所謂方舟計劃是苗樸一早就跟他小隊眾人探討的一個計劃，旨在新造一條船，其目的是使重新獲得橫跨地海的能力。
而現在，計劃的具體內容以及技術支持苗樸已經完成並儲存在源晶石中交給了康大年。
按照這個計劃，康大年他們將花費至少1個月的時間，建造一條晶石船。與其說是船，不如說是一個超大號的羊皮筏子。通過全封閉外殼和巨大的內部空間來獲得浮力，同時大量的能量供給，保證它的外殼堅固以防止海水的腐蝕。當它的主體全部完成後，苗樸會將一套荊棘之心佈置在內部成為駕馭以及調控各項的核心。說白了，這方舟就是一個潛艇式的基地。
當然，作為非專業人士，苗樸是無法給出晶石船具體建造規格數據的，這船的細節設計還要靠小隊中唯一的專業人士李國方。這位57歲的船長在原本的大海船毀於肆虐地底世界的超級能量風暴後，就已經開始了新船的設計規劃。實際上，方舟就是出自他的手筆，只不過隨著苗樸對晶石生成和加工技術的掌握，一直困擾著的船體材料問題完美的解決了，李國方的新船設計也跟著改了又改。
這次物資交換，除了對外輸出了人員、稀有物資、技術、計劃，還有一個重點就是契約副本。
契約副本是用來控制劉翔他們這些人的終極手段，這個東西苗樸交給了康大年，這樣一來康大年就有了管理這些人的終極底牌。而且這東西也是一個保障，一旦他出了意外，契約副本將會成為唯一有效控制簽約者的手段，這也是苗樸深明的弊端（他個人的重要性比例太高）而進行的一種佈置。
再一個就是戰力補充，天獄基地、2號基地，都獲得了來自山體基地新一輪的戰力補充，傾斜幅度比較大，以應對處於多事之秋的天獄局勢和未來地鐵隧道行動的消耗。
讓苗樸欣喜的是，對博派和鷹派在天獄中的駐地搜刮果然讓他獲得了些好處，其中最具價值的是一批植物要素：、、、。
是針對植系衍生物能量核心的，一個可調控的能量發動機，可以讓衍生物自我調節能量輸出，並且更好的運用爆發力以及待機時間（放緩流速，降低消耗），
則強化了能量超導效率，降低了運作消耗，這同樣對爆發力和待機時間大有好處。
目前顯得最是無用，它能夠讓衍生物獲得攝取外界游離能量的能力。雖然極具意義，但無法單獨運作，需要一整套的體系配合。這個體系的增加，會大大加大衍生物的結構複雜度，在經過一番綜合驗算後，苗樸認為對衍生物使用它的性價比並不高。
簡單的好處在於易於修復，另外也不容易出問題。這也是他一直對衍生物研發所秉持的態度，相比於能夠自我恢復但效率緩慢，他更看重迅速有效的外部注入式補充，現在的戰鬥主力、戰兵乃至於射擊傀儡都是這種補充方式。
當然，的價值還是有的。比如偵查型、狙擊型衍生物，長期在外活動。那麼就很有效果了。雖然也可以攜帶能量節，但畢竟有攜帶量的限制，能量節用於緊急補給更合適。
最後是，這個新的植物要素最是不凡，也最讓苗樸驚喜。它可以讓衍生物在誕生過程中隨機獲得一項屬性加成或能力。這個要素可以讓每一個衍生物都變得非同一般，讓衍生物在不乏統一性的基礎上擁有自己的特色、特長。
不過獲得這個效果的付出也是不小，一旦使用，消耗的能量是原本的5倍。也就是說不考慮材料，製造5個普通衍生物的能量將只能製造一個擁有能力的衍生物。
這樣的支出對於批量生產炮灰怪自然是顯得有些蛋疼，但對走精英化路線以及準備將植裝怪系外骨骼裝甲量產的苗樸來說卻是再好不過的，他都恨不得立刻重新打造輔助軀體以感受的好處了。
4大母樹系要素的獲得，讓苗樸賺了個盆滿缽滿，與之相比，收留兩支人類團隊的付出就變得不值一提了，而以後兩支隊伍的勞作成果每一分都可以看成是淨利潤了。
經過8小時的休整，補充了相應物資的行動隊再度出發，這次隊伍中少了劉翔，但射擊傀儡由原來的100增加到了160。
再度抵達地鐵隧道區的前沿基地，已經是16個小時以後，自從在隧道中全殲有首領的衍生怪物戰團，到現在已經超過100個小時。衍生怪物的表現出乎意料的沉得住氣，藍血人就更不用說了，苗樸完全可以想像他們暗自****傷口的種種情形。
見識過藍血人的生物生產線，苗樸對藍血人的遞增幅度有一個較為清晰的認知。就算這裡的藍血人基地有著跟天獄藍血人基地一樣的生產能力，每天也就是大約10名左右的產出，4天40名。苗樸不覺得這個數量能夠彌補之前與衍生怪物大戰的損失。
所以現在的藍血人一方仍舊是戰力虧空，短時間內恐怕無法恢復。
衍生怪物則恐怕是截然相反的可能性更高一些，它們數量充足，更重要的是掌握著主動，說不定在這裡跟對手相峙的同時，在其他地方已經展開行動，所以耗不起，耗下去的結果極有可能就是突如其來的滅頂之災。
不過苗樸既不打算因此而率先對藍血人動手，也不準備找衍生怪物們在地鐵隧道區可能存在的一個前沿哨站，他的行動方案是一如既往的笨辦法——解析能量潮汐的運作原理。
這樣的一項工作，並不需要大隊人馬，只要一個能夠勝任相關技術的人就可以了，比如他自己。
若是過去，他這時候恐怕就興沖沖的一個人上路了，不過經過這一段時間的適應
，他現在終於有了幾分指揮官的覺悟。這種事，不該由他來親自操持，這不光是因為「千金之子，坐不垂堂」，還因為他在後方可以做更多的事。
於是他派遣了一頭前往。
這頭攜帶了一個非常昂貴的新設備，源晶石頸環，這設備可以看作是的分身，然而它實際上跟是有本質區別的，從運作原理的角度看，這個分身更像是一部智能百科全書。它只能提供它知識庫中有的信息，而無法給出創造性的建議或意見。
打發離開之後，苗樸準備開鑿新的避難所，這個避難所更接近能量潮汐的核心，也更接近藍血人的基地。這麼做的目的自然是將來對藍血人用兵可以更迅速省時，而不至於將大量的時間花在路上。
建設新避難所是一項單調而枯燥的工作，花了3個多小時，將前沿避難所推進到了距離藍血人基地5分鐘路程的區域。新的避難所是除前沿基地不算，由後向前數的第4個避難所，沿用中轉站方案，1號和3號都被當作誤導敵人，實則棄置的假站處理。而2和4作為真站進行建設，具體情況乏善可陳。
倒是偵查那邊，經歷堪稱驚險。它是依靠換通道的方法來躲避能量潮汐的，為此不得不以潮汐源頭為點打轉，該源頭宛如太陽，每一分每一秒都在向週遭釋放著恐怖的能量，穿行其間有多麼危險可想而知。
的第一階段偵查花費了90多分鐘，帶回來的資料讓對能量潮汐源頭的情況有了更多的瞭解。
在對其配備進行了適當的調整之後，第二階段的偵查開始了，這次用時更長一些，將近150分鐘，總的來說還算順利，幾項重要的推測得以確認，潮汐源頭的情況也基本浮出了水面。
下水道區域的核心是一個奇特的正方體，這個正方體乍看上去跟其他連接通道的積淤池沒什麼區別，實際上最大的區別是每一個通道的邊緣位置都隱藏著空間門。以至於只要這些空間門開啟，它就會從一個普通的樞紐，變成可以向六個方向傾瀉能量或物質的多口噴嘴。
地鐵隧道的核心，本質上也是這樣的，只不過它的結構更複雜。
乍看起來，它就是一個三岔路口，一如地鐵隧道區的其他路口，但實際上它是一個可360度旋轉的內膽，這個內膽一共對應著三套三岔路口共計9條通道。同時，它與通道的接口也是空間門。
另外，這個內膽的中心是有物質的，一個奇特的能量發生器，將之稱為。
是一種源明造物，它的技術難度極高，即使在源明時代，也只有統治者階層中的佼佼者才能夠製造。它的構成材料極其稀有，比之陽谷礦的天外隕鐵還要稀有。這兩者，決定了它的數量。
運作原理的一部分，類似於電流的正負極，它自身是負極，空間門提供正極，每次能量潮汐，都是空間門開啟，正極能量出現，然後引動異能之心的負極能量聚合，從而形成能量潮汐，噴湧向前。
當然，這樣描述只是為了更好的理解這種現象，具體的真實情況要更為複雜。
本身具有一定的類微波效能，這就使得它運作的時候，地鐵隧道核心區域非常危險，某種角度講，跟高溫熔爐內部一樣，沒有足夠的抗力，進入哪個範圍會被迅速瓦解。
藍血人利用了和正極能量，他們分別在地鐵隧道核心中以及空間門之外的通道邊沿安置了採集棒、採集環，傳導通道。於是，在每次的能量潮汐中，截取一些正、負級的能量，雖然不多，但也不菲。而且，苗樸發現，藍血人們本來可以更狠一些，但他們沒有這樣做，關於這點從他們安裝的採集棒、採集環數量就能夠看出，他們本可以安裝更多，但實際上採集環是四個，採集棒則只有兩個。
發現了這些情況後，苗樸開始思考一個問題：「衍生怪物究竟想從藍血人那裡獲得什麼？」
如果只是阻止藍血人的寄生吸血行為，採集棒、採集環為什麼不破壞？要知道也是多基地，若是不搗毀設施，很可能前腳消滅，後腳就又死灰復燃。而若不是衝著藍血人在地鐵隧道中的吸血行為來的，又會是為了什麼？難道這只是針對藍血人全面清剿行動中的一個？
苗樸覺得不像，主要是因為衍生怪物之前在攻伐藍血人基地中的表現太過悍勇，完全就是一種不惜代價的做派。清剿有必要搞的這麼趕嗎？尤其是這個敵人已然被堵死在了家門口。
想了半天苗樸也沒想出個靠譜的推論來，難道是他這個相對而言的窮**絲不能理解大土豪的心態？
這時，已經展開了第三階段的偵查。這次用時更長，在中途三次補充能量的前提下，總共花費了近9個小時才完成了這次偵查。總算功夫不負有心人，真的找到了衍生怪物的前沿哨站。
該哨站跟苗樸他們所建立的避難所繫列不在一個平面上，最快捷的抵達方式，就是在地鐵隧道的核心轉動對接相應通道的時候衝進去。不過這個方面只適合極少數人，有的地鐵隧道核心實在是太危險了。
偵查結束之後，是一個相對無事的枯燥期。小隊的眾人靠著建設前沿基地打發時間，而則進一步的進行估算，算地鐵隧道核心轉到衍生怪物前哨站所在通道的時間與規律，另外還有藍血人基地的相對坐標。
這兩項都比較複雜，主要是因為地鐵隧道區域的空間結構與地下水道的一樣，不能以常理代入，包括引力、方向感等都與外界不同，若是以為所走過的路都在一個平面上，那就大錯特錯了。
好在有著一套不俗
俗的應對辦法，直到目前為止，尚未出現過大的差錯，苗樸也對其接下來的表現很有信心。
與衍生怪物大戰之後的第5天中午，前進基地的分解工作終於全面結束。原本堆積如山的衍生怪物屍體，變成了各類原料，其中數量最為龐大的怪物骨肉，作為有機類原料被加工成一種粉末。這種粉末與相應的異能能量結合，就可以重現當初小隊在地下遺跡時期從植系巢穴的能量網絡中劫取的那種能量混合物。也就是說，衍生怪物的雪中送炭，一舉解決了苗樸在前線催生新的洪荒巢穴的最大難題。
之後不久，那邊的運算終於有了結果，小隊開始了新一輪的挖掘工作。
這次挖掘是在最前沿的避難所進行的。按理說，這避難所在隧道的此端，而藍血人的基地在隧道的彼端前方，不但距離超過3000米，還隔著20米寬的隧道，筆直向上掘削的話，無論如何也不可能與之有交集。但卻很篤定的告訴苗樸，就是這個方向，一直挖，最終就會鑿出一條通往藍血人基地的隧洞。
不管這個判斷多麼離奇，苗樸選擇了相信，他讓傀儡們開動起來，以平均每小時300米的速度推進。
結果，這次掘削，讓小隊成功的見識了聚合三區幕後的一些神奇。
空間斷層，就像魔方之間的縫隙，以某種規則存在著。但掘削工作穿過這個危險的斷層，垂直的挖掘一下子變成了橫向挖掘，所謂的地心引力的改變異常的突兀。
這便是幕後，若是台前（隧道中），這個斷層的過度會自然的很多，就像老式公交車的那種膠皮軟橋，可以伸縮的一段區域內負責將原本生硬突兀的轉折變得自然。
所以從斷層此端看彼端，見的是人員站在側壁上進行掘削，而掘削出的土石也不會直墜而下，而是鬆散的堆在側壁上。
這樣的情況初時讓人看的嘖嘖稱奇，但未幾便習慣了。實在是因為這條隧道比預期的要長上許多，而經過的斷層也多達4個，經歷多了，也就麻木了。
23個小時，隧道完成，全長約6500米，彼端差最後一步沒有鑿通，但已經確認是經過晶石硬化的土層，這種類似於打地基的土層處理方法，正是藍血人所慣用的。
接下來就是等待了，等一個最合適的時機。
當地鐵隧道核心部又一次的結束了與衍生怪物前哨站所在的那條隧道的對接之後，在隧道盡頭待命的展開了對藍血人巢穴的突襲……
這是一次完美的突襲，藍血人根本沒有想到，在這樣結構複雜的區域，竟然有敵人可以開出一條超過6公里，且方向正確的隧道直達他們基地的內部