與此同時，遠在夏龍的拿破侖三世，也已經收到了海軍部的電報：
「孤拔上校的快速支隊已經到達指定位置，現已開始攻擊。」
拿破侖三世看完了電報，滿意地點了點頭，對秘書說道：「讓海軍部給孤拔上校回電：放手幹吧！法蘭西在看著你！」
對整個港口形勢瞭解之後，孤拔立刻開始佈署他的軍艦。基爾港的普魯士守軍根本沒有想到法國海軍會出現在這裡，他們明知道這些法**艦來意不善，現在也只能眼睜睜看著法國人在港灣口排兵佈陣。
噸位最大的「海洋」號鐵甲艦吃水較深，難以逼近基爾海岸，孤拔做出了一個大膽的舉動，將「海洋」號鐵甲艦佈置在了基爾港4座炮台的火力交匯點上，或者說佈置在了一個可以同時炮擊基爾港4座炮台的位置。「海洋」號鐵甲艦排水量7580噸，1870年完工於佈雷斯特，艦長87.73米，寬17.52米，吃水8.99米，航速14節，孤拔之所以敢於冒險把這艘軍艦放在4座普魯士炮台的炮口下，主要因為「海洋」號是1艘正宗的鐵甲艦，水線帶包裹著厚達200毫米的裝甲。同時，「海洋」號炮火兇猛，裝備有4門270毫米主炮，4門240毫米主炮和8門140毫米副炮，270毫米火炮對付基爾港的炮台，幾乎是無敵的。孤拔根據得到的情報，認為基爾港主炮台最大的火炮只有不會超過170毫米，於是按照法國海軍以往的測試情況，決定軍艦停泊在200毫米裝甲能夠抵禦住170毫米炮彈的地方，即距離炮台1000米左右。吃水較淺的巡洋艦則被命令直接抵近射擊。
命令下達後，旗艦「海洋」號首先開動，在基爾主炮台外900米的位置停泊。以右舷朝向基爾主炮台和旁邊普魯士人臨時擴建的炮台，左舷以及艦尾火力控制普魯士人修建在港口右岸的2座炮台。吃水較淺的巡洋艦「奧波尼阿特」號一直深入到基爾岸邊的地方，在基爾主炮台側翼的副炮台前120米處停泊，以避開主炮台的火力射界，用右舷對準副炮台。另一艘巡洋艦「昂布斯卡德」號停靠位置更加深入，這艘巡洋艦負責炮擊港灣兩側的炮台，擔當策應的工作。
一切佈署完畢後，孤拔按照法國人打仗的傳統，派出一名軍官乘舢板登岸，向普魯士守軍遞交了一份最後通牒，要求守軍交出要塞。對這份書信，守軍置之不理，而是提高了戒備，同時急報在基爾港內的海軍艦艇。
看到普魯士方面沒有任何回應，孤拔下令在「海洋」號的橫桁桁端掛出信號，命令各艦做好戰鬥準備。8時整，「海洋」號掛起了巨幅戰旗——這是戰鬥的信號，隨著「海洋」號群炮鳴響，其它法艦不甘落後，接連開火射擊。在得到法軍的最後通牒後，守軍就已經加強防備，嚴陣以待的基爾炮台聞聲立刻還擊。
激烈的炮戰僅僅進行了5分鐘，基爾港的3座炮台很快都被摧毀，戰鬥變成了針對主炮台的決戰，8時45分，基爾主炮台北側被擊中起火，普魯士軍隊未能控制住火勢，9時炮台火藥庫劇烈爆炸。在法國鐵甲艦270毫米和240毫米主炮的猛烈轟擊下，普魯士軍隊的炮台被火光和濃煙包圍了，在驚天動地的爆炸中，著火的人體的殘肢飛到半空中，如同被撕扯成碎片的洋娃娃，和碎裂扭曲的炮管一起紛紛落下。基爾港炮台群的防禦宣告失敗，孤拔的軍艦僅用了不到半個小時便掃清了基爾外圍防禦。
9時32分，一面巨大的三色旗在基爾港主炮台上空升起。
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《林義哲日記》：「是日八點鐘，法水師以四鐵甲船、二巡海快船攻普國基爾炮台，九點炮台全行打碎，普軍死傷甚重……二刻後，法軍上岸，與主炮台豎旗一面，乘勢破其山頭炮台，毀炮十餘尊及其營盤，掠得槍械甚多……」
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在摧毀了基爾港的岸防炮台之後，法**艦在孤拔的帶領下長驅而入，向停泊在港內的普魯士海軍艦船發起了攻擊。
港內的普魯士海軍各艦，面對法艦突然而至的攻擊，匆忙展開了各自為戰式的還手，在如此狹窄的水面上作戰，簡直猶如白刃拚殺，法**艦已然搶佔了先手，儘管得到了炮台守軍的及時通知，普魯士軍艦紛紛起錨，準備和法艦放手一搏，但一切都顯得太晚了。
排水量10933噸的普魯士海軍旗艦「柯尼斯·威廉」號，是此刻港內所有普魯士軍艦的靈魂支柱，艦長茨威格中校正拚命大喊號令，調度艦上各個崗位進入戰鬥狀態，意圖改變「柯尼斯·威廉」號所處的不利陣位，用舷側火力攻擊法國旗艦「海洋」號，以給黑鷹旗下的軍艦們發揮標桿表率作用。「柯尼斯·威廉」號上上現在簡直忙作了一團，輪機艙裡，水兵們在賣力地鬆開蒸汽閥門，驅動蒸汽機。艦首錨甲板，幾柄大鐵錘急急地砸著粗重的錨鏈，火星四濺中，鋼鐵錨鏈似乎還不為所動。本就不寬的露天火炮甲板上，此刻到處都是忙碌的人群，頂著法**艦劈頭蓋臉打來的炮彈，巨大的210毫米主炮被水兵們推著、滑車拽著，沿著敷設在甲板上的軌道，緩慢地進入舷側炮位。船舷邊上的一個個炮門洞裡，240毫米主炮的炮手們費勁地進行著裝彈的操作。在茨威格艦長的命令下，「柯尼斯·威廉」號的桅桿上也懸起了巨幅的戰旗，這艘巨大的鐵甲艦猶如一條正在掙脫束縛的巨獸，緩緩地移動著。
陷入法艦炮火集中攻擊中，「柯尼斯·威廉」號努力調整成舷側對敵陣位。不甘於被動挨打，裝備在「柯尼斯·威廉」號艦尾的1門210毫米口徑的大炮首先開始了還擊。
衝在最前面的法國旗艦「海洋」號首先被2顆炮彈擊中了舷側，炮彈穿透鐵甲被鐵甲之內的橡木內襯阻滯處。孤拔預料到普軍的火力如此之猛，但他沒有想到普軍擁有的210毫米火炮能首發命中。不久，又一顆射自「柯尼斯·威廉」號主炮台的炮彈射來，擊中了「海洋」號的舷側炮位，1門240毫米主炮嚴重受損，但是週遭的人員沒有損傷，因為這顆射來的普軍炮彈是不會爆炸的實心彈。
幾乎與上述的一幕同時發生，站在「柯尼斯·威廉」號飛橋上的艦長茨威格猛然間感到腳下一陣劇烈震動，伴隨著爆炸聲，一團火焰從艦體左舷中部升起。「海洋」號和「馬倫戈」號的270毫米主炮接連擊中了「柯尼斯·威廉」號。
由於「柯尼斯·威廉」號船大炮多，因而是法國海軍的重點攻擊對象，孤拔率艦衝進港內之後，便指揮四艘鐵甲艦，集中火力對它進行攻擊，以求先聲奪人。
在四艘法國鐵甲艦的猛烈轟擊下，「柯尼斯·威廉」號的巨大艦體很快便成了蜂窩，「它不斷被炮彈擊中，鐵質的艦體無法承受如此重創，海水順著破口不斷灌入艦內，它的左舷一下子炸裂開來……巨大的船隻受到接連不斷的致命的炮火轟擊，不斷地發出氣喘聲，機器奄奄一息，就像肺部在呼吸最後的一口氣一樣」。
猝然遭受重創的「柯尼斯·威廉」號開始不斷地傾斜下沉，但普魯士水兵仍然在努力地操縱它往岸邊淺水區挪動，意圖擱淺自救，最終還是無法支撐，在近岸地方無助地沉沒。因為該處海水不深，沉沒後的「柯尼斯·威廉」號還有大量上層建築露出水面。開戰不到10分鐘，普魯士海軍的旗艦即痛苦地沉沒了，似乎預示了此戰的結局。就在「柯尼斯·威廉」號鐵甲艦下沉的最後時間裡，一名不知名的普魯士水兵爬上桅桿，高揚起一面黑鷹旗，號召港內的其他軍艦堅持作戰。
在「柯尼斯·威廉」號遭到重創的同時，一艘普魯士軍艦衝出了陣列。這是普魯士巡洋艦「赫爾塔」號。
「赫爾塔」號是普魯士建造的巡洋艦，排水量只有2580噸，機動性要比大型軍艦更為靈活。在聽到港口外傳來炮聲時，艦長凱勒少校就覺察情勢不對，預先下令起錨，這一十分警覺的舉動使得「赫爾塔」號成為基爾港之戰中最先進入主動攻敵狀態的普魯士軍艦之一。「赫爾塔」號巡洋艦此時之所以突然開動，和「柯尼斯·威廉」號鐵甲艦的沉沒大有關係。還在「柯尼斯·威廉」號遭到法艦炮火聚攻時，艦體小、轉向靈活的「赫爾塔」號就準備駛近「柯尼斯·威廉」號，幫助旗艦抵禦炮火，但尚未來得及赴援，「柯尼斯·威廉」號便已經沉沒了，「赫爾塔」號上的官兵們悲痛不已，決心要拚死扭轉眼前的不利局面。
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