整編軍議的一開始，就宣佈了汝寧軍各支軍團的組成和主官的任命。汝寧軍的武裝力量分為了戰兵、民團和護莊、護路、護礦隊。吳世恭將成為武裝力量的最高指揮。
薛永利將為整支汝寧軍戰兵的正統領，周巡為副統領。但是他們在平時只能夠指揮戰兵軍團，用現代的話來說，就是只能夠指揮野戰部隊。只有在戰時，在吳世恭的授權或者緊急狀態下，他們才可以指揮就近的汝寧軍其他武裝力量。
而在這裡，戰兵將是全脫產、拿軍餉的兵丁組成，武器裝備也是最好，他們將是未來作戰的主力。而這次汝寧軍的戰兵將增至一萬五千人；
民團也升格為二線部隊，也是全脫產，不過武器裝備差一些，軍餉也低一些。民團的主要任務就是防禦要塞和維持地方的作用，還有在作戰時起到運輸和輔助的作用。形象地形容一下，就像是現代的武警部隊一樣。這次最終商議，民團建立了十二個，每個民團五百人，共六千人。
但其中有一個民團將比較特殊，就是余子璉為知縣的那個民團。這個民團如何處置將由吳世恭和張學斌與姚員外這些歸德當地士紳商議以後再做決定；
而護莊、護路和護礦隊，就是半脫產的民兵組成了。他們將由退役的老兵率領，使用著汝寧軍淘汰的武器和簡陋的武器，為汝寧軍控制地方起到作用。當然，在作戰的時候，也能夠輔助作戰的。
由於吳世恭收容的難民增多，汝寧軍將會讓所有的適齡男丁共五萬三千多人全部參加軍訓，並且規定每人在護莊、護路和護礦隊每年服役一個月。因此在平時，這支民兵隊伍將有四千五百人左右。但戰時甚至可以總動員。
此外，還有薛強率領的一千五百人的內務司部隊，他們平時將起到維持地方治安和剿匪的工作。當然，在剿匪的過程中，當獲得授權以後，內務司可以讓汝寧軍的其他武裝力量配合。
還有薛志農的山川司行動隊和外圍打行成員近五百人。這次吳世恭也將把這支武裝力量正式歸入汝寧軍的管理。
至於歸德衛趙銘指揮的那些軍戶，吳世恭準備讓俞繼這些原歸德衛的軍戶通過關係滲透進去，爭取盡可能多的歸德衛軍戶支持。
還有就是盟軍了，不過現在說得上歸於汝寧軍指揮的盟軍，也只有南陽守備李祿率領的三百多名親兵和南陽私鐵礦礦主私募的一千一百多名家丁了。
但是這種同盟是相當鬆散的。只有在共同利益下，這些盟軍才會歸汝寧軍指揮。而且除了李祿的親兵以外，其他的那些盟友的戰鬥力，也就是比欺壓百姓好上一些，根本就是靠不住。
汝寧軍戰兵的五大軍團不變。吳世恭在軍議上宣佈了正副軍團長和主要部隊軍官名單：
教導軍團正軍團長：李三河；副軍團長：俞繼；
南陽軍團正軍團長：赫飛；副軍團長：楚格、吳書墨；
這兩個是全編軍團。
歸德軍團正軍團長：薛強；副軍團長：錢綺；
汝寧軍團正軍團長：楊如松；副軍團長：梁輝；
這兩個是半編軍團。
騎兵軍團正軍團長：張彪；副軍團長：薛存壯（原薛府護衛。提拔任命）；
直屬炮隊團長：熊正恩；副團長：鞏本實；
熊正恩是原炮隊副統領。而鞏本實是原炮隊技術最好的炮長，這次是破格提拔。
直屬工兵團團長：薛存義（原薛府護衛。提拔任命。是薛存壯的堂弟）；副團長：郭明（原千戶所堡壘軍戶，提拔任命）；
而陶辛被任命為親兵大隊大隊長。
以下軍官的任命也不細表了。不過這次整編，基本上所有的軍官都升了一級。不過陞遷最快的就是周巡、錢綺等四人，還有梁輝炮隊的這些人。
這也可以看出，汝寧軍中，多參加戰鬥的軍官陞遷就快。騎兵和炮兵的軍官陞遷也快。當然最高興的就是這時候旁聽的楊狗蛋，他是兒子、女婿雙豐收。
南陽軍團之所以設立倆位副軍團長，主要是因為書墨還要主持龍眼寨和羅家鎮大營的建造，還要為汝寧軍組建起有效的前沿防線。所以暫時還是留任。
而岡薩雷斯這些葡萄牙的軍官，除了幾位造炮和造彈藥的工匠調任到了工坊司以外，還留下了近二十名。他們暫時先作為顧問幫助此次整編，不授實職。
這次任命，還空餘了副連長以上的軍官五十幾位左右，等此次整編結束以後，汝寧軍中包括葡萄牙軍官在內的優秀軍官，才會提拔任命。
接下來就是安排整編軍隊的訓練了。這些天，汝寧軍的高層軍官，結合遲明這些人記錄整理的此次出征的所得，再加上葡萄牙軍官的教授，初訂成了汝寧軍新cāo典和新戰術手冊。
在未來幾個月的時間內，汝寧軍將會按照這個新cāo典和新戰術手冊來訓練兵丁。而這次將大量增加從十人隊到整支軍團聯合作戰的戰術內容。當然，在訓練中如果發現問題，也將修改增減新cāo典和新戰術手冊內容。
關於軍隊的內容基本上就是如此了。在吳世恭的安排下，除了直屬部隊副團長以上，駐外部隊副軍團長以上的高級軍官留下接著進行軍議以外，吳世恭讓其他參加軍議的軍官盡快趕回自己的部隊，開始招募新兵，加緊訓練了。
吳世恭交待了，他將在一個月之後離開汝寧軍大營，全面巡視各支部隊，查驗訓練效果，所以務必讓各位軍官重視此次整編。
接著吳世恭就開始了汝寧軍文武官員的高級會議了。首先吳世恭向鄧啟帆提出，要加強地方上的控制。
這些天吳世恭和鄧啟帆商議了幾次，發現投靠汝寧軍的地方士紳子弟不少，但是很難安排他們，可是放棄這些識字並且有些背景的人也可惜。再加上隨著汝寧軍地方的擴大，吳世恭招收的家奴的增多，很多民間事務需要人來處理，所以這次索性成立汝寧軍的民政系統。
為了加強地方上的控制，整個民政系統將分為：鄉——縣——府——汝寧軍四級。相比較明朝最基層的官僚機構是縣級，汝寧軍的控制將會大大地增強。
這次汝寧軍可以說是完全duli出了明朝官員體系，建立了一個新的民政系統。一旦有什麼問題，將會立刻成為大逆不道的大事。所以吳世恭特別強調了，除了在汝寧府北部山區這些特殊的地方以外，整個汝寧軍的民政系統暫時都收縮在屯田農莊、礦區和汝寧軍聚集地之內，不要擴張滲透。
而民政系統的官員實行兩長五官制。正長官全面抓總，副長官負責財政。還有三名官員分別負責屯田、學政宣傳和一名地方內務司長官兼任的官員。地方上重大事宜將由這五名官員投票決定。
雖然看起來官員數量是多了一些，但是這麼一來，一方面可以安撫拉攏那些地方上的士紳，另一方面又可以培養大量的民政官員。畢竟吳世恭的野心並不僅僅限於自己的屯田農莊和礦區內的。
不過吳世恭對於那些官員的任職地也有要求，在五位官員中，起碼三名要異地任用，防止地方上duli王國的產生。
而吳世恭對於民政官員業績的要求就是，首先就是要穩定，在這亂世中，穩定是壓倒一切的。吳世恭不想看到任何後方起火的事的發生。
第二個就是財政收入。在明朝這個農業社會裡，農業的收入肯定是大頭，不過吳世恭也要求這些官員重視林業和畜牧業。尤其是工業和商業的稅收。在這方面其實吳世恭和現代這些官員重視招商引資的情況差不多。
汝寧軍的財政很緊張，依靠吳世恭一個人來賺取收入總有些力不從心的地方，而戰爭財也是可一可二不可三的事。但是把官帽子在那些地方官員面前晃悠著，他們也將發揮出巨大的能量，為吳世恭的汝寧軍增加很多的財源。
當然，吳世恭也要求張學斌配合這些地方官員，從那些地方上的士紳吸引投資，甚至動用張學斌的關係到南直隸和浙江等工商業發達的地區招商引資。全面推動汝寧軍工業和商業的發展。
為此，吳世恭還將制定出一系列，包括象《專利法》在內的鼓勵工業和商業發展的法令，讓那些商人放心地在吳世恭的地盤中賺錢。當然，這些商人也將為汝寧軍繳納稅收，不能夠象明朝政府一樣，工商業的稅收基本上都收不上來。
另外吳世恭還向所有的文武官員強調了，嚴禁做那些眼紅霸奪商人財產的事，而且那些商人人身和財產是來去ziyou，不可以任意阻攔。一句話，現在的汝寧軍民政的核心就是：農業、工業和商業全面發展。
吳世恭是不知道，他的這些舉措，已經把汝寧軍的政治體系推到了資本主義的道路上去了。(……)