中平元年，大漢帝國風雨飄搖。黃巾之亂，西北兵亂使得原本就在不斷衰微的帝國更是雪上加霜。好在一切都已經過去，黃巾軍被招安漢中，西北叛軍兩大首領邊章和韓遂內鬥損失慘重。到了歲末年初年關將至之時，整個大漢帝國的版圖之上，除了西北兩股叛軍內鬥的殺聲之外，其餘各處已經恢復了平靜。
望著刀槍林立，嚴陣以待的宛城和荊州守軍。袁術破口大罵，袁紹面色鐵青，隱藏在暗處的呂布目光森冷無比。他們不敢公然對宛城用兵，宛城已經得到秦陽從十常侍那裡弄來的聖旨，外來軍隊一概不許進入！而荊州的劉表卻是漢室宗親，更是無所畏懼。
無論這四十五萬大軍兵鋒向誰，都免不了要有著承受叛亂之名的危險。最重要的是，他們在承受著危險的同時，他們還並沒有遇到他們真正想要廝殺的對手，當他們思索著是否在宛城或荊州廝殺之時，西北的叛亂已經平定。四十五萬大軍師出無名，只有黯然退軍。
而此時他們的對手，袁術和呂布都恨不得殺之的那個黃巾明王，此時卻也是有些焦頭爛額。甚至整個漢中城都能感覺到明王殿下的焦躁不安。
「報殿下，漢中城內並沒有發現聖女的蹤跡，我們已經派人搜索整個漢中。」
「去城西客棧的人回來沒有？」
「剛剛回來，在城西客棧他們在廢墟之上找到了一封信。」
「我擦！你們怎麼不早說？快拿上來！」
秦陽揮退了回來報信的士兵，趕忙展開手裡的錦書。錦書上的字跡娟秀，一看就是出自女子之手。「大壞蛋！我走了！我在城西客棧等了你三天，你竟然真的都不來找我！我恨你一輩子！」
沒有署名，但秦陽卻知道這信是出自誰的手筆。簡直和她的行事風格太像了，秦陽彷彿看到一個帶著青銅面具的倩影，在氣呼呼的寫完這封信後，頗為留戀的看了那早已破亂不堪的客棧一眼，然後落寞的離去。在此之前，秦陽對張寧只有深深的愧疚，其實這愧疚更多的是來自對已經隕落的張曼成。但是此時秦陽卻是覺得自己的心好似微微的疼了一下。一想到自己很有可能再也聽不到那個刁蠻的聲音，看不到那玲瓏的身影之後，秦陽似乎有些失魂落魄。
「小祖宗，你也沒告訴我你在城西客棧等我啊！而且，而且原本我是要去那的，這不是有事耽擱了麼……」秦陽欲哭無淚，若不是突如其來的變故，秦陽恐怕早已和郭嘉去了城西客棧，如果那樣的話……，秦陽再度沉默。
「殿下，寧兒她……有消息了麼？」張白騎急匆匆從大門外走進來，他剛剛聽說在漢中之內搜尋的隊伍回來，就直接來到了秦陽這裡。
「她走了。」秦陽揣起錦書低沉說道。
「走了？去哪了？」
「我也不知道，漢中城內沒有，現在正在加大範圍搜尋整個漢中。」秦陽苦笑了一下，這丫頭的脾氣真是夠大的。
「哦……」張白騎心中焦急，但他也看出秦陽好似心事重重。沉吟了一下張白騎低聲道：「殿下，屬下斗膽，有個問題想問殿下。」
「什麼事？」
「殿下和寧兒之間……」張白騎在琢磨著措詞。
「我和聖女之間有點誤會，不過你放心，我絕對不會讓聖女受到半點危險。別說翻遍整個漢中，只要她沒有離開大漢帝國，我就不會放棄尋找……」秦陽聲音很淡，充滿了疲憊。他結束了對話，準備好好靜一靜，對於張寧，他心中複雜無比……
轉眼之間中平二年的年關到了，飽受戰亂摧殘的大漢帝國百姓，終於在這來之不易的和平之中迎來了中平二年的春天。
在新年伊始，秦陽對整個漢中的軍政以及人員調度做了極大的改革。統一了軍政，對軍隊進行重新編製。
政務方面由馬元義全權負責，戲志才推薦的張魯輔助馬元義治理漢中政務。整個漢中境內減免賦稅，使百姓專心務農。並且軍隊在訓練之餘開始在各地屯田生產，盡快恢復漢中因為戰爭而十分疲弱的實力和物資儲備。
黃巾教務以及整個漢中地域的守備力量調度工作，秦陽交給了張白騎。另外將原本黃巾教麾下的三萬護教軍全部撥給張白騎，加上新招募的士兵。一共五萬人馬統一改編成漢中守備營，張白騎就任漢中守備將軍一職。這個官職乃是秦陽在黃巾軍內部的編制，如今的將軍便相當於原本黃巾軍之中的渠帥。至於大漢帝國的官職，除了秦陽必須冠名之外，其餘的黃巾將領並不如何看重。
黃巾軍重新整編，秦陽是黃巾軍最高統領，郭嘉、戲志才為軍師，加上最近投效的一些頗有謀略的謀士統統被編入黃巾軍的最高統帥部。管亥任秦陽的親衛隊統領，負責最高統帥部所有成員的保衛工作。裴元紹，周倉任黃天營統領，陶升，嚴政任后土營統領，這兩營精簡之後共六萬人馬直接受秦陽節制。
原黑山軍渠帥張燕任黑山將軍，整個黑山軍改編為黃巾黑山騎兵營編制三萬。黃巾明王特賜予黑山軍「黃巾之劍」大旗，秦陽希望將黑山軍打造成一柄真正的利劍，所向披靡無往不勝！
原白波軍統領彭脫，經過秦陽再三考驗之後，成為新任神機營將軍。神機營編制為三萬，除了兩千官兵負責神機弩，八千精銳弓箭手之外。秦陽又為神機營預先留下了三百霹靂車的空餘位置。神機營將成為陣地阻擊以及攻打堅城的利器。
另外，原本黃巾軍也被秦陽重新整編。取消了原本各州黃巾軍的番號，統一整編為漢中軍一至五營。每營編制為三萬，分別由功勳卓著的渠帥和統領擔任將軍。
他們分別是，黃巾軍第一營將軍，張牛角。第二營將軍，黃龍，副將軍黃邵。第三營將軍，韓忠。第四營將軍，馬相。第五營將軍，廖化。
此次廖化能夠升任將軍一職，也並非完全是因為秦陽對其的賞識以及他對秦陽的忠心。論軍功，此次黑山白波之亂廖化功不可沒，自從投效了秦陽之後在叛軍上下四處奔走宣揚秦陽正統，從而直接導致最後在波才被殺之後，漢中城內四萬白波軍迅速瓦解投誠。而且廖化自從得到秦陽給的修煉之法後，戰力增長迅速，短短時間內就堪與一些原本就是斗者的統領不相上下。鑒於廖化的功勞和實力提升速度，秦陽才力排眾議，破格將廖化提升為將軍一職。
被秦陽整編之後的漢中軍，總數將近三十五萬。這是從原本黃巾軍、護教軍、黑山白波軍五十多萬之中選拔精銳而出。各個兵種十分齊全，分工明確戰力彪悍。根據秦陽的指示，原本后土營之中的老弱殘兵，一概得到豐厚的經費，並且給他們在漢中各處分了土地，使他們衣食無憂。
並且挑選其中經驗豐富之人，進入秦陽在漢中組建的軍官學校任職。軍官學校第一任校長由馬元義擔任，主要目的便是為了培養優秀的軍事戰略人才。作為有著超時代眼光的秦陽，對於人才的儲備和培養自然不遺餘力。
漢中整軍之後，整個漢中的面貌為之一新。黃巾軍操練不斷，由張白騎牽頭組成的兵工廠夜以繼日的開爐鍛造，在秦陽的一些提議之下，許多武器裝備都被改進。並且秦陽還讓郭嘉將兵器樣品派人送到各地諸侯手中，甚至并州和汝南也不例外。
在以前，作為一個宅男的秦陽對於什麼科技軍工，還有物理化學之類的一概全都不精通。要是早知道能夠穿越，秦陽恐怕還在吃奶的時候就開始拚命學了。所以，他很無奈的成為了最沒有創意的穿越者。雖然造不出先進的武器，弄不出什麼讓眾人讚歎的奇思妙想，但秦陽劃時代的思想卻也是發揮得淋漓盡致。雖然很多東西他都是依葫蘆畫瓢，但效果卻也是十分顯著的。
秦陽的目標很簡單，如今曹操還在帝都閒逛，劉備兄弟三人還在幽州流浪，孫權恐怕還在吃奶，而漢中就如同是一個表面上臣服大漢的國中之國，秦陽要以完整的軍工產業帶動整個漢中的發展，使漢中在將來亂世到來之際，擁有整個大漢帝國之中軍隊最強，底蘊最深厚，牢不可破，無堅不摧足以一舉統一天下的力量！
漢中城頭，黃巾明王的大旗在迎著獵獵寒風飛舞。秦陽迎著風雪站在漢中城巍峨的城頭之上，迎著呼嘯的冷風，他彷彿看見亂世之中，身邊的大旗高高飄揚，大旗所指之處，黃巾軍戰士嘶聲怒吼，仰天咆哮。刀光劍影，無數英雄豪傑璀璨奪目。鼓角爭鳴，風起雲湧的亂世到來之際，秦陽絕不坐以待斃。
「天祐黃巾！黃巾萬歲！漢中軍萬歲！」秦陽拔出佩劍昂首指天，振臂高呼。
「天祐黃巾！黃巾萬歲！漢中軍萬歲！明王萬歲！」漢中城下，數十萬熱血男兒發出震天怒吼，在這歲末年初之際，曾經讓天下聞之喪膽的黃巾軍用自己的吼聲告訴世人，他們已經準備好了，黃巾明王的大旗必將席捲天下！
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寫到這裡，秦陽作為黃巾明王已經統一了整個漢中，本書的第一部分已經完成，接下來的故事會更加精彩。馬上會開始第二卷，「帝都風雲」。