. 博麗神社
博麗神社（はくれいじんじゃ）是位於幻想鄉的最東邊的神社。由於幻想鄉內的神社只有博麗神社，所以一般都以「神社」稱呼博麗神社。博麗神社位於大結界的邊界上，嚴格來說可能的幻想鄉地圖博麗神社並不在幻想鄉內。由於是位於邊界上，所以經常會有很多外界的物品從這裡流入幻想鄉，所以神社周圍不時都有妖怪和人類前來收集這些物品。另外，由於神社內不受結界力量影響，『永夜抄』的finala路線結局中描述神社內外的觀月方法都不同(這時永夜異變仍然持續)。
現在博麗靈夢住在那裡，鳥居在博麗神社的東邊，因迷途誤闖幻想鄉的外來人來到這裡會由靈夢引領回到外界。由於規定了神社內妖怪不能襲擊一般人，被妖怪追殺的人類會來到這裡避難。由於靈夢不論人妖都歡迎的性格，使得神社附近經常聚集不同的妖怪，於是人們以「妖怪神社」稱呼博麗神社，更有說妖怪把神社給佔據了。因為這樣，神社總是缺乏人們來參拜，靈夢經常歎息匯聚不到人們的信心(香油錢)，不過當『風神錄』中被發出停止營業要求的時候，她不太在意。
『東方靈異傳∼highlyresponsivetoprayers.』的第1－5關以及『東方封魔錄∼thestoryofeasternwonderland.』的第1關都是以博麗神社作為舞台的。
作為守矢神社的分社『風神錄』當中，八阪神奈子計劃回復自家神社的信仰，其中一個步驟就是在幻想鄉內建立守矢神社的分社。靈夢考慮一下後接受。於是博麗神社為人們帶來了風雨、五穀豐穰、武運等利益，所以漸漸為人好評，開始有人前來參拜。
博麗神社附近博麗神社附近每逢夜晚都會出現惡靈和怪物。神社西邊有墓地，藉由在東邊的彼岸升起並落在西邊墓地的太陽以抑制這些靈魂。神社的後山則有通向夢幻世界的湖及作為魔界之門的洞窟。『東方幻想鄉∼lotuslandstory.』第1－3關中神社的後山及後山的湖，『東方怪綺談∼mysticsquare.』第1關中通往魔界的洞窟，還有『紅魔鄉』夜晚時的神社背面，這些作品都分別用了這些位置成為舞台。
外界的博麗神社由於博麗神社位於幻想鄉的邊界，所以同樣存在於外界。由於博麗大結界是常識的結界，持有外界知識的人將博麗神社視為在外界的，而持有幻想鄉知識的人則視為在幻想鄉內的。不過自從博麗大結界成立以來就沒有人知道神社在外界的樣子，現在也沒有人去研究這件事。不過在『香霖堂』中記述，霖之助曾在結界減弱之際飛越結界到幻想鄉以外，望向神社看見有很多人聚集在那裡。
紅魔館
紅魔館（こうまかん）是在妖怪之山的山腳，霧之湖畔建立的洋館。紅色少窗，館前的通道也是一片紅色。有一座鐘樓，裡面比外見為大，並設有地下室。館的主人是蕾米莉亞·斯卡蕾特，不過由於主人是「小孩子」，實際管理著紅魔館的是女僕長十六夜笑夜。門前有紅美鈴看守，防止湖上的妖精入侵紅魔館。芙蘭朵露·斯卡蕾特被姐姐蕾米莉亞軟禁在館內的房間內。另外館內住著一些妖精女僕。館內被笑夜變得比外見更寬廣。
『紅魔鄉』第3－6關，以及extra關都是以紅魔館作為舞台的。
大圖書館紅魔館地下的大圖書館。帕秋莉·諾蕾姬終日都在這裡閱讀書本，像個書齋一樣。圖書館內既不通風也不通陽光，瀰漫著陣陣霉味。藏書大部分都是魔導書，當中更有些是帕邱莉自己書寫的。亦有混雜一些不是魔導書的書，當中多數是外界的書本。『紅魔鄉』第4關就是以大圖書館作為舞台的。
冥界
閻王判決幽靈轉生或成佛之前幽靈逗留的場所。界內雖然有蟲靈但它們不會叫，有些活的植物混雜著植物的靈魂在這裡養殖。由於天界已滿，幽靈無法成佛，冥界因此擠滿幽靈，而且由於將幽靈送往外界的話會引起騷動，因此閻王將冥界擴張，現在冥界非常廣闊。冥界透過結界連接著彼岸、地獄、天界，「春雪異變」後這個結界消失，到八雲紫再次建立結界之前，這裡成為了鬼們猖獗跋扈的無法地帶。
『萃夢想』中，冥界的墓地作為了魂魄妖夢關卡的舞台。
幽明結界現世與冥界間的結界。正常來說無法越過它，但在「春雪異變」後，不知為何八雲紫不重新建立，使得冥界可與幻想鄉直接相通。所以使得幽靈來到幻想鄉，引發更多的異變。幽明結界處於上，東邊的博麗神社則處於下的位置。『妖妖夢』第4關的末段，以及『花映塚』對普莉茲姆利巴三姊妹的關卡都以此處作為舞台。
白玉樓的樓梯通往白玉樓的一段很長的樓梯。『妖妖夢』第5關、extra、phantasm都以此處作為舞台。在『花映塚』則作為魂魄妖夢關卡的舞台。
白玉樓白玉樓（はくぎょくろう）是位於冥界的日式大宅。號稱有二百由旬般大。屋主是西行寺幽幽子，也有庭師兼護衛的魂魄妖夢以及不少幽靈住在這裡。白玉樓有很大的庭園，當中種滿櫻花，到春天時大片櫻花盛放，使這裡成為妖怪、幽靈、人類的人氣觀光點。『妖妖夢』第6關就是以白玉樓的庭園作為舞台的。
西行妖西行妖（さいぎょうあやかし）是位於白玉樓的一棵有妖力的櫻花樹。千年前一名在幻想鄉的「歌聖」在壽命將盡時，希望在這棵櫻花樹下永遠長眠。於是，那棵櫻花樹越來越漂亮的盛開，越開越廣，使更多人在此過世，使得此樹得到妖力。但自從幽幽子在白玉樓定居之後，都未見西行妖再開花。原因是以前此樹就已封印著一具屍體，亦即西行寺幽幽子的屍體，使她永遠不會轉生、消滅。若把封印解開，幽幽子將會再次進入輪迴轉世的循環。「春雪異變」中幽幽子收集春度企圖使該亡駭復活，但因為封印消失的話幽幽子本人也會消失，所以注定失敗，該櫻花樹是永遠無法開花的。在『妖妖夢』『永夜抄』以及『東方文花帖∼shootthebullet.』中幽幽子發動符卡時，背景會出現西行妖。雖然在『花映塚』中借用了西行妖的名稱作為extra關卡的稱呼，但西行妖本身並沒有在作中登場。
迷途竹林
幻想鄉中位於人間之裡與妖怪之山相反方向，生滿竹樹的竹林。這裡瀰漫著濃霧，而且每天都因竹林的生長使得當地環境不停變化，加上有著一定的坡度，使得來到這裡的妖精們都迷路。以前被稱作「高草郡」，相傳因為一次海嘯而使此地在幻想鄉出現。竹林內建有永遠亭，因幡帝自稱是竹林中的主人，與永琳一起阻止永遠亭被一般人進入。在『永夜抄』之後，籐原妹紅在這裡充當人類的帶路人，為來到這裡的人類帶路。
『永夜抄』第4關、extra都是以此處作為舞台。
永遠亭永遠亭（えいえんてい）是在竹林中不為人知的地方建立的房屋。輝夜、永琳、鈴仙、帝還有很多兔都住在這裡。原本這裡只是永琳與輝夜居住的地方，一直以來不見歷史記載，自從「永夜異變」後開始為人所知。『永夜抄』第5、6關都是以此處作為舞台。
無緣塚
穿過魔法森林，再走過再思之道，即可到達無緣塚（むえんづか）。位于于結界破隙中與結界的交點，連接著冥界與三途川，有時會在此處找到外界的物品。這裡有稱為「紫櫻」的妖櫻樹。『花映塚』對四季映姬·ヤマザナドゥ的關卡便以此處作為舞台。
再思之道穿過魔法森林之後可看見連接無緣堤的再思之道（さいしのみち）。秋季時周圍會有石蒜盛開。想放棄生命的人來到這裡受石蒜的氣味影響後都會回復人生鬥志，所以此處被稱為「再思之道」。『花映塚』對小野塚小町的關卡便以此處作為舞台。
彼岸
走過三途川後可到達的死後世界。由包括十王的是非曲直廳成員管轄，作為十王與配下的審判官（閻王）們以輪班制的方式持續進行著審判幽靈的工作場所。在幻想鄉則由四季映姬擔任。
中有之道妖怪之山內通往三途川的路，活人也可以前往。路上有各種商店提供服務，這些商店不只為死者提供服務，還為活人們提供服務，收入為冥界解決財政問題。
三途川中有之道對出作為彼岸與現世的交界的河流。雖然這是淡水河，但這裡生活了各種已絕種的水中生物。河上浮有一條船，由小野塚小町擔當船長，載著幽靈渡過河流。地獄閻王裁定有罪的幽靈們會去到的地方。隸屬十王的鬼神長與他配下的鬼們在這裡對幽靈進行懲罰。
妖怪之山
在幻想鄉之中一般會以「山」稱呼「妖怪之山」。很多古老的妖怪與神明都住在這裡，在這裡建立了一個異於其他人類和妖怪的文化社會。當中的天狗和河童持有媲美外界的高科技。這是當幻想鄉還有鬼居住的時候，由率領天狗的鬼神們建立的社會為基礎，組成的一個特別的社會。他們的團結力很強，而且遇到外邊來的人，會加以排斥、驅趕。
山的裏側有通往三途川的中有之道，山腰有「大蟾蜍之池」。另外，妖怪之山的瀑布是流向霧之湖的。
大蟾蜍之池妖怪之山內浮著蓮花的池。這裡比較靠近妖怪之山入口，靠近這裡的外來人會被山中的妖怪驅趕。住有會食人的大蟾蜍，平時也會見到奇魯諾把這裡作為她冷凍、解凍青蛙的遊樂場。『花映塚』對射命丸文的關卡便以此處作為舞台。
守矢神社、風神之湖守矢神社（もりやのじんじゃ）是妖怪之山上建立的神社，內裏有風祝東風谷早苗、神祇八阪神奈子、洩矢諏訪子住在這裡。原本是在外界建立的神社，因為神社在外界缺乏人的信仰，八阪神奈子為此計劃取得妖怪的信仰，將風神之湖一起移入幻想鄉，直到現在。表面上是供奉八阪神奈子，實際上只有洩矢諏訪子被供奉，守矢神社便是兩位神祇合作經營而成。『風神錄』第5、6關便以此處作為舞台。
天界
成佛的幽靈、或是人類經過修練，斷除一切**後可前往，供天人及天女居住的地方。天界在離地極高的空中。天界的食物方面雖然這裡只有桃，不過這些桃有鍛鍊身體的效果。這裡分成了幾個世界，總加起來比冥界更寬闊。「幻想鄉緣起」記載天界是存在於冥界，位於冥界的高空上。有說現在由於天界呈飽和狀態，所以對幽靈有著所謂的成佛限制。八雲紫則不認同，她認為這是因為天界很狹窄而作的一個謊話。
有頂天天界的其中一部分。別名「非想天」，位于于妖怪之山的高空中。
地底界
地靈居住的地下世界。
舊都以前為地獄的一部分。鬼、或是持有強大力量的妖怪都有住在這裡。
地靈殿由古明地覺在灼熱地獄上建立，內裏住有大量寵物，包括火焰貓燐、靈烏路空等。
魔法森林
聚集著幻想鄉中的「魔」的森林。幻想之中一般以「森林」稱呼「魔法森林」。這森林有妖氣瀰漫，飄著妖菇的孢子，形成普通人不能忍受的瘴氣，不單是人，連妖怪也不想靠近。能忍受這裡的瘴氣的人類則能夠住在這裡，可以保自己不受妖怪襲擊。另外那些妖菇的孢子帶來的幻覺，其實也可以提高人類的魔力，所以立志使為魔法使的人都會前來這裡居住。森林內有霧雨魔理沙的家「霧雨魔法店」、愛莉絲·瑪格特洛伊德居住的「瑪格特洛伊德邸」（マーガトロイド邸）、光之三妖精居住的「在沒有盡頭的前方屹立的樹」（果てしなく前から立っている大木）。森林的入口則有古代道具屋「香霖堂」。
玄武之澤魔法森林附近的溪流。崖邊可見到玄武岩的柱狀節理。附近有無數洞穴，其中有祭祀玄武的、有光苔生長的等等。這地是由很久以前妖怪之山的一次火山爆發而形成的。
人間之裡
幻想鄉大部分人類都住在這裡。這裡有妖怪的賢者保護人類不受妖怪襲擊。幻想鄉一般以「裡」稱呼「人間之裡」。裡內有河童所雕造的龍神石像，石像中眼睛可用作測量天氣，準確度達70%左右。裡中也有專門服務妖怪的商店，人類的博麗靈夢、十六夜笑夜，或是妖怪的八雲紫、風見幽香都會來這裡購物。上白澤慧音在這裡開設私塾居住，稗田阿求也住在裡中。還有，霧雨魔理沙的故鄉－大道具店「霧雨店」也在人間之裡中。
香霖堂香霖堂（こうりんどう）
是由森近霖之助經營的舊物店。位於博麗神社、人間之裡、魔法森林之間。雖然有很多外界的物品（例如個人電腦、數位相機、爐等等），不過展示的貨品都不會列出價錢，店內大部分也是非賣品。『東方香霖堂-curiositiesoflotusasia.』主要以這裡作為舞台。
其他
霧之湖
妖怪之山山腳附近的一個終日被濃霧包圍的湖。妖怪之山的水會流向這裡。雖然霧使得這裡能見度很低，但以面積來說，環繞湖步行一周大概需一小時。『紅魔鄉』的第2、3關，以及『花映塚』對奇魯諾的關卡都以此處作為舞台。
荒廢洋館
霧之湖附近，與紅魔館相反方向的一個騷靈屋。普莉茲姆利巴三姊妹住在這裡。原本是外界「普莉茲姆利巴伯爵」居住的屋子。
無名之丘
與妖怪之山正反方向的一個低山草原。在春天時會有鈴蘭盛開。「無名之丘」這個名字的來源是由於以前未有博麗大結界的時候，人們會把未起名的嬰兒丟在這裡讓他們被鈴蘭毒氣毒死，故而得名。『花映塚』對梅蒂森·梅蘭可莉的關卡以此處作為舞台。
太陽花田
妖怪之山反面內呈缽狀的草地。在夏天時會有向日葵盛開。妖怪和普莉茲姆利巴的樂隊在夏天的夜晚都會在此舉行演唱會。『花映塚』對風見幽香的關卡以此處作為舞台。
貓棲息的村落（マヨヒガ）
遠離人裡的一個深山村落。住著一群由八雲橙領導的貓。
八雲紫的屋
位於幻想鄉的東北邊，與博麗神社一樣位於大結界邊緣的一個古舊屋子。八雲紫和八雲藍都住在這裡。屋內放有外界的書本和道具。
另外『花映塚』中有「妖怪獸道」和「幻草原」兩個地名出現，但它們的所在位置則不明。