神農自登位成為共主之後，凡事親力親為，以身作責，教導人民製造弓箭以獵獸，將耕種五穀的方法傳播到各個角落.
人類學會種植五穀後，許多吃不完的糧食因為保存不好而毀壞。神農又教大家捕捉山中幼獸小鳥，用那些吃不完的糧食來飼養，等到幼獸小鳥長大後再將其宰殺。這樣，可謂一舉兩得，既將那些吃不完的糧食發揮了功用，有免除了人族去山上捕獵的危險。慢慢的，人們發現豬、牛、馬、羊、狗、雞等六種動物最好飼養，便將其統稱為「六畜」。
從此人們不再缺少食物，並且還有剩餘，有時剩餘多了吃不完又不能長期保存，無奈只得扔掉，浪費不已。神農針對這個問題特意召開大會徵求眾大臣的意見，最後終於想出了一個辦法。
神農命人在陳都城內建立了一條大街，並以之為市致天下之民，聚天下之貨，交易而退，各得其所。如此人們有多餘的物品便拿到這裡互相交換自己認為值得和有用的東西，不僅大大減少了浪費，更將之用在了有用的地方。
那時候的人族還是用獸皮裹身，後來神農治麻為布，並將之推廣，從此人們用麻布來做成衣裳，不用再穿獸皮，逐漸走出愚昧！
雖然有伏羲發明了瑟，但人民除了生產還是沒有什麼更加豐富的生活，神農於是乃取東海之桐，削之為琴，結絲為弦，長三尺六寸六分，上有五弦，曰：宮、商、角、徵、羽。其聲可道天地之德，能表神農之和，能使人們娛樂，人皆謂之為神農琴也！
時人族每烤制食物皆用手，如若不小心常會被灼傷，更是缺少盛物的器皿，神農乃以土製成各種可是盛裝的器皿，謂之為陶器，自此人們可以用陶器來盛食物，方便了許多。
雖然知道了春夏秋冬，但卻不知該在什麼時候種植谷種，什麼時候是收穫的季節，神農於是乃歷數年觀察四時變化，冷暖交替，在伏羲時代的曆法上加以改進，立歷日，立星辰，分晝夜，定日月，月為三十日，十一月為冬至。從此人們懂得了什麼時候該是種植谷種，什麼時候該是收穫，如此生產大大增加了許多。
一系列的治理措施下來，人族的生活明顯有了較大的提高，人口也增加迅速，呈現出一副比伏羲時代更加興旺的態勢。神農對百姓無有相害之心，刑政不用而治，甲兵不起而王，是以諸侯大臣盡皆擁護，百姓人人愛戴！
神農見人們的生活在他的治理下日漸好了起來，心裡高興不已，走在陳都的大街小巷上，看著熙熙嚷嚷的往來族人，心中充滿了自豪感。忽然一陣悲痛的哭聲從前方不遠處傳來，神農大奇，忙走上前去，推開擁擠的人群一看，只見地上正坐著一個滿臉淚水的少婦，她正抱著一個嬰兒，只是明眼人一瞧便知那嬰兒早已氣絕了。
神農上前輕聲問道：「你這孩子怎會如此？」
那女子聞聲抬首一看，見是共主，心中一驚，正欲起身參拜，卻被神農摁住，神農和聲說道：「無須如此多禮！你且告訴我這孩子怎會夭折了？」
女子聞言又是一陣哭泣，悲傷地說道：「只因是病死了！」
神農聞言心下恍然。原來如今人族不識醫藥。是以每有生病便不知治療。故而常有死亡。這個問題也困擾神農許久。只是以前有太多地族中事物要操持。並沒有花太多地精力在這方面。今日他看到一個幼小地生命就這樣地消逝。心底裡好似有塊重若千斤地巨石壓著。心潮起伏。久久不能平靜下來！
神農安排人幫那女子收殮了孩子地屍體。隨後一個人回到家中，憂心忡忡。
而後，神農經常得聽到有些老弱族人偶爾遇上頭痛、發燒之事仍然無法治癒，有些族人就這樣死掉了，甚至一些壯年男女發生這樣的狀況也就無法幹活了，只能躺在床上等著好轉，而且這些現象現在越來越多，再就是誤食毒物或被毒蟲、毒蛇所傷的族人越來越多，人族卻是束手無策，只能眼睜睜的看著族人死去。
老百姓的疾苦，神農氏瞧在眼裡，疼在心頭。怎樣為百姓治病？神農苦思冥想了三天三夜，終於想出了一個辦法。
第四天，他帶著一批臣民，從家鄉隨州歷山出發，向西北大山走去。他們走哇，走哇，腿走腫了，腳起繭了，還是不停地走，整整走了七七四十九天，來到一個地方。只見高山一峰接一峰，峽谷一條連一條，山上長滿奇花異草，大老遠就聞到了香氣。神農他們正往前走，突然從峽谷竄出來一群狼蟲虎豹，把他們團團圍住。神農馬上讓臣民們奮力殺搏，向野獸們撲去。打走一批，又擁上來一批，一直打了七天七夜，才把野獸都趕跑了。
這時，臣民們說這裡太險惡，勸神農回去。神農搖搖頭說：「不能回！黎民百姓病了沒醫的，我們怎麼能回去呢！」他說著領頭進了峽谷，來到一座茫茫大山腳下。
這山半截插在雲彩裡，四面是刀切崖，崖上掛著瀑布，長著青苔，溜光水滑，看來沒有登天的梯子是上不走的。臣民們又勸他算了吧，還是趁早回去。
神農搖搖頭：「不能回！黎民百姓餓了沒吃的，病了沒醫的，我們怎麼能回去呢！」
他站在一個小石山上，對著高山，上望望，下看看，左瞅瞅，右瞄瞄，打主意，想辦法。後來，人們就把他站的這座小山峰叫「望農亭」。然後，他看見幾隻金絲猴，順著高懸的古籐和橫倒在崖腰的朽木，爬過來。神農靈機一動，有了！他當下把臣民們喊來，叫他們砍木桿，割籐條，靠著山崖搭成架子，一天搭上一層，從春天搭到夏天，從秋天搭到冬天，不管颳風下雨，還是飛雪結冰，從來不停工。整整搭了一年，搭了三百六十層，才搭到山頂。傳說，後來人們蓋樓房用的腳手架，就是學習神農的辦法。
神農帶著臣民，攀登木架，上了山頂了，嘿呀！山上真是花草的世界，紅的、綠的、白的、黃的，各色各樣，密密叢叢。神農喜歡極了，他叫臣民們防著狼蟲虎豹，他親自採摘花草，放到嘴裡嘗。為了在這裡嘗百草，為老百姓找吃的，找醫藥，神農就叫臣民在山上栽了幾排冷杉，當做城牆防野獸，在牆內蓋茅屋居住。後來，人們就把神農住的地方叫「木城」。
白天，他領著臣民到山上嘗百草，晚上，他叫臣民生起篝火，他就著火光把它詳細記載下來：哪些草是苦的，哪些熱，哪些涼，哪些能充飢，哪些能醫病，都寫得清清楚楚。
有一次，他把一棵草放到嘴裡一嘗，霎時天旋地轉，一頭栽倒。臣民們慌忙扶他坐起，他明白自己中了毒，可是已經不會說話了，只好用最後一點力氣，指著面前一棵紅亮亮的靈芝草，又指指自己的嘴巴。臣民們慌忙把那紅靈芝放到嘴裡嚼嚼，喂到他嘴裡。神農吃了靈芝草，毒氣解了，頭不昏了，會說話了。從此，人們都說靈芝草能起死回生。臣民們擔心他這樣嘗草，太危險了，都勸他還是下山回去。他又搖搖頭說：「不能回！黎民百姓餓了沒吃的，病了沒醫的，我們怎麼能回去呢！」說罷，他又接著嘗百草。
正欲繼續試嘗那些還未嘗過的異草，卻見東方天際遠遠飄來一朵七彩祥雲，神農定睛一看，只見師傅熊貓飄然而來……
待熊貓降下祥雲，神農忙領著眾人上前拜見，疑惑地問道：「拜見師傅，不知師傅何來？」
熊貓看著神農蒼老了許多的容顏，心底忍不住地歎了口氣，對他道：「神農，聖父知你嘗百草，屢種劇毒，是以賜下先天靈寶赭鞭於你！」言罷從袖中取出一條色呈褐色，長有三尺六寸的神鞭給他。
神農接過赭鞭，拿在手裡掂量了一下，只覺其輕盈靈動，不用祭煉便可用之，他問道：「不知此寶有何功效？」
熊貓笑道：「此寶遇毒則色變，可辨萬毒，更有諸多妙用，正是適合你用。」
神農聞言大喜不已，朝東海蓬萊島拜道：「神農謝過聖父賜寶！」
熊貓見寶物已經送到了神農手上，對他說道：「我也該回去復旨了，神農，卻是苦了你了！」言罷歎息一聲。
神農微笑說道：「師傅說的是哪裡話？神農身為人族共主，若不能為我人族謀福又有何用？」
熊貓朗聲大笑道：「好好好！你說得不錯！想人族自誕生之日起雖有諸多磨難，但卻一步步地走到了今日，靠的不就是我們這種刻苦耐勞，無所畏懼，永往無前的精神麼！」
神農也一臉嚴肅地說道：「神農定當謹記師傅的教導，神農此生只為我人族而存！」
熊貓聞言點點頭，隨即告辭了神農一行人，駕雲而去。
從此，神農但凡見到以前未曾見過的草木便用熊貓所給的神鞭赭鞭打一下，看其有毒無毒，並將他們記錄下來，等到晚上的時候便將那些毒草服下，檢驗其毒性的強烈，慢慢的神農發現各種毒藥都有都有五行屬性，有些厲害的毒藥更是混含了數種五行之力，所以才毒性劇烈，神農察其寒、溫、平、熱之性，辨其君、臣、佐、使之義，慢慢的便可以用之解毒，還可以治病。
一天神農在石縫中找到一支開小黃花的籐狀植物，神農用赭鞭打一下發現其中蘊含劇毒，便把花和莖吃到肚子裡以後，沒有多久，就感到肚子鑽心地痛，好像腸子斷裂了一樣，連忙用功將毒性化解，一會神農起身擦了一下頭上的汗說道：「幸好我有老師傳下的道法護身，不然就會死在這裡了，一定要將這種草記下來告訴族民，以免族民誤食而喪命。這種草吃下去肚子鑽心地痛，好像腸子斷裂了一樣，就叫『斷腸草』吧」。
經過數十年的辯嘗神農發現甘草可以治療咳嗽，大黃可以治療便秘，黃蓮可以消腫等等。他又發現了一種綠色葉子地木葉。食之可解百毒。謂之查。又作茶也。神農嘗中毒七十餘次。均靠著茶葉解毒。
如此，終於將山上的百草嘗完。眾人正欲返回之時，卻驚奇地發現那些冷杉全都長高長大，遍山搭的木架不見了。原來，那些搭架的木桿，落地生根，淋雨吐芽，年深月久，竟然長成了一片茫茫林海，擋住了回去的道路，正不知如何是好，只見從天際落下一輛天車，從車上下來一仙子，正是一個天庭的仙女。
那仙女朝神農施禮道：「奴婢見過人皇陛下，奴婢奉玉帝旨意特來送人皇陛下回陳都！」
神農聞言拱手說道：「如此有勞仙子了！」旋即帶著眾人上了天車，一聲嘶鳴聲中，天車飛騰上天，朝著陳都的方向而去。而那片神農嘗百草之地則被後人稱為「神農架」。
神農回到陳都之後便開始著書，寫下一本藥經。書中將洪荒常見之物，不常見之物一一寫進書中。只是神農得熊貓事先指點，在那藥經之前寫下是藥三分毒之說，這在後世醫術上人所皆知。
神農寫完藥經後，開始研究藥理為人族治病。人族中人何其之多，那些病症雖無後世那麼多，可每日前來看病求醫的也不少，神農一邊為人族看病，一邊研究治病之法寫在藥經之上。神農也將這藥經傳授給人族，讓人們知道萬物的藥性與作用。一些人在神農那裡學到不少醫理，便開始學神農在人族四方走動，為人治病。這些就是最早的遊方郎中。
神農在為人族治病之時，熊貓又教神農用針灸之法治病，那人體經脈穴道繁雜無比，熊貓為其指出大概，那些細小之處讓神農自己去研究。
為此，神農研究無數屍體寫下人體經脈穴道全圖，在研究經脈穴位之時而且還把人體研究個透徹，也一併寫在書上留於後人學習。本來這人體全圖，現在還沒人敢研究的，畢竟這是對死人不敬的。那神農身為人族共主，為了人族研究醫理，人族自然感激還來不及，倒不會阻止神農此舉，倒有不少人前來獻身幫助神農研究。這些當然也是熊貓的推舉了，他想讓人族醫理快速發展，就先讓神農把這醫術研究個通透，還免去後人不少的麻煩。
神農還在陳都親自教授族人醫藥之術，他又發現有些病發起來很快，等藥煎好的時候病人已經快不行了，藥服下去也不管用了。所以神農又想找到一種方法，將藥物的精華全部存下來，在病人剛發病的時候便將其服下，病人便可以乘早將其服下便可以保住性命，神農想了很久，都沒找到方法。
於是，神農便去向熊貓請教。
熊貓遂取出一個匣子，打開一看，正是一部名為《丹學經典》的黃皮書，乃是逍遙算到神農會問及丹學上的事情，特意賜下此書交於熊貓，等神農來問時將此書交給神農。這書可是逍遙精心編製的，雖然在煉丹一途上，老子可謂是舉世無雙，就連逍遙也是略輸一籌。但逍遙不怕，逍遙畢竟是後世來的，多少也知道些後世製藥的原理，且老子那一套煉鉛煉汞的手法還是不要在人族流傳的好，他一幹幹瘦老頭是聖人吃了沒關係，不代表下面那些凡人吃了沒關係，萬一哪個白癡沒事兒要想成仙，煉些鉛汞吃了，跟找死沒兩樣。
神農得了此書歡喜不已，又熊貓從袖中將逍遙所煉的丹?取出，賜名『神農鼎』，為神農專門煉丹所用。而神農鼎在神農的手中大放光芒，救死扶傷無數，從此被視為繼天皇伏羲的伏羲琴之後人族又一功德至寶，地皇神農獨一無二的象徵。
不過逍遙贈丹書一事卻是惡了老子。論煉丹，洪荒首推老子，原本老子也算出神農會為丹學之事為難，但他故作清高，沒有採取主動，以為憑借自己洪荒第一煉丹師的名聲，神農遲早會來向他求取。而他正好可以借此機會顯擺，好好大施恩澤，讓人教太上老君之名能夠深入人心。可是老子沒想到這逍遙又鑽了出來，破壞他的好事，老子自此對逍遙這樣大包大攬的干預人族之事極度不滿。
在經過數十年的刻苦專研，神農嘔心瀝血寫下《神農本草經》。《神農本草經》乃是神農畢生所學之大成，闡述了藥物的三品分類及其性能意義，藥物的君臣佐使及在方劑配伍中的地位和作用，藥物的陰陽配合、七情合和、四氣（寒熱溫涼）五味（辛甘酸苦鹹）、有毒無毒，藥物的采造，藥物的煎煮法，藥物與病證的關係等，最後神農將得自熊貓之處的煉丹技巧針灸技巧等等也寫在了上面。
此書一成天地震動。那神農寫下的藥經，囊括了後世所有病症，其中的治理之法寫得清清楚楚，而且此書把洪荒中所有的東西全部詳細的記載下來，就算那些洪荒絕種的東西在這書中也有詳細的記載，此書可謂記載完了洪荒過去未來一切。此書一出可謂是逆天的存在，雖然此書只是為解人族危難而出，可裡面有些東西卻不該出現，天道為此震怒欲將此書毀去，可神農為人族發展有大功德，天道只好將那天劫臨而不發。也不退去。
這時熊貓現身，對著神農說道：「徒兒，你這書卻是逆天了。天想將此書毀去，你欲何為？」
神農道：「老師，此書可謂寫盡洪荒一切，若傳給人族可謂造化人族，若將此書毀去，我多年辛苦卻是付諸流水，人族不知何時才能有出頭之日。」
熊貓笑道：「癡兒，人族發展大興，天道大勢所趨，若天道將此書毀去，天道自己就逆了自己，你又何必擔憂。只是此書太過逆天，只能傳下半部，剩下的半部由我擇人而授」
於是神農將自己寫下的《神農本草經》上半部傳授給人族，那剩下的下半部被熊貓帶走。天劫立刻散去，功德降落，神農得此功德，雖尚未證得人皇果位，但實力突飛猛進。
而神農傳下的《神農本草經》上半部，流傳人族之間，人族得到此書的幫助，死傷人口大減有了此書人族的壽命也開始延長，這卻是大有益於萬民，隨著《神農本草經》傳世，神農也功德日漸增加，比起伏羲有過之而無不及。
至此，神農承前啟後，開創了伏羲以後人族的又一次輝煌！