乾隆四十九年元月丁未。上南巡。車駕發京師。命皇十一子永瑆、皇十五子永琰、皇十七子永璘、隨駕。諭；「朕巡幸江浙。省方觀民。鑾輅所經。宜施渥澤。用溥春祺。所有經過宜隸、山東、地方。本年應徵地丁錢糧。俱著加恩蠲免十分之三。該部即遵諭行。」此令一下，全國的百姓有陷入一種空前的振奮之中，聖上南巡雖然減免了地方不少的稅負，但是南巡的各項示意最終還是要壓在南巡所過地方之中，地方官員也要以此加大對管轄區域民眾的剝削，所以南巡對於江南的百姓來說，並不是一個好消息。
是日、駐蹕黃新莊行宮。
戊申，諭；「此次南巡。經過直隸、山東、二省。所有辦差文武各官。住俸、罰俸、降級之案。俱著加恩准其開復。如無此等參罰案件者。各加一級。」
是日、駐蹕涿州行宮。翼日如之。
己酉。孝聖憲皇后忌辰。遣官祭泰東陵。
庚戌。又諭曰、衍聖公孔憲培、現在制中。到曲阜時。並其本家官員人等。毋庸賜宴。並著於中水地方送駕。賜扈從王公大臣、及直隸官員等食。此次南巡。所有直隸、山東、派出辦差兵丁。著加恩賞給兩月錢糧。
是日、駐蹕紫泉行宮。
辛亥。諭、朕巡幸江浙。上年業經降旨。照從前之例。於江浙兩省、冬兌漕糧內。各截留十萬石。豫備臨時平糶之用。所有此次減歇漕船。向例止給一半月糧。於該丁等生計。未免拮据。著加恩、於應給月糧外。再賞給十分之二。以示體恤。該部即遵諭行。
是日、駐蹕趙北口行宮。
壬子。諭、貴州提督敖成。前在金川軍營。著有勞績。擢任提督。於營務亦能實心整飭。今聞溘逝。深為軫惜。著加恩晉贈太子太保。所有應得恤典。著該部察例具奏。以貴州鎮遠鎮總兵保成、為貴州提督。江西九江協副將李傑龍、為鎮遠鎮總兵。
是日。駐蹕思賢村行宮。
癸丑。遣官祭先儒毛萇祠。
是日。駐蹕太平莊行宮。
甲寅。諭曰、廣東巡撫尚安、現在丁憂。孫士毅、著調補廣東巡撫。所遺廣西巡撫員缺。著吳垣補援。廣西布政使瑺齡、去冬陛辭。此時諒已抵任。孫士毅接奉此旨。著將巡撫印務。即交瑺齡護理。速行馳赴新任。彭元瑞。著調補吏部右侍郎。金士松。著調補兵部右侍郎。所遺禮部侍郎員缺。著陸費墀補授。
是日。駐蹕紅杏園行宮。
乙卯駐蹕絳河行宮。
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乾隆四十九年甲辰。二月。丁巳朔祭先師孔子。遣大學士三寶行禮。
丙寅。上謁少昊陵。至曲阜謁先師廟。遣官祭啟聖林、及顏子、曾子、子思、孟子祠。是日。駐蹕古泮池行宮。
丁卯。孝康章皇后忌辰。遣官祭。孝陵。上詣先師廟。行釋奠禮。詣孔林酹酒。詣元聖周公廟行禮。
戊辰。遣官祭黑龍潭昭靈沛澤龍王之神。玉泉山惠濟慈佑龍王之神。
戊寅。上祭河神。渡河。詣陶莊河神廟、風神廟、行禮。命皇十一子永瑆、祭河瀆之神。皇十五子永琰祭淮瀆之神。皇十七子永璘、祭順黃壩河神廟。睿親王淳穎、祭楊莊金龍大王廟。遣官祭故河道總督靳輔、齊蘇勒、嵇曾筠、高斌等祠。
庚辰。遣莊親王永瑺、祭寶應縣湖神。
壬午。孝昭仁皇后忌辰。遣官祭景陵。諭、朕巡幸江浙。已降旨將經過地方本年額賦。蠲免十分之三。而省會駐蹕之地。恩膏更宜優渥。著將江南之江寧、蘇州、浙江之杭州、所有附郭諸縣。本年應徵地丁錢糧。概予豁免。俾近光黎庶。無事輸將。益享盈寧之福。該部即遵諭行。
乾隆四十九年。甲辰。三月。丙戌朔。上祭江神。渡江。幸金山。命皇十一子永瑆、祭江瀆之神。皇十五子永琰、祭金山之神。
丁亥。祭先農之神。遣恆郡王永皓行禮。
辛卯。遣官祭周泰伯祠。先賢言子祠。宋臣范仲淹祠。韓世忠祠。故大學士蔣溥墓。巡撫湯斌祠。張伯行祠。總河陳鵬年祠。以禮部右侍郎莊存與、為會試知貢舉。大學士蔡新、禮部尚書德保、為正考官。兵部左侍郎紀昀、工部左侍郎胡高望、為副考官。
乙未。上詣蘇州府文廟行禮。遣官祭歷代帝王廟。鑄給四川新疆管屯同知佐雜各官關防。從調任成都將軍特成額請也。豁免江西吉安幫糧船乾隆四十八年、遭風漂沒額糧、一千七十六石有奇。予故貴州提督敖成祭葬如例。謚勇愨。旌表守正被戕山東鄒縣民楊明子媳劉氏。以巡捕中營副將蘇靈、為甘肅涼州鎮總兵。甘肅安西協副將雙喜、為西寧鎮總兵。
是日、駐蹕蘇州府行宮。