日軍隨即向林遠部隊所在的陣地發動了猛攻，可是在林遠部隊的強大火力下，日軍一次次無功而返，在這個過程中，直升機一次次地將彈藥運進戰場。
籐田次郎看著那些直升機氣急敗壞地叫道：「把那些討厭的東西給我打下來，快！」
一個日軍軍官無奈地說道：「隊長，它們太高了，我們的什麼武器都打不到。」
籐田次郎咬牙切齒地罵道：「混蛋，支那人都是混蛋！」籐田次郎罵完，轉身對通訊兵說道：「開啟電台，我要和指揮部，水田明遠師團長通話。」
通訊兵答應下來，時候不大線路接通，籐田次郎說道：「師團長，支那人的防線太嚴實了，我們根本就無法突破！」
水田明遠聽見這話，心驟然收緊，說道：「你們無論如何也要把那支林遠部隊給我趕走，如果不把他們趕走，我們的大部隊就無法從山中撤退！」
籐田次郎高聲答道：「明白，我這就組織敢死隊強攻！」
水田明遠無奈地放下話筒，心想：「戰況越來越不妙了，如果不能盡快打開局面，整個部隊就都完蛋了！」
就在這時，突然一個通訊兵一臉驚慌地說道：「隊長，不好了，林遠部隊突破漁郎川防線了！」
水田明遠頓時驚聲說道：「突破了漁郎川防線？怎麼回事？」
通訊兵說道：「林遠部隊調來了大口徑火炮，對我們的防線進行了地毯式攻擊，我們的防線隨即崩潰，無力阻攔林遠部隊的渡江部隊，林遠部隊隨即渡過漁郎川，向我們的駐地發動攻擊。」
水田明遠立刻說道：「命令最近的402聯隊出動，一定要把攻過來的林遠部隊擋回去！明白了嗎？」
通訊兵答應下來，去傳達命令，可是沒過多少時間，又一個通訊兵跑來說道：「師團長，401聯隊發來消息：原本進行阻擊作戰的林遠部隊，突然改變了作戰方式，由阻擊作戰轉為了進攻作戰，現在正在朝我們進攻。」
水田明遠聽見這話頓時一陣絕望，他頹然坐回到椅子上，無奈地說道：「看來我們師團要遭受滅頂之災了。」
一邊的參謀長急忙說道：「師團長，我們趕緊撤退吧，撤到元山去，雖然林遠部隊堵在我們撤退的必經之路上，可那條路還是可以撤走一些部隊的。」
水田明遠搖頭說道：「我從清津撤退到了吉州，現在又要撤退到元山，我就算是到了元山，又有什麼面目去見其他人呢，我是不會撤退的。」
參謀長苦勸了十幾分鐘，水田明遠就是不答應撤退，還讓指揮部的人都撤走，正在僵持不下之時，一個通訊兵風風火火地跑了進來，對水田明遠說道：「師團長，不好了
，一支林遠部隊已經長驅直入，距離我們的駐地就只有十公里了。」
水田明遠沒有說話，參謀長在一邊說道：「林遠部隊發起進攻不過十幾分鐘，怎麼可能瞬間就突破到距離我們只有十公里的地方？」
通訊兵說道：「全是因為401聯隊柴琦大隊的一中隊，那支中隊，整建制向林遠部隊投降，所以林遠部隊瞬間從我們的防線上打開了一道缺口，他們就從這道缺口中進來，向我們發動了攻擊。」
水田明遠站起身來，長歎一聲，說道：「大勢已去，參謀長，你趕緊帶著指揮部的人撤退吧，我要帶領警衛中隊和支那人做最後的戰鬥。」
參謀長咬咬牙，說道：「師團長，既然你不願意撤走，那我們就留下來和林遠部隊一決雌雄！」
水田明遠點點頭，對通訊兵說道：「命令各部隊，分散突圍！師團部將不再對各部隊進行指揮！」通訊兵面色沉重地點點頭，指揮室裡的每個人都面無血色，因為每個人都明白：最高指揮官一但下達了這樣的命令，就說明部隊已經到了死地，絕無生還的可能！
水田明遠說完向部下伸出手，說道：「給我一支槍！」一個士兵把一支步槍送到水田明遠手上，水田明遠一拉槍栓，把子彈推上膛，高聲說道：「跟著我，為天皇陛下獻身的時候到了！」
水田明遠搶先走出營房，眾人炸毀了電台，燒燬了文件，向遠處的戰火衝去……
而接到分散突圍命令的日軍各部，很清楚他們已經被林遠部隊包圍，根本衝不出去，於是向林遠部隊發動了自殺式攻擊，戰鬥一直持續到第二天凌晨才宣告結束，日軍第100師團除戰役開始的時候逃出去的幾個大隊之外，其餘全部被殲滅，以水田明遠為首的指揮部成員都死在亂軍之中。
這次戰役裡，第一次出現了日軍整建制投降的情況，後來林遠部隊調查發現:整建制投降的中隊是新組建的，裡面的士兵本來就是缺吃少穿的農民，而且年紀偏大，都是拖家帶口的，不願意白白送死，於是在中隊長的帶領下，向林遠部隊集體投降。
這讓日軍高層無比震怒，在戰役結束後，日軍取消了第100師團這個番號，以後日軍其他軍種的部隊，也以「100」這個番號為恥，至此，吉州戰役到此結束，這場戰役分為兩個階段，第一階段是金水村攻堅戰，以第九師團遭受重創結束；第二個階段是第100師團殲滅戰，以第100師團和第九師團殘部全軍覆沒而告終。
日軍主力被殲滅，林遠部隊便順勢佔領了吉州，並且一路向南推進，很快就佔領了吉州附近的大片村鎮，林遠部隊在佔領村鎮之後，清除日本的地方政權
，肅清朝奸，深得民心。
林遠看到戰報便興奮地一拍桌子，說道：「朝鮮戰局，已經勝利了一大半了！」
給林遠送戰報的侍從好奇地問道：「林帥，吉州打下來之後我們也不過才佔領了朝鮮的東北部，從地理面積上看不過才勝利了四分之一，您為什麼說我們勝利了一大半呢？」
林遠指著牆上的朝鮮地圖朗聲笑道：「你看看地圖就明白了。」