朱燮元詢問也算是一種客氣，總管幾省軍隊的督軍為了功勞評定的事問一下欽差也是對皇帝的尊重，同時也有試探楊漣和劉僑真實來意的意思。楊漣也知道朱燮元的意思，於是說道：「我是文官不方便品評武事，都察院品評官員的功勞一般都是按其行為來，無過就是有功，軍隊裡應該是無功即為有過所以不一樣。皇上讓我們先來調查只是表明一種態度，就是朝廷肯定會把這事處理好，而且皇上的聖旨裡說了隨即會有新旨意到來，朱大人耐心等待便是。」
朱燮元說：「去年皇上要求各軍區守備部隊和野戰部隊分開，貴州情況特殊所以定了一年之期，聽說其它各地早就完成了這一行動，現在西南軍區也應該有所表示。一年之期馬上就要到來，到時候秦良玉秦總兵肯定會提前來商議，我馬上去信催促讓其盡快成行，不過秦總兵在川西一帶恐怕得耽擱一段時間，到時候一起商議一下。」
劉僑這時候問道：「我去年年初去過川西一帶，當時還是侯良柱侯將軍陪同前去，秦總兵去川西難道那裡又發生了什麼事嗎？」
朱燮元說：「原來劉大人跟侯總兵還有這一段交情，侯總兵現正在永寧一帶協助地方安民和守備，我已經去信催促他來貴陽見欽差，到時候劉大人可以跟他多親近。去年陝西旱災有少量流寇出現，今年年初有部分流寇向南流到川西，據說是被西北軍區剿滅的殘部，秦總兵帶兵前去一是剿滅流寇二是訓練士兵，現在應該已經剿滅完向回走了。」
劉僑說：「本來皇上要求我們去拜會秦總兵，既然她要來皇上的聖旨也會送來貴州，我們就在周邊看一看。」
接下來的幾天就是楊漣和劉僑在貴州遵義一帶視察的時間，劉僑發現這裡跟去年年初已經有很大不同，三岔河跟鴨池河沿線都修建了眾多的村堡，既可以駐軍也可以住民。經詢問才知道這是沿趙率教部隊的主張做的，就是先在沿河沿路修建堡壘駐軍堅守，守住後再不斷在堡壘周圍修建村落住民，達到軍隊開拓民眾跟進的效果。以前在貴陽邊的貓跳河一帶這樣做，現在貓跳河旁邊已經見不到多少軍隊，基本上都是喜笑顏開的百姓了。
在修建堡壘是就注意了修建地點和規模，修之前就想到今後要民用所以沒有修在偏遠險峻處，而是當道而建方便交通。軍隊向前開進後這些堡壘就用來囤積糧食和進駐官府機構，慢慢的各堡壘邊就演化成集市很是熱鬧，稍微大一點的交通便利的地方已經逐漸出現繁華景象，有時各地的守備軍會隨時來巡查安全。
劉僑看到這些不由得讚歎天啟的深謀遠慮，把軍隊分為野戰軍和守備軍有什麼效果還看不出來，但把軍隊裡的人分為修建後勤部隊和專業戰鬥部隊顯現出了效果。不願意打仗的人搞修建其手藝是日漸提高，兩年不到比起趙率教的那支教師爺部隊也沒多少差距，看趨勢將來超過他們也不是不可能，做得多經驗就豐富。專業打仗的部隊其戰鬥力也有明顯提升，從這次消滅奢、安叛匪的戰鬥中就可以看出端倪，屢戰不勝的官軍能夠變得勇猛異常應該是篩選的功勞。
篩選勇將剔除疲兵使軍隊戰鬥力大增是一個方面，但是其壞處也是很明顯的，就是一個個變得爭強好勝了，為了一點軍功同袍間鬧得紅了臉，跟以往寵辱不驚的風貌有巨大的反差。不過劉僑也能夠理解，以前是得過且過不求有功，都知道沖得快死得快沒什麼上進取勝之心。現在不想打仗的人都篩選走了剩下的都是爭強好勝的人，遇到敵人不是想著怎麼跑而是奮勇當先砍殺，這時候再要求其寵辱不驚就有點不現實，大家都不傻都知道做了事就要有體現。
除了觀看軍隊的情況劉僑主要還看當地錦衣衛的狀況，以前錦衣衛在各地相當於督察部隊，主要看將領是否忠誠，現在的錦衣衛分為兩組，一組是刺探軍情讓軍務院及時瞭解敵人和己方軍隊的動態，另外一組就是以大鐵公司的名義協助各地官府推廣新型農莊和工業事務。天啟給這些錦衣衛提高了待遇，同時也禁止其勒索地方，也就是增加了其正當收入而禁絕了其灰色收入來源，加上有內衛的二次監督，各地錦衣衛也能夠做到兢兢業業。
劉僑看到的是軍隊事務，而楊漣看的重點是民事，因為打仗所以貴州的輔政機構還不太完備，但是各地官府在大鐵公司的配合下已經開始大力推行新型高產農作物。以烏撒、東川一帶為例，以前是安效良的領地地勢高交通不便非常貧窮，但是其氣候條件非常適合土豆的栽種，而且不到兩年就出現了變異的新品種。這種新品種個頭大味道好或煮或烤都非常好吃，外地人都紛紛來買運出去賣高價，當地人喜出望外就像撿了寶。
在推行新品種高產農作物的同時，雲南軍隊因為已經沒有叛軍的壓力所以也開始推動新型農莊的建設，曲靖、尋甸、武定還有北邊的東川、烏撒，都開始了轟轟烈烈的基礎建設。先是軍隊分為專業戰鬥部隊和修建後勤部隊，然後是將軍隊變成大學堂讓願意來的都進來學習，同時不斷讓已經學習到技術的人員退役，如此循環往復培訓出一大批有技術的人，也修建了眾多的新型村莊。
老百姓的生活水平提高了朝廷的稅收也增加了，這時候奢崇明和安邦彥那一套就沒有人聽了，以前聽從他們的話是因為他們能誘騙人，現在官軍這邊能夠給百姓帶來看得見的好處，誰好誰不好大家都有個比較。老百姓都是現實的人，一邊是沒好處有危險看不到前途，另一邊是好吃好喝安全生活，選哪裡不用教大家都不傻，所以奢崇明和安邦彥向雲南方向發展的路就沒有了，也是他們鋌而走險要會永寧的原因。
劉僑和楊漣如此看了不到半月，心中的感受是各不相同，但都是高興多過擔憂，可以預想在如此好的狀況下西南地區的一切狀況都不是問題。十月下旬的時候秦良玉到了貴陽，湊巧的是前一天天啟的旨意也由快馬送了過來，四川總兵侯良柱也跟一些川軍降臨隨秦良玉一起到來。在大家見面座談的時候，雖然開始都是笑逐顏開互相問候，但是明眼人都能看出大家都有些情緒在裡面，說不清會不會當著欽差的面當場發作出來。
有句話叫住朋友間應該同甘共苦，是說不同的人如果做到既能夠一同享福也能夠做到一起受苦，那麼這樣的人才能夠算得上真正的朋友。但是現實中這樣的人太少了，能同甘不能共苦的多，能共苦不能同甘的也多，但是真正能做到同甘共苦的少之又少，沒有其它原因利益使然罷了。在座的這些軍官就是能共苦不能同甘的人，打仗的時候可以並肩抗敵共渡難關，但是在分功勞時卻又想著如何比他人高一頭。
朱燮元沒有管黔軍將領和川軍將領的怪異態度，對這些他已經傷了心不想多管，他本想一碗水端平結果是兩邊不討好。朱燮元先是對秦良玉致意，在奢崇明起事時朱燮元剛剛由布政使升為巡撫，正需要兵的時候秦良玉率先到來，並且與敵大戰後來收復四川全境，其功勞很大不說也算是對朱燮元有解圍之德。見朱燮元向秦良玉致意其他如許成名等軍官都紛紛見禮，因為秦良玉南征北戰功勞大，充四川總兵官的時候許成名不過才是個都司屬於晚輩。
朱燮元首先請楊漣宣讀天啟的旨意，在這道送來的聖旨中天啟下令由每個軍官自己自呈經過，如果所寫不實其他人可以糾正，最後寫完無異議後由劉僑集中送北京。對這件事天啟說了軍務院的軍法處增加了新功能，除了論過處罰外還有論功行賞的功能，以免分功不均引起不滿情緒。而且天啟特別提出對那些在平叛中死亡的將士也要論功，這一提法讓大家都大為滿意都贊同皇上仁德，其實也不是天啟仁德是因為現在有了兩個閒錢，用來收買人心正合適。
專業的事由專門的部門來辦才是正理，大家聽了天啟的安排都比較認同，互相間疑惑防備的目光又變得柔和了些，有些人都已經在懷想當時並肩殺敵的友情了。不過聖旨中也不全是好事，天啟的旨意是消滅了奢崇明和安邦彥並不是結束，而且可以說就算把安位餘部都安撫好了也沒有結束，他需要的是把整個西南的土司都做一個調整。現在的土司既管軍又管民相當於土皇帝，天啟的意思是土司可以存在但是只能管軍，要斬斷他們與百姓的聯繫。
朱燮元一聽就知道自己的建議沒說好，他在奏疏中建議保留安位的土司地位，說當地人管當地事簡單方便，但現在天啟的意思是剝奪土司的一般權力，事情就有些不好辦了。其他將領聽了這些多數有些茫然，他們不知道這些調整意味著什麼，但是心眼靈活的知道打下奢崇明和安邦彥並不是結束，而是一切才剛剛開始。