蛇窟，佐助見到了病榻上的大蛇丸，藥師兜站在旁邊。大蛇丸道，「你來了，佐助。」佐助道，「有什麼事？」兜道，「早上收到了木葉遭受空襲的情報。是早已應該滅亡的空之國的忍者干的。」佐助嘲諷，「你還對木葉這麼感興趣啊！」大蛇丸道，「事到如今，木葉怎麼樣，我可管不著。我叫你來，可不是為了說這件事。」大蛇丸的臉色不大好，不住地咳嗽。
大蛇丸吩咐，「佐助，去給我帶個男人過來。」佐助疑惑，「男人？」藥師兜解釋，「是個醫生。」大蛇丸道，「那位醫生曾經教過我再生的禁術。是他的話，一定和我不同，應該早已完成了再生的忍術。」佐助似乎聽說過，「是那個男人啊！」大蛇丸道，「帶他來，我現在需要那個術。」
雨林，各種動物出沒，還有一條清澈的河流。晶臧等人護送神農師徒來到這裡，大家沿著河流划船行進。小櫻、阿雪、神農一條船，晶臧、雛田一條，鳴人與阿瑪魯一條，都是小船。神農道，「阿瑪魯的村子就在雨林的上游，在那附近有個遺跡。」鳴人很是不滿，「為什麼非要用這種船來渡河啊？我們用腳跑，不是更快嗎？」小櫻厲聲道，「在這雨林當中，毒蛇、毒蟲、毒獸可到處都是。」鳴人嚇了一大跳。
神農道，「而且這條河中，有很多食人魚、鱷魚、毒魚什麼的。」鳴人臉色有些難看，晶臧忽然喊道，「鳴人，快看岸邊。」鳴人扭頭觀看，疑似鱷魚的動物從岸邊潛入了水中。鳴人的頭上都是汗水，「是鱷魚嗎？還是毒魚？」雛田有些害怕，晶臧道，「放心啦，雛田。在水上行舟，水下的這些傢伙奈何不了我們。你忘了嗎？我可是木葉最強的水遁忍者。」雛田吐氣，「說得對喲！」阿瑪魯不屑，掏出一把刀子，「船上還有比忍者有用多的醫生在。鳴人，我會用這把手術刀救你的。」
鳴人哼了一聲，「現在保護你這位醫生的，可是忍者！」鳴人站起來起哄，「話說要讓你在身上動刀的話，本來能救的人也沒命了。」阿瑪魯也惱怒站起來，「開什麼玩笑！別看我這樣，我可是神農老師的第一弟子啊！和你們那種冰冷的忍者世界不同。我們靠的可是師生之間的羈絆，以及傳承的醫術！」鳴人火大，「你說什麼，這我可不能當做沒聽到。要論師徒關係的話……」晶臧無語，「這個白癡，又開始耍寶了！」
果然，鳴人開始變身為奇怪的形體，「大嘴巴的伊魯卡老師，戴著面罩的卡卡西老師，還有長頭髮的好色仙人，和我之間的羈絆，要比你……堅固百倍呢！」小櫻看不下去，當場給鳴人一船槳。鳴人悲呼，「好痛，你幹什麼啊，小櫻？」小櫻示意，「稍微安靜一下。」鳴人這才注意到，三條船都停止了前進。阿雪似乎發現了什麼，氣氛有些緊張。雛田打開白眼，「上空有散發查克拉的飛行風箏，和襲擊木葉的完全一樣！」
神農道，「這可不妙啊！」晶臧道，「我過去看看吧。」神農道，「不，你對附近的地形完全不瞭解，很容易暴露。大家先躲到樹林裡，看看情況再說。」阿雪大喊，「有敵人，快躲起來。」上空果然出現了4個空忍，在向下觀察。晶臧等人及時把船滑入了叢林中，鳴人和阿瑪魯來不及進入樹林，鳴人及時把小舟翻過來，然後抱住阿瑪魯跳入了水中。晶臧本來想把這幾架敵機打下來，小櫻勸阻，「會暴露目標的。現在不知道敵人有多少。要是被發現了，你再動手。」
似乎很幸運，4個空忍沒發現什麼異常，繞了一圈飛走了。阿雪幾人從樹叢下探出頭，晶臧喊道，「鳴人，你們沒事吧？」鳴人從水下浮上來，「終於躲過去了。」鳴人翻過小舟，來到船上，發現阿瑪魯不見了。阿瑪魯的手術刀掉落河中，他就潛入到水下尋找。但是在上來時，被水草纏住了腳，終於溺水了。昏迷中，阿瑪魯想起了與神農老師的相遇，是神農救了阿瑪魯。阿瑪魯希望能變強成為忍者，因為他沒有雙親，而遭到了村民的歧視。他想成為忍者，讓大家對自己刮目相看。
神農卻說，「阿瑪魯，我已經放棄了戰鬥的道路。雖說戰鬥需要力量，但能夠拯救生命的力量更加可貴。」阿瑪魯不明白，神農道，「也就是說有殺人之刃，也有救人之刀。」後來，神農就把那把手術刀傳給了阿瑪魯。晶臧發現水下不對，馬上告知了鳴人。鳴人潛入水下，把阿瑪魯救了上來。鳴人把阿瑪魯托到了船上，但是一群食人魚開始圍攻鳴人。晶臧急忙結印，發動水遁忍術，驅散了食人魚。
看到阿瑪魯如此關注手中的手術刀，鳴人也露出笑容。來到船上，鳴人發現阿瑪魯打濕的胸前有很大的凸起，眼睛都直了。阿瑪魯臉色通紅，急忙穿上外衣，「笨蛋！」鳴人道，「你這傢伙，難道是……」鳴人開始搖晃，晶臧大叫不好，一隻食人魚咬住了鳴人的大腿。晶臧射出苦無，殺死了食人魚。阿瑪魯大驚，「這個魚是毒魚！」鳴人暈了過去，晶臧吃驚，「這麼厲害啊！」
來到岸上，阿瑪魯撕扯衣服，用布條繃帶壓住鳴人的大腿動脈。阿瑪魯用火機燒了一下手術刀，劃破鳴人的傷口處，流出毒血。阿瑪魯吸允毒血，非常幹練。晶臧稱讚，「小哥，看不出來，你還挺厲害的嘛！」阿瑪魯顧不上說話。小櫻忽然發現鳴人臉色通紅，「你臉紅什麼啊？」鳴人支吾，「啊，不，沒什麼啦。」神農道，「被村人排擠的孩子，依靠救人之刃得到了大家的認可。雖然遍體鱗傷，還是跑出來報告村莊的危機。而且現在正在救治已經成為夥伴的忍者。真是成長了啊！」
阿瑪魯處理完了，「已經沒事了。」阿雪鬆了口氣，「太好了，鳴人！」晶臧道，「鳴人體內有九尾，就算不進行救治，也死不了的。」鳴人臉黑，「晶臧，你到底是不是我的死黨？」晶臧哈哈大笑，「我只是實話實說而已。」雛田道謝，「阿瑪魯，謝謝你了。晶臧說的話，你別在意。」小櫻過來，為鳴人的傷口進行醫療忍術治療，「毒素確實被完全排除了，解毒劑也開始起作用了。」小櫻稱讚，「真厲害，是完美的處理。」
神農也道，「阿瑪魯，做的很不錯！」阿瑪魯大喜，「是的，老師！」顯然，神農對這個弟子非常滿意。鳴人感動，「弟子和老師嗎？真好！」隨後，眾人沿著叢林前進，神農與晶臧在前頭開路，小櫻、雛田、阿雪依次跟著，阿瑪魯扶著鳴人吊在後面。晶臧對那些毒蟲很頭疼，神農道，「不必擔心，這附近毒蟲和野獸很少出沒。」話音剛落，一條毒蛇從樹上落下來，晶臧的苦無射出去，毒蛇斃命。
神農有些尷尬，「馬上就要到阿瑪魯的村子了。」大家繼續前進，鳴人道歉，「之前說了你很多壞話，抱歉啊！你蠻厲害的！」阿瑪魯道，「不是我。是我的老師神農厲害。」鳴人開始搞怪，不斷比劃，「但是，剛才這個怎麼說呢？就是那個……難道你是……」阿瑪魯沒有說話，撅起嘴。鳴人吃驚，「果真是女孩嗎？」阿瑪魯生氣，「用得著這麼吃驚嗎？」鳴人道，「這當然會吃驚了。」
阿瑪魯問道，「我就那麼像男生嗎？」鳴人點頭，「嗯。連晶臧都沒看出來。」阿瑪魯忽然蹲下來，「神農老師也是這樣看待我的嗎？」鳴人自作聰明，「這樣啊，原來你喜歡上神農大叔了！」阿瑪魯大怒，跳起來，給他一記耳光，「八嘎，不是這樣的！」可憐的鳴人，臉立即被打扁了，「我還不怎麼能活動呢？」阿瑪魯有些歉意，「對不起啊，鳴人。」晶臧在前面大聲招呼，阿瑪魯與鳴人急速跑過來，鳴人還跌了幾次觔斗。
來到樹林外，大家看到前面的村路還有煙霧升起。阿瑪魯不顧大家勸阻，直接向村子裡跑去。大家只好跟上去，穿過前面的叢林，來到村外。村子裡還在燃火，顯然這裡也遭到了轟炸，到處都是火光和煙塵。房屋都燒著了，地上有射擊的痕跡，落地的苦無，被刺死的小女孩。燃燒的房屋在倒塌，但沒有看到活著的人。阿瑪魯大喊，「大家，大家都在哪裡啊？有沒有人在啊？」
阿瑪魯跑上高台，「一定躲在哪裡，大家快出來吧！」但是沒人回應，只有火還在燃燒。一排弩箭向阿瑪魯射過來，苦無等暗器佈滿了四周。阿瑪魯來不及躲閃，神農手持短刀趕到，擋住了弩箭和苦無的攻擊。神農及時把阿瑪魯推下高台，自己卻被隨後密集的暗器射成了蜂窩。神農大喊，「阿瑪魯，你沒事吧？」阿瑪魯爬起來，發出驚叫，「老師！」神農倒下，滾落了台階。阿瑪魯接住老師，大為著急。晶臧等人這才跑進村子，村子的路他們不熟悉，鳴人堅持讓晶臧用水遁忍術滅火，所以耽誤了時間。
小櫻問道，「這是怎麼回事？」阿瑪魯焦急，「老師，振作點！」神農感歎，「我竟然衝上去就……沒有力氣了，竭盡全力，真是老了。」阿瑪魯哭了，「為什麼要……」神農道，「因為你是我認可的弟子。」神農摘下頭上的紫色頭巾，遞給阿瑪魯，「接下來就拜託你了。和大家一起協力來尋找村民吧。把他們救出來……」鳴人大急，「大叔！小櫻、晶臧，快救人！」二人立即跑過來，用醫療忍術救治神農。阿瑪魯哭道，「求求你老師，千萬別死！」但是神農依然閉上了眼睛。
雛田的白眼看得很清楚，已經來不及了。晶臧和小櫻也只好停止救治，醫療忍術救不活死人。鳴人難過，「為什麼會……」晶臧歎氣，「我們的任務，失敗了一半啊！」阿瑪魯抱住老師的屍體放聲大哭。事後，經過調查，發現上面的那些弩箭等東西，都是敵人留下的機關陷阱。只要有人衝上高台，就會發射。所以阿雪才沒有感知到敵人的位置。然後，大家幫著阿瑪魯把神農安葬了。墳墓上放置了十字架，十字架上掛著神農生前的大衣。
阿瑪魯道，「神農老師是我的救命恩人，我本來是個被拋棄的孩子。」在患上不明原因的怪病後，沒有一個村民願意照顧阿瑪魯。神農冒著被感染的風險，對她進行了治療。當阿瑪魯醒來的時候，神農充滿笑容，「你做得很好，阿瑪魯！你很努力啊！」
大家也都很難過，但是沒有發現更多村民的遺骸。雛田道，「他們一定到什麼地方避難了。」小櫻道，「我們就去把村民找出來吧。」晶臧同意，5人就一起行動離開這裡。留下阿瑪魯自己在神農墳前哭泣。失去神農，對於阿瑪魯的打擊很大。阿瑪魯解下自己頭上的紅色頭巾，拿著老師的紫色頭巾放聲大哭，「我還有很多話沒有對老師說呢……什麼都沒有來得及說……」
雛田與晶臧一組，雛田發現了一股奇怪的查克拉，二人就追蹤過去查看。鳴人站在河邊發呆，小櫻落在樹上，發現是鳴人，才鬆了口氣。這裡霧氣瀰漫，小櫻跳下來，鳴人疑惑，「小櫻，你沒和阿雪在一起嗎？」小櫻嗯了一聲，「我擔心阿瑪魯，讓阿雪回去照顧他了。你在做什麼，找到村民了嗎？」鳴人指了指前面的霧中的建築物，小櫻吃驚，「那是什麼？」鳴人道，「應該是神農大叔所說的遺跡吧。」