碧波蕩漾的大海上，兩艘鄭軍的快哨船正在一前一後的巡航著。由於清軍大隊人馬已經進抵銅山，所有人都知道一場血戰迫在眉睫了，因此船上的氣氛肅殺，神經質的領班甚至親自上刁斗充當瞭望哨，然而其目的卻是不要發現清軍好讓自己又多活上一天。
但該來還是終歸回來，一聲淒厲的呼叫聲甚至連稍遠處的友船都能聽見：「施琅來了！」
幾百根桅桿密密麻麻的出現在眾人的視線內，這壯觀的景象讓所有人在一瞬間內為之失神，好半天後才回復清明的領班再度咒罵著：「還愣著幹什麼，掉頭，向大帥報告」
「快哨船發現清軍舟師的時候是在花嶼、貓嶼一帶，按照清軍的船速，今天應該會在八罩嶼過夜。」八罩嶼又叫望安島，相傳這個名字還是朱成功當年征台時路徑此地所取的。
「八罩嶼？」林升有些不敢相信陳諒的判斷。「八罩嶼地形險惡又多暗礁，施琅也是知兵的人，他就不怕一旦遇上大風來個船毀人亡嗎？」林升這個說法也是有典故的，蒙古之所以東征日本失敗正是因為颱風的原因，而六月又是颱風多發季節，他以為施琅、朱天貴、林賢都是老海狗的出身絕不會犯這個錯的。「會不會南下大嶼（註：七美嶼）了？」
「林軍門說的有道理。」陳啟明也持相同的判斷。「八罩嶼上淡水稀缺，清軍數萬人不喝水是不可能的，全靠船上運的水也是不可能的，因此停在大嶼才是最有可能的。」
「天色已暗，快哨船也不好再探。」劉國軒目光死死盯在地圖上，對於林升和陳啟明判斷他總覺得有些不對，因此他命令著。「但不管是大嶼還是八罩嶼，明日清軍必然一早就攻到，讓各部都做好應對的準備了，明早提早用飯」
康熙二十二年六月十六日（公元1683年7月10日）清晨，施琅所部出現在娘媽宮（註：即馬公島）洋面上，此時鄭軍水師也已經出動，劉國軒以江勝部為左翼、林升部為右翼，各率八百料以上福船、廣船各八十艘嚴陣以待。
見到鄭軍已經做好了準備，施琅當即命令所部以速度較快的鳥船先行出擊，試圖以此攪亂鄭軍的陣形然後再投入主力一舉殲滅鄭軍。然而，鄭軍水師的威名猶在，清軍水師又有相當一部分是從鄭軍中叛逃的，彼此沾親帶故，因此並不願意就這麼兵戎相見。所以施琅命令下達後，只有右營游擊藍理及其弟藍瑤、藍瑗、藍珠率領的七艘戰船突入了鄭軍陣營中。
見到藍理孤軍深入，林升當即調動舟艦圍攻了上去，一頓炮火之後，藍理所部各艦紛紛起火，隨後以跳幫戰術為主的鄭軍便靠了上去，雙方頓時陷入了殘酷的肉搏戰當中。
此時見到藍理牽動了鄭軍的隊形，施琅便勒令第二波鳥船繼續出擊，但此時恰逢漲潮，清軍艦船被海浪推向岸邊，又遭到牛心山、四角嶼、雞籠嶼上鄭軍炮火的威懾因此隊形大亂。見到如此兩級，林升和江勝當即包抄上去，清軍不能應付，一時焦頭爛額，頹勢盡顯。
「給本官衝上去！」眼見局勢的發展出乎自己的預料，施琅當即拔出刀來，指揮著坐艦及其餘艦船實施救援，在他親自參戰的帶動下，原本尚且有些猶豫的清軍艦船也作出反應，雙方或互射銃炮或跳幫肉搏，戰事一度極其慘烈。
「施琅？」透過海上的硝煙，隱隱約約看見施琅帥旗的林升當即決定擒賊先擒王，於是其座下戰船如離弦之箭般直衝施琅的帥艦。「把鹿銃拿過來。」林升從手下搶來一桿火銃，死死的將施琅套在準星和照門之中，等到對面人影依稀可見了，他猛的一扣手中的扳機。「漢奸、逆賊受死吧」
雖然林升瞄得很準，但他畢竟是將領而不是經常操習火銃的士伍，因此在巨大的反作用力之下，不可避免的手顫抖了一下，脫膛而出的鉛彈並沒有打中施琅，只是在擊透船板的時候帶起一簇木屑掠過施琅的頭部，將其的眼角眉梢劃得血流滿面。
「該死！」林升心裡咒罵著，但卻大聲宣佈著。「施琅死了！」滿船的明鄭士伍跟著大聲鼓噪著，清軍那邊聽到之後一陣慌亂，林升滿意的命令道。「靠上去！殺了施琅！」
兩條船緩緩的接近著，林升臉上露出了勝利在望的笑容，但他卻光想著自己可以實施斬首戰術，而在清軍眼中同樣那個「賊」那個「王」的自己也是別人的斬首目標。結果一發炮彈從邊上的清軍舟船上射過來，一下子打斷了林升面前的桅桿，桅桿落地，正巧砸在林升的腿上，林升慘叫一聲暈死了過去。
見到林升負傷暈厥，鄭軍戰船便顧不得唾手可及的施琅了，匆匆忙忙的向己方遁去，施琅由此逃過一劫，但更對鄭軍不利的是，由於林升的帥旗隨著桅桿一起消失，右翼的鄭軍一時失去指揮，等到陳諒反應過來接過指揮權的時候，絕大部分的清軍得以突破鄭軍的阻攔防線向西逃到了西嶼洋面重整旗鼓。
當然鄭軍也不是沒有收穫，一陣廝殺之後這至少留下了清軍不下二十條戰船八百餘人，其中藍理所部各船一條也沒有逃出去，藍理本人也被一刀劈傷，腹破腸流之後力屈被擒，而鄭軍只付出了七條船，三百人左右的傷亡。
「林兄，不必氣餒，」在娘媽宮的港口中，劉國軒和一眾將領探望著負傷的林升。「好好修養，余等一定為你報仇，將那施琅逆賊斬殺於澎湖洋上。」林升默然的點點頭，說起來出現這樣的情況也是他自己的衝動，否則今天這一役就讓清軍吃不消了。「來人，」看到林升閉上眼睛，劉國軒命令著。「送林大人回東寧修養」
送走了林升，劉國軒馬上召開軍事會議重新安排水師指揮權：「如今林大人受傷返回東寧修養，那接下來就由水師右提督江勝江大人領本隊戰船五十艘，陳諒、陳啟明兩總兵分置左右翼各領戰船四十隻，此外再由樓船鎮總兵邱輝邱大人為本隊前鋒，領戰船二十隻，本官將親領後隊二十隻大船為諸位大人督陣。」
眾將一一領命，這時劉國軒說道：「施琅而今移師西嶼洋面，甚為不智，西嶼頭有本藩陸師炮台，其正好為本藩水陸兩師夾擊，明日決戰當一鼓而定」
可是劉國軒料錯了，因為傅為霖的通風報信，清軍方面對鄭軍在澎湖的不知一清二楚，因此第二天清晨，當劉國軒準備出動全軍出動跟施琅所部清軍決一死戰的時候，卻得到了清軍不知去向的消息，劉國軒無奈的收兵回營，並派出十餘隻快哨船四下打探。
清軍由於船隻眾多，所以很快就暴露了位置，劉國軒聞訊便率鄭軍水師主力南下，進駐虎井嶼、桶盤嶼與清軍在八罩嶼的水營隔海對峙。由於先前的勝利，劉國軒錯誤的認為清軍不堪一擊，於是不待己方營盤紮穩便全力向八罩嶼進攻。
此時清軍以逸待勞，發揮船多的優勢，林賢和朱天貴等部與施琅通力合作，自辰至午奮戰不止，縱然是劉國軒親冒矢石也未能打開局面，最終劉國軒力戰不勝帶著輕傷和十五條船的損失退回了虎井嶼、桶盤嶼。
當天夜裡，施琅實施夜襲，用火攻船直襲鄭軍水營，劉國軒猝不及防，雖幾經搏殺，當最終未能守住兩島，天明之後劉國軒被迫撤回娘媽宮，此時鄭軍大中型戰船已經不到一百八十艘，而清軍依然保有近二百艘，戰力的天平開始傾斜了。
六月二十日清晨，施琅派人以慰問劉國軒傷勢的名義前來實施招降。
對於施琅的圖謀，劉國軒明確予以拒絕：「尊侯仕明游擊，亡歸延平，復主逋逃，臣事三姓，此足下智若轉圜，勇於捨舊，捷出尋常萬萬，猥欲策駑末步驥塵，殷殷意厚，敢不拜嘉。國軒老矣，君存與存，君亡與亡，若一旦背而他之，卒然反噬，雖犬馬有不忍為，而謂國軒不犬馬若也？詰朝相遇，不盡欲言。」
儘管招降被劉國軒用辛辣的語言給頂了回去，但施琅卻依舊沒有放棄臨陣策反的念頭，他不斷派人以向故舊問安的名義給鄭軍各部送去招降的書信，姚啟聖也恰好此時派人過來誘降，在兩廂夾攻的情況下，鄭軍中的高級武官開始動搖了，其中左衝鎮鎮將楊德率部叛逃，造成鄭軍上下極大的震動。
為此劉國軒再度召集眾將，苦口婆心的告誡道：「以功，則三桂莫大，然以撤藩窘死，他皆殲殄，唯琅與天貴廑存，假以毒我。海氛朝以靖，兩人夕以誅耳。且兩軍殺掠相當，勝敗未卜，何餒然即欲投燼若斯？願共諸將軍決一死戰，以定去就何如？」
劉國軒語重心長的話語打動了猶豫不定的鄭軍諸將，於是軍心重新穩定下來，然而此時施琅得到來自大陸的增援，戰船總數更是達到了二百四十艘，佔有絕對優勢的他便不在等待鄭軍從內部瓦解，六月二十二日，最終的決戰開始了。