在進入珊瑚海域後，艦隊曾不止一次遭到水下潛艇的襲擊，這些潛艇不知是有意還是無意，打了就跑，也搞不清楚是誰幹的。別動軍方面發出了強烈的抗議，各方皆表示不是他們動的手，互相指責，但這個行為卻沒有因此而停下。直到日本大本營為了撇清此事和日本人有關係，特此下令讓南雲忠一多照顧照顧這支別動軍的艦隊，南雲忠一隨即派出一支潛艇部隊護航，才結束了這次有針對的暗殺行動。別動軍的艦隊在付出了六艘艦艇和幾百將士的生命後，才輾轉抵達了莫爾茲爾港。
在去往霍尼亞拉的第三支艦隊，在抵達所羅門海域後，同樣是遭到了這種暗算，由於這一帶更加危險，南雲忠一特意派了一個航母戰鬥群予以保護。可是，日本人的這一舉動，則被盟軍看出是一個機會，隨即派出一支艦隊前去暗殺。
「盟軍來了，你們撤走吧……」別動軍這支小型艦隊的檢測系統似乎比日本人的還要強大，日本人還沒發現盟軍的襲擊，卻被他們發現了，於是提前通知日本人。同時，別動軍方面公開警告盟軍，不要對別動軍做出敵意的舉動，很容易引起重大誤會。
可是麥克阿瑟這次沒有妥協，他公開表示這只是針對日本人的軍事行動，保證不會有一顆炸彈投到別動軍的艦隊上空，也不會有一枚魚雷撞擊別動軍的艦隊。日本人沒有拖大，立即下令航母戰鬥群向安全區域撤離。並派出艦隊前去支援，但盟軍的行動很迅速，派出的力量也很強大，日本人還沒有來得及撤到安全區域，便和他們交上手了。經過幾個小時的海戰，日軍戰敗，被擊沉了一艘戰列艦、兩艘巡洋艦。航母也身受重傷，所幸沒有沉沒。可以說，這次日本人的損失還是比較大的。如果他們不採取這次的舉動，恐怕就不會有這個損失了，雖然很多別動軍將士依舊不喜歡日本人。但是日本人這次的舉動，卻是贏得了這支艦隊將士們的好感，對他們的印象改觀了不少。
可以說，別動軍對於日本人這次的損失，心裡是有些不快的，雖然他們不和日本人一夥，但至少日本人是為了保護他們安全抵達目的地，而盟軍這種行為明顯有些挑釁的意味，當著別動軍的面殺雞。也許是日本人承擔了這次的損失，在接下來的航程中。別動軍的這次艦隊反而顯得平順了不少，沒有遭到什麼暗在的敵對行動，終於安全的抵達了霍尼亞拉。
得知三支艦隊終於都抵達了目的地，葉蘇也做出了反應，首先。瀋陽方面公佈的發表了抗議聲明，表示艦隊在珊瑚海域遭到的暗襲，分明就是宣戰行為，別動軍一旦確認真兇，必會還以顏色。同時別動軍還譴責盟軍有威脅別動軍艦隊安全之嫌，不顧艦隊將士的反對。公然做出有威脅艦隊安全的舉動，特此表示抗議。前面一份抗議，別動軍方面沒替日本人打抱不平，也沒有明確指認誰是兇手，後面一份抗議則公然指向了盟軍方面。這一前一後都是抗議，態度卻又有所不同，但無一例外的對盟軍方面是多有不滿，因為從聲明中看，別動軍明顯是偏向日本人這邊。在得知了別動軍的聲明之後，羅斯福很是惱火，把麥克阿瑟臭罵了一通，認為他的舉動有可能為盟軍帶來危機。麥克阿瑟則不以為然，他認為有必要讓別動軍知道南太平洋的危險，所以他才採取了一些暗中的警告行動，至於別動軍的抗議，他還真不大在乎……
東帝汶的問題不大，別動軍基本可以有效控制和防衛，而且，別動軍可以通過南沙群島中的黃山馬礁修建的機場，用運輸機對東帝汶進行持續的各種軍用物資的補給，暫時可以保證自給自足。但莫爾茲比港和霍尼亞拉的力量明顯還偏弱小，對於這兩處戰略意義重大的港口，幾千別動軍將士根本無法有效控制，所以，別動軍要麼放棄兩地，要麼繼續派駐力量。而別動軍方面，則選擇了後者，不顧危險。
瀋陽方面卻迅速的做出了回應，葉蘇並沒有因為所羅門群島海域比較危險而中止向莫爾茲比港和霍尼亞拉派遣兵力的舉動，反而還反其道行之的加大了力量的投入。
「別動第二潛艇部隊和別動第三潛艇部隊隨軍行動，駐斐濟第一潛艇部隊和瀋陽號航母戰鬥群進入珊瑚海接應，遇到敵對行為，可以自由反擊……」這是葉蘇向下面下達的命令，意思很明顯，如果誰要對我動手，那就無怪我撕破臉皮了，這是極為強硬的表現。
「鑒於我艦隊在珊瑚海連續遭到攻擊，讓我軍受創嚴重，特此派出護航海軍部隊，不對任何第三方表示敵意……」這是別動軍方面在向外公開的聲明。
「看來，葉蘇是要強硬介入南太平洋了……」得知來自中國的消息後，羅斯福和丘吉爾皆是憂心腫腫，但一時又找不到反對的借口，誰叫狂妄的麥克阿瑟給了別動軍這樣一個借口。
日本人自然是沒有什麼異議，表示日本聯合艦隊不會出現在別動軍艦隊一百海里之內，盟軍方面為了表示襲擊事件和他們沒關係，也表示盟軍的艦隊不會出現在別動軍艦隊一百海里之內。
在這樣一種形式下，又有兩支別動軍的艦隊出發了，依然是以運兵船為主，不過，水下卻派出了潛艇部隊，這是別動軍潛艇部隊的第一次護航任務。這兩支艦隊在海上航行，主要戰力自然要靠潛艇部隊，潛艇部隊的分工明確，每支部隊有二十一艘潛艇，全部升到水面上，以十幾節的速度跟著艦隊一起走。別動軍的這種行為似乎有些不妥，因為潛艇本來就注重隱蔽性，這不明顯是把行蹤給暴露了嗎？但是，他們依然這般做，可是，出奇的，一路之上，沒有任何勢力採取敵意行動。因為這些海域基本上都是日本人控制的，此時，日本人更不會去刺激別動軍了，所有日本船隻，只要一發展別動軍的艦隊，便會迅速的繞道，或者讓到一邊，等別動軍的艦隊過去之後，才走這條航道。可以說，為了把別動軍引入南太平洋，日本人是投入了大本錢的……(.您的支持，就是我最大的動力。)