蚩尤被十二金仙纏住，眼見刑天被了真困住，那玄陰煉魂陣又被慧心破去，心中焦急，心知這等情況之下再不能保留，遂大喝一聲，化出數百丈大巫真身，人身牛首，手提魔刀劈開番天印，後退幾步，又向十二金仙中的懼留孫砍去，卻被太乙真人擋住，你來我往，戰將開來。
卻說那應龍見玄陰煉魂大陣被破，便找上風伯鬥將起來，大巫風伯身在霧中，如魚得水，掌中異寶順風旗，更是威力倍增，一時間應龍也拿之不下。
大巫雨師卻被女魃纏住，女魃身有異能，所過之處，水汽皆散，雨師卻拿她無法，便是手上絕活卻被女魃天生異能相剋，戰鬥起來礙手礙腳，見拿不下女魃，便尋思讓風伯替換他，且戰且退，往應龍與風伯打鬥之處而去。
哥倆都有一個心思，見對手難纏，便欲換開，幾人漸漸戰到一處，應龍卻知二人想法，只管找上風伯，便不欲他們聯在一起。
軒轅見蚩尤被十二金仙攔住，其他大巫都被困住，便專心指揮手下大軍向九黎軍隊攻去，雙方實力不相上下，殺將開來，一時間僵持下來。
九天玄女見戰鬥相持不下，扯出素色雲界旗往空中一拋，便見素色雲界旗放出無數金光，九天玄女向旗子一拜，口中不知念些什麼，須臾，只見從九天之上降下一金甲神人，領著數萬天兵天將從天而降，將九黎大軍擋住廝殺，那神人轉首對黃帝說道：「小將奉昊天金閥無上至尊自然妙有彌羅至真玉皇上帝（又名玄穹高上玉皇大帝）之命前來相助人皇。」說完便領著一眾天兵天將向九黎軍隊殺去，軒轅一見大喜，趕緊指揮有熊軍隊圍住九黎部落，使之不能逃脫。軒轅麾下眾將士見天庭派兵相助自己一方頓時士氣大振，而蚩尤一方卻是士氣低迷，軒轅見狀又忙揮軍一陣掩殺，將蚩尤九黎部落戰士殺的大敗。
很快九黎軍隊便被殺的四散而逃，軒轅見狀趕緊令手下軍士大喊「降者不殺」，那九黎軍士本就被殺的士氣低迷，一聽投降不殺，便紛紛繳械投降了。
應龍見軒轅已將九黎軍隊打敗，心下焦急，自己第一次上陣，卻還未立下寸功，如何是好，當下發威，暴喝一聲，身形狂漲數百倍，現了真龍之身，一爪爪向雨師，雨師趕緊抵擋，卻聞聽背後一陣風聲，未及轉頭，便如被大山撞在身上一樣，卻是那應龍虛晃雨師一爪，實則攻擊重點在那龍尾之上，雨師未料應龍有此攻擊，不覺之下被撞飛百里，頓時五臟六腑如同移位一般，口吐鮮血，未及起身，便被趕來的應龍一爪抓破頭顱而亡。
風伯見兄弟死了，當下又驚又怒，暴喝一聲，現了大巫真身，甩開女魃，抽身向應龍攻去，應龍與之硬碰硬一招，雙雙倒退數十里，風伯正要起身再攻，卻被趕來的女魃一拳打在背後，正對心臟，也是風伯合該身亡，暴怒之下只想著要報弟仇，卻未及想到自己安危，被女魃打爆了心臟倒地身亡。
軒轅見九黎軍隊已敗，又見雨師風伯雙雙被擊斃，當下大喜，卻見那十二金仙圍攻蚩尤一人而攻之不下，心下頓時不喜，這十二金仙大戰時不知道跑哪兒去了，要收尾了又來撿功勞來了，哪兒想十二人對上蚩尤一人還久攻不下，丟人。
那廣成子他們心中也急啊，眼見人家都差不多解決完了，自己等人卻連一個蚩尤都還未解決，心下惱怒，這面皮是丟光了，不過這蚩尤也確實不好對付，瘋狂下來，連那番天印也不顧，橫衝直撞之下，打的十二金仙心裡憋屈不已。
蚩尤也見大勢已去，心下也是不好受，便欲逃去，尤其見雨師風伯二人身隕後，更是心慌，當下提刀便猛攻太乙真人，欲從他那兒打開一條逃生之路。也是太乙真人倒霉，沒事兒站著那一個方向幹嘛，被發狂的蚩尤一路猛攻，欲退吧，卻丟不起這人，先不說他身為闡教金仙的身份，還有他那北極紫微大帝的身份，當著那些還未離開的天兵天將的面兒上，便不好退開。打吧又不是蚩尤的對手，不被發狂的蚩尤給殺了就已經不錯了。
正在為難之時，天邊飛來一玉如意，擊在蚩尤身上，將蚩尤打暈，正是那元始天尊手上的三寶如意，見太乙真人困境，不得不出手一助，打暈蚩尤後，也不停留，便自飛回天外天。
眾人連忙上前將蚩尤擒住，因巫族肉身神通無雙，眾人便欲將蚩尤琵琶骨穿透，廢其神通，以便關押，可那蚩尤乃是大巫之身，一身筋骨直如精鋼一般，眾人皆是束手無策。
此時又自東海蓬萊島方向飛來一劍，劍身一面刻日月星辰，一面刻山川草木；劍柄一面書農耕畜養之術，一面書四海一統之策。有詩為證：
劍光黯黯青黃色，文章篇篇墨綠銘；
山川草木鑄本性，日月星辰結精鋩。
韜略在心劍在手，不知誰作蛟龍吼？
勸君慎用少出鞘，無作莫使神兵羞。
正是那玄天想到軒轅要斬蚩尤，還得用得一劍，正是那後世有名的軒轅劍，若說這軒轅劍可是後世最出名的東西，後世華夏人可能不知道人教老子的太極圖，可能不知道女媧的山河社稷圖，可能不知道盤古的開天斧，但絕對不會不知道軒轅劍，這可是華夏人心中的聖劍，帝王之劍，意義重大。
若說這玄天給的軒轅劍也是有來頭的，正是那太一臨死時使的妖皇劍，當初天庭花了巨資打造的，對巫族**有著巨大的克制作用，當初補天之時，玄天有段時間離開了，說是去還那乾坤鼎，其實以他的修為，哪兒需要多少時間，還了乾坤鼎後便急急趕往天庭了，當時其他聖人們正盯著至寶混沌鍾呢，可沒注意到這些情況，卻被玄天撿了個便宜，將那天庭收藏拿了個精光後才悠悠然的回到眾聖邊來，還假意道那眾聖爭寶失了聖人面皮，其實是自己得了好處還賣乖來著。
果然，軒轅用那軒轅劍將蚩尤鎖骨刺穿，穿上龍筋，並捆綁一番送回大軍陣中關押。