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以兵部尚書的身份，統領大軍剿滅蘇天成，這本來是順理成章的事情了，加之朱由菘的身份不一般了，身為皇室宗親，在外人看來，這樣的安排是非常合適的，可惜朱由菘自己知道，這絕不是什麼好的任務。
儘管朱審烜投靠了蘇天成，但朱由菘可沒有這樣的想法，他不會背叛朝廷，不管怎麼說，如今都是他朱家的天下，換做以前，皇室宗親就算是不准進入朝廷為官，被分封在大明各地成為藩王，受盡了朝廷的欺負，也沒有見到有誰反對朝廷的，頂多就是想著能夠掌握權力，更不用說如今皇室宗親可以進入朝廷為官了。
有些諷刺意味的是，皇室宗親能夠進入朝廷，偏偏就是這個蘇天成的主意，現在蘇天成反叛朝廷了，不知道那些已經進入朝廷或者地方上為官的皇室宗親子弟會怎麼想，恐怕皇上想到這件事情，內心也不是很舒服的。
派出秦三德成為監軍，這樣的情況是絕無僅有的，要知道秦三德是秉筆太監，在宮內的身份，僅次於王承恩，就連在皇宮裡面有著不錯資歷的曹化淳、高起潛等人，也要在秦三德面前規規矩矩的，這也就說明了，皇上對他朱由菘根本就不放心。
從京城出發的時候，朱由菘的心情不是很好，這次他要直接趕赴南京去，按照聖旨的要求，駐紮在武昌的左良玉和廬州的黃得功，帶領大軍進入到南直隸後，兩人都要首先到南京去，包括鳳陽總督馬士英，也一樣要趕赴南京。眾人在南京就要具體商議如何作戰了，畢竟是三十三萬大軍，需要安排佈置的事情太多了。
戰鬥的指揮方面，朱由菘確實不懂，不過在朝廷裡面，這種外行領導內行的事情，比比皆是。不算是什麼事情，但秦三德的情況就不一樣了，秦三德以前做過江寧營的監軍，不管是不是參與了多次的戰鬥，但對軍隊還是熟悉的。特別是蘇天成造反之後，皇上特別的信任太監。加強了監軍制度，包括遼東和大同等地，都派去了監軍，掌握這絕對的權力。
一路上，朱由菘很少說話，他們的行程也不快，從南直隸來的消息。蘇天成也暫時停止了進攻，南直隸目前還沒有什麼事情，朱由菘憑著本能相信，不管江寧營如何的驍勇，面對三十三大軍的時候，想要取得勝利，也絕非那麼簡單的事情。
秦三德的想法不一樣了。
這麼多年的辛辛苦苦，總算是成為了秉筆太監。在宮裡的地位僅次於王承恩了，而且因為和內閣首輔周延儒之間的關係，令他能夠掌握很多的情況，在宮裡也是游刃有餘，本來以為這種情況會維繫下去的，想不到蘇天成造反了。
蘇天成的造反，令太監的權力開始增大增強。但秦三德卻不看好，他在江寧營之中那麼多年，也經歷了大大小小不少的戰鬥，對於江寧營的戰鬥力是非常清楚的。朝廷掌管的其他軍隊，最為缺乏的就是精神，說的更加直白一些，就是凝聚力，可江寧營不一樣了，江寧營的將士，內心想到的都是軍隊的榮譽，將榮譽看的比生命還要重要，而且蘇天成最為厲害的一點就是，讓江寧營的將士效忠他蘇天成，不是效忠朝廷。
這樣的軍隊是打不垮的，也不可能被朝廷招安的，除非是蘇天成願意效忠朝廷。劉澤清率領的十萬大軍，在短短幾天的時間裡面，灰飛煙滅，被江寧營剿滅了，可以想像，江寧營的戰鬥力是多麼的恐懼。在秦三德的印象裡面，江寧營還沒有真正吃過敗仗，每一次的戰鬥，蘇天成都是仔細考慮，做出來了全面的部署，這一次朝廷派出三十餘萬大軍前去征伐，難道蘇天成會不做任何的準備嗎，那是不可能的。
蘇天成遲遲沒有進攻南直隸，這在秦三德看來，是一個非常可怕的信號，估計蘇天成就是在等著這三十多萬大軍集結在一起，到時候，江寧營與大軍展開決戰，一旦這三十餘萬大軍崩潰了，朝廷也差不多要崩潰了。
如此艱巨的任務，給予秦三德巨大的壓力，他成為了監軍，實際上就是總指揮，要帶領三十餘萬大軍作戰的，該如何的做好各項部署，這不是小事情。
內心裡面，秦三德是非常悲觀的，認為朝廷沒有什麼希望了，可他的這種想法，只能夠隱藏在內心裡面，絕不敢透露出來半個字。朝廷裡面的文武大臣，就是到了如今的局勢，想到的還是自身的權益，根本沒有考慮到朝廷的未來，或許很多人認為，就算是蘇天成成為了皇帝，他們依舊可以在朝廷裡面做事情，蘇天成要推翻的只是皇上，他們這些科舉出來的士大夫，到時候照樣是朝廷的官員。也正是因為這樣的氛圍，在朝廷裡面，看不出來過多的焦急，也看不出來有人悲痛欲絕的情況，就連內閣首輔周延儒，恐怕都在想著自身的退路了。
秦三德的情況就不一樣了，包括宮裡的諸多太監，太監是依附皇上存在的，離開了皇上，他們就是廢人，什麼作用都沒有，所以在蘇天成造反之後，太監是非常用心的，也是一心想著剿滅蘇天成的，可惜他們的能力不夠，也得不到朝廷文武官員的支持。
皇上大規模的清理官吏，重用錦衣衛和東廠，這一點秦三德也不是很支持，儘管他現在兼任東廠的廠衛，若是皇上總是按照這樣的方式來做事情，不要蘇天成造反，朝廷就會垮下去了。
秦三德這次擔任監軍，還是抱著赴死的心態的，江寧營的諸多管理制度，他是清楚的，這次能夠統領大軍，他也要想著貫徹這些制度，要求大軍嚴格遵守，凝聚起來戰鬥力，擔任大明各地的將領，都有些傲慢，不過他有辦法，既然手持尚方寶劍，得到了皇上的支持，有敢不服從命令的，不管是什麼身份，他都是敢於砍掉對方腦袋的。
對於朱由菘，秦三德沒有過多的看法，其實他也清楚，朱由菘不過是一個傀儡，不可能真正的指揮大軍作戰的，再說了，皇上本來對朱由菘就有些懷疑的，因為朱由菘的經歷之中，與蘇天成有著太多的交集。
離開京城的時候，皇上曾經秘密的召見秦三德，提出來了不少的要求，其中就有針對朱由菘的，皇上不相信朱由菘會造反，但也不完全放心朱由菘，一旦戰局出現了不利的變化，朱由菘是不是會像朱審烜一樣，也是直接投靠蘇天成了，這可是說不清楚的事情。所以皇上直接將尚方寶劍賜予了秦三德，這個尚方寶劍，不僅僅可以懲罰下面的將士，關鍵時刻，也可以對付朱由菘的。
同樣因為考慮到的事情很多，秦三德一路上的話語也是很少的，幾乎沒有與朱由菘有什麼交談，都是默默的趕路，一路上經過的府州縣，都是熱情隆重的接待，生怕得罪他們了。
取道河南，進入南直隸所屬的鳳陽府之後，鳳陽總督馬士英早就得知了消息，派出了軍隊，在亳州等候，駐地在亳州的武平衛衛指揮使，也專門去迎接了。
在亳州歇息的時候，朱由菘和秦三德兩人，都感覺到了，他們之間要統一認識，不管怎麼說，名義上朱由菘是總指揮，秦三德是監軍。
在守衛嚴密的官驛裡面，朱由菘和秦三德終於開始了一次重要的交談。
朱由菘的態度很是謙遜，專門徵求秦三德的意見，言下之意這次的作戰，拿主意的還是秦三德，在如此重大的戰役面前，秦三德也不會客氣，要是兩人還相互客氣了，真正等到失敗的哪一天，誰也不要想著過好日子。
「大人，咱家也就不客氣了，皇上如此安排，是賦予大人和咱家重托的，三十三萬大軍，不僅僅是護衛南直隸，還要在機會成熟的時候，剿滅江寧營，咱家在江寧營好些年，知道江寧營的驍勇，更是清楚蘇天成的睿智，故而大人和咱家的任務不輕啊。」
「蘇天成佔領了山東和浙江、福建等地，應該說，南直隸被夾在中間了，由此咱家以為，蘇天成是一定要拿下南直隸的，南直隸乃是我大明的富庶之地，更是我大明的都城，鳳陽乃是我大明的龍興之地，南直隸是絕不能夠有閃失的，若是兵敗了，大人與咱家都無法交代。」
「咱家到南京之後，準備推行不少的決定，這需要得到大人的支持啊，咱家也不藏著掖著，到了南京之後，咱家會按照江寧營的管理要求，要求孫大人、馬大人、左大人和黃大人，對軍士進行約束，提高戰鬥力……」
秦三德開始侃侃而談，說出來了自己的一些見解，包括大軍暫時不要同蘇天成作戰，甚至可以想辦法，與蘇天成暫時保持默契，必須要對軍隊進行大規模的整訓，還要大規模的集結糧草，等到秋收之後，再來進行決戰等等。
聽到秦三德這麼說，朱由菘總算是放心一些了，他雖然也考慮該怎麼指揮大軍，可惜沒有足夠的經驗，根本想不到關鍵的地方，如今看來，秦三德已經做了很好的考慮了。