側妃包玉憐有了身孕，這可是秦王府的一件大事。為此朱由檢免去了她的工作，讓她專心在府中養胎。正好因為民團暫無合適的軍官，武功高強的蕊兒不得不臨時代管，府中雜務無人料理，包玉憐可以頂替她幾天。
包玉憐還有些不情願，因為天天給附近的百姓看病，已經培養出感情來了。但朱由檢卻告訴她，孕婦的抵抗力本來就差，現在又正值春夏之交，天氣越來越溫暖，各種病菌也進入了活躍期。萬一讓病人傳染，那可就了不得了。
「病菌」這個概念，朱由檢並沒有和別人提起過，但卻告訴了身為醫生的包玉憐。
包玉憐還半信半疑地道：「王爺，這些東西您都是從哪裡聽來的？既然『病菌』肉眼不能得見，您又怎麼知道它們是致病原因？」
「總之你聽為夫的沒錯！」朱由檢也沒詞了，只好敷衍道，「等什麼時候為夫買個顯微鏡，你一看就知道了！」
藉著這個由頭，朱由檢又開始部署衛生工作。首先他開始修建幾間寬敞的浴室，男女各二間，至少可以同時容納幾十人淋浴。
當然在這個時代，他不可能馬上做出鍋爐、冷熱水管道和淋浴噴頭來，只得因陋就簡，用幾十個懸在頭頂的大木桶代替。燒水和加水的工作也只能人工完成，為此涇陽商幫又招募了十幾名浴室工人。
浴室的建成還需要幾天時間，可新的規定已經提前通知到了所有工人、學生、商幫夥計和團勇：不論是誰，每天工作學習完畢之後，必須進行淋浴，否則一律不准吃晚飯！
此規定一出，登時引發軒然大波。陝西地處內陸，水資源較為缺乏，當地的農民並沒有經常洗澡的習慣，頂多是天氣炎熱之時，晚上在自家院子中用涼水擦擦身子。這樣千百年下來，村民們早已習慣了渾身髒臭，不論男女老幼，人人皆是如此，倒也不覺得有多難受。
可朱由檢此時驟然讓大家在浴室淋浴，大家一想到幾十個人光著屁股共處一室，都覺得有些難以接受。尤其是一些保守的婦女，更是堅決不允。
但朱由檢這次卻不像平時那樣彬彬有禮了，而是直接告訴大夥兒：誰要是再反對，立即開除出涇陽商幫！
看在白花花的銀子的份上，大家只好不情不願地服從了這項規定。當然朱由檢也算是顧及到了老百姓的感受，多費了不少緊缺的磚塊，把每個淋浴位隔成了單獨的小室。
老百姓們還沒緩過勁來，朱由檢的第二項重大衛生措施又出台了：第一嚴禁隨地吐痰，必須吐入草紙之中；第二嚴禁隨地大小便，即使是在自家的農田和茅廁裡也不行！白天想要解手，必須到指定的若干新建廁所；夜間在自家解手時，則必須使用涇陽商幫提供的恭桶，白天再將便溺之物倒入指定地點。
這下老百姓的牴觸情緒就更大了。不論男女老幼，此前皆是有痰便吐，吐到哪算哪，誰還隨身備著草紙？又有俗語說糞是農家寶，「肥水不流外人田」，村民們只要是在田間勞動，大小便都是就地解決的。而且家家都有豬圈，真正養豬的極少，主要目的還是當廁所用。
有些老百姓實在想不通，乾脆親自找上門來，對朱由檢牢騷滿腹地道：「幫主，管天管地，管不了拉屎放屁！咱們涇陽商幫是為百姓做了不少好事，可也不能連這些芝麻粒大的事都管吧！」
朱由檢卻是十分耐心地勸解道：「鄉親們，第一有痰當然要吐出來，第二糞是農家肥，這些我也知道。可你們知不知道，很多疾病正是經由痰液與新鮮糞便傳播的！你們不怕得天花、鼠疫、白喉、血吸蟲病、傷寒、霍亂這些病麼？」
眾人嚇得連連搖頭，這些病可都是要人命的！
「我也不是不讓大家施肥，只是要對糞便進行統一的處理。」朱由檢娓娓道來，「在修建廁所的同時，我還會挖幾個大化糞池。將糞便倒進去以後，再加入生石灰，滿了以後就將化糞池用土掩埋。過上一兩個月，再將糞便挖出來，這時候的糞便已經乾燥無害，仍可以當作肥料使用。至於隨地吐痰，更是陋習，希望大家一定要改！」
眾人這才將信將疑地散去。朱由檢卻是深深地歎了口氣，心想這千百年來養成的衛生習慣，可不是一朝一夕就能改得了的。而對待陳規陋習，光靠嘴上宣傳勸說可遠遠不夠，必須使用鐵腕手段！
於是朱由檢下令抽選了幾十名工人，成立衛生糾察隊，專門在各家各戶和田間地頭轉悠。一旦發現隨地吐痰和隨地大小便的行為，立即進行嚴懲：第一次罰銀五兩，第二次開除！
朱由檢之所以這麼重視衛生問題，是因為他知道在歷史上多次發生嚴重的瘟疫，其實就是大規模流行的傳染病，造成百姓的大量死亡。
尤其是明末這段時間，瘟疫屢屢爆發，天花和鼠疫橫行肆虐，疫區往往十室九空，軍民亡者不計其數。這也是明朝滅亡的重要原因之一。
而傳染病的流行，就和衛生習慣有非常大的關係。所以朱由檢才花大力氣改善衛生條件，甚至不惜得罪老百姓，也要把這項至關重要的事情安排好。
當然朱由檢這幾天實在太忙，不可能在秦王莊中監督浴室和廁所的施工。他只在秦王府中陪蕊兒睡了一夜，第二天清晨便集合涇陽商幫的夥計，由解勝帶領著，開始往西安城中運銀子。
由於近期已經採購了大量物資，又投資設立了黃海商幫，秦王府的存銀消耗很快。這五十萬兩銀子一搬，存銀已經不足二十萬兩了。
朱由檢又叮囑解勝，不要集中大批採購，而是要細水長流，零打碎敲，盡量讓這幾十萬兩銀子能支撐三個月。
之前他已與李鶴年商議過，讓陝西商幫對鹽、鐵、煤等商品也進行大幅度的降價，拉出與三大商幫大打價格戰的架勢。當然這種降價可不是為了甩貨，如果真有人來買，則要盡可能以缺貨等理由搪塞。
如此一來，一方面三大商幫會放鬆警惕，猜不出朱由檢的真正意圖；另一方面，這些物資的市場價格會繼續走低，朱由檢建立戰略儲備庫的成本也會更低一些。
而且朱由檢還特意交代，對這三大商幫也要區別對待。晉中商幫和虎嘯商幫雖然也陰損毒辣，但至少沒有找流氓地痞行兇搗亂，因此不是這一輪的重點打擊對象。
而對於榆林商幫，則要集中銀兩大肆採購。反正對方是低價傾銷，賣得越多賠得越多。如果能先搞垮榆林商幫，就起到了敲山震虎的作用，另外兩家商幫也會有所收斂。
朱由檢剛將這些事情安排完畢，多日不見的林佑坤正好風塵僕僕地趕了回來。朱由檢大喜，忙揮退左右，神秘地問道：「林指揮使，本王安排你做的事，如今進行得怎麼樣了？」
林佑坤忙躬身稟道：「回殿下，第一件事，我已讓指揮副使姚慕陽領著他手下那幾百人駐在涇陽縣。沒有我的命令，不許出縣城一步。」
「好！」朱由檢冷笑一聲道，「既然他不怎麼聽話，本王也用不著他。前兩天我已經給萬歲上了奏章，就說皇恩過於浩蕩，本王受之有愧。秦王衛建制人數太多，懇請萬歲裁撤一半，只留下林指揮使和五百秦王衛即可。」
「萬歲會恩准麼？」林佑坤疑道。
朱由檢微微一笑道：「不管怎麼說，本王畢竟是藩王，藩王擁兵太多乃是大忌。就算萬歲是我的親哥哥，我要主動減少秦王衛，他肯定也是高興的。而且萬歲給本王專設秦王衛，魏忠賢這老閹賊已經很不滿意。如今我主動減少護衛，魏忠賢就沒有攻擊我的借口了。第二件事辦得怎麼樣？」
「末將這些日出動數百名秦王衛詳加探查，有些人還沒回來，尚未統計完畢。」林佑坤忙稟道，「現已探明，以涇陽縣為中心，方圓三百里內，共有大的土匪山寨三十五處，多分佈於西安東南方向的秦嶺之中，西北的銅川方向也有一些。至於小的賊匪窩點，更是星羅棋布，遠處的一時難以查清，只查了涇陽附近的幾個縣。這是詳單，請殿下過目！」
朱由檢接過詳單看了一眼，見上面滿是密密麻麻的小字，詳細記錄了附近賊匪的窩點、頭目姓名和大略人數。
「林指揮使，辛苦你了！你還記得咱們在京師賑濟災民之時，曾經搶劫過一家米店麼？」朱由檢興致勃勃地道。
林佑坤也莞爾一笑道：「當然記得。殿下那時還說了一句話，末將現在還記憶猶新：賊吃賊，越吃越肥！」
「沒錯！」朱由檢殺氣騰騰地道，「如今國難當頭，民不聊生，這些人卻嘯聚山林，一味戕害百姓！本王現在手頭正緊，正好奪取他們的不義之財，用之於民！」