在五影大會上團藏的死已經造成了軒然大波，誰也沒想到參加五影大會的六代火影居然會這樣就死了。雖然大家也調查過到底是誰和團藏戰鬥，但是毫無疑問的，都沒有發現任何的線索，好像團藏就那樣消失了一樣。
「根」小隊的成員因為失去的團藏的束縛已經變成盲目無序，不知道到底改服從誰的命令。不過還好在木葉有三代這個老火影坐鎮，所以三代很快的就把「根」小隊這把利劍掌握在了手中，同時像火之國的大名宣佈，要讓卡卡西出任最近的七代火影。
綱手的失蹤給了三代實在是太多的壓力，三代現在就算是當火影也不會像當初一樣能承受得住壓力。所以三代才會上書，讓卡卡西來接替自己的火影位置，總的來說在木葉可能是打倒佩恩的鳴人聲望最高，而且在重建的時候鳴人也出了很多力。
但是鳴人也只是單單的實力上強罷了，如果論辦事能力還有實力的綜合的話，卡卡西才是真正的當火影的人選，所以三代才會選擇卡卡西作為第七代火影，並且速召卡卡西，大和，鳴人還有小櫻以及剩下的小強們回村，因為以三代火影的老練已經看出來了，忍者界要亂了。
五影大會的結束是以卡卡西暫代火影之職結束的，大家都表示同時組成聯合軍，並以在鐵之國的誓言為標準，像五大國的大名發送通報，然後一起開會，決定對付「曉」的事。
在五影大會結束之後，小櫻帶著佐井還有牙等人去尋找佐助，最後小櫻把眾人都用迷藥迷倒，看到了現在的佐助。誰知道佐助居然因為一言不合，轉手要殺掉救過自己幾次命的香磷。
阻止了佐助之後，小櫻就和佐助動起手來，但是誰知道佐助的實力已經今非昔比，那裡是小櫻能夠對付的了的。就算是大蛇丸現在過來的話，估計也只是能和佐助戰個平手罷了。
佐助因為憎恨，已經突破了現在的境界，誰都不知道在戰鬥的時候佐助能達到什麼樣的實力。佐助的萬花筒寫輪眼已經完全的變成了憎恨之眼，這種憎恨之眼的潛力很大，誰都不知道佐助在戰鬥的時候會發揮出什麼樣的實力。或許是百分之八十，又或者是百分之二百。
小櫻與佐助的戰鬥很快就被卡卡西攔了下來，就當佐助要學著夜神月「殺」死自己的老師的時候，突然鳴人出現了。以仙人模式下出場的鳴人一下就把佐助打飛了出去，這個時候突然一個人影出現在了佐助的背後，這個人正是斑。
不知道和佐助說了些什麼，佐助與鳴人約定好了下一場的戰鬥，眾人就離開了。誰都不知道這兩個人的心中在想著什麼，但是讓大家都心知肚明的是，這就是宿命，也是羈絆。
夜神月消失了，但是雪之國的所有事物還是處理的井井有條。在內陸的忍者世界產生的波動，讓在雪之國這個偏遠地方的雪忍村有了積攢實力的時間，因為在夜神月消失的這段時間中，又發生了許多的事。
五大國的大名決定聯手了，但是還是因為當頭的這個問題吵了起來，最後好不容易平復下了之後，他們的心裡都有些芥蒂，所以這次的五大國聯軍並不像想像中的那麼齊心。
不過更令人驚訝的在後面，佩恩居然帶著雨忍村的人開始宣戰了，這次的宣戰是以佩恩帶著自己的組合，佩恩六道來到了一個小的忍村，然後以一個「神羅天征」直接滅掉了一個忍村為導火線，這也預示著大家，戰爭不遠了，第四次忍者大戰，或許馬上就要開始了。
在這麼亂的情況下，夜神月還是悠閒的在監獄中，或許說是痛苦的在監獄中也說不定。每天只能保持著一個姿勢，連動一下都不能的夜神月只能緩慢的運轉自己那只剩下一絲的查克拉來修補自己的經脈，然後調動生命力來修復自己已經被破壞的細胞組織。
很快夜神月就發現，這麼修復一點用都沒有，因為每隔一天，就會有一個人來檢查夜神月的身體。發現夜神月的身體居然在慢慢的恢復，就連斑都被驚動了。見到了夜神月之後，斑笑著說道「月，真沒想到你給了我這麼多的驚喜，你的身體真像是一塊寶地，我期待著你再次回到我身邊的那一天。」
說完之後，斑在夜神月的身上下了一個封印，然後離開了，這個封印讓夜神月的查克拉根本就不能運作。現在夜神月只能靠著自己**的恢復在恢復自己的傷勢，但是就算夜神月的身體恢復能力強大，也需要很長的時間才能恢復自己的身體。
不過現在的夜神月把更多的時間用在想東西上面，想著自己到底要怎樣才能快速的恢復自己以往的風采，然後衝出雨忍村的大牢。