「軒轅小兒！出來受死！」蚩尤得到虎魄刀之後就立刻率大軍前來叫陣，但每天都只有一個答覆，那就是軒轅不在。雖然九黎的族人們都建議趁軒轅不在立刻決戰，但蚩尤卻不以為然，他要等軒轅會來。用新得到的虎魄刀徹底打敗他，軒轅借助神兵之力壓著他打了怎麼多年，這次說什麼也要打回來才行啊！想到這裡，蚩尤緊了緊手中的虎魄刀，為了它，蚩尤可是連親生骨肉都犧牲了啊。
「他怎麼還不會來啊，都這個時候了，人族聯軍不能沒有他啊！」九天玄女在主帳內著急的來回走動。畢竟敵人的主帥天天來叫陣，對人族聯軍的士氣打擊是很大的啊。雖然士兵們都知道軒轅是為了找到一柄神兵來與蚩尤抗衡，但這也不是長久之計啊！
「軒轅小兒！還不出來受死！」蚩尤每天重複都要重複這一句話，有點厭煩了。蚩尤現在已經在想，是不是接受族人的建議，先把這人族聯軍滅掉再說。大不了等軒轅會來，再跟他好好打上一架。
「大膽蚩尤~！本不欲殺你，但無奈你三番四次挑釁與我，今天有你沒我！」眾人只聽一片「嗡」鳴之聲。軒轅腳踏一璀璨奪目的紅輪，正式揚塵所贈的太虛。手持一面刻日月星辰，一面刻山川草木。劍柄一面書農耕畜養之術，一面書四海一統之策，正式聖道之劍軒轅劍！在半空之中凌空虛渡而來。
「軒轅？你小子終於回來了，大軍聽令！全力進攻！」蚩尤一看軒轅已經到了，心中頓時大喜，立刻下命令進攻，他要跟軒轅好好算算這麼多年來的帳。其實蚩尤心中還有一個想法，那就是嫉妒軒轅有得到一個神兵。「這才幾天不見，軒轅這小子居然又得到一件神兵，老子為了這虎魄刀連自己的兒子都搭進去了，這也是沒辦法的事，得到神兵也必須有點犧牲。可為什麼他軒轅，就可以什麼都不犧牲得到神兵？」蚩尤心中不由得妒火燒心。以他的眼光，又怎麼可能認不出來，軒轅腳下的太虛是神兵啊。
「軒轅小兒！拿命來吧。」蚩尤終於忍不住心中的妒火，揮舞著虎魄刀殺向軒轅，一路上遇神殺神，凡是被虎魄刀砍中的，不管是人還是仙，都渾身潰爛而死，無一生還。
「怕你不成，今天有你沒我！」軒轅見到自己兵將的慘狀，心中也不由得大怒，腳踏太虛，手持軒轅劍直奔蚩尤而去。
軒轅與蚩尤終於展開巨戰，雙方一來我往，各顯神通戰技。太虛和軒轅劍和戰虎魄刀，三大大神兵互有奇能，拼得山崩地裂，日月無光，虎魄一刀同時面對兩件神兵，仍然能不落下風，甚至還一度反壓，但還是未能分出勝負。
隨軒轅而來的群眾卻被波及，死傷枕藉，軒轅頓時心中不忍。而反觀蚩尤的九黎大軍也好不到哪裡去，但蚩尤所帶領的九黎，大多都是巫族的後裔。巫族乃是天生的戰鬥種族，對他們來說，死在戰場上是最好的歸宿。所以蚩尤是越打越興奮，無辜受到波及的人也是越來越多。軒轅正要罷戰之際，蚩尤的虎魄刀，突然散發出強烈的怨氣，蚩尤受到虎魄刀的怨氣反噬，陷入萬劫不復之地，一動也不能動。
原來這些無辜受到波及的人所產生的怨氣，都被虎魄刀所吸收，從而喚醒了虎魄刀的刀靈，也就是蚩尤的坐騎——戰虎！
這些怨氣都被刀靈戰虎吸收，喚醒了戰虎心中的七大恨：「自古天地七大恨，一恨年華早逝，二恨光陰難返，三恨世事無常，四恨人心莫測，五恨生無可戀，六恨死亦難安，七恨天地不仁，忠義只換七大恨，恨恨恨恨恨恨恨……」所以戰虎甦醒之後第一件事就是背叛自己的主人，也就是蚩尤。
軒轅見蚩尤不知為什麼一動不動，雖然想不通為什麼，但也知道這是個最好的機會。手中軒轅劍不停刺出，對著蚩尤頸部及四肢連接處接連刺出五劍，只聽得蚩尤一聲大喊，整個整個身子被分成六份，就算這樣蚩尤也還未死。原來軒轅劍乃是聖道之劍，在刺殺蚩尤的時候，也將蚩尤體內的怨氣消去了一部分。蚩尤因禍得福，修成了大巫巔峰之身。只聽蚩尤大笑道：「軒轅小兒，你能耐我何？」軒轅見那被分成六份的屍體，竟然有漸漸復合的樣子！軒轅大驚，忙讓人將帶上五份屍體，趕往六方極遠之地，埋於山下，並由幾位修士聯手布下封印陣法，將蚩尤的六份屍體封印在大山之下，使其用不能復合。
自此軒轅在真正得到了洪荒人族所有部落的認可，成為正真的天下共主。
軒轅降封炎帝之子薑榆罔為諸侯，將他封在洛水盧氏城。但姜榆罔雖然不服軒轅，但也無奈軒轅的功績，但面子還是要的。所以姜榆罔不肯受封，率家人遷徙江南，後定居於湖南茶鄉，以醫為業，救死扶傷，深得當地百姓厚愛。從此，軒轅天下共主的地位最終確立，自稱為黃帝，號令天下，凡是不順從的部落，都以天子的身份去加以討伐。前後共經五十二戰，天下始歸一統。
天下一統之後黃帝劃分州野，制禮興樂，教化百姓。同時還發明各種器具用物，方便日用。其中，大臣曹胡發明了上衣，伯余造了下衣，於則做了鞋子。百姓們從此不再穿獸皮樹皮。黃帝還依浮葉飄於水上的道理作了舟船，共鼓又配上舟楫行於水上。又根據轉蓬的道理發明了車輔，便利了交通。黃雍父發明了春，黃帝接著又令人製作了釜甑，使得百姓可以蒸飯烹粥。以後又造屋室，築城邑，使百姓不再巢居穴處。黃帝又與歧伯作內外經，使百姓疾患得以治癒。他還確定了天下萬物的名稱，劃分星度為28宿。
黃帝又劃野分疆，以八家為一井，三井為一鄰，三鄰為一朋，三朋為一里，五里為一邑，十邑為都，十都為一師，十師為州，全國共分九州；設官司職，置左右大監，監於萬國，設三公、三少、四輔、四史、六相、九德共120個官位管理國家。對各級官員提出「六禁重」，「聲禁重、色禁重、衣禁重、香禁重、味禁重、室禁重」，要求官員節簡樸素，反對奢靡。提出以德治國，「修德振兵」，以德」施天下，一道修德，惟仁是行，修德立義，尤其是設立「九德之臣」，教養百姓九行，即孝、慈、、信、言、恭、忠、勇、義，進行思想道德建設。在使用人才上，訪賢、選賢、任能，因才使用。實行以法治國，設「禮法度」、「治法而不變」，命力墨擔任法官，對犯罪重者判處流失，罪大罪極者判處斬首。
黃帝在農業生產方面有許多創造發明，其中主要有實行田畝制。黃帝之前，田無邊際，耕作無數，黃帝以步丈畝，以防爭端，將全國土地重新劃分，劃成「井」字，中間一塊為「公畝」，歸政府所有，四周八塊為「私田」，由八家合種，收穫繳政府，還穿土鑿井。對農田實行耕作制，及時播種百谷，發明杵臼，開闢園、圃，種植果木蔬菜，種桑養蠶，飼養獸禽，進行放牧等。縫織方面，發明機杼，進行紡織，製作衣裳、鞋帽、帳幄、氈、袞衣、裘、華蓋、盔甲、旗、胄。制陶方面，製造碗、碟、釜、甑、盤、盂、灶等。冶煉方面，煉銅，製造銅鼎、刀、錢幣、鉦、銚、銅鏡、鍾、銃。建築方面，建造宮室、鑾殿、庭、明堂、觀、閣、城堡、樓、門、階、蠶室、祠廟、玉房宮等。交通方面，製造舟楫、車、指南車、記裡鼓車。兵械方面，製造刀、槍、弓矢、弩、六纛、旗幟、五方旗、號角、鼙、兵符、雲梯、樓櫓、炮、劍、射御等。日常生活方面，熟食、粥、飯、酒、肉、稱尺、斗、規矩、墨硯、几案、氈、旃、印、珠、燈、床、席、蹴踘等。此時師兄天皇伏羲，所創造的書契已經不能很好的記錄世間所發生的事情，黃帝便命倉頡造出了更實用的，凡人字。
以甲乙十天干紀日，以子丑十二辰來紀月，而六旬為一甲子。
黃帝有四妃十嬪。正妃為西陵氏，名嫘祖，她親自栽桑養蠶，教民紡織，人稱她為「先蠶」。嫘祖組織一大批女子上山育桑養蠶織絲。但很快又遇到了一個大難題，蠶養了很多，繭也產了不少，但抽絲和織帛卻有了困難。就在這時，群女中有一個身材矮小、皮膚黝黑、面部醜陋的女子發明了纏絲的紡輪和織絲的織機。黃帝得知後，對此項發明大加讚賞，讓她給眾人傳授技藝。後來在嫘祖的撮合下，黃帝娶了這位醜女，作為次妃，這位次妃被尊稱為嫫母。這一切改變使得百姓甘其食，美其服，樂其俗，安其居。一派太平景象。