天空一片灰蒙、陰暗，世界的某處有個陰冷的聲音在不斷呼喊著：「十代，你在哪裡！我深愛的人，游城十代！」陰霾再度籠罩決鬥學院…
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十月十一日決鬥學院開學的日子，上學期十代、萬丈目、翔他們順利的升入三年級。這也意味著這學期結束後，他們就要離開決鬥學院奔向各自人生的目標了。但同時這一年也是對大家影響最大的一年！
此時決鬥學院中的多媒體教室裡坐滿了學生，有歐西裡斯紅、太陽神黃以及歐貝里斯克藍的學生。新的學期裡決鬥學院又迎來不少新生，但所有人的目光無一不是盯著坐在前排的十代。
在上一年裡十代的表現十分的活躍，決鬥的實力更是隱隱成為學院第一，也只有在學院裡掛個名的愛德菲尼克斯可以和十代一較長短。這使得決鬥學院原本的學生對他充滿了敬佩，而新生聽到十代的事跡對他充滿好奇。
「大哥，你看整個學院的學生都在討論你呢！」身穿歐貝里斯克藍制服的翔興奮的說道。如今的十代比起原劇情中這個時刻的他多了一份成熟，雖然仍然顯得有些稚嫩但至少他明白了決鬥並不是一味追求快樂，有時也要背負一些責任。
十代的另一個小弟太陽神黃的劍山也馬上說道：「那是當然了，大哥現在可是整個學院裡實力最強的決鬥者，人氣不比當年決鬥學院的帝王凱撒低啊！」
「什麼啊！我可是gx大賽的冠軍，我才是學院裡最強的決鬥者！」十代身後的萬丈目馬上大聲反駁道。
「切，那還不是因為大哥為了對付齋王才沒有參加gx冠軍賽的嘛！如果大哥參加了冠軍肯定是大哥的！」翔在一旁小聲的嘀咕著。聽到翔的嘀咕聲萬丈目抓狂得想把翔給撕了，而吹雪則側著臉笑瞇瞇的看著兩人。
這時十代淡淡的說道：「好了，不要再爭論這個問題了。如果讓我說誰才是決鬥學院實力最強的決鬥者，那麼就是現在還不知道在何處的天麟！這一年裡我的實力雖然提升了不少，但最多也只是達到天麟離開前的水平而且還是在天麟不使用那副牌組的情況下！」
聽了這句話除了劍山之外，大家都沉默了。十代、萬丈目、吹雪以及翔都忘不了我與影丸的那場決鬥，特別是最後三幻神同時在場時所帶來的那股恐懼感，即使到了現在想想都讓人不寒而慄！見到大家都一臉的沉默，劍山在心裡暗道：『天麟到底是個怎麼樣的人呢？』
翔首先打破沉默的局面，說道：「也不知道天麟大哥和明日香現在在哪裡，多這麼久了怎麼還不回來啊。」
「是啊，我那個妹妹跟他走了那麼久都不知道和我這個老哥聯繫下，真是有了情郎忘了哥啊！」吹雪也發現氣氛有些沉悶，馬上玩笑的說道。眾人聽到吹雪這句話都不禁噗哧一笑，沉悶的氣氛馬上消失得無影無蹤。
就在這時原本還人聲鼎沸的教室忽然靜了下來，十代等人一看原來是鮫島校長、庫洛諾斯教授拿破侖教頭以及學院的其他老師來了。
鮫島校長微笑道：「馬上新的一年就要開始了，希望各位抱著希望渡過無悔的一年。現在請新生代表早乙女禮上台宣誓！」
身穿歐西裡斯紅的早乙女禮走上台，當著所有人的面進行了莊嚴的宣誓。早乙女禮自從那次來找凱撒時被十代打敗後就喜歡上了他，進入決鬥學院後總是不時的向十代傳達自己的心意。連旁人都知道禮的心意，也只有十代這個感情小白還不清楚。
宣誓結束後，鮫島校長接著說道：「為了讓大家在新學期裡實力得到更大的提升，我校迎來了新的學生！」
鮫島校長打開身後的大屏幕，指著屏幕的地圖說道：「決鬥學院是以培育決鬥者為己任，在世界各地都有分校，今年我校迎來了各地分校頂尖的學生！」
劍山：「這麼說他們都是各個學院的冠軍了！」
「各分校的冠軍嗎，有意思！」十代並沒有像原作中表現得那麼的興奮，可見他確實是成熟了些。
鮫島校長微笑道：「那麼我就來介紹一下，首先是決鬥學院東部分校的代表阿蒙?加勒姆！」從教室的側門走進位面帶微笑的英俊少年，帶著貴族的氣質向所有人打了個招呼。
「接著是決鬥學院西部分校的代表奧斯辛?歐布賴恩！」又一個人從側門走了進來，與阿蒙不同歐布賴恩像個沉默的戰士，冷漠的看著所有人。
鮫島校長繼續說道：「然後是決鬥學院南部的代表吉姆?克勞戴爾?庫克！」一個抱著鱷魚穿的像西部牛仔的少年跑了進來，一看就是個很容易相處的人。
「最後是決鬥學院北部分校的代表約翰?安德森！」此時所有人都期待著最後一人的出現，然而出乎意料的是眾人左等右等就是不見約翰?安德森的出現。
席位上的萬丈目突然說道：「約翰、約翰?安德森，然道是那個擁有寶玉獸卡組的約翰！」
「寶玉獸？」十代疑惑道。
劍山馬上問道：「萬丈目前輩你知道什麼嗎？」
「過去萬丈目集團曾經動用所有的財力想從工業幻影那裡購買寶玉獸的卡組。」
劍山：「萬丈目前輩你家又做這種事了。」
「可惡，那已經是很久之前的事情了！」萬丈目不滿的反駁道。
「工業幻影根據發現的古代書籍瞭解到過去古羅馬的君王為了製作古羅馬君臨天下的象徵從世界各地收集七種不同的寶石製成石板，但這些寶石卻在途中遇上暴風雨消失在了海裡…」
「接著呢？」見萬丈目說道一半就停下了，翔迫不及待的問道。
「後來這些寶石被帕伽索斯社長找到並根據寶石的種類製作成了七張卡片，帕伽索斯社長不肯用金錢來交換，把它們送給了某個大賽的少年冠軍。」
十代微微一笑：「那個叫約翰的有著這麼珍貴的卡組啊！就是不知道與我的元素英雄和新空間人比起來如何。」
『彭！』教室的大門突然被大力打開，所有人都緊張的盯著門口。此時門外站著個少年，少年見到那麼多雙眼睛看著自己不好意思的摸了摸自己湖藍色短髮說道：「不好意思我遲到了，因為我是個路癡。」
少年的一句話馬上化解了剛才的尷尬，見到眾人被自己的話逗樂了少年微微鬆了口氣，趕緊走進教室。
當少年經過十代跟前時，十代站了起來高興的說道：「原來是你啊，新同學！」
「嗯，你也在這裡啊！」少年打了個招呼，看來兩人之前見過面了。
「對了但現在都還不知道你的名字呢，你叫…」
少年微笑道：「不好意思，到現在我都沒有自我介紹一下，我叫約翰、約翰?安德森。現在還在進行開學典禮，等下聊啊！」說完接著往台上跑去。
看著台上的約翰十代喃喃道：「有意思，你就是約翰?安德森，寶玉獸的擁有者啊！」
見到約翰終於出現後鮫島校長不禁鬆了口氣，微笑道：「那麼再介紹一次，這位就是決鬥學院北部分校的代表約翰?安德森！」教室裡再次響起了掌聲，給予各學校的代表最熱烈的歡迎。
就在眾人以為開學典禮應該要完結了的時候，從教室的側門再次走出一道魁梧的身影，走到鮫島校長的身旁…