林丹汗
1603年，蒙古帝國的布延薛禪汗去世，次年由他的長孫林丹汗繼位。
林丹汗即位後，在巴林部境內的阿巴噶哈喇山修建了瓦察爾圖察漢浩特作為整個蒙古的政治、軍事、經濟、文化中心。林丹汗加強了傳統的左右翼三萬戶的地方行政體制，命永謝布部卻熱斯塔布囊為特命大臣，率領一支軍隊駐防趙城（今呼和浩特一帶），管理右翼三萬戶的蒙古各部，任命烏齊葉特(內喀爾喀)鄂托克錫爾呼納克洪台吉為管理左翼三萬戶的特命大臣。察哈爾八鄂托克雖屬左翼三萬戶，但直屬林丹汗。
林丹汗為了有效地控制蒙古各部和鞏固汗權，以察哈爾部為基礎，直接控制了內喀爾喀巴林、札魯特、巴岳特、烏齊葉特、弘吉剌特等五部，同時也遙控了蒙古其他各部。林丹汗執政前期，漠北喀爾喀三汗以及漠南喀喇沁的昆都倫汗、阿魯科爾沁的車根汗、科爾沁奧巴洪台吉、鄂爾多斯土巴濟農等，定期前往察漢浩特，朝見林丹汗，並與大汗共同商討政務大事，參加大汗舉行的宴會、圍獵等活動。蒙古各部汗、濟農、諾延、台吉，按照圖們札薩克圖汗**約束諸鄂托克，並定期向林丹汗朝貢獻物（《大黃冊》，1957年列寧格勒版）。
林丹汗利用藏傳佛教，進一步擴大自己的影響。林丹汗登基那年，四世*雲丹嘉措所遣邁達裡呼圖克圖札阿囊昆噶寧波(大慈諾門汗)經鄂爾多斯抵達呼和浩特，作為蒙古地區黃教的坐床喇嘛。不久，林丹汗將邁達裡諾門汗、卓尼綽爾濟迎請至察漢浩特，不但自己信奉黃教，而且讓他們在察哈爾地區活動，宣揚該教。1618年，當林丹汗26歲時，西藏紅教方面派遣沙爾巴呼圖克圖到達蒙古地區，尋找自己的支持者，林丹汗為紅教喇嘛沙爾巴呼圖克圖的法術所折服，在察漢浩特隆重地迎接了他。林丹汗封他為國師，並接受深奧密乘之灌頂。沙爾巴呼圖克圖為了取得林丹汗的信任，從五台山取來元世祖時紅教八思巴喇嘛用千金所鑄嘛哈噶喇金佛。林丹汗修建金頂白廟，將金佛供於其中。林丹汗為了弘揚佛教，召集昆噶敖德斯爾、班第達顧實、阿南達顧實為首的33名大翻譯家，在1628－1629年期間翻譯了108卷《甘珠爾經》(前人已翻譯過其中一部分)，並用金字抄寫在藍紙上。林丹汗把祖傳下來的傳國金印和嘛哈噶喇金佛、金《甘珠爾經》視為三**寶。
林丹大汗以沙爾巴呼圖克圖為國師，改奉紅教後，極大地影響了他從前的形象和聲譽。信奉黃教的漠北喀爾喀和右翼三萬戶的各部汗、濟農、諾延、台吉，與林丹汗逐漸有所疏遠。影響較大的邁達裡諾門汗，也與林丹汗發生了分歧，久居漠北喀爾喀，已不再同情和支持林丹汗。儘管林丹汗改奉紅教後，其統治地位大受影響，但蒙古各部基本上仍聽從於他的統一號令。而正當此時，女真人已從東北地區崛起。其建州部首領努爾哈赤，統一了女真各部，於1616年在赫圖阿拉即汗位，國號曰「金」，史稱「後金」。努爾哈赤統一女真各部的戰爭，早已引起蒙古和明朝的注意。
更何況，後金勢力和影響已波及到蒙古邊緣各部。科爾沁、內喀爾喀五部及喀喇沁等，不斷遣人至察漢浩特，希望林丹汗採取必要的防範措施，以遏制後金勢力。1608年，努爾哈赤的長子褚英率領5000人進犯烏拉部。烏拉部為女真人的一支，與科爾沁相鄰。烏拉部派人向科爾沁部求援。經林丹汗同意，科爾沁部翁阿岱巴圖爾諾延及其子奧巴率領科爾沁部大軍到達烏拉境，與烏拉部聯軍共同打退了褚英的軍隊。不久，葉赫部(在昌圖和開原之間所居)首領錦太什受到努爾哈赤的威脅，又向林丹汗告急求援。林丹汗遂命翁阿岱巴圖爾及其子奧巴領科爾沁部兵，往援葉赫部，殺死了努爾哈赤的部將布揚古（《皇清開國方略》卷12）。後金天命年間，科爾沁部的台吉們奉林丹汗的命令，曾幾次同後金交戰，保衛了自己的邊疆。顯示了自己的勢力，科爾沁部的明安諾延的3個兒子還曾率領部眾深入後金境內，大掠其牲畜。但是，後金國主努爾哈赤在遼東地區的地位尚未鞏固，他不敢與蒙古和明朝同時對立。因此，對蒙古人的挑戰，盡量採取忍讓遷就的態度，甚至以通婚（努爾哈赤娶科爾沁明安台吉女為妃）為手段，爭取與科爾沁、內喀爾喀諸台吉保持和睦友好關係。
1619年六月，當努爾哈赤攻打明朝撫順、開原.鐵嶺、遼陽之際，林丹汗也趁機親率察哈爾和內喀爾喀五部，攻佔了明朝的廣寧城。當時，明朝為了不讓努爾哈赤與林丹汗聯合，使明朝東、北兩面受敵，不斷派人到察漢浩特，竭力討好林丹汗，希望他與明朝保持友好關係。林丹汗也考慮到，與明朝保持友好，進行貿易，有利可圖；同時利用明朝可以遏制和削弱後金勢力。因此，努爾哈赤攻打遼東地區的初期，明朝北境基本上安然無事。為了表示謝意，明朝每年向林丹汗贈送白銀千兩。
1619年夏，後金取得了遼東地區以薩爾滸之戰為中心的總體戰役的勝利，士氣大振。七月，努爾哈赤準備乘勝攻打鐵嶺。駐守鐵嶺的明軍勢單力薄，難以抵擋後金精稅。於是明朝派人至察漢浩特，向林丹汗求援。林丹汗命內喀爾喀五部弘吉剌特鄂托克齊賽諾延、札魯特鄂托克巴克、色本以及科爾沁明安諾延之子桑噶爾寨台吉等領兵萬餘，往援鐵嶺明軍。林丹汗所遣大軍乘夜色到達鐵嶺城下。此時，努爾哈赤集中優勢兵力，已攻克了鐵嶺。他得知蒙古援軍1萬餘人兵臨城下，便指揮諸貝勒出城交戰。齊賽諾延率領的蒙古軍隊，經不起數量上優勢、鬥志旺盛的後金軍隊的猛攻，紛紛敗下陣來，奔遼河奪路而逃。後金軍隊緊緊追殺，活捉了齊賽諾延、巴克、色本、桑噶爾寨等台吉。
1619年十月，林丹汗派遣使臣康喀勒拜瑚持書到努爾哈赤住地，自稱「四十萬蒙古之主」，藐視稱「水濱三萬人之王」（《皇清開國方略》卷7）的努爾哈赤，要求努爾哈赤無條件釋放所獲內喀爾喀台吉和科爾沁台吉，並警告努爾哈赤不得進犯林丹汗所攻取的廣寧城。努爾哈赤釋放了除內喀爾喀弘吉剌特的齊賽諾延以外的所有台吉，並寫了一封指責林丹汗的措詞強硬的信，通知內喀爾喀五部以牲畜一萬贖回齊賽諾延。林丹汗拒絕努爾哈赤的要求，但仍準備設法營救齊賽諾延。
1621年三月，努爾哈赤和諸貝勒率領大軍，圍攻瀋陽，打敗明軍7萬守城部隊，佔領了瀋陽城。努爾哈赤留下部分兵力駐守瀋陽，指揮其餘大部分兵力，準備乘勝攻取遼陽城。林丹汗得知後金佔領瀋陽並留下少數部隊守護的情報後，令管理蒙古左翼三萬戶的大臣，烏齊葉特鄂托克的錫爾呼納克杜稜洪台吉率領內喀爾喀卓哩克圖諾延、達爾漢巴圖爾、巴哈達爾漢等2000騎兵前往瀋陽營救被禁的齊賽諾延。錫爾呼納克杜稜洪台吉所率輕騎到達瀋陽城下，與守城部隊展開激戰。但蒙古軍隊擔心努爾哈赤的援兵前來增援，便撤回蒙古本土。1621年八月，內喀爾喀五部送萬頭牲畜，贖回了弘吉剌特鄂托克齊賽諾延。
1603年1612年，後金國主努爾哈赤遣人至蒙古科爾沁部，娶明安台吉女為妃。1614年四月，努爾哈赤第二子代善娶科爾沁札魯特台吉鍾嫩女為妻。同月，札魯特內齊汗，將其妹嫁與努爾哈赤五子莽古爾泰。接著，努爾哈赤第四子皇太極娶科爾沁部莽古思台吉女為妃。同年十二月，札魯特部額爾濟格台吉女嫁給努爾哈赤第十子德格雷。1615年努爾哈赤又納科爾沁孔果爾台吉女為妃。1617年內喀爾喀巴岳特鄂托克達爾漢巴圖爾諾延之子恩格德爾娶女真舒爾哈齊四女為妻。經如此頻繁的聯姻，減少了來自蒙古方面的壓力，使努爾哈赤集中精力去對付明朝。
1618年四月起，努爾哈赤指揮後金大軍，先後攻克了明朝的遼東要鎮撫順、開原、鐵嶺，並取得了薩爾滸大捷，殲滅了明朝在遼東地區的有生力量。1621年三月，努爾哈赤攻取瀋陽後，乘勝攻克了遼陽城，四月遷都遼陽。1622年正月，努爾哈赤率領大軍西渡遼河，攻下了明朝的軍事重鎮廣寧(也稱北鎮)。1625年遷國都於瀋陽。此時，後金國主努爾哈赤完全掃除了明朝在遼東地區的勢力。鞏固了在遼東的統治後，他將注意力逐漸轉向了蒙古察哈爾部。首先對察哈爾的外圍內喀爾喀、科爾沁等部採取了離間、拉攏、威脅等手段，以孤立和削弱林丹汗的勢力。
1619年七月的鐵嶺戰役後，努爾哈赤頻繁遣人至內喀爾喀，要求諸台吉與後金盟誓修好，共同對付明朝。努爾哈赤與內喀爾喀建立同盟的目的是為了離間內喀爾喀與林丹汗的關係。十一月，在內興安嶺的色特爾黑地方，內喀爾喀五部部分台吉與努爾哈赤所遣使臣額剋星額、綽庫爾、雅希禪、庫爾禪等刑白馬烏牛，設酒盟誓，表示彼此修好，與明朝為敵（《皇清開國方略》卷6）。1621年十一月，內喀爾喀五部的古爾布什、奔古勒二台吉率領所屬六百戶，至遼陽歸附於後金（《皇清開國方略》卷7）。努爾哈赤設大宴迎接，並將松古圖公主嫁給了古爾布什台吉。
內喀爾喀部分台吉與後金通婚、盟誓等事，引起了林丹汗的疑心。他嚴厲指責管理左翼三萬戶的大臣錫爾呼納克杜稜洪台吉管束不得力，甚至懷疑他暗中與努爾哈赤已有聯繫，準備對錫爾呼納克杜稜洪台吉和其他諸台吉採取必要的措施。這反而加速了蒙古內部的分化。本來從林丹汗信奉紅教後，尊崇宗喀巴黃教多年的漠北喀爾喀以及漠南影響較大的諸部，已與林丹汗貌合神離，開始自行其是了。1622年二月，管理左翼三萬戶的特命大臣錫爾呼納克杜稜洪台吉與林丹汗發生分歧，遂率領所屬烏齊葉特部與明安諤勒哲依圖台吉所屬烏嚕特部共三千多戶，投奔遼陽城，歸順了努爾哈赤。受其影響，1623年正月，內喀爾喀拉巴什希布、索諾木、莽果、*台吉等也各率所屬五百戶投奔了遼陽城。此時，烏珠穆沁部翁袞都喇爾子多爾濟車臣濟農與其叔之子塞稜額爾德尼台吉也因與林丹汗不和，率部投奔了漠北喀爾喀車臣汗碩壘。蘇尼特部素塞巴圖嚕濟農、浩齊特部策凌伊爾登、阿巴噶部都思噶爾札薩克圖濟農各率所部，也投奔了漠北喀爾喀車臣汗碩壘。
針對錫爾呼納克杜稜等台吉投奔努爾哈赤，林丹汗傳令內喀爾喀和科爾沁部，不得與後金使臣擅自往來，若被發現，定要興師問罪。
1623年五月，努爾哈赤又暗遣佑雷和伊沙穆，分別前往札魯特右翼台吉達雅和色本兩處。奉命監視右翼的札魯特左翼台吉鍾嫩和巴林左翼台吉昂安等，中途劫奪了佑雷、伊沙穆所帶衣物。色本懼怕林丹汗問罪，於是率部逃入科爾沁。科爾沁奧巴也惟恐得罪林丹汗而不敢收留。色本台吉走投無路，只好投奔後金國主努爾哈赤。努爾哈赤得知內喀爾喀的很多台吉懷有歸順之心，但被林丹汗所阻不敢輕舉妄動。於是決定以武力相助欲附之台吉。經多次往來，努爾哈赤已爭取了科爾沁奧巴為首的諸台吉。1624年二月，努爾哈赤遣巴克什、希福、庫爾禪至科爾沁，在伊克唐噶哩坡(今科左中旗花土古拉蘇木一帶)與奧巴為首的諸台吉刑白馬烏牛盟誓（《皇清開國方略》卷8）。此時，林丹汗叔祖岱青台吉與林丹汗不和，遂領所屬錫納明安鄂托克及其六子逃入科爾沁境內，受到奧巴洪台吉的保護。林丹汗命弘吉剌特鄂托克齊賽諾延領兵追回岱青台吉。齊賽諾延深入科爾沁，斬殺了前來堵截的奧巴屬下六台吉，取勝而返。1625年十一月，林丹汗親自率領內喀爾喀部分兵力，前往科爾沁奧巴洪台吉所在地格勒珠爾根城，圍城問罪。努爾哈赤命三貝勒莽古爾泰、四貝勒皇太極率領5000名精銳騎兵，由農安塔前來援助奧巴，迫使林丹汗撤走。內喀爾喀巴岳特鄂托克達爾漢巴圖爾之子恩格德爾台吉欲歸後金，因懼林丹汗，不敢前移。努爾哈赤命諸貝勒率兵，移其部眾於遼陽。
在此期間，努爾哈赤以札魯特部人奪其使臣財務為借口，派阿巴泰、德格類等貝勒率領3000人，深入札魯特左翼擊斬了昂安台吉，盡獲其妻孥人戶畜產而去。面對後金統治者的軍事壓力，林丹汗未能有效地組織各部與後金正面作戰，客觀上為後金提供了蠶食其外圍各部的機會。
1626年五月，努爾哈赤親統大軍，分兵八路進攻巴林部，擊斬了該部台吉囊努克，收其畜產班師。巴林部的部分台吉率部逃入科爾沁境，歸順了努爾哈赤。同年十月，後金以札魯特台吉鄂爾齊圖等兵阻前往科爾沁的使臣為借口，由大貝勒代善、二貝勒阿敏率領萬餘兵馬攻打了左翼札魯特諸台吉，俘虜了巴克為首的14個台吉及人畜。隨後，後金統治者又以武力迫使察哈爾所屬阿剌克楚特鄂托克小台吉圖爾濟率屬下百餘戶歸附了後金。
1626年八月，後金國主努爾哈赤去世，其四子皇太極即位。皇太極登基後，加快了征服蒙古各部的步伐，三征林丹汗。
皇太極以軟硬兼施的手段，拉攏並征服了察哈爾部外圍的內喀爾喀(巴林、札魯特、巴岳特、烏齊葉特、弘吉剌特)和科爾沁部，使素來強大的察哈爾部的力量大為削弱。於是皇太極將軍事行動的鋒芒直指察哈爾部。
奈曼和敖漢為察哈爾八鄂托克成員，影響較大。努爾哈赤及其繼承人皇太極早就通過奈曼鄂托克中有影響力的烏木薩特綽爾濟喇嘛，策動奈曼部長袞楚克巴圖魯台吉歸順後金。1627年二月，皇太極暗中遣人至奈曼部袞楚克所在地，希望袞楚克說服敖漢部首領索諾木杜稜及克什克騰部首領索諾木諾延歸順後金。四月，奈曼和敖漢部遣人表示，他們曾說服林丹汗與後金講和，但他們的努力遭到林丹汗和克什克騰部長的拒絕。六月，奈曼和敖漢部長派遣烏木薩特綽爾濟喇嘛至都爾弼城(後為清朝養息牧場)，通知後金兩蒙古部來降。皇太極領諸貝勒自都爾弼渡遼河，迎接了兩部長。1627年十二月，察哈爾阿喇克楚特部長多爾濟伊勒登、安班和碩齊、扣肯巴圖魯、昂坤杜稜等台吉，也先後率部依附於皇太極。
在此期間，皇太極曾數次遣人策動喀喇沁部歸順後金，但其所遣使臣均被察哈爾所屬多羅特部人截殺。1628年二月，皇太極以使臣被殺為由，親自率領精銳之師征戰察哈爾。皇太極命其弟多爾袞和多鐸貝勒為先鋒，率精兵先進。多爾袞探知多羅特部青巴圖嚕塞稜及其部眾在敖穆倫住牧，於是合兵襲擊了敖穆倫，多羅特部多爾濟哈坦巴圖嚕受傷遁走，台吉固嚕被殺，其部眾萬餘人被皇太極俘獲（《皇清開國方略》卷11）。
皇太極與喀喇沁通使，進兵察哈爾殺掠了多羅特部。於是，林丹汗興師進抵喀喇沁部所在地，以武力裹走了喀喇沁蘇布地塔布囊及其弟萬丹偉征所屬戶口牧產。喀喇沁拉斯喀布汗與土默特、鄂爾多斯、阿蘇特、永謝布的部分台吉聯合，攻打了駐守趙城(在呼和浩特城一帶)的林丹汗的一支軍隊。1628年七月，喀喇沁部首領派遣以4名喇嘛為首的使團與皇太極的使臣，刑白馬烏牛盟誓，歸順了皇太極。
趁此機會，皇太極決定第二次征察哈爾林丹汗。1628年九月，皇太極分遣巴克什和希福傳令西北歸順的外藩蒙古各部率領所屬兵馬，到達約定地點，以征察哈爾林丹汗。敖漢部長索諾木杜稜、奈曼部長袞楚克巴圖魯會於都爾弼城；內喀爾喀諸貝勒所率兵馬會於遼陽城；喀喇沁和科爾沁部會於綽羅郭勒。皇太極統領大軍乘夜攻入察哈爾部的錫爾哈錫伯圖、英湯圖等地，俘獲了很多人畜而還。科爾沁台吉滿珠習禮及巴敦(孔果爾之子)力戰察哈爾部眾，將所獲物獻給了皇太極。皇太極分別賜二人」達爾漢巴圖嚕」和」達爾漢卓哩克圖」號。惟有科爾沁部長奧巴不忍心殺掠林丹汗及其部下，以足疾為由未到達所會之地，與其弟布達齊率部抵達察哈爾邊界，虛張聲勢而還。皇太極遣人問罪，罰駝十峰，馬百匹（《皇清開國方略》卷12）。
1630年十一月，阿魯科爾沁部長達賚楚琥爾、四子部落台吉伊爾扎布墨爾根台吉、阿魯伊蘇特部台吉齊桑達爾漢、噶爾瑪伊勒登等各率所部先後歸順了皇太極。皇太極將他們安置在西拉木倫河北岸遊牧。1631年十一月，林丹汗為了用武力奪回阿魯諸部台吉，遂興師到達阿魯科爾沁達賚楚琥爾牧地，帶走了塞稜阿巴海的部眾。皇太極親率2000名精銳騎兵聞訊趕來，林丹汗早已越過興安嶺而去。
1632年三月，皇太極決定第三次遠征察哈爾林丹汗，傳令歸順後金的蒙古各部速率部來會。四月，科爾沁、札魯特、巴林、奈曼、敖漢、喀喇沁、土默特、阿魯科爾沁、翁牛特、阿蘇特等部的部長檯吉會於西拉木倫河岸，總兵力約10萬。四月下旬，皇太極率領大軍越過興安嶺，駐守都埒河。當夜，鑲黃旗兩個蒙古人偷馬逃出，將大軍壓境的消息報告給林丹汗。林丹汗欲率部撤至漠北喀爾喀，但喀爾喀三汗與他不和。於是林丹汗率領所屬10萬之眾，西奔庫赫德爾蘇，經呼和浩特，渡黃河到達鄂爾多斯。皇太極分兵三路窮追林丹汗41天，五月下旬進駐呼和浩特，得知林丹汗已南渡黃河而去。遂停止追擊，經宣府、張家口返回。途中收攏了林丹汗所遺部眾數萬人。
後金大軍到達呼和浩特後，林丹汗在成吉思汗陵前舉行莊嚴的儀式，宣稱自己為全蒙古的」林丹巴圖魯汗」，遂帶領察哈爾、鄂爾多斯部眾，移動成吉思汗之陵，西渡黃河至大草灘。林丹汗在大草灘永固城一帶擁眾落帳，等待時機，重整旗鼓，準備東山再起。此時，一向堅決支持林丹汗事業的漠北喀爾喀卻圖台吉(土謝圖汗部)，於1634年初，率所部4萬之眾，直奔大草灘與林丹汗會合。林丹汗和卻圖台吉通過紅教的關係，與藏巴汗和白利(康區)土司頓月多吉建立了聯繫（金巴道爾吉《水晶鑒》，留金鎖校注）。
1634年夏，林丹汗不幸因病去世。林丹汗福金蘇泰與其子額爾克孔果爾額哲率領察哈爾和鄂爾多斯部眾自大草灘返回鄂爾多斯。喀爾喀卻圖台吉率部進入青海。
林丹汗病故後，皇太極於1635年二月命多爾袞、岳托、薩哈廉、豪格領兵1萬，前往鄂爾多斯尋找林丹汗子額哲。三月，多爾袞在西喇珠爾格地方遇到林丹汗的妻子囊囊，得知額哲所在地。四月二十日，渡過黃河，至托裡圖找到了額爾克孔果爾額哲。後來，後金統治者將察哈爾部安置於義州，分設左右翼察哈爾八旗，封林丹汗子額哲為親王，並將皇女馬喀塔格格嫁之，設都統和副都統統治察哈爾左右翼。
1636年三月，漠南蒙古十六部49個大小領主齊聚瀋陽，承認皇太極為汗，並奉上「博格達·徹辰汗」的尊號（內蒙古社科院歷史所《蒙古族通史》，民族出版社，2001年發行版）。蒙古人之所以承認皇太極為汗，是因為當時的女真（滿族）部和蒙古人似乎有著同一祖源關係，而且可以確定的是皇太極的父親努爾哈赤的先祖就是猛哥帖木耳（猛哥帖木耳是蒙古名字，他曾於1412年被明朝冊封為建州左衛指揮）。同年，皇太極在盛京(瀋陽)即位，改國號「清」，改元崇德。
親眷
八大福晉（八大妃、八大太后）
林丹汗病死後，他的部下逐漸土崩瓦解，他的福晉們也開始尋找自己新的歸宿。
後金天聰八年八月，林丹汗的側福晉，時稱竇土門福晉，由他部落的一名叫多尼庫魯克的護送下，率先到皇太極的軍營行幄，表示歸順，並選擇了木湖爾伊濟牙爾地方暫時駐牧。皇太極考慮後，決定娶竇土門福晉。
在皇太極納娶竇土門福晉後不到一年，後金天聰九年三月，林丹汗的多羅大福晉囊囊太后娜木鍾率領一千五百戶部眾來歸；四月，林丹汗另一個多羅大福晉蘇泰太后帶著她的兒子額哲，即林丹汗的繼承人，又率一千戶部眾來投，並獻上歷代傳國玉璽；隨同兩位尊貴太后前來的還有林丹汗另兩位側室福晉伯奇福晉、俄爾哲依圖福晉及林丹汗的妹妹泰松公主等。她們的到來，讓皇太極和諸王貝勒們欣喜若狂，因為這不但給他們送來美女，還帶來了眾多的家產人口及牲畜財帛等。
當林丹汗的八大福晉們歸順後，時為大汗的皇太極娶竇土門福晉和囊囊大福晉；其從弟濟爾哈朗娶蘇泰大福晉；其七兄阿巴泰娶俄爾哲圖福晉；其長子豪格娶苔絲娜伯奇福晉；將高爾土門福晉賜林丹汗屬下寨桑祁他特車爾貝為妻；二兄代善娶林丹汗之妹泰松公主；皇太極將次女馬喀塔下嫁林丹汗長子額哲；多爾袞娶了竇土門福晉的蒙古養女（一說是林丹汗之女）。
第一大妃，號多羅大福晉，囊囊大福晉（？－1674），史稱囊囊太后，是林丹汗的正室大福晉，八大福晉之首。統管阿紇土門萬戶斡耳朵。阿霸垓博爾濟吉特氏，名娜木鐘，又一名為德勒格德勒，蒙古阿霸垓部後封郡王額齊克諾顏之女。1635年（後金天聰八年），她生下林丹汗的次子，也是遺腹子阿布鼐（亦作阿布奈）。1636年（後金天聰九年）三月，歸順滿清，改嫁愛新覺羅·皇太極。崇德元年七月被封為西麟趾宮貴妃，位居崇德五大福晉的第三位。順治元年九月迎至燕京。順治九年十月尊皇考懿靖大貴妃。康熙十三年十一月二十日薨；葬昭陵貴妃園寢。她又為皇太極生下皇十一子襄昭親王博穆博果爾；皇十一女固倫端順公主，嫁蒙古阿霸垓部博爾濟吉特氏噶爾瑪索諾木。又撫養一蒙古女，名淑濟（疑為林丹汗之女），於崇德八年(1643年)七月嫁濟旺之子德參濟王子噶爾瑪德參（噶爾瑪）。
第二大妃，斯琴圖福晉。統管高爾土門萬戶斡耳朵，故又稱高爾土門福晉。1636年（後金天聰九年），改嫁林丹汗屬下寨桑祁他特車爾貝為妻。
第三大妃，蘇泰大福晉，史稱蘇泰太后。統管哈納土門萬戶斡耳朵，故又稱哈納土門福晉。葉赫那拉氏，名蘇泰，葉赫部德爾赫禮台吉之女。子一，長子額爾克孔果爾額哲。1636年（後金天聰九年）四月，歸順後金，改嫁愛新覺羅·濟爾哈朗。她是濟爾哈朗時已去世的繼福晉之姊。
第四大妃，芭德瑪瑙伯奇福晉（？－1669）。統管竇土門萬戶斡耳朵，故又稱竇土門福晉。阿霸垓博爾濟吉特氏，名巴特瑪·璪（亦作芭德瑪瑙），蒙古阿霸垓部塔布囊博第塞楚祜爾之女。1635年（後金天聰八年）八月，她在其部落的一名叫多尼庫魯克的護送下，到皇太極的軍營行幄，表示歸順，並選擇了木湖爾伊濟牙爾地方暫時駐牧。她是第一位向滿清歸順的林丹汗遺孀，改嫁給皇太極。崇德元年七月被封為東衍慶宮淑妃，位居崇德五大福晉的第四位。順治元年九月，迎至燕京。順治九年十月尊皇考康惠淑妃。康熙六年薨；葬昭陵貴妃園寢。她撫養一蒙古女（疑為蒙古林丹汗之女），於崇德五年(1640年)正月嫁多爾袞。
蘇巴海福晉，名蘇巴海。所管領的部民不詳。她曾經享受單獨謁見天聰汗並被賜予大宴招待。地位應高於俄爾哲圖福晉和苔絲娜伯奇福晉。
烏雲娜福晉，名烏雲娜。統管阿喇克綽特萬戶斡耳朵，故而又稱阿喇克綽特福晉。貴英恰之妹。該太后被漠北某一部落俘虜以後失蹤了。
俄爾哲圖福晉，名俄爾哲圖。所管領的部民不詳。1636年（後金天聰九年），歸順滿清，改嫁愛新覺羅·阿巴泰。疑為阿巴泰時已去世的元配嫡福晉那拉氏（男三坦之女）之妹。
苔絲娜伯奇福晉，名苔絲娜，也稱伯奇福晉。所管領的部民不詳。1636年（後金天聰九年），歸順滿清，改嫁愛新覺羅·豪格為其側福晉。
1.囊囊：就是漢語『娘娘』的音譯字。絕對不是名字。
2.額哲：林丹的長子，全名『額爾克孔果兒額哲』，其中，額哲在蒙語中有『主人』的意思，所以，額哲究竟是名字的一部分，還是跟在名字後面的尊稱，很難判斷。本書採用通用習慣，以額哲稱之。其餘，汗、台吉、喇嘛、諾顏、濟農等皆類似。
3.斡耳朵*：這句話在漢語中，語焉不詳，但我們根據史料，可以做出如下判斷：
部落下屬的各個萬戶都會抽調一部分部民，有男有女，一起送交到大汗身邊，這些人擔負的職責是『身兼各種職責的皇室忠誠奴僕和驍勇善戰的擺都拉』，這種雙重身份的可汗隨從，可能統稱為斡耳朵。滿人後來也採用了這個辦法，洪承疇投降後金後，其母親就被抽調，入宮去服侍孝莊，結果剛烈的老太太好像就此自殺。
4.濟農：蒙語，副汗，在漢語語境中，可以理解成太子去南京監國。但後來，逐漸轉變成地方部落長官。也由原來可汗對嫡長子的任命，演變成親朋擔當。
5.台吉，汗之子。分一到四等。
6.竇：漢語意為『弟弟』；
7.土蠻：又做『圖門』『土門』，漢語意為『萬戶』。竇土蠻萬戶，又可以稱作『弟弟的萬戶』或『小萬戶』；
8.阿紇：又做『阿哈』『阿喇』，漢語意為『哥哥』。阿紇土蠻萬戶，又可以叫做『兄長的萬戶』或『大萬戶』；阿喇克綽特，又可以叫做『克綽特哥哥的萬戶』。
9.高爾：又做『高勒』，漢語意為『中心』。高爾土門萬戶，又可以稱作『中心萬戶』
10.哈納：可汗，汗。
11.擺都拉：又做巴牙喇，漢語意為『中軍』，可引申為內廷人員。
12.伯奇：又做『別乞』音『beki』，黃金家族血統以外，部落領之女兒的尊稱。從其貴族傳承上看，很類似漢語中的『小姐』『夫人』，但級別要更高一些，也許『縣主』『鄉君』更貼切。
妹妹
兀浪哈大公主，林丹汗之大妹，大公主。大公主前夫曾經是林丹汗最得力的助手，統領察哈爾本部中軍萬戶的貴英恰。貴英恰台吉，鐵槊科諾特十蘇木之一，朗素萬戶濟農。
泰松公主（亦稱泰松格格），林丹汗之二妹，二公主。袞楚克台吉，鐵槊科諾特十蘇木之一，奈曼萬戶濟農。他於1632年在林丹汗北征漠北期間逼走留守漠南的土巴濟農，又殺害桑哈兒寨濟農，似乎是企圖政變未遂，逃入明邊後失蹤了。他可能就是殺害桑哈兒寨濟農後逃入明邊的林丹汗妹夫。太鬆公主在林丹汗死後，在1636年（後金天聰九年）與眾福晉一起歸附滿清，改嫁愛新覺羅·代善。
弟弟
粆圖台吉，鐵槊科諾特十蘇木之一，林丹唯一還『存活』的弟弟，其下落不明。
子嗣
長子，額爾孔果洛額哲，簡稱額哲。生母為蘇泰大福晉。1635年（後金天聰九年)，皇太極將次女馬喀塔許配給他；1636年（清崇德元年)完婚。同年，額哲被封為察哈爾親王。1641年（清崇德六年)額哲因病去世。
兒媳：愛新覺羅·馬喀塔(1625—1663)，清太宗皇太極的皇次女，生母為孝端文皇后科爾沁博爾濟吉特氏哲哲。1625年（後金天命十年）生。初封固倫公主。天聰九年(1635)，皇太極將她許配給林丹汗之子額哲；清崇德元年(1636)出嫁。額哲死後，於順治二年(1645)復嫁額哲之弟阿布鼐。順治十四年(1657)尊固倫長公主；十六年封固倫永寧長公主；後改封固倫溫莊長公主。康熙二年(1663)卒。
次子，阿布鼐（阿布奈），母為囊囊大福晉阿霸垓博爾濟吉特氏·娜木鐘。1635年（後金天聰九年)生，為林丹汗的遺腹子。順治二年(1645年)，嫁寡嫂、清太宗皇太極的皇次女固倫公主馬喀塔為妻。阿布鼐在順治五年襲其兄額哲遺爵封察哈爾親王。阿布奈對其先人的恥辱耿耿於懷，多年不朝覲。於是被革職下獄。後因「負恩失禮」被削爵並處死。
阿布鼐有二子，長子布爾尼，次子羅布藏。布爾尼襲親王，尚長史辛柱公主。
1634年，一直和後金抗戰到底的蒙古林丹汗在大草灘因病去世。次年漠南蒙古諸部基本歸附於後金。後金統治者皇太極將蒙古察哈爾部安置於義州，分設左右翼察哈爾八旗，封林丹汗子額哲為親王，並將皇次女馬喀塔格格嫁之，設都統和副都統統治察哈爾左右翼。
林丹汗長子額哲因病去世後，其弟阿布奈襲為親王，又尚公主。但是，阿布奈對其先人的恥辱耿耿於懷，多年不朝覲。於是被革職下獄。
1673年十一月，平西王吳三桂在雲南起兵反清，自稱周王。1674年十月，耿精忠在福建稱王，起兵反清。康熙皇帝遣京師大軍南征吳三桂和耿精忠，一時京城空虛，兵力不多。在察哈爾地區進行宗教活動的阿雜裡喇嘛和僧額渾津等人乘此機會，鼓動親王布爾尼和羅布藏，聯絡原察哈爾所屬奈曼等部，舉旗反清（王先謙《東華錄》，康熙十四年五月乙丑條）。布爾尼親王和羅布藏聽從了阿雜裡喇嘛和僧額渾津的鼓動，決定舉兵營救被禁於瀋陽的父親阿布奈，爾後攻打北京。1675年三月，親王布爾尼和羅布藏籌備兵器、整頓和訓練察哈爾右翼四旗兵馬。察哈爾都統晉津、副都統布達裡、附牧察哈爾的喀爾喀公垂札布也積極支持親王布爾尼和羅布藏的反清計劃。布爾尼親王遣人聯繫調駐宣府的察哈爾左翼官兵的同時，又派人策動各旗蒙古王公參加反清起義。原察哈爾所屬奈曼旗郡王扎木禪積極響應了布爾尼親王的號召。布爾尼親王決定三月二十五日舉事。不料其計劃和活動被長史辛柱公主所發覺。長史辛柱公主暗遣其弟阿濟根告發了這一密謀。土默特貝子濟濟斯札布也遣三等侍衛捨布來告布爾尼親王派人聯繫的事。清廷覺得事態嚴重，不能不採取對策。於是康熙皇帝與皇太后(孝莊文皇后)商量後，遣侍衛塞凌赴義州，以議事為名，召布爾尼、羅布藏入京。布爾尼知其為計，不赴京，軟禁了侍衛塞凌。三月二十五日，布爾尼親王、羅布藏、阿雜裡喇嘛、僧額渾津喇嘛、喀爾喀公垂札布、都統晉津、副都統布達裡舉事反清，率領數千人的隊伍(其中也有奈曼旗郡王扎木禪的部眾)，直奔張家口，準備與調駐宣府的察哈爾左翼四旗的散秩大臣綽爾濟、一等侍衛阿達、參領舒什蘭會師。但這3人不敢與清廷對抗。而察哈爾左翼四旗官兵，不顧散秩大臣綽爾濟的阻攔，在宣府嘩變，毀長城邊牆，去投布爾尼親王隊伍（王先謙《東華錄》，康熙十四年四月丁巳條）。三月二十七日，布爾尼親王的起義隊伍到達張家口以北的鄂西奚，奪取御馬廠和清朝大臣馬廠的馬群挺進張家口。此時，由於京師八旗官兵盡南征，無兵力討伐布爾尼。康熙帝深憂之時，太皇太后向康熙皇帝推薦了大學士圖海。於是康熙命多羅信郡王鄂扎為撫遠大將軍，大學士圖海為副將軍，率師討伐布爾尼。圖海臨時召集了京師滿洲、蒙古八旗所有包衣人，發給武器，率之以行。出張家口後，將軍圖海『以察哈爾有數百年之業，珠玉寶物不可勝計，若能獲取，富貴終身『（印鸞章《清鑒》，上海書店，1985年）激勵包衣大軍。1675年四月二十一日，將軍鄂扎和圖海率領的家奴隊伍到達歧爾哈素後，探知親王布爾尼的隊伍在達祿駐營。四月二十二日，圖海的隊伍到達祿時，親王布爾尼設伏山間，列陣以待。圖海指揮隊伍猛烈攻擊，布爾尼親領大隊擺列火器抗擊。包衣大軍衝破了布爾尼的陣地。布爾尼親王大怒，兩次組織人馬進行英勇抗擊。但仍不能抵擋包衣隊伍的連續進攻。喀爾喀公垂札布遁走，都統晉津率其部分屬下投降。親王布爾尼和羅布藏等領30餘騎突圍，逃往札魯特旗境內。此時，科爾沁和碩額駙沙津奉命率領五旗兵馬至札魯特旗的貴勒蘇特，包圍了布爾尼親王。羅布藏台吉是額駙沙津的妹夫，於是面見沙津，稱其兄布爾尼已遁走，自己來乞命（王先謙《東華錄》，康熙十四年五月辛酉條）。沙津令他先招來布爾尼方可饒命。遂遣30人與羅布藏同往。布爾尼與羅布藏相見後，二人又一同遁走。沙津追及，將布爾尼和羅布藏射死。事後，清廷也絞死了阿布奈。