宋教仁遇刺後，在上海方面組織特別法庭對宋教仁刺殺案進行審理的時候，卻又遇到相當的困難！
首先是兇手武士英已經無緣無故的暴卒；二是要犯洪述祖已經逃到青島的德國租界，無從捉拿；三是涉案的國務總理趙秉鈞稱病躲進醫院，對於上海方面要他出庭的要求，趙秉鈞只管拿出醫生的診斷報告，雖然發出過幾次電報為自己辯駁，但就是拒不到庭
孫中山正在日本，他在得知消息後立刻於3月25日返回國內，隨即在上海的黃興寓所召開會議，以討論下一步的對策。
孫中山在得知案件過程後極為悲憤，他在會上極力主張起兵討袁，幾乎把去年與袁世凱相談甚歡的事情忘了個一乾二淨。但是，參與會議的國民黨高幹們，大多不贊成孫中山要動武的意見。特別是二號領袖黃興，他認為目前案件的審理對國民黨一方有利，應該先考慮法律解決，不到最後一步不應該輕談戰事。
孫中山聽後極為生氣，他在心眼底已經認定袁世凱毫無救藥，必然要搞**復辟；與其等他露出狐狸尾巴，倒不如現在就動手。孫中山聲稱只要現在給我兩師的兵力，我就親自率領向袁世凱問罪。
但問題是，當時國民黨連兩個師的軍隊也沒有。不過話說回來，就算有兩個師的兵力，恐怕也像黃興說的那樣，敵不過袁世凱那些訓練有素的北洋軍。孫中山沒有和他們交過手，黃興可是知道他們厲害的。
事實上，當時宋案尚未完全釐清，即使國民黨人有一千個理由懷疑袁世凱，但也不宜直接認定袁世凱就是幕後元兇，興兵討袁未免有「地方反抗中央」之嫌。因此，當孫中山要求對袁世凱動武的電報發出去後，國民黨的三個實力派都督，江西都督李烈鈞、安徽都督柏文蔚、廣東都督胡漢民，都立刻回電表示絕無實力獨立。
孫中山當時還有一個辦法，那就是去日本爭取援助，但他大概忘記了，在南北會談前，他也曾在歐美、日本各國轉了一圈，結果沒有討得一文錢，兩手空空而回。那些列強雖然戴著文明帽，但都是些唯利是圖的勢利眼，在袁世凱沒有當上總統的時候尚且不肯押寶到孫中山身上，如今袁世凱已經當上了大總統，他們怎麼會再去支持孫中山呢？
而在善後大借款後，有了錢的袁世凱就乾脆撕下臉皮，他非但不理睬國民黨籍議員的抗議，反氣勢洶洶的斥責孫中山、黃興等國民黨人說道：
「我現在算是看透了。孫文這些人左也是搗亂，右也是搗亂，除了搗亂，他們就沒有別的本領了。你聽聽，孫文說什麼『公今日捨辭職外，決無他策』，還說什『必以前次反對君主之決心，反對公之一人，義無反顧』，他媽的，孫文還想下定決心跟老子干呢！你們可以告訴國民黨人，我袁世凱就不能聽人搗亂，他孫文若敢動槍動炮，或另行組織政府，我就發兵征伐，而絕無姑息養奸之餘地」。
總統府秘書長梁士詒有些擔心：「大總統，這樣太直接了吧？」
袁世凱氣呼呼的答道：「就說是我說的，我對這話負責！」
另外，為了緩解南方國民黨要求內閣總理趙秉鈞出庭的壓力，袁世凱又派人在直隸製造了所謂的「血光團刺殺案」作為反擊。當時有個自稱「女子暗殺團團長」的女子向北京地方檢察廳自首，自稱奉了「血光團團長」黃興的命令來北京搞暗殺，而北京軍政執法處在第二天又以「血光團團員」的名義逮捕了參議院議員謝持，於是乎，各大報紙熱炒「血光團」，彷彿前清雍正皇帝的「血滴子」一般可怕。由此，北京地方檢察廳便趁勢栽贓，反過來發傳票要求黃興到案對質，這也使得宋案更加的撲朔迷離、更具戲劇性了。不僅如此，袁世凱隨後又下令撤銷黃興陸軍上將的軍銜，並要懸賞捉拿黃興、陳其美這些「反黨」。
事情鬧到這步田地，雙方惟有兵戎相見了！
6月9日，袁世凱先下手為強，下令免除李烈鈞的江西都督職務，任命黎元洪兼署江西都督；14日，又將廣東都督胡漢民免職；30日，安徽都督柏文蔚也被免職。如此一來，國民黨籍的三位都督都被袁世凱以「不稱職」、「不孚眾望」的名義罷免，當然，根本原因還在於「不服從中央」！
至此，南方的國民黨人也只能丟掉了和平幻想並起而應戰。江西都督李烈鈞，本是江西武寧人，家道殷實，年少便任俠仗義，後由江西武備學堂選送到日本士官學校留學，在日本期間秘密加入了同盟會。李烈鈞在回國後先後在江西、雲南的新軍中任職，武昌起義後擔任江西都督，時年不過三十一歲，可謂是少年得志。
李烈鈞被袁世凱免職後，他並沒有立即舉兵討袁，而是先通電下野，並於6月15日離開南昌前往上海。到上海後，李烈鈞分別見到了孫中山、黃興、陳其美等人，他們在反覆會商後認為袁世凱難以感化，現在的辦法也只有舉兵反抗，或許還有一線生機。
7月7日，李烈鈞從上海返回江西後秘密召集舊部，並於7月12日佔領湖口炮台。次日，李烈鈞成立江西討袁軍並發佈討袁檄文，宣佈江西獨立。
由此，「二次革命」正式爆發，
在李烈鈞宣佈獨立後，黃興、陳其美等人隨後分頭行事，準備響應。7月14日，黃興趕赴南京，在駐南京的第一師和第八師的基礎上組織討袁軍，並計劃脅迫江蘇都督程德全宣佈獨立。當晚，黃興等人率士兵衝進都督署，程德全驚慌之下，只得假言同意，隨後黃興便以程德全的名義通電江蘇獨立。
第二日，程德全料想南京必有大戰事，自己無權無兵，何必惹這麻煩事，於是便攜家眷悄然離去。等到了上海，程德全便急忙向袁世凱發去一通電報，聲稱「南京獨立」乃黃興等人所為，為自己洗刷干係。黃興等人得知程德全避去後，也不做理會，只管將司令部搬到了空督署，繼續排兵佈陣，迎接強敵。
早在武昌起義前，革命黨在湖南便搞得有聲有色，因而湖南都督譚延闓也在各方的壓力下宣佈獨立，並派兵前往江西支援李烈鈞。不過，譚延闓此舉乃是心存狡黠，他以「支援江西」為名，將那些革命黨控制的軍隊調出省城長沙，既滿足了革命黨的要求，又鞏固了自己的統治，豈不一石二鳥、兩全其美？
和李烈鈞一樣，安徽都督柏文蔚在被免職後也通電下野，隨後前往南京小住。等到李烈鈞宣佈獨立後，他也重返安徽並於7月17日宣佈獨立，同南京、江西構成犄角之勢。
在前清的時候，江西、江蘇、安徽本是兩江總督管轄之地，在這次革命與北洋軍可謂是首當其衝，等於是接著完成武昌起義時尚未進行的南北之戰了。
在革命的後方，福建都督孫道仁本心存觀望，但他手下的師長許崇智首先宣佈起義並進而率兵脅迫，孫道仁也只得像程德全一樣，勉強加入了討袁的陣營。浙江都督朱瑞原本是革命隊伍中的一員，但在武昌起義後與同盟會的人結下樑子，這次竟然不顧革命大義，非但不參與討袁，弄到最後反要派兵進攻上海呢。
廣東向來就是革命的大本營，被免職的胡漢民和新任都督陳炯明並沒有中袁世凱的離間之計，他們在7月18日聯合起來宣佈獨立。胡、陳二人本打算出兵援贛的，但因廣西都督陸榮廷和駐紮粵北的巡防統領龍濟光被袁世凱收買，廣東兩肋均受威脅，因為派兵計劃只得擱淺。
在西南方面，廣西都督陸榮廷已經投向袁世凱一邊，雲南都督蔡鍔是梁啟超的弟子，他對「二次革命」卻不甚贊成，因此宣佈中立，而貴州都督唐繼堯原本是蔡鍔部下，這次也跟隨老領導宣佈中立。
至於四川那邊，自從武昌起義結束後就沒有安寧過！革命黨寄托厚望能夠起獨立的，只有熊克武和王恆岳兩個人。
頗為可歎的是，南方革命黨雖然打出「革命」口號，但基本是各自為戰，而且軍隊內部素質參差不齊，內部思想也不統一，軍官投敵、軍隊嘩變屢有發生，戰鬥力實在可疑。
反觀袁世凱這邊，北洋軍編制整齊，最近又得了一筆巨款，手頭寬裕，兵強馬壯，正是廝殺的好時候。更要命的是，此時的袁世凱不僅在政治上名正言順、外交上列強支持，而且老百姓也是人心思定，並不希望發生戰事。
亂哄哄的「二次革命」開始了！
四川，熊克武將將第5師改編為4個步兵團、1個騎兵團、1個炮兵團、1個工輜兵營，並將蜀軍將弁學堂速成班中的優秀畢業生劉伯承、鄭經武、張志芳、高建勳等編入第5師，以加強中下級軍官的力量。
四川的「革命」也在瞬間爆發！
而在這個時候，王恆岳卻在冷眼旁觀著一切！