剛開始的時候，這支進入沙漠的大月氏軍隊的將領並不知道自己派出的信使全部被護教軍攔截了，他還在等著包圍莎車城的大月氏軍主力前來接應自己。
可是好幾天過去了，當他一直沒有接到包圍莎車城的大月氏軍主力派回來的信使，他才發現事情不妙。知道這時，他才派出大量的斥候對周圍進行探查，發現了一直跟隨在自己身後並且攔截了自己和大月氏軍主力派出的信使。
在確定了這支進入沙漠的大月氏軍準備撤退之後，左靈立即告知了董卓。董卓接到消息之後立即發現了這是一個難得的好機會。只要能夠阻擋住駐紮在莎車城外圍的大月氏軍的主力，護教軍將有機會全殲這支深入沙漠的大月氏軍。
此時住駐紮在莎車城外的大月氏軍也發現了情況不妙，他們已經很多天沒有收到北上的大月氏軍的消息了，而且自己派出的信使也一直沒有消息。
當他們知道護教軍專門派出了一支軍隊跟在這支北上的大月氏軍的時候，董卓已經完成了對這支大月氏軍退路的封鎖。由於四面都是茫茫的沙漠，這支大月氏軍只能沿著蔥嶺河的河道行軍，所以護教軍只需要封鎖住蔥嶺河流入沙漠的入口，就能將大月氏軍堵在沙漠內。
當然，為了防止大月氏軍真的從沙漠中逃竄，董卓在蔥嶺河入口處東西各百里的範圍內都設置了崗哨，一旦大月氏軍真的進入沙漠，這些崗哨可以監控大月氏軍走出沙漠的地點。如果大月氏軍從更遠的地方走出沙漠，那麼當他們走出沙漠的時候，幾乎也不會剩下多少戰鬥力了。
面對著董卓的封鎖，駐紮在莎車城外的大月氏軍主力只能主動向護教軍發動進攻。面對著護教軍用偏箱車和巨盾組成的防線，大月氏的軍隊也毫無辦法。
雖然大月氏軍的投石車的射程比護教軍的投石車的射程高了那麼一點點，但是每當大月氏軍出動投石車的時候，護教軍都會派出騎兵對這些器械進行破壞。大月氏軍很顯然十分缺乏使用騎兵或者對抗騎兵的戰鬥經驗，面對著護教軍的騎兵衝鋒往往毫無辦法，在幾次拚死阻攔才保住這些珍貴的攻城器械之後，大月氏軍再也沒有派出過投石車。
大月氏軍不再使用攻城器械，護教軍中的各種器械就有了用武之地。面對著進攻的大月氏軍士兵，護教軍的投石車和弩車發揮出了最好的狀態，給大月氏軍造成了嚴重的損失。
大月氏軍的人數雖然多，但是也無法承受這麼大的損失。在幾次進攻無果之後，大月氏軍也停止了進攻。
雖然停止了進攻，但是並不代表他們已經放棄了那些被護教軍阻擋在沙漠中的同胞。他們決定對莎車城發動進攻以牽制護教軍的兵力，以便讓被護教軍攔住的大月氏軍有更多的機會突圍。
就在大月氏軍準備攻城的時候，李文侯率領著援軍來到了莎車城下。
在此之前董卓已經接到了閻明對護教軍進行整編的統治，現在他和李文侯地位相當，都是護教軍第一軍團的軍長，因此董卓對李文侯十分客氣，讓李文侯十分受用。
雖然閻明已經決定對護教軍的每一支軍隊都進行混編，但是由於現在正在戰爭之中，自然不可能立即進行混編，閻明只是決定對目前這些軍地出現的傷亡情況進行補充的時候不再考慮民族問題進行補充。
李文侯帶領著大漢太平道護教軍第一軍團第二軍的全部騎兵來到了莎車城下。第二軍是以羌人護教軍為基礎重新編製的，在原來羌人護教軍的基礎上又補充了一個師的兵力，並在之前的四個師中混編進了不少的漢人士兵。羌人護教軍中原有的前中左右四個師的師長全部留人，不過各個軍之間的中級軍官進行了大規模的調整。而新編入的後師的師長則由原來的隴西太守李相如擔任。
在護教軍控制住了整個涼州之後，李相如仍然被任命為隴西太守，在發現閻明一心想要把涼州境內的文官和武將權力徹底分開之後，一心想要恢復自己匈奴輝煌的李相如卻不太願意繼續在地方文官的位置上繼續幹下去，他希望能夠通過為護教軍征戰從而獲得在護教軍中更高的地位，為自己日後重返草原重振匈奴打下基礎。
在涼州平定之後，太平道並沒有立即向外擴張，因此也一直沒有擴張自己的軍隊，只是對原來涼州境內的各支武裝進行了整編，而李相如組織起的隴西郡兵被編入了漢人護教軍中，李文侯私下組織的匈奴死士則秘密的隱藏了起來，等待著機會。
很快機會就來了，西征西域的護教軍遇到了強大的敵人，需要大量的支援。在太平道高層的壓力下閻明也終於同意了向中原擴張勢力，為了盡快平定中原的黃巾軍，也需要大量的士兵，太平道終於開始了大規模的擴軍。
李相如在太平道西域遇到強敵這個消息傳到隴西之後就開始了招募士兵。雖然閻明在涼州境內大力推行軍政分離，但是畢竟時日尚短，目前還只能做到職務上的軍政分離，也就是在護教軍中擔任職務的將不能在擔任各地政府中的職務，反之亦然。雖然職務上分離了，但是涼州數百年來形成的傳統卻不是短時間內能夠改變的，李相如憑藉著自己隴西太守的職務成功的說服了掌管隴西郡徵兵、地方防務等的郡尉，提前開始徵募士兵進行訓練。
那些被隱藏起來的匈奴死士則被安插進了這支軍隊之中，由於有了這些戰鬥力十分強悍的精銳的帶動，這些新招募的士兵訓練進步十分迅速，等到閻明正式的徵兵的命令向下發佈之後，李相如招募的這批士兵已經有了不俗的戰鬥力。
這時李相如又親自找到了閻明，要求加入護教軍而不再擔任隴西太守。對於李相如的請求閻明無可奈何之下只能答應下來，根據等級換算，李相如直接就擔任了護教軍的師長，不過當時手下的士兵只有他從隴西郡提前招募的這批士兵。
後來又陸陸續續的有各族新兵補充進了這支軍隊，很快就補充滿了一個師，最後在護教軍進行整編的時候，這個師被編入了護教軍第一軍團第二軍，成為了第二軍的後師，這也是第二軍中唯一的一個純步兵的師。
由於閻明派遣援軍的時候還沒有進行整編，這個師當時還沒有編入第二軍，因此第二批的援軍之中並沒有這支部隊。