在伏羲證了人族三皇中的天皇之位後，卻是將共主大位傳給了烈山，經過了一些時日的考察，加上河圖洛書的演算，伏羲亦是清楚，烈山乃是天命地皇，他自然也不會阻止。
烈山氏繼位人皇后，人族在其領導之下豐衣足食，人口又漸漸地增多，而烈山氏又現了五種可以種植，可以食用的穀物，分別是粟麥、稻五種，這五種穀類被人族成為五穀，而烈山氏又被人族尊稱為神農。
在神農的領導下，隨著食物的保證，漸漸的人族手中出現了剩餘物品，人們一點點習慣用自己手上的剩餘東西去和別人交換自己所需要的東西，不過交換過程中出現了不均衡的現象，使得神農十分犯愁。
因為以物易物的事情，沒有標準尺度，難免有偏漏，神農苦思冥想，這時，人族中有智者，發明貨幣，統一價值，神農聞之大喜，立馬發佈貨幣，解決了以物易物的鄙陋。
洪荒時期，雖少有巫妖之禍了，但是生存的環境還是極其危險的，變幻莫測的天氣與毒蟲猛獸，無一不在威脅著人族的生存，畢竟人族實在太孱弱了，神農看著族人們不斷的被病痛侵擾，看著族人們不斷的用生命來判別各種動植物是否可以食用，是不是有毒，能不能加以利用，心中也是難受交加，這時候的醫道還不發達，往往生病的人族就意味著生命的消逝，每一種毒物，通常都要付出幾條人命或更多，神農為了自己的族人，開始繼五穀之後，做出的第二件造福洪荒的大事，神農決定親自嘗百草。
人族中的大臣們紛紛阻止神農的行為，可是神農絲毫不為所動，他心意已決，為了這件有利千秋的大事，他義無反顧。
神農帶著一批臣民，從陳出，向西北大山走去，神農在身邊準備了兩條袋子，左邊的裝能吃的，右邊裝有毒的。他們走了很多的路，腿走腫了，腳起繭了，還是不停地走，整整走了七七四十九天，來到一個地方。只見高山一峰接一峰，峽谷一條連一條，山上長滿奇花異草，大老遠就聞到了香氣。
神農他們正往前走，突然從峽谷竄出來一群狼蟲虎豹，把他們團團圍住，神農馬上讓臣民們揮舞石斧石矛，向野獸們打去，打走一批，又擁上來一批，一直打了七天七夜，才把野獸都趕跑了。那些虎豹蟒蛇身上被石斧石矛一條條一塊塊傷痕，後來變成了皮上的斑紋。
這時，臣民們說這裡太險惡，勸神農回去。神農搖搖頭說：「不能回！天下黎民病了沒醫的，中毒了沒法救，我們怎麼能回去呢！」他說著領頭進了峽谷，來到一座茫茫大山腳下。
這山半截插在雲彩裡，四面是刀切崖，崖上掛著瀑布，長著青苔，溜光水滑，看來沒有登天的梯子是上不走的。臣民們又勸他算了吧，還是趁早回去。神農搖搖頭：「不能回！天下黎民病了沒醫的，中毒了沒法救，我們怎麼能回去呢！」
他站在一個小石山上，對著高山，上望望，下看看，左瞅瞅，右瞄瞄，打主意，想辦法。後來，人們就把他站的這座小山峰叫「望農亭」。
然後，他看見幾隻金絲猴，順著高懸的古籐和橫倒在崖腰的朽木，爬過來。神農靈機一動，有了！他當下把臣民們喊來，叫他們砍木桿，割籐條，靠著山崖搭成架子，一天搭上一層，從春天搭到夏天，從秋天搭到冬天，不管颳風下雨，還是飛雪結冰，從來不停工。整整搭了一年，搭了三百六十層，才搭到山頂。
這就是後世神農架的由來。
在山上，白天，神農領著臣民到山上嘗百草，晚上，他叫臣民生起篝火，他就著火光把它詳細記載下來：哪些草是苦的，哪些熱，哪些涼，哪些能充飢，哪些能醫病，都寫得清清楚楚。
有一次，他把一棵草放到嘴裡一嘗，霎時天旋地轉，一頭栽倒。臣民們慌忙扶他坐起，他明白自己中了毒，可是已經不會說話了，只好用最後一點力氣，指著面前一棵赤色的靈芝草，又指指自己的嘴巴。
臣民們慌忙把那紅靈芝放到嘴裡嚼嚼，喂到他嘴裡。神農吃了靈芝草，毒氣解了，頭不昏了，會說話了。從此，人們都說靈芝草能起死回生。
正值神農忙於嘗百草，利益萬民之時，天外飛來一鞭入了他手，同時腦中也傳達了一道信息，原來這鞭子乃是赭鞭，用此物觸及植物可用來鑒別百草的藥性，是青虛耗費心神煉製，也是一件後天靈寶了神農得到了赭鞭，頓時驚喜萬分，連忙跪下向東，三拜，對嘗百草，也更加有信心了。
此後神農嘗完一山花草，又到另一山去嘗，還是用木桿搭架的辦法，攀登上去。一直嘗了七七四十九天，踏遍了這裡周圍的山山嶺嶺。他嘗出了三百六十五種草藥，
神農嘗完百草，為洪荒人族找到了醫病的草藥，便準備下山回去。他放眼一望，遍山搭的木架不見了。原來，那些搭架的木桿，落地生根，淋雨吐芽，年深月久，竟然長成了一片茫茫林海。
神農回到部族之後，就回到自己的大帳開始整理自己這些年嘗百草的認知，經過兩年的時間，神農終於完成了洪荒中第一部醫術《神農本草經》。
卻說神農在家修注《百草經》之時，卻不免冷落了家人，神農有個女兒名叫女娃，最得神農喜愛，卻也是非常懂事，他見父親忙碌便也不去打擾，只能無聊遊玩，一日聽到有人說東海美景，波瀾壯闊，頓時心生了想法，瞞著神農，獨身一人往東海而去。
到了東海，女娃見到大海之廣，滔天捲浪，不由心生震撼，更覺驚奇，也不顧好歹，尋了一小舟，入海中，恰巧一道大浪花湧來，一下子把小舟打翻，女娃落入海中，正要被淹死的時候，卻有一白龍救了她，原來此龍正是東海龍王三太子，自從四海龍王叛離龍族，他們的子嗣妻女也是慘遭禍患，雖然事先轉移，可畢竟家大業大，也不能全部救出，到底還是有些人來不及轉移，如今成為了過街老鼠的地步，死的死，淪為奴僕的淪為奴僕，這東海龍王三太子如今早已經不是龍族太子了，自從外出遊玩，正好躲過了一劫，如今也是一條野龍，見母親與幾位哥哥妹妹身死，龍三太子發誓要報復龍族，一直隱藏在東海中修煉，這次也是他注意到女娃。
說來也巧，這龍三太子曾去人族中遊玩過，畢竟東海中對他太危險，要不是甚為龍族，離開了水，修煉太慢，只怕早已經捨棄而去了，不過也有了時間，常去人族逛逛，如今人族為洪荒主角，他要報仇，卻想在人族中撈取些好處，提升下修為，在人族中，女娃地位非凡，他早見過了，這次見地皇之女有危險，頓時覺得這是一個大好機會，連忙顯化出了龍身，救了女娃一命，與地皇結下一個善緣，他卻是不知道，這不僅是與地皇神農的一個善緣，更與東海有了大因果。
本來，女娃死在東海中，會怨氣沖天，化為精衛鳥，立誓填海的，雖是徒勞無功，可總歸是東海的禍端，如今因為龍三太子出手，這禍端也消除了，整個東海欠下了龍三太子的一份因果。
有了龍三太子，女娃在東海中再無危險，安全的遊玩了一天，直到日落黃昏，在龍三太子的陪伴下，回了陳都，見過神農，頓時神農連忙拜謝龍三太子的大恩，有了這件事情，龍三太子也是與人族氣運有了一點聯繫，自身氣運大增，修煉更是順風順水。
這些事情，青虛也看在了眼中，心中感慨，因為他的插手，洪荒大勢沒有改變，小勢卻已經變了太多，要是以往的龍三太子，見到女娃落海，怎麼可能會無聊的救人。
……
在人族都城陳都的北方十萬里處，有一個人族的中型部落，名叫有熊，依靠在姬水附近，君主名曰少典氏。他的夫人有二，一是女登，二是附寶，她們是姐妹，是有礄氏之女。
有一天晚上，附寶見一道電光環繞著北斗樞星。隨即，那顆樞星就掉落了下來，附寶由此感應而孕。懷胎24個月後，生下一個小兒，這小兒剛剛出生，有熊部落的外面就來了一個道人。
衛兵自然把有道人來訪的事情報告給了族長少典。少典聽聞有修士到來，不敢怠慢，放下孩子，急急忙忙迎了出了。
迎到部落的門口，少典看見一穿月白道袍的修士，相貌非凡。少典急忙施禮，這道人，打一稽，還禮，「我乃盤古玉清聖人元始天尊大弟子廣成子，今特來收令兒為徒，族長不必客氣。」原來是青虛知道軒轅降生，特意讓廣成子到來收徒，否則，只怕原始天尊算到這事，會讓青虛來收徒，對於這人皇之師的功德，青虛也看不上眼，何不成全了廣成子，現在的廣成子修為也到了大羅金仙的門檻，有了這些人皇之師的功德，順理成章的進入大羅金仙不是問題。
少典一聽，馬上想了起來，這道人竟然是闡教門下，便馬上興高采烈的帶著廣成子來到了部族中央的大帳，神農得到過闡教仙人的指點，這件事情在人族中也不是什麼秘密，故而，在人族中，闡教的地位與威望還是很大的。
來到大帳之中，少典請廣成子上座，自己陪在下，吩咐手下的族人去叫附寶帶著新生的小兒前來。
不多時，附寶抱著一個孩子旁邊來到了大帳。正與少典談話的廣成子的目光不禁投到了那孩子的身上，滿意的點了點頭，「天生的道胎，還真是一塊璞玉啊。」
附寶不知道什麼事情，可是那少典可是聽聞了這仙師要來收徒弟，其忙上前，「這孩子初生，還請仙長賜名。」旁邊的附寶也是聰慧之人，一聽少典喊出仙長二字，急忙看了看廣成子。
這時廣成子道：「這孩子與我有緣，生於軒轅丘附近，賜名軒轅。今貧道特來收徒，此子當為我親傳弟子，貧道現要帶其回山細心教導，待十八年後軒轅自會歸來。」
附寶聞言雖然不捨，但附寶也是聰慧之人，知能得闡教仙人收為弟子日後必能成為一大才。廣成子見少典夫婦已然同意便說道：「那貧道就將其帶走了，十八年後貧道便會放其歸來。」說完便駕祥雲向九仙山飛去，此處值得一提，巫妖之戰結束後，闡教門下弟子，大多出外尋找到靈山福地，開闢了洞府。
青虛在青峰山開闢了紫陽洞，其他門人，也各自開闢了仙府，如廣成子在九仙山開闢桃源洞，赤精、子在太華山開闢雲霞洞，懼留孫在狹龍山開闢飛雲洞，太乙真人去乾元山開闢金光洞，黃龍真人到去二仙山開闢了麻姑洞，文殊道人五龍山開闢雲霄洞，普賢道人去九宮山開闢白鶴洞，慈航道人到普陀山開闢落伽洞，靈寶法師在崆峒山開闢元陽洞，玉鼎真人去了玉泉山開闢金霞洞，道行道人在金庭山開闢玉屋洞，除了十二仙，還有雲中子，去往終南山開闢了玉柱洞府，只有南極仙翁留在了崑崙山中。
……
洪荒之中有個大部落，乃是由畎夷、於夷、方夷、黃夷、白夷、赤夷、玄夷、風夷、陽夷九個部落組成，合稱九黎或九夷，每個部落之下，還各有九個氏族，共計八十一個，人口之繁盛，實力之龐大。當有熊軒轅降生過後不久，九黎也得了一子，生有一十七斤重，七歲方出口能言，自改名姓為蚩尤，長至如今已是十三歲，身高兩丈，不拜天地，不尊三清聖人，不修世間道法，天生便有千鈞神力，徒手撕裂虎豹猶如兒戲，一身凶悍煞氣，洪荒異獸亦是不敢招惹於他。如此武勇，族長黎軗素來看重，有意立其為繼位人選。
這蚩尤何許人也？前世乃是十二祖巫之下，巫族有數的大巫之一，一身修為通天，少有人可比，在巫妖之戰中，僥倖不死，後來后土化了六道輪迴，卻是借助化六道的大勢，耗費巨大心血，加上蚩尤捨去了大巫之體，畢生修為，諸多大功夫，成功的把他投胎到了人族中，讓他有機會成為人皇不說，更是有了人之體，修道也有了指望，加上地府巫族為他後盾，前途不可限量。
此時洪荒巫族，殘餘精英大多聚於地府之中，有大巫刑天、相柳、九鳳、河師、雨伯，至於十二祖巫殿與盤古殿，也搬入了地府中，蚩尤轉世過去了十幾年，眼看時機成熟了，立刻告別了父親族人，下了地府，尋求巫族幫助。
七日之後，蚩尤攜刑天、相柳等十餘位大巫回至部落，各大巫皆言自己敬服蚩尤武勇，乃是隨他投奔而來，九黎舉族震驚。
九黎族長黎軗剛正豪邁，素有威望，但也是個缺謀少智之人，只道部落得了強助，實力更上層樓，卻沒去想過引狼入室之說。此番事過，在他看來，可以降伏巫族餘眾的蚩尤，實在是天命所歸，九黎大興之主，是以不出一年，他便禪位相讓，讓蚩尤掌得大權。
轉世成人的蚩尤，倒也並不只是一個好勇鬥狠之徒，二十多年的做人生涯，已然頗具心機。其時九黎部落仙術道法興起，求道之士極多，族人和其它部落一般無二，拜的是三清聖人，人族聖母女媧娘娘，供的是天庭神仙——雖然職空仙缺。大巫實力強橫不假，但畢竟是外來戶，強行爭權奪利，即便成功也是徒然傷了九黎元氣。
巫族立足未穩，蚩尤也不急著與神農交惡開戰，只是派遣不斷加入部落的巫族精英，率領九黎族人橫掃吞併周圍部落，這大巫戰力何等驚人，順昌，逆亡，猶如秋風掃落葉一般，擴充九黎人口實力。藉著這等戰功，蚩尤逐步提升巫族地位，而九黎八十一個氏族的大權，漸為其中的大巫所掌。十幾年過後，九黎以劫掠征戰為主，勞作收穫為輔，勢力範圍反倒在閉門不出苦修《百草經》的神農所統轄勢力範圍之上，且族人能征善戰，凶悍異常。而這些個大巫兼氏族族長，對外則稱為蚩尤八十一兄弟。
……
話說那有熊軒轅上九仙山隨廣成子學藝十八載，廣成子見時機已到便讓軒轅回族，軒轅回族後其父少典氏便傳位與他，從此軒轅便為有熊一族之長。
那軒轅經廣成子授治世之能、道法神通，有大德，眾尊服，自離九仙山，回族中之日起，興獵耕，福無數人眾，功德顯彰，有皇之相，又因出身聖人門下，週遭部落無不與之親近，入其盟愈來愈多。