「放開我！！」碇真嗣掙扎著想要衝到武明身邊，可是卻被葛城美裡死死地拉住了，葛城美裡再怎麼說也是一個軍人，力氣上比起碇真嗣這個小毛孩強得多，所以碇真嗣現在除了乾瞪眼以為什麼都做不了，「我不會讓你殺掉明日香的！！」
剛剛碇真嗣被告知不用他出擊了，以為這一次的第十五使徒已經入侵了二號機，現在二號機就是nerv的敵人，所以武明讓碇真嗣留在指揮室裡，免得他搗亂，知道了這一切的碇真嗣自然很生氣，所以就有了剛剛的那一幕。
「現在我要對付的是第十五使徒，至於會不會殺掉明日香，那不是我要管的，還是說你願意出去對付現在的二號機？」武明淡淡地說道，彷彿明日香的生死與他完全無關，冷漠的語氣讓在場的所有人都一直心寒。
「怎麼可能，我是絕不會傷害明日香的。」碇真嗣似乎有點冷靜了，他也知道現在明日香被使徒控制了，如果不盡快阻止失控的二號機的話，第三新東京市用不了多久就會被它踩成一片廢墟。
「沒關係，真嗣你不用出戰。」大屏幕被零號機連接上了，綾波麗的影像出現在了碇真嗣面前，「我知道，因為真嗣你太過善良了，所以要你做這種事實在是很殘忍，不過你放心好了，我會創造一個你不用駕駛eva也能快樂地生活的世界。」綾波麗說完就切斷了視頻連接，這時候零號機正好升到地面上了。
「綾波」碇真嗣握緊了拳頭，有生以來，他第一次發現自己是這麼的沒用，他非常想出去救明日香，可是現在的情況是他沒有這個能力，他根本就找不到在對付使徒的同時救出二號機的明日香的辦法。
綾波麗和明日香的戰鬥沒有任何懸念，僅憑本能作戰的二號機根本就不可能打得贏綾波麗駕駛的零號機，最後的結果是二號機的插入栓被零號機硬抽出來了，與此同時零號機的超震動粒子刀刺入了二號機的核心，至此，第十五使徒沉默。
「插入栓裡還有生命反應，明日香還活著。」赤木律子有點激動地提醒道，比起上次八號機的駕駛員屍骨無存（靈夢跑了當然不會留下什麼痕跡），明日香實在是太走運了，這也是綾波麗刻意而為之的結果。
「真的嗎？太好了」聽到赤木律子的話，碇真嗣也鬆了口氣，這是他最希望看到的結果，武明看到碇真嗣的樣子搖了搖頭，他知道自己沒有評論碇真嗣的資格，在某些方面，武明和碇真嗣一樣，他們都天真地希望不用作出犧牲就能得到最好的結果，不過武明也知道那是不可能的，如果真的能這樣的話，未來的武明就不用大費周章地制定那麼詳盡的計劃來改變過去了。
「警告，出現新的at力場反應，確認是第十六使徒。」就在所有人都鬆了口氣的時候，magi發出了警告，更要命的是，而且根據機器的顯示，現在這個新出現的第十六使徒的位置就在零號機附近。
「麗，快找找」葛城美裡下意識地讓綾波麗找使徒，不過很快她就發現自己想多了，因為現在零號機的右手正抓著一條光鞭一樣的東西，而且它似乎還在侵蝕零號機的手，零號機的右手上那突起的血管看著就讓人發毛。
「看樣子我是跑不掉了。」零號機裡傳出了綾波麗略顯無奈的聲音，剛說完她就把裝有明日香的插入栓通過第三新東京市的武器運送通道送走了，然後雙手緊緊地握住那條正在侵蝕零號機的光鞭。
「綾波，你也快逃啊，零號機恐怕是保不住了。」葛城美裡連忙提醒道，她跟武明不一樣，在碰到eva和駕駛員的選擇的時候，她肯定會像現在這樣放棄eva來保全駕駛員，「第十六使徒留給真嗣來對付就行了，你快啟動彈射裝置。」
「不行哦。」綾波麗的影像連接到了大屏幕上，她現在的樣子彷彿並不是面臨著生死抉擇，而只是在討論一件無關緊要的一樣，「現在第十六使徒是被零號機的反向at力場困住的，我要是跑了的話它也就能掙脫了。」
「沒關係，我會去對付第十六使徒的，所以綾波你」碇真嗣連忙拿起話筒說道，他有一種感覺，如果不盡快做些什麼的話肯定會發生讓他永遠後悔的事，不過已經晚了，碇真嗣還沒說完，綾波麗就打斷了他的話。
「我說過了，真嗣，我會創造一個你不用戰鬥也能幸福地生活的世界。」綾波麗微笑著說道，同時她拉開了零號機的自爆保險，不緊不慢地輸入讓零號機自爆的密碼，「真嗣，答應我，一定要快樂地活下去啊。」
「綾波！！！」碇真嗣歇斯底里地喊著，可是綾波麗已經切斷了零號機和指揮室的連接，不管碇真嗣再怎麼叫她也聽不到了，下一秒，第三新東京市的上層被巨大的爆炸淹沒了，零號機自爆的能量絕不會比核彈差，被中和了at力場的第十六使徒是不可能倖存下來的。
「好了，現在馬上回收損傷的二號機，看它的樣子，修一修還是能繼續用的。」武明說完轉身叮囑了一下葛城美裡就走了，「有新的使徒出現的話告訴我一下，我先去看一下明日香的情況。」
「真嗣，你也回去，這裡我來處理就行了。」葛城美裡拍了拍碇真嗣的肩膀，現在的碇真嗣跟丟了魂似的，眼睜睜地看著兩個朋友遇險也完全沒辦法出手相救，對他來說這種打擊實在太大了。
「真嗣啊，你要記住，人都是靠自己的力量長大的，只有孩童才會依賴父母，學會自立。」綾波麗的話似乎還在碇真嗣的耳邊迴盪，在nerv裡面就數綾波麗跟碇真嗣的關係最好了，現在綾波麗的死對碇真嗣的影響可不小。
「真嗣，你也不要太傷心了，麗她也是為了打倒使徒而已。」赤木律子歎了口氣安慰道，這次的使徒來襲實在太突然了，再加上nerv一次性損失了兩個駕駛員，要是碇真嗣再這麼消沉下去的話，那就沒幾個能抵抗使徒的人了。
「放心，我會創造一個你不用駕駛eva也能快樂地生活的世界。」碇真嗣再次想起了綾波麗的話，綾波麗溫柔的話語此刻卻彷彿利刃一樣切割著碇真嗣的內心，能傷害人的不一定是冷漠，有時候溫柔對人的傷害更加大。
「對不起對不起」碇真嗣無力地跪在nerv指揮室，眼裡一滴又一滴地掉在地上。，在他看來，綾波麗的死全是因為他不肯出戰，如果他出手的話，也許現在不僅明日香能得救，綾波麗也不用拉著第十五使徒自爆了。
「真嗣，你不要這樣，其實就算你真的出動也改變不了什麼，當時零號機已經被侵蝕了，初號機去了也沒辦法把零號機和第十六使徒分離出來，反倒是初號機很有可能會被一塊兒侵蝕。」葛城美裡搖搖頭說道，第十六使徒出現得太突然了，也許綾波麗的做法是最正確的，不然現在第三新東京市可能就完了。
「可是可是我」碇真嗣還是沒辦法從這個打擊中恢復過來，如果能再選擇一次的話，他絕不會像剛剛那樣坐視不理，現在他已經明白了，很多事不是逃避就能解決問題的，第十四使徒的時候是這樣，剛剛對付第十六使徒的時候也是這樣，碇真嗣的這種性格正是造成這種局面的原因。
「現在不是讓你在這裡哭的時候了，真嗣，你必須隨時準備好對付剩下的使徒。」碇源渡冷冷地走到碇真嗣面前，他的語氣依舊是那麼的冷漠，不過比起武明，碇源渡做事還是有些分寸的，畢竟他不像武明那樣能毫無顧忌地做出決定。
「我知道了。」碇真嗣慢慢地站了起來，這一次，他沒有對父親的冷漠產生反感，碇源渡說得沒錯，現在已經不是哭的時候了，如果他再這樣下去的話，那綾波麗的犧牲就會被他白白地浪費掉。