半個時辰以後，得到朱由檢授意的顧炎武重新提審王至發等人，先是疾言厲色地道：「爾等欺君、行賄、偷逃田賦數額巨大，依律當斬！」
王至發等人一聽就嚇得體如篩糠，連連叩頭求饒-顧炎武心中暗笑，卻換了一副溫和的表情道：「但本官方才思慮再三，覺得爾等尚有可恕之處。比如投獻偷稅之事，由於年代太過久遠，很多具體數字現已無法查清，再說管莊太監也要承擔一半責任；行賄嘛，依你所言，這幾萬兩是捐給衙門的，也勉強說得過去。只有欺君一節，例無可恕，卻要本官如何迴旋？」
王至發等人見顧炎武有為自己開脫之意，自然拚命抓緊這根救命稻草，痛哭流涕地道：「但憑大人吩咐，只要能留下草民性命，草民願傾盡家財，全家老小為大人做牛做馬…」
「好了好了，人豈有做牲畜之理？」顧炎武嘲諷地笑道，「本官畢竟是初來乍到，你們幾位是當地累世鄉紳，熟悉風土人情，衙門辦事少不得你們的支持。因此儘管你們罪責不輕，本官還是想救你們這一次。按理說欺君之罪絕不可赦，但若是真投獻而不是假投獻，那也就算不得欺君之罪了。你們掛在皇莊名下的田產…」
王至發等人也不傻，自然明白了顧炎武的意思。對於地主來說，土地可是他們的心頭肉，幾輩子巧取豪奪才積攢下來這麼多，讓他們把地交出來，那可比剜肉還疼。
但是看顧炎武的意思，如果還死攥著這些田產，自己的腦袋可就要搬家了，孰輕孰重，地主們還是分得清的。於是王至發趕緊道：「只要不殺草民等，草民等情願將所有田產獻給萬歲爺以贖罪！」
其他三個地主也紛紛表態。顧炎武卻輕輕搖頭道：「按理說本該如此。但把田產全獻出去，你們一家老小如何生存？這樣吧，本官好人做到底，只要你們獻上一半田產，再補繳這一半田產最近十年少繳的田賦，本官就在萬歲面前捨命為你們求一次情。當今萬歲乃寬仁聖君，也許就能赦了你們，也未可知。」
這時候王至發等人哪還敢討價還價，反覺得顧炎武是真心為他們著想，無不感激得嚎啕大哭，並賭咒發願，今後不論顧炎武要做什麼事，他們一定全力支持。
顧炎武見目的達到，便命衙役釋放王至發等人，並差人立即取來他們的地契，當場做了交割。這四人原本合計有田地三千頃，這一下子就被劃走了一千五百頃。顧炎武還專揀離通惠河和官道近的地劃，難民們的安置點問題自然迎刃而解。
半刻之後，聽完顧炎武的詳細匯報，朱由檢歎了口氣道：「唉，讓他們撿個便宜！這樣吧，你把此事經過和處置方法寫個奏折，馬上遞進內閣，朕要看看大臣們有什麼反應。如果沒有太大的反對意見，朕就以此為成例，派人徹查全國皇莊，清理投獻問題。」
當天傍晚，顧炎武的奏章就遞進了內閣，真可謂一石激起千層浪。到了第二天下午，內閣把一大摞奏章直接轉了過來，朱由檢粗粗一點，至少有七八十份。
朱由檢一一瀏覽，看罷不禁雙眉緊鎖。原來他認為，自己對王至發等人已經算是寬大處理了，沒想到竟有一多半大臣認為不該沒收投獻的土地。
他們還真是振振有詞，說投獻算是積弊，少繳了多少田賦，因為年代久遠根本無法清查，如果罰沒一半田地，未免處罰過重。而且地主是民，管莊太監算是官，若不是管莊太監脅迫利『誘』，地主們也不敢做這種事，所以偷逃的田賦主要還是得向那些太監討要。至於這些地主，頂多補繳幾年田賦也就算了，田地本來也不屬於皇莊，還應發還本人，方顯皇帝之寬仁。
不出意外，持這種主張的，絕大部分是東林系官員。另有一部分官員，以戶部尚書王在晉和戶部侍郎畢自嚴為首，認為罰沒一半投獻田產並無不當，但不該劃入皇莊，而應劃入官田。
官田也叫公田，顧名思義，就是歸官府所有的田地。按照明代制度，官田由官府耕種。當然官府的官吏既不會自己去種地，也不會花銀子雇工，他們只需派役，也就是讓普通農戶出徭役，說白了就是白使喚老百姓替他們幹活。官田的出產，一部分以比民田高得多的稅率上繳戶部，剩下的則歸官府支配，換句話說就是進了當地衙門的小金庫。
王在晉和畢自嚴有此主張，倒也並非沒有道理。早在嘉靖年間，因為皇莊佔地越來越多，朝野上下怨聲載道，嘉靖皇帝曾將一部分皇莊改稱「官地」，撤回管莊太監，由當地有司代管，並聲稱不再增加皇莊數量。王畢二人自然是想以此為理由，把這些土地劃歸戶部，好多收些田賦，改善入不敷出的窘境。
只有溫體仁、周延儒、黃宗羲、王夫之等少數官員支持顧炎武的處理方案。黃王二人是顧炎武的密友，而且他們認為這個方案也算是比較中庸，各方都可接受。
至於溫體仁和周延儒，他們自是早就看透了，這個方案不可能是顧炎武自己提出的，肯定是得到了皇帝的授意。既然皇帝要這麼辦，那就得這麼辦，誰要是反對，他們就恨不得咬誰；而且是反對的人越多、官越大越好，全讓他們咬下去最好，這樣他們就可以繼續往上爬，進一步擴張自己的勢力了。
看完所有奏章後，朱由檢問顧炎武：「忠清（顧炎武字忠清），你覺得諸臣所議如何？」
顧炎武謹慎地答道：「陛下，臣以為不罰沒投獻之地，不足以懲戒這些奸佞之徒，陛下只罰沒一半已經是莫大的恩典了。諸臣為其開脫，實不足取。但王、畢二位大人所奏，似乎不無道理，還請陛下斟酌。」
朱由檢聽了搖頭笑道：「忠清，你以為朕是貪圖那點田賦麼？朕意已決，其他投獻之地，一律依此處置！」
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