瞭解完秦兵的狀況後，李定國和李來亨又簡要介紹了敵人的情況。原來這兩員大將都是有心人，看出朱由檢對作戰計劃很動心後，就各自提前派出偵察兵，冒充走私的商人，到包克圖做了一番偵察。兩方的情況互相印證，就可大略掌握蒙古人的兵力分佈了。
原來鄂爾多斯部內部又分為六旗，每旗約有兩千戶，共約一萬餘戶；每戶的青壯年男子少則一人，多則三四人。蒙古人是「馬背上的民族」，每個成年男子都是戰士，因此共有二萬左右騎兵，剩下的就是老弱婦孺了。其中他們的酋長帖木爾自轄達拉特旗，號稱「青山汗」，就在包克圖一帶遊牧。其餘五旗則以包克圖為中心，或近或遠地分佈著。
說起來，鄂爾多斯部的兵力與秦兵也不相上下。但自從隆慶年間「俺答封貢」後，西北邊境相對較為穩定，鄂爾多斯部已經數十年沒經歷過大的戰爭，族人較為懶散，整日沉迷於美酒婦人，戰鬥力大打折扣。
不過現在已經入秋，隨著天氣轉涼，蒙古草原上的其他部落會逐漸向南遷徙。這些部落儘管平時為爭奪草場，偶爾也會有衝突，但面對漢人，總是一致對外。如果等到那些部落趕到河套地區，那可就比較麻煩了。
瞭解了所有相關情況後，朱由檢終於下定決心，事不宜遲，立即展開復套作戰。在他看來，不管是哪個部落，總歸都是蒙古人；只要是蒙古人，就是大明、也是他朱由檢的仇敵。此番復套作戰，不但是為了收復失地，為千千萬萬被蒙古人殘殺的漢人百姓報仇，也是為了告慰李崇瑤的在天之靈！
復套作戰計劃基本採取李定國的方案。整個行動分為三個階段。第一階段是以少量兵力突襲包克圖，將長期在那裡設集市做生意的蒙古人全部殲滅，並迅速建立防禦工事；第二階段是用這少量兵力吸引鄂爾多斯部的大部兵力來圍攻，並且死死地拖住他們；第三階段則是以主力騎兵部隊對敵軍進行反包圍，裡應外合一舉殲滅之。
這個作戰計劃雖然構想巧妙，但實施起來難度也很大，每個階段都面臨不同的困難，而最困難也是最關鍵的就是第二階段。其難度在於，在這個階段不能投入兵力太多，否則以蒙古人的狡猾程度，很可能會放棄包克圖北遁入茫茫草原，那就無法實現全部落殲滅的作戰意圖。
但兵力太少，又有被敵人一口吃掉的危險。尤其是包克圖地勢平坦，無險可守，當蒙古人的上萬大軍發起衝鋒時，如果與之硬拚，即使是秦兵的主力部隊也難有勝算。
因此在這種情況下，以配備火器的步兵和車兵為主，構築臨時工事，用陣地戰抵禦蒙古人，使敵人失去騎兵的傳統優勢，就成了朱由檢惟一的選擇。在這方面，第一團無疑沾了很大的光，他們不但火器裝備最好，新加入秦兵的五百戚家軍也暫時劃歸一團，那數十輛戰車和幾十門小型佛朗機炮可是陣地戰的利器。
因此在經過反覆討論之後，朱由檢做出決定：以解勝的第一團兩個步兵營、一個車兵營、一個工兵營、外加五百戚家軍，和李定國的第二團一個步兵營、一個車兵營，共約三千兵力，承擔第一階段和第二階段作戰任務。
而四個團的所有騎兵營、偵察營共約五千兵力，隱匿在包克圖以南的沙漠中，負責決定性的第三階段作戰。解勇的第五團則抽出騎兵和偵察兵做為預備隊，一旦戰事不利，負責接應主力撤出戰鬥。
由於兵力一分為二，在誰擔任戰場最高指揮官的問題上，又發生了激烈的爭執。朱由檢本來打算親臨包克圖指揮作戰，但所有將領一致堅決反對，理由是戰場太過危險，尤其是還要故意被圍困一段時間，秦王一旦有個閃失，那一切都失去意義了。
朱由檢拗不過眾將，也只得退而求其次，跟隨騎兵部隊參加第三階段的戰鬥。這回誰再攔也不管用了，如此重大艱險的作戰，朱由檢不可能縮在大後方。這個時代又沒有電報電話，根本無法遙控，朱由檢做為全軍主帥，必須親臨一線掌握敵情。而且他對整個部隊的士氣激勵作用，也是任何人無法代替的。
接下來郝永忠和李來亨又想搶著去參加第一階段和第二階段的作戰。因為他們心裡很清楚，相對於圖窮匕現的第三階段，被敵軍重重包圍的第二階段更為危險。這麼艱巨的任務，他們可不想推給戰友，都想把指揮權搶過來，自己去面對蒙古人的瘋狂進攻。
朱由檢卻把臉一沉道：「本王已經做出了決定，你們就不要再爭了。第一團和第二團對火器和車戰運用更為嫻熟，而第三團和第四團騎兵有優勢，本王這也是量才而用。前兩階段，由李定國負總責；第三階段，本王親自指揮！兵貴神速，本王給你們三天時間返回駐地動員部隊，三天之後必須出發，先到李來亨的鄜州集結。但是不可提前透露行動計劃，只說是正常訓練。從出發到集結完畢，大概需要五天；鄜州距包克圖八百餘里，又途經沙漠地區，步兵和戰車至少也需要十天時間。今天是七月初八，我們要爭取在月底之前結束戰鬥！」
令出如山，除瞭解勝之外，其他四員大將當夜就離開了秦王莊。解勝的第一團立即開始緊鑼密鼓的備戰工作，將士們雖然不知道將要有什麼行動，但那山雨欲來的氣氛還是讓所有人都感到緊張和興奮。
為了嚴格保密，朱由檢對任何人都沒透露作戰計劃，除了蕊兒和戚美鳳。蕊兒要一如既往地負責秦王府的大小事務；戚美鳳則要深居簡出，做出秦王貪戀女色的樣子，以迷惑無孔不入的東廠和錦衣衛。
剛剛成婚就要分別，戚美鳳當然有些不捨；但她是最能理解朱由檢的軍事思路的，只是緊握住朱由檢的手，簡單而深情地叮囑道：「王爺保重！」
朱由檢自然知道這「保重」二字的千鈞份量。三日之後，藉著送岳父戚顯宗東歸的機會，第一團的遠征軍浩浩蕩蕩地開出秦王莊駐地。
戚顯宗沙場老將，豈會看不出些端倪，只是語重心長地拱手道：「殿下，末將告辭了。西北戰局混亂，正是英雄用武之地，望殿下善保貴體，以待時局之變。」
當戚顯宗一行漸漸消失在官道的盡頭後，朱由檢回望了一眼巍峨的秦王莊城牆，在棗紅馬上挺直胸膛，對身旁的解勝道：「傳令下去，全軍開拔！」