扶蘇生死未知的消息終於在十天後傳到了咸陽城，當李斯得知後，心中略有驚訝，他心頭總有一股不祥的預感，「難道李由沒有見到皇長子？」他暗自琢磨。
至於趙高，扶蘇的生死不知雖然讓他很不滿意，但，既然事情已經到了這個地步，他也只能再想辦法了。
「什麼？扶蘇遇刺生死不知？」始皇帝聽到趙高的匯報，他孱弱的身子驚訝的站起來，指著後者，嘶聲喝問道。
趙高那獨有的雌性聲音再次響起，他的表情十分凝重，說道：「正是，皇長子悄悄離開咸陽城，在泗水郡沛縣至譙縣的途中被六國殘餘所行刺，而今皇長子失蹤，生死不知。」
始皇帝聞言，他的身子晃了晃，趙高見此，急忙上前恭敬的扶住，輕聲說道：「陛下，您沒事吧。」
始皇帝倔強的神情揮了揮手，他悲愴的拍著案台，心頭充斥著悶火，咬牙切齒狠厲的說道「六國殘餘，這群鼠輩，妄圖毀我大秦基業。趙高，傳朕旨意，所有郡縣，凡六國貴族殘餘一律滅族，凡包庇私藏六國殘餘者滅族，凡拒抗亂言者滅族。」
一連三個滅族，始皇帝恐怖的怒火似乎才得以宣洩，而後他虛弱的身體終於在扶蘇遇刺的打擊下暈倒了過去。
趙高見此，急忙召喚太醫，同時又將始皇帝的旨意頒發下去。當群臣得知扶蘇遇刺後，議論之聲自然難免，尤其是原先認為李斯危也的那些人，這個時候再看向李斯，眼神也好轉了許多。若是扶蘇遇刺身亡，那蒙氏的所有投資都將付諸東流，李斯和李氏又怎麼可能被摧毀呢？
當然，也有許多保扶蘇的人，紛紛將矛頭指向李斯，認為此乃後者的毒計，倒是趙高這個閹貨落得了逍遙。對於這一點，李斯自然有自己的渠道得知，然而，始皇帝的旨意在那裡，他們雖然私下傳言，但也不敢公開訴說，因為，這是要滅族的。
扶蘇生死未知令人擔憂，然而始皇帝暈倒的事情更讓群臣放不下心，他們總感覺一股風雨飄搖的時刻即將到來。太醫們自然焦急萬分，始皇帝至今仍處在昏迷中，此乃氣血攻心所致，草藥之類無法起效，只能依靠始皇帝自己甦醒。
終於在第三日，一直讓群臣和眾皇子擔心的始皇帝醒了過來，此時的他第一個召見的便是李斯，見到後者，始皇帝躺在床榻上，虛弱的說道：「李斯，你輔佐朕統一六國，創造我大秦萬年的基業，朕待你不薄，甚至常與你共飲共食。」
聽到這番話，李斯感慨萬分，始皇帝所說不錯，原本他一小吏，為了出人頭地，出師荀子來到秦國輔助始皇帝，最終他如願以償的坐到了丞相的位置，這一切，自有他的努力和謀略，當然更多的也有始皇帝的賞識和恩賜。若是拋卻雙方的身份，兩人的確是多年信任的好友。
「朕只想問你，扶蘇是否是你派人行刺？」始皇帝閃過一絲狠辣，沉聲的問道。
聞言，李斯心中忐忑，不過還是立刻恭敬的回答道：「陛下，斯雖然想保全李氏，但也不會做出如此悖逆的事情，此事與斯絕無任何干係，請陛下明察。」
李斯並未說出趙高的陰謀，若是扶蘇還活著，或許面對始皇帝的問話，李斯還有可能講出實情，但現在，一切都晚了，已經是挽不回來的局面了。同時他又想到自己長子李由，心中不免生起怒意，暗道李由為何沒有去護送扶蘇。
始皇帝閉上了雙目，沉默了片刻，最後才再次開口說道：「你退下去吧。」
「諾！請陛下保重身體。」李斯行禮退去，不過背後已經滿是冷汗。
「李斯……」突然，剛剛轉身的李斯，又被始皇帝喊住。
李斯身子一顫，非常擔憂的轉過來，恭敬的彎腰等待著始皇帝的吩咐。
「帝國還需要你，朕還需要你，你可明白朕的意思？」始皇帝略有歎息的說道。
「斯必鞠躬盡瘁為帝國為陛下分憂。」李斯再次鬆了一口氣，立刻表態。
「嗯。傳朕旨意，扶蘇遇刺之地，百里範圍化為焦土，朕要讓那片土地陪伴我兒。」始皇帝躺在床榻上微微點了點頭，冰冷的說道，隨後才讓李斯退下去。
現在扶蘇生死未知，觀眾皇子中，無一人可以繼承他的大業，始皇帝不由心生悲歎，現在的帝國還需要他，他不可以倒下，他要尋到扶蘇，或者再培養一個繼承人，否則，他即便是升仙，也放不下心啊。
始皇帝原先嚴禁亂言的旨意，實際上是在保護李斯，因為，正如他所說的那樣，在沒有第二個繼承人之前，帝國少不了李斯。
或許就是這樣一種焦急或者說病態的心理，讓始皇帝醒來後更加瘋狂的想要成仙，想要長生不老，他不願意看到自己親手創建的帝國毀於一旦。為了長生，始皇帝再次大肆服用仙丹靈藥，更是命趙高招募全國道士仙師進宮煉丹和傳授養生之道。短短幾日，整個咸陽宮一片藥香和丹爐的煙火。
趙高每日服侍始皇帝，自然知道後者瘋狂舉動的意圖，然而，面對這般情況，他卻未曾進行阻攔和勸說，他就像一隻老狐狸，從來不在始皇帝面前留露自己的小聰明，這也是為何他能受到始皇帝信任的原因之一。
然而，始皇帝原本就虛弱到極點的身體，在丹藥強烈藥力的刺激和充斥下，根本就無法吸收的五臟六腑終於被損傷的無法修復。一心想要長生，卻因扶蘇的遇刺而盲目不顧身體服食丹藥的秦始皇終於再次昏迷。
次日，整個咸陽宮甚至是咸陽城都籠罩在悲愴的氣氛中，千古一帝秦始皇未能完成他的心願，帶著遺憾和成仙的美夢，於公元前212年，即始皇帝三十五年，死於咸陽宮。
可悲！可歎！一心長生，卻也死在了長生路上，千古一帝創造的大秦帝國，未來將何去何從乎？