會戰結束後的一個星期後，楊震在佳木斯軍區新的駐地召開了戰役總結會，以及下一步的工作部署。所有野戰部隊旅以上幹部，地方部隊軍分區，除了留一名值班之外，全部按照總部要求參加會議。
在會議上楊震除了對會戰中出現的各種問題進行了總結之外，還提出了今冬以及明年開春後，工作發展的目標。實際上楊震將工作計劃訂到的是自己知道的明年六月份蘇德全面爆發當月。因為他也不知道，日本人會不會認為蘇德戰爭爆發，自己外援通道被切斷，而自以為有空子可鑽。
按照目前形勢的發展，楊震決定將部隊繼續劃分為野戰軍和地方部隊。野戰軍由四個縱隊組成，每個縱隊下轄四個步兵旅。同時組建軍區裝甲兵司令部、炮兵司令部以及航空兵司令部。
地方部隊報請中央同意後，則組建合江軍區以及松江軍區、嫩江軍區三個二級軍區。各軍分區不在由總部直屬，而是劃歸二級軍區建制。同時為了適應新的形勢，軍區在對現有各個分區進行一定調整的同時，也將新成立一批軍分區。
在軍分區調整上，楊震將老根據地的一、二、四三個軍分區併入合江軍區建制，三分區則併入新成立的松江軍區。同時以原偽滿濱江省轄區為基礎組建五六兩個軍分區，龍江省轄區組建七八兩個軍分區。
以牡丹江、偽滿東安省轄區組建直屬軍區建制的東安軍分區和牡丹江軍分區。而同時將二分區遷移到原偽滿黑河境內，原二分區轄區轉為一分區建制。牡丹江軍分區、東安軍分區因為地理位置重要，並不劃歸任何一個二級軍區建制，由總部直屬。
按照楊震的要求，地方部隊除了在承擔地方剿匪、保護工需企業等重要目標，以及承擔地方守備的任務之外，還要承擔編製、整訓地方武裝的職能。在戰時，可以直接轉化為野戰部隊。每個軍分區除了保留一個建制團的武裝之外，還要有組建兩個架子團。同時配合各縣武裝部承擔徵兵工作。
而兩個直屬總部的軍分區，則是實打實的編組為三個團。這兩個軍分區，雖然只是旅級建制，但是由於目前戰略位置至關重要，所以在所有軍分區編制之中，是唯二保持滿編建制的軍分區。
這兩個軍分區不僅兵力配置與野戰旅相等，而且這兩個軍分區，炮兵編製也與野戰旅相同。同時為了保持對琿春以及偽滿吉林省境內的日軍保持一定的壓力，這兩個軍分區還將各自編組一個騎兵營。
原本按照楊震的意思，這種直屬軍分區要編製四個的。除了牡丹江與東安之外，還要編成齊齊哈爾和雙城兩個軍分區。但是在猶豫了一陣子後，還是決定將這兩個軍分區改為由軍區野戰部隊，以及嫩江軍區部隊兼任守備任務。
在此次作戰會議上，變化最大不是各個野戰縱隊，而是軍分區一類的地方武裝。此次會戰結束後，楊震撤銷了原各分區序列內的基幹團，而是改為保留一個完整的建制團，其餘的兩個團則編成架子團，也就是後世所說的預備役部隊。對於這些架子團，楊震的要求是在補充兵員後，必須能夠拉得出、打的響。
在目前軍區主力野戰任務仍舊很重的前提之下，楊震還是決定將有限的兵員優先加強給野戰縱隊以及編組即將組建的裝甲兵。至於地方部隊，暫時也只能先編組一個滿編團。其他額只能先編成兩個架子團。
不過雖然各個軍分區只能編成一個主力團，但是各縣的縣大隊卻全部升級，由原來的三個中隊，擴編為四個中隊。人員、裝備全部按照野戰部隊的標準編製。同時各縣的每個區也組建了連一級建制的區中隊。
再加上每個縣組建的屬於直屬社會部領導的各個公安局所指揮的公安中隊，實際上分區武裝是擴大了。這些縣大隊的經費、軍裝、武器雖然由軍區統一撥付，但是所需的其他物資，如糧食、蔬菜、被服則由各縣統籌供應。
而各個區中隊，則作為受當地縣委直管的地方不脫產武裝。平時在家搞生產，每個月集中三到五天進行軍事訓練。各個區中隊並不著裝，則集中接蘀隨時可以升級的原有縣武裝，擔任本縣的警備任務。
這樣一來，在保持地方武裝數量不減少的情況之下，軍區的負擔實際上是降低了。各個預備部隊的數量，也比以前顯著增加。更不會戰時出現縣大隊被升級、拉走後，地方的警備力量出現空白的情況。
而各個野戰縱隊雖然依舊還只是四個縱隊，並未增加編製，但是每個縱隊卻增加了一個旅的編制。同時在各個二級軍區除了所屬各個軍分區之外，還編組了一個軍區直屬獨立旅以及兩個架子團性質的獨立團。
這樣一來，表面上看是編製還是四個縱隊，但是在需要的時候，整個野戰軍在地方武裝完成集中後，可以在短時間之內迅速在擴編兩到三個縱隊。各個縱隊的第四旅，實際上與之前的影子部隊類似。只不過他們的部隊是整編部隊，但是幹部配置，卻是按照兩個旅配屬的。
在公佈完部隊編制調整之後，楊震接著公佈了各級指揮員調整的命令。四個縱隊司令員、政委，除了二縱政委陳翰章調任軍區剛剛組建的裝甲兵司令部任司令員兼政委之外，其餘的幾個縱隊軍政主官人選並未改變。
而在旅一級，除了此次會戰之中一批戰功卓越的副旅職幹部以及團職幹部受到重用，被提拔為軍分區司令員之外，最讓人感覺到意外的是，所有地方部隊目前最重要的一環，牡丹江軍分區司令員的職務，居然由原來擔任縱隊參謀長的馬春生改任。
如果說馬春生的被調離有些讓人感覺到意外的話，那麼這個軍分區政委的職務，則由關內調任不長時間的軍區宣傳副部長王立人調任，更加讓大家感覺到意外。很多人都認為這個牡丹江軍分區恐怕與之前的四分區一樣，是準備用來組建第五縱隊的。
王立人在調任東北之前，是八路軍一一五師政治部敵工部副部長，前敵政治鬥爭以及對敵鬥爭經驗豐富。去年年底調任東北後，一直在東北局工作。此次會戰之前，為了加強軍區政治工作，經李延平幾次要求，總指揮才放人。
而馬春生就更不用說了，作戰狡猾多變、不拘一格，是一位難得的軍事指揮員。在縱隊參謀長的位置上表現的極為突出。此次將這二人調到一個新組建的軍分區任司令員、政委，幾乎所有人都認為這是為了組建將來的第五縱隊做準備。
四個縱隊司令員、政委，除了王光宇升任軍區副司令兼嫩江軍區司令員，並報請中央任命為軍區常委之外。一縱隊司令員由四縱司令員杜開山接任，四縱司令員則由劉長順接任。劉長順不在擔任一分區司令員兼生產建設兵團司令員、富錦綜合訓練基地司令員。
劉長順調任四縱司令員後，原一分區司令部升級的合江軍區，兼生產建設兵團司令員、富錦綜合訓練基地司令員則由一旅政委歐陽吉善調任。同時調五旅旅長易良品任松江軍區司令員。
看著下面的各級幹部聽到新的人事安排後，表情各異的臉，楊震嚴肅了一下語氣道：「全軍各級軍政幹部，要按照總部的要求，利用三到五個月的時間，完成新的徵兵以及部隊組建任務。力爭到明年三月份，完成重新組建十五萬地方部隊的要求。」
「同時要完成對野戰縱隊的重新組建。各個縱隊要抓緊時間完成部隊的重新編組以及人員的補充。野戰部隊各個旅要在最短的時間補充完畢，並在一個月之內完成對團以下幹部的調整。」
「軍區各個野戰縱隊，從現在開始，一直到明年六月份之前。只要日偽軍不大舉進攻，將沒有任何的野戰任務。軍區所有除了在與日軍對峙的一線部隊之外的部隊，所有的任務只有一個，那就是訓練。」
「我不管你們採取什麼辦法，我只看結果。明年五月份之前，軍區無論是野戰部隊，還是地方部隊，都要實行考核。不合格的，軍政主官就地免職。軍區沒有太多的時間，給你們糟蹋。」
「同時航空兵要在接手蘇軍轟炸機後，在最短的時間之內完成轉換訓練。現在不是已經完成對第三批的飛行員選拔以及初級訓練嗎？我同樣要在明年六月份之前，看到你們的訓練成果。還有在選拔一批飛行員，作為後備力量。另外，你們要與軍區政治部協調好，盡量爭取偽滿國高、國中的畢業生，參加飛行訓練，以擴大後備飛行員的來源。」
「五年陸軍、十年空軍、百年海軍。培養一名合格的飛行員遠比培養一批步兵難得多。而現代化的空戰也將越來越殘酷。後備合格的飛行員數量充足與否，甚至直接關係到一場戰爭的勝敗。」
「在現在空地一體化的戰爭之中，你們航空兵是任重道遠那。航空兵能不能有效的使用現有裝備，為地面部隊撐起一把保護傘，對於我們今後作戰之中，能不能避免付出一些不必要的代價，極為重要。只有一百分的努力不夠，要五百分的努力才行。」
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