「它是以能量形態而存在的生命形式，我們的意志雖然能夠滲透到外太空，卻無法對它進行攻擊，這也是普羅休斯得以橫行宇宙的原因.直到一個意外發生」亞格拉迪斯閉上眼睛說道：「在這顆星球上，曾經形成多個文明。在第四代文明，也就是以亞特蘭蒂斯為代表的超科技文明，讓這顆星球煥發無以倫比的生機。科技、生命、文化、藝術皆達到前所末有的高度。」
「零，你無法想像，亞特蘭蒂斯比你們要更快地發現能量的奧秘。」
在零的眼前，出現了一片蔚藍的海洋。金色的太陽在海平面徐徐升起，在藍天白雲的襯托之下，一座位於海平面上的浮空島顯得那麼壯觀。畫面拉近，零如同立於雲端，只見浮空島上擁有著懸浮於半空的山巒，瀑布自山間流下，在半空激盪的水氣幻出道道七彩的虹橋。
而主島之上，卻有無數壯麗的城市。其中最大一個都城位於島嶼的正中，城市裡有著高聳的宮殿，又有各種古拙的建築以圓周線第次分佈。在城市的正中，聳立著一座武士的高大雕像。雕像高舉著一枚完美的六邊形水晶，晶石閃爍著能量的光芒，並將它源源不斷地輸送到城市各處。
從空中看，可見城市裡遍佈著渭徑分明的能量網路，但整個城市卻沒見到任何類似發電站的建築。這座浮空島上所有的能源，皆取自自然。
「這是？」零失聲問，但心中已經猜到答案。
「亞特蘭蒂斯的主城，太陽之都。」亞格拉迪斯伸手一揮，畫面拉近，出現了類似機坪般的場地。在這片廣闊的地面上，停放著零在大裂隙中所見到過的六翼飛船。
亞格拉迪斯說道：「身處這個文明的人類，他們無疑是幸運的。自從發現能量的奧秘後，亞特蘭蒂斯人自光源中分離能量，使之應用到各種領域之上。他們本身也進化到一種臨界點，距離完美生物只一步之遙的臨界點。這使得亞特蘭蒂斯已經具備探索宇宙奧秘的能力和條件，然而在探索的過程中，其中一艘飛船卻引來了普羅休斯的注意。跨越億萬光年的遙遠距離，普羅休斯來到我們所在的銀河系，並目標確切地朝地球而來。」
畫面再變，無數的六翼船正在升空。而小型的浮空艦更是多不勝數，亞特蘭蒂斯人盡起精銳，紛紛迎向天穹。在天穹的上方，蔚藍的天際消失了。取而代之的是近乎看不到邊際黑暗，有旋轉不休如同鑽頭般的雲柱正從外太空朝地面刺來，每一根雲柱的四周都纏繞著多如繁星的爆炸光點，正是亞特蘭蒂斯的戰士們正迎戰來自外太空的巨大威脅！
這是場壯烈的戰爭，以億萬對一的懸殊戰鬥，然而數量多的一方卻並不具備壓倒性的優勢。普羅休斯從身體中分化出一隻隻如同浮空艦大小的能量蟲，它們蜂湧迎向了亞特蘭蒂斯的戰士。每一分每一秒，都有火團在天空炸裂，跟著掉下的不是毀壞的浮空艦便是不斷消失的能量蟲。
然而浮空艦是有限的，能量蟲對於普羅休斯來說卻是無限的。於是隨著時間的推移，勝利的天平漸漸向域外天魔般的普羅休斯一邊傾斜。
畫面突然消失，零大口喘氣。那壯烈到無法形容的戰鬥，讓他從靈魂到身體都感受到了深深的震撼。零看著亞格拉迪斯問：「結果是什麼？」
「你還站在這裡，結果不是顯而易見嗎？」亞格拉迪斯雖然在笑，但笑容卻充滿了悲嗆：「戰爭的最後，我們雖然勝了，卻付出了慘烈的代價。在這場戰爭裡，普羅休斯犯了兩個錯誤。一個是它低估了亞特蘭蒂斯人的科技和決心，我不得不說，他們是我見過的最優秀特種。聰明、勇敢、堅強並不畏犧牲。為了生物得以延續，他們犧牲整個文明為代價，將普羅休斯逼到了絕境。無奈之下，普羅休斯降臨星球，打算用本體絕對的優勢一舉毀滅亞特蘭蒂斯人，而這是他犯的第二個錯誤。」
亞格拉迪斯驕傲地說道：「它的降臨，給了我參戰的機會。就算普羅休斯橫掃宇宙億萬年，最後還得在我為它特別製造的囚牢裡從上個文明一直呆到了現在。」
在黑暗的世界中，突然出現了光。零看到了跳躍的地火，它們是燃燒的岩漿。岩漿流淌著，在地心不知幾千英里的地方，以一種特殊的構造流淌著，彷彿是某種能量回路。而在能量回路的正中，囚禁著一頭黑色的獸。它渾身冒著漆黑的氣息，六扇黑色的羽翼無力地伏著。它彷彿察覺到零的存在，便這麼抬頭朝零看來，並發出無聲的咆哮。
「普羅休斯，這是它的正體。我把它囚禁在了地心，用特殊的能量紋路形成囚牢，讓它一困就是成千上萬年。」亞格拉迪斯淡淡說道，那語氣儘管平淡，卻足以讓零明白為了困住這頭稱霸宇宙的星獸，地球付出了一個文明終結的慘重代價。
亞格拉迪斯無奈地說道：「本來我以為還可以困住普羅休斯更多時間，這樣或許通過和其它意志的溝通，我會找到徹底消滅它的辦法。同時，也得以讓你們有更多的時間成長。零，如今在地球上繁衍生息的你們，是我根據亞特蘭蒂斯人殘留的細胞所創造的生物。我只使用了最基本的細胞片斷，卻拿走了亞特蘭蒂斯的傳承。就以亞特蘭蒂斯的科技也無法對付普羅休斯，我的本意是讓你們自由發展，看是否能夠發展出不同的文明。可到頭來，你們走的卻是亞特蘭蒂斯的老路，且科技水平比他們還要代了好幾個層次。」
「你們對能量的運用我只能夠用粗陋來形容，可即便如此，我也不想插手。我還抱著希望，然而那場改變了整個星球的隕石雨，同樣改變了我的決定。」亞格拉迪斯的語氣透著某種遺憾，他說道：「大災變的到來，隕石雨的撞擊，讓這顆星球的物理環境出現改變。普羅休斯雖仍在囚牢裡，可現在囚牢卻缺了一角，這使得它得以把自己的細胞片斷通過缺口傳播開去，以引起了動植物的瘋狂異變。等我發現的時候，已經來不及了。」
零瞪大了眼睛，失聲道：「你是說異變獸都是受到普羅休斯的影響？」
「沒錯，否則為何最溫順的動物在變異之後也成為狂暴的生物。那是傳承了普羅休斯的記憶印記，在普羅休斯的生命歷程裡，毀滅是唯一的主旋律。除此之外，不容其它！」
亞格拉迪斯繼續道：「普羅休斯的目的很簡單，它要製造除人類外其它的智慧生命體，以抗衡我所創造的你們，進而建立起可以把它從囚牢裡拯救出來的力量。看到外面那活屍之王嗎？那就是普羅休斯的成品之一，它們被稱為真王，而像這樣的怪物，除了莉莉絲之外還有六隻。」
「為了阻止普羅休斯，我只得插手。知道能力者為什麼會出現？」亞格拉迪斯指著自己道：「那是我解開了你們進化的枷鎖，否則，你們是沒有能力對抗普羅休斯的怪物大軍。」
零為之動容，能力者的出現一向是學術界一個解不開的迷。它們好像是一夜間突然出現，儘管最初的能力者只接觸到基礎的能力，可正是有了他們的出現，才有了現在諸多高階強者。可能力是如何來的，卻無人知曉，儘管學者們拿到初代能力者的基因標本，然而在其中卻發現屬於能力的基因片斷根本沒有任何傳承，就彷彿是突然間出現，如同上天的禮物。
而現在，從亞格拉迪斯嘴中，零終於知道了真相。
說到底，能力者和異變獸，又或者擁有智慧的異族之間，便是亞格拉迪斯和普羅休斯的軍備竟賽，至於誰是最後的勝利者，卻仍然是個末知之數。
「話又說回來，亞特蘭蒂斯雖然毀滅了，可他們卻仍然留下非常豐富的文明遺產。其中之一，便是你們人類稱之為神的存在。」亞格拉迪斯說道：「在戰爭的後期，為了對付普羅休斯，亞特蘭蒂斯的學者決定發明一種完美的戰爭兵器，那就是神。在留下無數失敗品之後，無限接近於成品的神卻沒來得及啟動，戰爭就結束了。文明的毀滅，浮空島及太陽之城的隕落，讓神從此埋葬在深淵之中。直到被你們發現，這一代的你們，在科技領域上不及亞特蘭蒂斯，可你們善於探索和發現。你們雖然不能讓神完全啟動，卻找到將其分割，並植裝在人類身上，使之傳承部分能力的方法。那就是你們，十三名人造之神的計劃由來。」
「零，你的神之右眼是這份遺產中最為寶貴的東西之一。亞特蘭蒂斯科技最巔峰的造物，擁有著連我也為之驚歎的能力。只是你還無法打開能力的枷鎖，現在，我將打開你所有的枷鎖，讓你明白神之右眼和我的力量結合之後，將產生何等威能。」亞格拉迪斯頓了頓，又道：「不過在那之前，你得給我記住第三件事。宇宙的本源是能量，而能量的最高層次表現卻是規則！」