o型
發se：淡栗色
導師：尤諾·斯克萊亞
魔法術式：米德式
魔導器：旭日之心
個人簡歷：9歲時與魔法邂逅。10歲加入時空管理局。19歲時編入機動六科工作，擔任星辰分隊隊長兼先鋒教導官。25歲時因「凶鳥」案件被編入特務六科工作。
高町家最小的女兒，9歲時就讀私立聖祥大學附屬小學三年級，自稱「平凡的小學三年級生」。後為了幫助受了傷的尤諾尋找聖石之種而成為魔法少女。
擅長放粗系魔法，不擅長壓縮、收束系的魔法。與防禦魔法同時以「單人炮擊魔導師」戰鬥。作為擅長中距離∼遠距離的「炮擊魔導師」，接近戰方面也擁有非常流暢的技術，優秀的aaa級魔導師。另外，也有許多長距離炮擊等魔力同時放出。
菲特·泰斯塔羅莎·哈拉溫
代號：雷光1號（lightning01）
身世：第一例f計劃的克隆人（艾麗茜亞·泰斯特羅莎的衍生剋隆人）
所屬單位：時空管理局總局次元航行部隊、總局遺失物管理部機動六科
職務：執行官、搜查主任、雷光分隊隊長
發se：金黃色
使魔：艾爾芙
導師：莉妮絲
魔法術式：米德式
魔導器：雷光戰斧
擅長高速移動與斬擊，對射擊與高範圍魔法是個相當優異的術師。
艾爾芙，菲特的使魔。擁有犬狼形態和人形形態兩種。擅長拳頭攻擊，以及防護魔法、束縛魔法等的補助系魔法戰鬥。
原形：狼
發se犬狼形態
毛se：橙紅色
主人：菲特·泰斯特羅莎·哈拉溫
導師：莉妮絲
艾爾芙的真實形態為紅色的大狼，平時經常以人形陪伴在菲特身邊，一直以朋友的立場和菲特在一起。性格單純、忠心，對待自己的主人菲特而像個姐姐的樣子衷心愛慕，不惜戰鬥支援而獻身。正因為是犬科狼型的使魔，喜歡吃狗飼料。
魔法少女小圓主要講述的是圍繞著五位魔法少女的成長與冒險展開。
就讀市立見瀧原中學二年級的少女鹿目圓是個出生於良好家庭，親朋好友，有哭有笑，誰都擁有的日常生活的女孩。有一天。一名神秘轉學生曉美焰的出現，讓小圓開始改變了自己的命運。
小圓和朋友在回家途中發現一隻暗中喊求救人話的神秘生物，已經傷痕纍纍。追殺這個神秘生物的人，竟然是小圓認識的神秘轉校生曉美焰。之後遇上小圓的同校學生巴麻美後，神秘生物透露出自己的身份。自稱是「丘比」的神秘生物要少女們「和我訂下契約成為魔法少女吧」。
但現實遠比小圓所想的越來越殘酷，魔法少女的真相一再衝擊著小圓想成為魔法少女的想法……
鹿目圓香
生日：10月3ri
星座：天秤座
血型：a型
身高：不滿150
視力：兩眼都是1.5
喜歡的顏色：白色和粉紅色
喜歡的科目：美術
不擅長的科目：數學、英語、化學、體育
慣用手：右手
暱稱：粉毛，圓神，饅頭卡，粉圓，小圓臉
戰鬥武器：長弓
願望：起初是為了救活在眼前將近被車撞死的小黑貓。在曉美焰的回憶中第四次輪迴為了獲得打敗魔女之夜的力量；在第五次輪迴（本篇）願望是讓宇宙中過去、現在、未來的魔女消失在誕生之前特殊能力：創造宇宙，毀滅宇宙……
就讀於市立見瀧原中學二年級，家中有父母和弟弟四人。性格溫柔，很為朋友著想，非常友善、平凡的少女，在朋友間有著很好的品格。某一天，圓遭遇了一場不可思議的邂逅，知道了魔法少女和魔女的存在，同時也被qb邀請成為魔法少女。
因為焰的願望干涉時空而使其在成為魔法少女後的力量不斷提升，現在的她還只是個普通少女。但是魔女與魔法少女其實是一體兩面，小圓被丘比認為是最厲害的魔法少女，同時也將成為最強的魔女。出於各種原因涉足非日常世界的小圓，作為她最大的支持後盾就是家族的存在。
曉美焰
暱稱：黑長直，跟蹤狂，小焰，吼姆拉，homuhomu
性格：內向，溫柔，冷靜
身份：成績優秀的運動萬能的迷之轉校生，圓的同班同學……
戰鬥武器：長弓、裝備在左手上的圓盾（用來防禦、收納大量物品。其中存放著多種非魔法武器，手榴彈、槍械等皆為從黑幫或軍隊盜取。同時也是時間控制機器，可以讓時間暫停、倒流。因為願望的關係，最多只能使時間倒流至許願時的一個月左右前。如果在這期間炎沒有保護好小圓，也就是違背了願望的話，就強制將時間倒流至許願時的一個月左右前，但是倒流時間是可以自願選擇的。
巴麻美
特殊能力：相互聯繫。召喚大量細絲或緞帶牽制、切斷敵人……
暱稱：學姐，無頭學姐（adurarara），黃毛，麻美
性格：成熟、穩重、堅強、內心懦弱害怕（希望有人陪伴在身旁）……
戰鬥武器：最基本的武器是可以捆綁的絲帶，後來發展到白色線膛燧發槍（一把槍一次只有一發子彈，但可以同時召喚多把槍增加攻擊範圍以及大幅度強化一到兩把槍增加攻擊強度。通過把一把槍極大幅度強化成迫擊炮形態從而發出可以一擊必殺魔女的必殺技：「終曲」）
至此，一共表面上有四個陣營。